Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KHE9

Protein Details
Accession Q5KHE9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
71-101FWGYDPSPPRPKKKPTQGKTKKQLQRDRETAHydrophilic
316-339GVGKEFWRRAVRRKEGKRWVVWEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
79-92PRPKKKPTQGKTKK
324-332RAVRRKEGK
Subcellular Location(s) cyto 12, cyto_nucl 12, nucl 10, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002745  Ptrans_KptA/Tpt1  
IPR042081  RNA_2'-PTrans_C  
IPR042080  RNA_2'-PTrans_N  
Gene Ontology GO:0000215  F:tRNA 2'-phosphotransferase activity  
GO:0006388  P:tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation  
KEGG cne:CNE00310  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01885  PTS_2-RNA  
Amino Acid Sequences MPRPPEDPDVRNSKTLAYILRHGAEKEGLYIRSDGFIKLADVLARPKLKGVDEPTILHLVQTNAKKRFELFWGYDPSPPRPKKKPTQGKTKKQLQRDRETAAAAAASAAVAASGTGEGQEKGKEPDAATIDIIASSLASTDLTAPPSSLSINSTAPAPAQSSTSVDPPELPLISLPDPHTSASDSDANASANSDNPKGEYFIRATQGHSIQLESTAHLEQVKDDEEGKRKVGLMVHGTRWELWDTLKEQGLQKMTRQHIHLAPGFSGPITPRPNSTLYIYLDLSKLVAAGIPVYVSANGVVLTPGSKGGENGEGAGVGKEFWRRAVRRKEGKRWVVWEDGREVEREELSGEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.38
3 0.36
4 0.31
5 0.33
6 0.35
7 0.37
8 0.37
9 0.34
10 0.34
11 0.3
12 0.26
13 0.26
14 0.26
15 0.23
16 0.23
17 0.24
18 0.22
19 0.22
20 0.23
21 0.19
22 0.15
23 0.15
24 0.14
25 0.13
26 0.14
27 0.12
28 0.13
29 0.16
30 0.22
31 0.24
32 0.23
33 0.25
34 0.27
35 0.27
36 0.32
37 0.35
38 0.35
39 0.35
40 0.37
41 0.37
42 0.37
43 0.35
44 0.29
45 0.25
46 0.19
47 0.23
48 0.29
49 0.34
50 0.37
51 0.38
52 0.39
53 0.39
54 0.4
55 0.38
56 0.39
57 0.34
58 0.36
59 0.41
60 0.42
61 0.44
62 0.44
63 0.45
64 0.48
65 0.5
66 0.52
67 0.54
68 0.62
69 0.68
70 0.77
71 0.81
72 0.8
73 0.85
74 0.88
75 0.9
76 0.91
77 0.91
78 0.86
79 0.85
80 0.86
81 0.84
82 0.82
83 0.77
84 0.7
85 0.62
86 0.56
87 0.46
88 0.37
89 0.27
90 0.17
91 0.11
92 0.07
93 0.05
94 0.03
95 0.03
96 0.02
97 0.02
98 0.02
99 0.02
100 0.02
101 0.02
102 0.03
103 0.04
104 0.05
105 0.06
106 0.07
107 0.09
108 0.11
109 0.13
110 0.15
111 0.14
112 0.19
113 0.2
114 0.2
115 0.19
116 0.16
117 0.14
118 0.12
119 0.12
120 0.07
121 0.04
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.05
128 0.06
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.09
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.07
146 0.08
147 0.08
148 0.1
149 0.11
150 0.12
151 0.12
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.09
157 0.08
158 0.07
159 0.09
160 0.09
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.11
168 0.11
169 0.12
170 0.12
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.1
176 0.11
177 0.08
178 0.08
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.11
184 0.12
185 0.12
186 0.12
187 0.13
188 0.15
189 0.19
190 0.19
191 0.2
192 0.22
193 0.22
194 0.22
195 0.19
196 0.17
197 0.13
198 0.14
199 0.13
200 0.1
201 0.11
202 0.09
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.08
207 0.1
208 0.11
209 0.09
210 0.11
211 0.15
212 0.2
213 0.22
214 0.23
215 0.22
216 0.21
217 0.22
218 0.23
219 0.22
220 0.24
221 0.25
222 0.26
223 0.27
224 0.27
225 0.26
226 0.25
227 0.22
228 0.16
229 0.13
230 0.14
231 0.14
232 0.17
233 0.19
234 0.19
235 0.2
236 0.24
237 0.28
238 0.26
239 0.28
240 0.33
241 0.36
242 0.37
243 0.38
244 0.39
245 0.36
246 0.41
247 0.41
248 0.34
249 0.31
250 0.27
251 0.25
252 0.2
253 0.18
254 0.14
255 0.17
256 0.2
257 0.2
258 0.21
259 0.24
260 0.27
261 0.28
262 0.3
263 0.28
264 0.27
265 0.29
266 0.28
267 0.26
268 0.24
269 0.22
270 0.19
271 0.13
272 0.1
273 0.07
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.08
293 0.08
294 0.09
295 0.11
296 0.14
297 0.14
298 0.14
299 0.13
300 0.12
301 0.13
302 0.13
303 0.1
304 0.07
305 0.09
306 0.13
307 0.13
308 0.19
309 0.28
310 0.32
311 0.42
312 0.53
313 0.62
314 0.69
315 0.79
316 0.84
317 0.85
318 0.89
319 0.87
320 0.82
321 0.77
322 0.76
323 0.7
324 0.63
325 0.56
326 0.52
327 0.46
328 0.41
329 0.38
330 0.31
331 0.27
332 0.24