Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F9XMQ1

Protein Details
Accession A0A0F9XMQ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1038-1060FSVNVKYKPKVGKKGKQSESGSPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027040  PSMD4  
IPR003903  UIM_dom  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0008540  C:proteasome regulatory particle, base subcomplex  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF02809  UIM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50330  UIM  
Amino Acid Sequences MTQEPLKTPAPLLNNNHLDNLRFSQHGSLPRDASDLGRGRSGSSLGSQRLRPGPDQHQHQPLPGEDAGVNADQLDEKLRRLSLDKGLDDLPSVPGQRISEYEKALNTQAAKQGPGFQVIKRSEPRSDGIRLDNFPNVILCSARDPDAHLFASAARLPLLGGVGVEAILGAGHTVLESGKAAATNSSDVLRFETRYFPRLTSLATWRSEYLLRTRHLRNLARGKPGAPPGGTLSGRVGRAGKKSSAVLTYNSKLPWQVTNLHAVFLNGKKPPRVMQAAGDLGAATISDPTTGKIEKWGLEDLFTTPQLDEVAPNLVPYGLGDGPAGGPNVMDVSYTYGMISGEGFPGGRPFFRGVNEMRGRYIGGEISAVDTHLDIPKIPEMSDAICSVWIAKSSNVTSTTQSMCGMLTGSTLGIITAYSLGWDTTGPRYANGDVTARWVISPGVPIISLKVDDSFNQKRKSTSRVWAVALNALGEVYYLCDVPIGKPVRATGEDQTRNAWYAGRTVYWHLLEATRRIAREDELDKNATRGGYSPRSPSANMHLSQDQLVAEAREIEKFMRYRPSHFRKVCEGWDMQRKLEVDFASDDGKGAGENIFVIDCGLAENRPAGIQRYSRSLIPAQATPSESTTPLAPVSTSLFGSIGGFANRISPISESHTPLSPPPTPKSPPVPSTVIHDWSKQVFDLKGYSHDIVTSVAVDNSLSSLFTLGEDPLHTANEASSTTSPWADHGAREIPGRRTRFIIIGTNSGAVLVWNARDDDRTRETQPLRILQTESPEVSAVAASGLYLVHGGSDGLVQAWDPLASTVEPIRTINARSNGRVPRHMLVMNPAMDENTYAAVRAIYLDPDPTTLQGVVSFGAFLRYWSYGSNGHTAGRKRRVRHTDMDARLASRRQGHAVSGYIASEEAEMRRENEQQAREHIRRLKRFGALGDLTEEEAILYAQMVSEEAYHVEEQRRASDSAADASLDTASSVSENTVSTLTPDPSVAGPSASESNGVAEDEYEQQIQQAIRLSLMEGVNNDVPLESSRGNSSGDFDFSVNVKYKPKVGKKGKQSESGSPSASYTPVGGPSRYTTTEDEDLALALSLSMQDQGGYSSPPQQPSDAELALEIQHEEFPSLPGEGVGKGKGKSVQRW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.52
3 0.56
4 0.51
5 0.46
6 0.43
7 0.4
8 0.34
9 0.28
10 0.28
11 0.29
12 0.33
13 0.4
14 0.41
15 0.42
16 0.4
17 0.4
18 0.41
19 0.36
20 0.32
21 0.33
22 0.33
23 0.29
24 0.31
25 0.31
26 0.29
27 0.31
28 0.3
29 0.22
30 0.22
31 0.27
32 0.29
33 0.34
34 0.34
35 0.39
36 0.44
37 0.47
38 0.46
39 0.47
40 0.52
41 0.55
42 0.62
43 0.63
44 0.67
45 0.64
46 0.63
47 0.59
48 0.5
49 0.48
50 0.4
51 0.34
52 0.24
53 0.24
54 0.23
55 0.19
56 0.17
57 0.11
58 0.11
59 0.09
60 0.09
61 0.14
62 0.13
63 0.15
64 0.18
65 0.19
66 0.21
67 0.24
68 0.29
69 0.32
70 0.38
71 0.37
72 0.37
73 0.37
74 0.35
75 0.33
76 0.29
77 0.23
78 0.18
79 0.19
80 0.16
81 0.18
82 0.19
83 0.2
84 0.22
85 0.25
86 0.27
87 0.3
88 0.32
89 0.3
90 0.32
91 0.32
92 0.32
93 0.29
94 0.27
95 0.3
96 0.29
97 0.29
98 0.27
99 0.33
100 0.31
101 0.35
102 0.33
103 0.29
104 0.36
105 0.37
106 0.44
107 0.43
108 0.46
109 0.43
110 0.45
111 0.47
112 0.43
113 0.46
114 0.42
115 0.43
116 0.44
117 0.43
118 0.42
119 0.41
120 0.36
121 0.31
122 0.28
123 0.22
124 0.17
125 0.15
126 0.13
127 0.14
128 0.16
129 0.17
130 0.16
131 0.19
132 0.22
133 0.26
134 0.25
135 0.21
136 0.2
137 0.19
138 0.22
139 0.19
140 0.16
141 0.12
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.07
147 0.06
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.04
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.02
157 0.02
158 0.02
159 0.02
160 0.03
161 0.03
162 0.04
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.07
167 0.08
168 0.09
169 0.1
170 0.11
171 0.12
172 0.13
173 0.13
174 0.13
175 0.17
176 0.18
177 0.18
178 0.19
179 0.27
180 0.28
181 0.32
182 0.34
183 0.31
184 0.32
185 0.31
186 0.32
187 0.28
188 0.32
189 0.34
190 0.33
191 0.34
192 0.31
193 0.33
194 0.33
195 0.29
196 0.3
197 0.3
198 0.31
199 0.36
200 0.39
201 0.43
202 0.5
203 0.53
204 0.55
205 0.59
206 0.63
207 0.64
208 0.62
209 0.57
210 0.54
211 0.53
212 0.48
213 0.38
214 0.33
215 0.29
216 0.34
217 0.33
218 0.27
219 0.26
220 0.26
221 0.25
222 0.25
223 0.25
224 0.22
225 0.28
226 0.31
227 0.29
228 0.28
229 0.29
230 0.3
231 0.32
232 0.29
233 0.28
234 0.3
235 0.31
236 0.32
237 0.3
238 0.28
239 0.25
240 0.25
241 0.25
242 0.22
243 0.24
244 0.22
245 0.3
246 0.3
247 0.29
248 0.27
249 0.24
250 0.25
251 0.23
252 0.26
253 0.22
254 0.24
255 0.26
256 0.28
257 0.31
258 0.34
259 0.37
260 0.34
261 0.33
262 0.37
263 0.36
264 0.34
265 0.3
266 0.22
267 0.17
268 0.15
269 0.11
270 0.05
271 0.04
272 0.04
273 0.05
274 0.05
275 0.06
276 0.09
277 0.1
278 0.1
279 0.15
280 0.18
281 0.19
282 0.21
283 0.24
284 0.22
285 0.22
286 0.22
287 0.19
288 0.2
289 0.18
290 0.16
291 0.12
292 0.12
293 0.12
294 0.12
295 0.1
296 0.08
297 0.1
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.08
302 0.07
303 0.07
304 0.1
305 0.07
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.09
310 0.1
311 0.1
312 0.06
313 0.06
314 0.05
315 0.06
316 0.06
317 0.05
318 0.04
319 0.09
320 0.09
321 0.1
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.09
326 0.1
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.08
333 0.09
334 0.08
335 0.1
336 0.12
337 0.14
338 0.15
339 0.19
340 0.19
341 0.28
342 0.33
343 0.32
344 0.3
345 0.29
346 0.28
347 0.24
348 0.23
349 0.13
350 0.09
351 0.08
352 0.07
353 0.08
354 0.08
355 0.07
356 0.07
357 0.06
358 0.07
359 0.08
360 0.09
361 0.07
362 0.09
363 0.11
364 0.12
365 0.12
366 0.11
367 0.11
368 0.12
369 0.13
370 0.12
371 0.1
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.08
376 0.09
377 0.08
378 0.08
379 0.12
380 0.12
381 0.15
382 0.17
383 0.18
384 0.18
385 0.2
386 0.21
387 0.18
388 0.18
389 0.15
390 0.13
391 0.12
392 0.11
393 0.07
394 0.06
395 0.05
396 0.05
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.06
411 0.07
412 0.13
413 0.13
414 0.13
415 0.15
416 0.16
417 0.17
418 0.17
419 0.17
420 0.12
421 0.16
422 0.16
423 0.13
424 0.12
425 0.11
426 0.1
427 0.09
428 0.1
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.07
436 0.06
437 0.08
438 0.08
439 0.09
440 0.17
441 0.25
442 0.31
443 0.35
444 0.36
445 0.38
446 0.41
447 0.46
448 0.45
449 0.44
450 0.45
451 0.44
452 0.45
453 0.43
454 0.4
455 0.35
456 0.29
457 0.22
458 0.14
459 0.1
460 0.08
461 0.06
462 0.05
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.05
468 0.05
469 0.06
470 0.13
471 0.15
472 0.14
473 0.15
474 0.16
475 0.18
476 0.2
477 0.22
478 0.19
479 0.26
480 0.28
481 0.28
482 0.29
483 0.27
484 0.26
485 0.25
486 0.21
487 0.12
488 0.12
489 0.13
490 0.12
491 0.12
492 0.13
493 0.15
494 0.14
495 0.14
496 0.12
497 0.14
498 0.14
499 0.15
500 0.18
501 0.17
502 0.17
503 0.17
504 0.17
505 0.16
506 0.2
507 0.22
508 0.21
509 0.22
510 0.24
511 0.23
512 0.23
513 0.23
514 0.18
515 0.14
516 0.12
517 0.15
518 0.17
519 0.19
520 0.21
521 0.22
522 0.24
523 0.25
524 0.24
525 0.25
526 0.26
527 0.25
528 0.25
529 0.23
530 0.22
531 0.22
532 0.21
533 0.14
534 0.1
535 0.09
536 0.07
537 0.06
538 0.07
539 0.07
540 0.06
541 0.07
542 0.07
543 0.1
544 0.1
545 0.12
546 0.2
547 0.21
548 0.26
549 0.36
550 0.43
551 0.5
552 0.52
553 0.53
554 0.51
555 0.53
556 0.5
557 0.43
558 0.37
559 0.32
560 0.39
561 0.37
562 0.3
563 0.3
564 0.29
565 0.25
566 0.27
567 0.22
568 0.14
569 0.13
570 0.14
571 0.13
572 0.12
573 0.11
574 0.08
575 0.08
576 0.06
577 0.06
578 0.05
579 0.03
580 0.04
581 0.04
582 0.04
583 0.04
584 0.04
585 0.03
586 0.03
587 0.03
588 0.04
589 0.04
590 0.04
591 0.04
592 0.04
593 0.05
594 0.06
595 0.07
596 0.1
597 0.13
598 0.14
599 0.18
600 0.2
601 0.2
602 0.22
603 0.21
604 0.21
605 0.2
606 0.21
607 0.17
608 0.18
609 0.19
610 0.17
611 0.17
612 0.15
613 0.14
614 0.13
615 0.11
616 0.1
617 0.09
618 0.09
619 0.07
620 0.07
621 0.08
622 0.09
623 0.08
624 0.08
625 0.07
626 0.08
627 0.08
628 0.08
629 0.07
630 0.06
631 0.06
632 0.06
633 0.07
634 0.07
635 0.07
636 0.07
637 0.07
638 0.08
639 0.14
640 0.16
641 0.18
642 0.19
643 0.2
644 0.2
645 0.2
646 0.24
647 0.22
648 0.24
649 0.24
650 0.29
651 0.3
652 0.33
653 0.4
654 0.4
655 0.38
656 0.39
657 0.39
658 0.34
659 0.38
660 0.37
661 0.34
662 0.3
663 0.29
664 0.26
665 0.24
666 0.25
667 0.18
668 0.18
669 0.13
670 0.13
671 0.14
672 0.13
673 0.15
674 0.17
675 0.17
676 0.15
677 0.14
678 0.14
679 0.13
680 0.12
681 0.09
682 0.07
683 0.06
684 0.06
685 0.06
686 0.05
687 0.05
688 0.05
689 0.04
690 0.04
691 0.04
692 0.04
693 0.05
694 0.06
695 0.05
696 0.06
697 0.06
698 0.08
699 0.08
700 0.08
701 0.07
702 0.07
703 0.07
704 0.08
705 0.08
706 0.08
707 0.08
708 0.09
709 0.1
710 0.1
711 0.1
712 0.1
713 0.14
714 0.13
715 0.13
716 0.15
717 0.16
718 0.16
719 0.19
720 0.23
721 0.25
722 0.31
723 0.34
724 0.32
725 0.33
726 0.33
727 0.32
728 0.31
729 0.31
730 0.26
731 0.26
732 0.25
733 0.23
734 0.21
735 0.19
736 0.16
737 0.09
738 0.08
739 0.06
740 0.05
741 0.06
742 0.06
743 0.07
744 0.09
745 0.11
746 0.16
747 0.2
748 0.24
749 0.25
750 0.33
751 0.34
752 0.36
753 0.39
754 0.39
755 0.37
756 0.36
757 0.36
758 0.29
759 0.32
760 0.3
761 0.25
762 0.2
763 0.18
764 0.16
765 0.13
766 0.12
767 0.07
768 0.05
769 0.04
770 0.03
771 0.03
772 0.03
773 0.03
774 0.03
775 0.03
776 0.03
777 0.03
778 0.03
779 0.03
780 0.03
781 0.04
782 0.04
783 0.04
784 0.04
785 0.04
786 0.04
787 0.04
788 0.04
789 0.04
790 0.05
791 0.05
792 0.07
793 0.08
794 0.09
795 0.1
796 0.1
797 0.12
798 0.13
799 0.15
800 0.2
801 0.26
802 0.28
803 0.29
804 0.37
805 0.42
806 0.44
807 0.47
808 0.44
809 0.39
810 0.4
811 0.39
812 0.32
813 0.3
814 0.31
815 0.27
816 0.23
817 0.21
818 0.17
819 0.16
820 0.16
821 0.11
822 0.08
823 0.07
824 0.07
825 0.07
826 0.07
827 0.07
828 0.08
829 0.08
830 0.08
831 0.08
832 0.09
833 0.09
834 0.11
835 0.12
836 0.11
837 0.12
838 0.11
839 0.1
840 0.09
841 0.1
842 0.08
843 0.07
844 0.07
845 0.05
846 0.07
847 0.07
848 0.07
849 0.09
850 0.1
851 0.11
852 0.11
853 0.14
854 0.15
855 0.18
856 0.22
857 0.2
858 0.22
859 0.26
860 0.32
861 0.38
862 0.45
863 0.49
864 0.5
865 0.59
866 0.66
867 0.67
868 0.69
869 0.69
870 0.7
871 0.67
872 0.69
873 0.6
874 0.52
875 0.49
876 0.43
877 0.38
878 0.33
879 0.31
880 0.28
881 0.28
882 0.28
883 0.27
884 0.27
885 0.25
886 0.2
887 0.18
888 0.14
889 0.13
890 0.11
891 0.09
892 0.09
893 0.08
894 0.1
895 0.1
896 0.12
897 0.15
898 0.18
899 0.23
900 0.28
901 0.32
902 0.33
903 0.4
904 0.47
905 0.47
906 0.51
907 0.54
908 0.57
909 0.6
910 0.64
911 0.61
912 0.57
913 0.57
914 0.51
915 0.51
916 0.42
917 0.36
918 0.32
919 0.27
920 0.22
921 0.19
922 0.18
923 0.1
924 0.08
925 0.07
926 0.05
927 0.04
928 0.03
929 0.04
930 0.04
931 0.04
932 0.04
933 0.05
934 0.05
935 0.06
936 0.08
937 0.09
938 0.12
939 0.16
940 0.18
941 0.19
942 0.22
943 0.25
944 0.24
945 0.24
946 0.25
947 0.23
948 0.23
949 0.22
950 0.19
951 0.15
952 0.15
953 0.14
954 0.1
955 0.09
956 0.06
957 0.05
958 0.05
959 0.06
960 0.05
961 0.06
962 0.07
963 0.08
964 0.09
965 0.08
966 0.11
967 0.14
968 0.15
969 0.14
970 0.14
971 0.14
972 0.14
973 0.16
974 0.14
975 0.11
976 0.1
977 0.12
978 0.14
979 0.13
980 0.13
981 0.11
982 0.12
983 0.12
984 0.12
985 0.1
986 0.08
987 0.1
988 0.12
989 0.14
990 0.13
991 0.12
992 0.12
993 0.16
994 0.16
995 0.16
996 0.18
997 0.16
998 0.16
999 0.17
1000 0.17
1001 0.18
1002 0.19
1003 0.18
1004 0.14
1005 0.18
1006 0.18
1007 0.18
1008 0.17
1009 0.12
1010 0.13
1011 0.13
1012 0.17
1013 0.13
1014 0.14
1015 0.16
1016 0.17
1017 0.19
1018 0.18
1019 0.2
1020 0.18
1021 0.19
1022 0.19
1023 0.17
1024 0.18
1025 0.17
1026 0.21
1027 0.21
1028 0.22
1029 0.25
1030 0.26
1031 0.33
1032 0.41
1033 0.5
1034 0.57
1035 0.64
1036 0.71
1037 0.77
1038 0.86
1039 0.86
1040 0.85
1041 0.81
1042 0.79
1043 0.75
1044 0.71
1045 0.62
1046 0.51
1047 0.46
1048 0.38
1049 0.33
1050 0.24
1051 0.19
1052 0.16
1053 0.21
1054 0.22
1055 0.21
1056 0.22
1057 0.26
1058 0.3
1059 0.31
1060 0.33
1061 0.29
1062 0.33
1063 0.36
1064 0.34
1065 0.31
1066 0.26
1067 0.23
1068 0.2
1069 0.17
1070 0.1
1071 0.07
1072 0.06
1073 0.05
1074 0.05
1075 0.06
1076 0.05
1077 0.06
1078 0.06
1079 0.08
1080 0.09
1081 0.11
1082 0.12
1083 0.2
1084 0.25
1085 0.29
1086 0.31
1087 0.31
1088 0.31
1089 0.34
1090 0.38
1091 0.3
1092 0.26
1093 0.22
1094 0.21
1095 0.2
1096 0.2
1097 0.15
1098 0.1
1099 0.11
1100 0.11
1101 0.12
1102 0.11
1103 0.12
1104 0.13
1105 0.13
1106 0.12
1107 0.11
1108 0.12
1109 0.13
1110 0.15
1111 0.18
1112 0.2
1113 0.2
1114 0.24
1115 0.3