Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P0CO70

Protein Details
Accession P0CO70    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
317-339GEGDIKAKRKRIFRIGKSKEADEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
322-335KAKRKRIFRIGKSK
Subcellular Location(s) mito 9, cyto 8.5, cyto_nucl 6.5, nucl 3.5, extr 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027536  Mdm34  
IPR031468  SMP_LBD  
Gene Ontology GO:0032865  C:ERMES complex  
GO:0008289  F:lipid binding  
GO:0000002  P:mitochondrial genome maintenance  
GO:0007005  P:mitochondrion organization  
GO:1990456  P:mitochondrion-endoplasmic reticulum membrane tethering  
GO:0015914  P:phospholipid transport  
KEGG cne:CNE02420  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51847  SMP  
CDD cd21673  SMP_Mdm34  
Amino Acid Sequences MSFVFPSWSTAFSPAFHEDAKAMLEGALNKGDKPPVIQGKIEVVELHMGEQPPTLTLLEIGDLSIDRFRGILRLGYQGDAWLEVRCRVQANPLSHNPHLTFSTLPLSTPLLASQPLLVPMTLRLSKLHLRAILILVVSASKGITLVFKNDPLQNVDVSSTFDSVEVIRGYLQQEIEGQLREMFREHLPGIIHRLSQKWFSGSGVGGKVEMPYRDMSPVPSYAPINEEVEEEENEENHGTSPGNEESFPPRHIGPGGITLPLNNSVSQLAALSYSAHTLSPYARGHEHIAVRSFPYLGKSGAGTGSSGRASLASSSVGEGDIKAKRKRIFRIGKSKEADEKSEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.26
3 0.24
4 0.24
5 0.2
6 0.2
7 0.2
8 0.15
9 0.12
10 0.1
11 0.12
12 0.12
13 0.14
14 0.18
15 0.17
16 0.18
17 0.2
18 0.22
19 0.2
20 0.22
21 0.29
22 0.33
23 0.36
24 0.36
25 0.35
26 0.39
27 0.39
28 0.37
29 0.28
30 0.2
31 0.19
32 0.18
33 0.18
34 0.15
35 0.14
36 0.14
37 0.15
38 0.14
39 0.11
40 0.13
41 0.11
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.08
47 0.07
48 0.06
49 0.06
50 0.07
51 0.08
52 0.08
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.09
57 0.1
58 0.13
59 0.13
60 0.19
61 0.2
62 0.21
63 0.2
64 0.19
65 0.18
66 0.16
67 0.15
68 0.11
69 0.11
70 0.12
71 0.13
72 0.14
73 0.15
74 0.14
75 0.21
76 0.27
77 0.3
78 0.35
79 0.41
80 0.46
81 0.45
82 0.48
83 0.41
84 0.37
85 0.33
86 0.28
87 0.22
88 0.17
89 0.21
90 0.17
91 0.16
92 0.15
93 0.15
94 0.13
95 0.13
96 0.12
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.08
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.07
106 0.08
107 0.12
108 0.13
109 0.13
110 0.12
111 0.16
112 0.21
113 0.23
114 0.25
115 0.22
116 0.22
117 0.22
118 0.22
119 0.19
120 0.15
121 0.12
122 0.08
123 0.07
124 0.06
125 0.05
126 0.04
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.05
131 0.06
132 0.1
133 0.11
134 0.12
135 0.15
136 0.16
137 0.17
138 0.18
139 0.18
140 0.15
141 0.14
142 0.14
143 0.12
144 0.12
145 0.11
146 0.09
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.07
151 0.09
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.08
157 0.09
158 0.09
159 0.07
160 0.08
161 0.09
162 0.1
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.13
175 0.13
176 0.17
177 0.16
178 0.17
179 0.16
180 0.17
181 0.17
182 0.19
183 0.19
184 0.16
185 0.15
186 0.14
187 0.15
188 0.13
189 0.14
190 0.13
191 0.12
192 0.11
193 0.1
194 0.11
195 0.11
196 0.11
197 0.1
198 0.1
199 0.11
200 0.12
201 0.13
202 0.14
203 0.14
204 0.15
205 0.14
206 0.15
207 0.15
208 0.14
209 0.15
210 0.15
211 0.14
212 0.14
213 0.13
214 0.12
215 0.14
216 0.13
217 0.13
218 0.12
219 0.1
220 0.11
221 0.1
222 0.09
223 0.08
224 0.09
225 0.07
226 0.07
227 0.11
228 0.12
229 0.13
230 0.13
231 0.14
232 0.19
233 0.22
234 0.23
235 0.21
236 0.2
237 0.2
238 0.21
239 0.2
240 0.16
241 0.19
242 0.19
243 0.18
244 0.18
245 0.16
246 0.17
247 0.19
248 0.18
249 0.12
250 0.12
251 0.11
252 0.11
253 0.11
254 0.1
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.07
259 0.07
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.09
265 0.1
266 0.15
267 0.16
268 0.18
269 0.19
270 0.22
271 0.25
272 0.3
273 0.33
274 0.3
275 0.32
276 0.3
277 0.3
278 0.29
279 0.26
280 0.21
281 0.2
282 0.18
283 0.16
284 0.16
285 0.15
286 0.15
287 0.16
288 0.15
289 0.13
290 0.12
291 0.14
292 0.13
293 0.13
294 0.11
295 0.1
296 0.11
297 0.11
298 0.11
299 0.09
300 0.1
301 0.1
302 0.11
303 0.11
304 0.1
305 0.1
306 0.14
307 0.19
308 0.27
309 0.31
310 0.38
311 0.44
312 0.52
313 0.61
314 0.66
315 0.71
316 0.74
317 0.81
318 0.81
319 0.85
320 0.82
321 0.79
322 0.77
323 0.71