Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KMJ7

Protein Details
Accession Q5KMJ7    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MAENSQIKPRPVRHRHRNRIATEGDHydrophilic
45-70TLVDGAKAGKKRRKRQAPNGLPSLPTHydrophilic
1056-1075GSVTASGNKKGKKRKAPREEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-60KAGKKRRKRQ
1063-1075NKKGKKRKAPREE
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 7, cyto 7, cyto_nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:2000234  P:positive regulation of rRNA processing  
GO:0045943  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase I  
KEGG cne:CNB01450  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MAENSQIKPRPVRHRHRNRIATEGDVSSSRSKGKERAVDVNGDVTLVDGAKAGKKRRKRQAPNGLPSLPTDDSVGGQGESSTCRAPRRRDDSEHWDHIPVAQNEFTRVPPVWSKDGRFYFSVVHTSIHIHSSTSPSFPRLSTLSSTHPRGHSKPITSLQLSPINPFQIVSSSLDGTIKIWDWVAGRLIRTIDFHEPQSKVDHVAFGQVVGKWWLFAAVTHAKQSNSGQKLAYRLLRTPLGGNSNPILLGKLSNRPVSLIMSPRSTYLVALAANKAYTYRMPTPPFKSSDPWEDRPTCVKFVSDQPFTCGAFCPEKTLATATEEDWFATGDQKGVIRLWHGLTQAFRQVDAAASLALGGVVGSNQGPETEKRLPTTSLHWHAHAVSAIAFTPSGSQLLSVGEESVLVQWHLASGRREYIPRLGGRPIVSLAVRKATAAGEEEWWMALADGSVVRVGASSNRVASVGQGIRLDPLRPSSSDTPYPLSVHPSTGSLVVPSSHPSTIQFIDPIASTVLFDLEVVPSNRVSRREEKEHEPVKVEKVAFSDEQDGKSIWMATMEGREGDEGEGGGRVKNLKMWKWMDDRYLVNTQFPRPHGTSDISSVTFSPTPSAPGTSSNPVSTPDPYLLTTSTDGVAKIWHVRQSGKSEQGKVSAKKPIIVELYWSCRSTFNYRNLPIRASAFSPDVSILALSHGSVVTLWDVSSNILLKVLDNGLISDIMTIGFIGKEGRWLVGTGKGRGVAVWDLLSCEVAWSSPSLAADNLITSSTASYFISASNAPSSTTLRVFAPDSPAPLRTISIDTKVTQIVSLSQSSASESSSSLHFIGIAPSGEIYRFGDIAAALVPESANSVRQAQAKEGLSIWQEMFGKGAFLEEPETEEPITATASALQQRVSDKSGRPADIFEGPSHTMPPTGLLFDAFMDELLHGNTAAKDERKVKEVTRDEAVVYEMEVDDSGAEETSAGEIKGRAVEDGEIRELEAFFKDLLSSIPRAPLTPASRKPDTLRNRLPSHLTNHTPARSVATPLQSRKANGDASRGRASLLAGGNHVDESDIGTPGSVTASGNKKGKKRKAPREE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.91
3 0.93
4 0.94
5 0.87
6 0.84
7 0.76
8 0.7
9 0.62
10 0.53
11 0.44
12 0.35
13 0.35
14 0.29
15 0.29
16 0.27
17 0.27
18 0.3
19 0.35
20 0.43
21 0.48
22 0.51
23 0.58
24 0.57
25 0.58
26 0.54
27 0.5
28 0.41
29 0.32
30 0.26
31 0.17
32 0.15
33 0.1
34 0.09
35 0.07
36 0.08
37 0.14
38 0.21
39 0.3
40 0.38
41 0.48
42 0.59
43 0.69
44 0.79
45 0.84
46 0.89
47 0.92
48 0.94
49 0.93
50 0.91
51 0.82
52 0.72
53 0.62
54 0.57
55 0.47
56 0.36
57 0.28
58 0.21
59 0.19
60 0.19
61 0.19
62 0.12
63 0.11
64 0.11
65 0.11
66 0.12
67 0.13
68 0.15
69 0.17
70 0.26
71 0.33
72 0.42
73 0.51
74 0.58
75 0.64
76 0.69
77 0.75
78 0.77
79 0.78
80 0.76
81 0.68
82 0.61
83 0.52
84 0.48
85 0.48
86 0.4
87 0.34
88 0.31
89 0.29
90 0.31
91 0.33
92 0.29
93 0.24
94 0.24
95 0.24
96 0.27
97 0.31
98 0.36
99 0.4
100 0.43
101 0.48
102 0.52
103 0.52
104 0.46
105 0.43
106 0.39
107 0.36
108 0.37
109 0.29
110 0.25
111 0.22
112 0.24
113 0.24
114 0.22
115 0.2
116 0.16
117 0.17
118 0.22
119 0.23
120 0.23
121 0.24
122 0.24
123 0.25
124 0.24
125 0.27
126 0.23
127 0.25
128 0.25
129 0.27
130 0.32
131 0.37
132 0.42
133 0.43
134 0.46
135 0.49
136 0.49
137 0.55
138 0.54
139 0.51
140 0.55
141 0.55
142 0.57
143 0.52
144 0.51
145 0.47
146 0.47
147 0.44
148 0.39
149 0.36
150 0.31
151 0.29
152 0.27
153 0.22
154 0.16
155 0.18
156 0.17
157 0.17
158 0.16
159 0.16
160 0.16
161 0.16
162 0.14
163 0.14
164 0.12
165 0.1
166 0.1
167 0.11
168 0.12
169 0.13
170 0.18
171 0.17
172 0.18
173 0.19
174 0.2
175 0.19
176 0.2
177 0.22
178 0.24
179 0.25
180 0.27
181 0.31
182 0.31
183 0.32
184 0.34
185 0.31
186 0.27
187 0.26
188 0.24
189 0.18
190 0.21
191 0.19
192 0.16
193 0.17
194 0.15
195 0.15
196 0.15
197 0.15
198 0.11
199 0.11
200 0.11
201 0.09
202 0.08
203 0.14
204 0.19
205 0.2
206 0.23
207 0.26
208 0.25
209 0.28
210 0.33
211 0.35
212 0.31
213 0.32
214 0.31
215 0.3
216 0.34
217 0.37
218 0.38
219 0.32
220 0.31
221 0.33
222 0.34
223 0.32
224 0.31
225 0.3
226 0.3
227 0.28
228 0.28
229 0.25
230 0.23
231 0.22
232 0.2
233 0.16
234 0.1
235 0.12
236 0.13
237 0.19
238 0.23
239 0.24
240 0.25
241 0.25
242 0.26
243 0.26
244 0.27
245 0.26
246 0.24
247 0.25
248 0.26
249 0.25
250 0.26
251 0.23
252 0.19
253 0.15
254 0.14
255 0.12
256 0.14
257 0.14
258 0.12
259 0.12
260 0.12
261 0.11
262 0.1
263 0.1
264 0.15
265 0.2
266 0.27
267 0.32
268 0.39
269 0.44
270 0.48
271 0.51
272 0.48
273 0.46
274 0.44
275 0.49
276 0.5
277 0.5
278 0.52
279 0.49
280 0.49
281 0.52
282 0.5
283 0.42
284 0.35
285 0.31
286 0.26
287 0.33
288 0.38
289 0.36
290 0.33
291 0.34
292 0.37
293 0.36
294 0.34
295 0.27
296 0.23
297 0.23
298 0.22
299 0.23
300 0.21
301 0.21
302 0.21
303 0.22
304 0.19
305 0.17
306 0.18
307 0.14
308 0.15
309 0.15
310 0.14
311 0.13
312 0.12
313 0.09
314 0.11
315 0.1
316 0.08
317 0.09
318 0.1
319 0.1
320 0.11
321 0.11
322 0.1
323 0.12
324 0.13
325 0.15
326 0.15
327 0.16
328 0.17
329 0.18
330 0.22
331 0.2
332 0.19
333 0.16
334 0.16
335 0.14
336 0.13
337 0.12
338 0.06
339 0.05
340 0.05
341 0.04
342 0.04
343 0.03
344 0.02
345 0.02
346 0.02
347 0.03
348 0.03
349 0.03
350 0.03
351 0.04
352 0.06
353 0.07
354 0.13
355 0.19
356 0.2
357 0.22
358 0.25
359 0.26
360 0.26
361 0.31
362 0.33
363 0.35
364 0.35
365 0.34
366 0.33
367 0.31
368 0.31
369 0.26
370 0.18
371 0.1
372 0.09
373 0.08
374 0.07
375 0.07
376 0.05
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.06
384 0.07
385 0.06
386 0.06
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.04
394 0.04
395 0.05
396 0.06
397 0.09
398 0.1
399 0.11
400 0.15
401 0.16
402 0.17
403 0.19
404 0.22
405 0.24
406 0.25
407 0.25
408 0.24
409 0.25
410 0.25
411 0.24
412 0.2
413 0.17
414 0.15
415 0.15
416 0.14
417 0.13
418 0.12
419 0.11
420 0.12
421 0.1
422 0.1
423 0.11
424 0.11
425 0.09
426 0.1
427 0.1
428 0.09
429 0.09
430 0.08
431 0.06
432 0.05
433 0.04
434 0.03
435 0.03
436 0.04
437 0.03
438 0.03
439 0.03
440 0.03
441 0.04
442 0.05
443 0.07
444 0.07
445 0.08
446 0.08
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.13
451 0.11
452 0.12
453 0.12
454 0.12
455 0.13
456 0.14
457 0.14
458 0.09
459 0.12
460 0.12
461 0.12
462 0.17
463 0.19
464 0.23
465 0.25
466 0.26
467 0.25
468 0.25
469 0.26
470 0.22
471 0.23
472 0.2
473 0.18
474 0.17
475 0.15
476 0.14
477 0.13
478 0.13
479 0.08
480 0.08
481 0.07
482 0.07
483 0.09
484 0.1
485 0.09
486 0.09
487 0.1
488 0.13
489 0.13
490 0.13
491 0.11
492 0.09
493 0.1
494 0.1
495 0.1
496 0.07
497 0.06
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.04
502 0.04
503 0.04
504 0.04
505 0.06
506 0.07
507 0.08
508 0.08
509 0.1
510 0.13
511 0.15
512 0.19
513 0.24
514 0.3
515 0.37
516 0.41
517 0.44
518 0.52
519 0.53
520 0.5
521 0.45
522 0.41
523 0.36
524 0.35
525 0.3
526 0.21
527 0.18
528 0.19
529 0.16
530 0.16
531 0.2
532 0.17
533 0.17
534 0.17
535 0.16
536 0.14
537 0.14
538 0.13
539 0.07
540 0.06
541 0.06
542 0.05
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.06
547 0.06
548 0.06
549 0.06
550 0.05
551 0.04
552 0.04
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.06
558 0.06
559 0.1
560 0.13
561 0.14
562 0.21
563 0.23
564 0.28
565 0.33
566 0.35
567 0.33
568 0.34
569 0.32
570 0.3
571 0.33
572 0.28
573 0.26
574 0.26
575 0.26
576 0.27
577 0.27
578 0.28
579 0.23
580 0.25
581 0.24
582 0.25
583 0.23
584 0.22
585 0.23
586 0.18
587 0.17
588 0.16
589 0.15
590 0.14
591 0.12
592 0.11
593 0.09
594 0.11
595 0.11
596 0.12
597 0.11
598 0.13
599 0.16
600 0.18
601 0.19
602 0.17
603 0.17
604 0.18
605 0.19
606 0.16
607 0.15
608 0.13
609 0.13
610 0.13
611 0.14
612 0.12
613 0.13
614 0.12
615 0.11
616 0.11
617 0.1
618 0.09
619 0.08
620 0.08
621 0.07
622 0.1
623 0.12
624 0.15
625 0.16
626 0.18
627 0.22
628 0.28
629 0.32
630 0.37
631 0.39
632 0.39
633 0.38
634 0.43
635 0.46
636 0.41
637 0.4
638 0.38
639 0.35
640 0.35
641 0.34
642 0.32
643 0.28
644 0.25
645 0.26
646 0.22
647 0.28
648 0.27
649 0.27
650 0.24
651 0.23
652 0.26
653 0.29
654 0.33
655 0.35
656 0.41
657 0.44
658 0.5
659 0.49
660 0.47
661 0.42
662 0.38
663 0.31
664 0.24
665 0.22
666 0.17
667 0.16
668 0.15
669 0.13
670 0.11
671 0.09
672 0.08
673 0.06
674 0.05
675 0.05
676 0.05
677 0.05
678 0.04
679 0.04
680 0.04
681 0.05
682 0.04
683 0.04
684 0.04
685 0.04
686 0.05
687 0.05
688 0.07
689 0.07
690 0.06
691 0.07
692 0.07
693 0.07
694 0.08
695 0.08
696 0.09
697 0.08
698 0.08
699 0.08
700 0.08
701 0.08
702 0.06
703 0.06
704 0.04
705 0.04
706 0.04
707 0.03
708 0.03
709 0.04
710 0.05
711 0.04
712 0.07
713 0.08
714 0.08
715 0.09
716 0.09
717 0.1
718 0.17
719 0.2
720 0.19
721 0.2
722 0.2
723 0.19
724 0.19
725 0.2
726 0.13
727 0.11
728 0.1
729 0.09
730 0.09
731 0.09
732 0.09
733 0.07
734 0.06
735 0.06
736 0.05
737 0.05
738 0.05
739 0.06
740 0.07
741 0.08
742 0.08
743 0.08
744 0.09
745 0.08
746 0.08
747 0.08
748 0.06
749 0.06
750 0.06
751 0.06
752 0.06
753 0.07
754 0.07
755 0.07
756 0.07
757 0.07
758 0.09
759 0.09
760 0.1
761 0.11
762 0.11
763 0.11
764 0.12
765 0.14
766 0.15
767 0.15
768 0.15
769 0.14
770 0.16
771 0.16
772 0.16
773 0.21
774 0.19
775 0.22
776 0.22
777 0.23
778 0.22
779 0.21
780 0.2
781 0.16
782 0.19
783 0.18
784 0.2
785 0.21
786 0.2
787 0.22
788 0.22
789 0.2
790 0.16
791 0.15
792 0.14
793 0.14
794 0.14
795 0.13
796 0.12
797 0.12
798 0.14
799 0.14
800 0.11
801 0.09
802 0.09
803 0.1
804 0.1
805 0.12
806 0.1
807 0.1
808 0.09
809 0.09
810 0.1
811 0.1
812 0.1
813 0.08
814 0.08
815 0.09
816 0.08
817 0.09
818 0.09
819 0.09
820 0.08
821 0.08
822 0.09
823 0.08
824 0.09
825 0.08
826 0.07
827 0.05
828 0.06
829 0.05
830 0.05
831 0.07
832 0.07
833 0.08
834 0.09
835 0.11
836 0.15
837 0.19
838 0.21
839 0.21
840 0.28
841 0.27
842 0.27
843 0.26
844 0.25
845 0.22
846 0.23
847 0.2
848 0.18
849 0.17
850 0.16
851 0.16
852 0.13
853 0.13
854 0.1
855 0.11
856 0.07
857 0.07
858 0.09
859 0.08
860 0.13
861 0.14
862 0.15
863 0.14
864 0.14
865 0.14
866 0.12
867 0.12
868 0.08
869 0.07
870 0.08
871 0.11
872 0.14
873 0.15
874 0.15
875 0.17
876 0.19
877 0.22
878 0.24
879 0.26
880 0.25
881 0.33
882 0.39
883 0.39
884 0.38
885 0.36
886 0.37
887 0.37
888 0.36
889 0.28
890 0.27
891 0.26
892 0.26
893 0.25
894 0.22
895 0.17
896 0.15
897 0.17
898 0.13
899 0.12
900 0.12
901 0.11
902 0.11
903 0.11
904 0.12
905 0.09
906 0.08
907 0.07
908 0.07
909 0.08
910 0.07
911 0.08
912 0.06
913 0.08
914 0.08
915 0.1
916 0.14
917 0.15
918 0.21
919 0.28
920 0.31
921 0.34
922 0.38
923 0.39
924 0.45
925 0.5
926 0.48
927 0.45
928 0.44
929 0.39
930 0.37
931 0.34
932 0.23
933 0.17
934 0.14
935 0.1
936 0.09
937 0.08
938 0.07
939 0.06
940 0.06
941 0.07
942 0.05
943 0.05
944 0.05
945 0.05
946 0.07
947 0.08
948 0.07
949 0.08
950 0.08
951 0.1
952 0.13
953 0.13
954 0.12
955 0.12
956 0.15
957 0.17
958 0.19
959 0.2
960 0.17
961 0.17
962 0.18
963 0.17
964 0.16
965 0.13
966 0.12
967 0.1
968 0.1
969 0.1
970 0.09
971 0.11
972 0.14
973 0.15
974 0.16
975 0.21
976 0.21
977 0.22
978 0.25
979 0.31
980 0.34
981 0.41
982 0.48
983 0.5
984 0.53
985 0.57
986 0.58
987 0.6
988 0.63
989 0.63
990 0.65
991 0.67
992 0.67
993 0.68
994 0.7
995 0.65
996 0.63
997 0.61
998 0.56
999 0.53
1000 0.56
1001 0.54
1002 0.5
1003 0.45
1004 0.44
1005 0.37
1006 0.37
1007 0.36
1008 0.38
1009 0.43
1010 0.45
1011 0.52
1012 0.5
1013 0.5
1014 0.49
1015 0.49
1016 0.47
1017 0.42
1018 0.48
1019 0.46
1020 0.49
1021 0.52
1022 0.47
1023 0.43
1024 0.36
1025 0.35
1026 0.31
1027 0.29
1028 0.24
1029 0.2
1030 0.21
1031 0.21
1032 0.2
1033 0.19
1034 0.13
1035 0.09
1036 0.11
1037 0.12
1038 0.11
1039 0.11
1040 0.11
1041 0.11
1042 0.1
1043 0.12
1044 0.09
1045 0.08
1046 0.14
1047 0.21
1048 0.28
1049 0.35
1050 0.41
1051 0.49
1052 0.59
1053 0.69
1054 0.74
1055 0.79