Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F9XCM1

Protein Details
Accession A0A0F9XCM1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
343-366TANMQPPAKKQKREKNELDRNGLYHydrophilic
398-419WSHPSHKEDPPKPKTRKRTVAEBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 9.333, mito 6.5, cyto_mito 5.333, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MAPTNVTTATATATATAVQQNGSTKIKRPVPPGIQTNGAASSASSPSPSMANNKPPSAKQPPNSASDRAITASTVRPMARIRRDTLNQAAGRNSRNSAGMRSASFAADMAVHGYEPPPYVVTDAYVLKKHLGRPPSLVVHMHPTHFRFDGQDGMFQYKSPMRMFLDHVKNRTIPHDLLSYFIEGNVPFYEGCLIVQIHDHKSVAQAKGVKRPSSASSAVVPSSIHNYNQCLTPSPHVPYPKEEQNVGETAGKPKEEAKETDVDEKDADKEPTPNVPVDTSSKVAAKPKIYTVVLHPTAESIQMDLVLRASTSKINGDARATNDNSVMAPPSTPSTLVPPTPTTANMQPPAKKQKREKNELDRNGLYAFEGQVLLATNAPLMLEPTKSAEETIALLEEWSHPSHKEDPPKPKTRKRTVAEMAADEAAAAELERYMLVLDDRLASNSTGAQGAGGADGDGATGAATFEPRFERFKLIEDIKREHAEKKEQEKLKQLENDRKLQLQRQQQQQQQAAELAAQRQAEQERARREAAARETQLRQAEAQRQALAARAAASTPVAQANNNQAQMNQTQHAHPSAQGGVVANGMQNGVPAVQQNAMPNSIPGPAQARFQAQMSQAPASSPVIRQGTPQNMSSPMVGSVPMQQTNSSMAASPPRPASVVQTPQVSVPMTHAMSSRNSQQSHPSGTPRIPHSTPNISHATPINRPTMVATPRMTQASPPPNMMAQNSQMGQQMMMNNQVMNQANPQVMAQMAQQAQQRAMLQQQQQQQMVAAALQNGTFNGVNIASQGAGMTPQQQQQMMQMMQRQMMLQQQQQQQQQQQQQQQQQQMNPQQQQQQQQQQQQWAQQYAQQLQNMQGAQIRQMTPQMQAQIQHMARMGQMNGQLGNMMRGQMNGQMMNGNVNVNANNMQAIVAMQMQQQQQQQQQQQQQAQAQAQAQAQAQAHAQAQQAQAQAQAQAHAHAQAQAQQAHAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQHQGQGPQQAHGNATLQVQMQAHARLVYNRLMGVAAAKFGGPENIPQDTVDKIKQQSYAQAQQSVRDLVQRRAQQQQQQQIMMQQQQQQQQAAMQGMGGMMGHQGM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.12
3 0.14
4 0.12
5 0.12
6 0.15
7 0.17
8 0.22
9 0.28
10 0.29
11 0.33
12 0.41
13 0.5
14 0.53
15 0.56
16 0.61
17 0.64
18 0.7
19 0.7
20 0.65
21 0.61
22 0.56
23 0.52
24 0.43
25 0.35
26 0.26
27 0.19
28 0.18
29 0.16
30 0.15
31 0.14
32 0.12
33 0.13
34 0.15
35 0.17
36 0.21
37 0.26
38 0.36
39 0.41
40 0.46
41 0.5
42 0.51
43 0.57
44 0.6
45 0.63
46 0.58
47 0.63
48 0.62
49 0.64
50 0.66
51 0.6
52 0.53
53 0.47
54 0.43
55 0.34
56 0.3
57 0.24
58 0.22
59 0.23
60 0.23
61 0.24
62 0.22
63 0.24
64 0.29
65 0.38
66 0.44
67 0.46
68 0.47
69 0.52
70 0.57
71 0.6
72 0.62
73 0.62
74 0.55
75 0.52
76 0.54
77 0.5
78 0.5
79 0.46
80 0.41
81 0.33
82 0.35
83 0.34
84 0.32
85 0.32
86 0.32
87 0.29
88 0.3
89 0.3
90 0.25
91 0.24
92 0.2
93 0.14
94 0.11
95 0.1
96 0.09
97 0.08
98 0.07
99 0.08
100 0.08
101 0.09
102 0.1
103 0.11
104 0.1
105 0.1
106 0.12
107 0.11
108 0.12
109 0.14
110 0.17
111 0.19
112 0.21
113 0.22
114 0.25
115 0.28
116 0.33
117 0.36
118 0.37
119 0.37
120 0.4
121 0.45
122 0.46
123 0.46
124 0.41
125 0.37
126 0.41
127 0.4
128 0.37
129 0.36
130 0.33
131 0.33
132 0.33
133 0.32
134 0.26
135 0.25
136 0.31
137 0.27
138 0.29
139 0.27
140 0.31
141 0.3
142 0.27
143 0.29
144 0.25
145 0.28
146 0.24
147 0.27
148 0.25
149 0.28
150 0.34
151 0.39
152 0.47
153 0.48
154 0.5
155 0.5
156 0.49
157 0.48
158 0.47
159 0.42
160 0.32
161 0.3
162 0.33
163 0.28
164 0.28
165 0.28
166 0.26
167 0.2
168 0.19
169 0.18
170 0.12
171 0.14
172 0.13
173 0.12
174 0.1
175 0.1
176 0.11
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.09
182 0.14
183 0.18
184 0.19
185 0.21
186 0.21
187 0.19
188 0.25
189 0.31
190 0.28
191 0.29
192 0.32
193 0.34
194 0.43
195 0.49
196 0.45
197 0.4
198 0.42
199 0.41
200 0.41
201 0.39
202 0.32
203 0.29
204 0.29
205 0.28
206 0.25
207 0.22
208 0.16
209 0.2
210 0.19
211 0.18
212 0.18
213 0.2
214 0.21
215 0.24
216 0.24
217 0.23
218 0.24
219 0.27
220 0.29
221 0.31
222 0.34
223 0.37
224 0.38
225 0.38
226 0.43
227 0.46
228 0.44
229 0.41
230 0.38
231 0.35
232 0.35
233 0.32
234 0.29
235 0.22
236 0.24
237 0.26
238 0.24
239 0.21
240 0.23
241 0.27
242 0.28
243 0.29
244 0.28
245 0.32
246 0.34
247 0.42
248 0.39
249 0.34
250 0.31
251 0.29
252 0.28
253 0.25
254 0.25
255 0.18
256 0.2
257 0.21
258 0.25
259 0.26
260 0.24
261 0.22
262 0.21
263 0.21
264 0.23
265 0.24
266 0.2
267 0.2
268 0.21
269 0.22
270 0.27
271 0.29
272 0.29
273 0.28
274 0.3
275 0.34
276 0.33
277 0.31
278 0.3
279 0.35
280 0.34
281 0.31
282 0.28
283 0.23
284 0.23
285 0.23
286 0.19
287 0.1
288 0.08
289 0.09
290 0.09
291 0.08
292 0.08
293 0.07
294 0.06
295 0.06
296 0.08
297 0.08
298 0.09
299 0.1
300 0.13
301 0.16
302 0.17
303 0.2
304 0.21
305 0.23
306 0.28
307 0.28
308 0.25
309 0.23
310 0.22
311 0.19
312 0.17
313 0.15
314 0.1
315 0.09
316 0.08
317 0.1
318 0.1
319 0.1
320 0.1
321 0.14
322 0.16
323 0.17
324 0.19
325 0.18
326 0.19
327 0.2
328 0.2
329 0.19
330 0.21
331 0.26
332 0.28
333 0.31
334 0.33
335 0.4
336 0.5
337 0.54
338 0.58
339 0.62
340 0.67
341 0.73
342 0.79
343 0.81
344 0.81
345 0.85
346 0.83
347 0.8
348 0.71
349 0.62
350 0.53
351 0.42
352 0.32
353 0.22
354 0.15
355 0.09
356 0.08
357 0.06
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.06
362 0.06
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.04
367 0.05
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.09
372 0.1
373 0.1
374 0.11
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.09
379 0.07
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.07
384 0.08
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.13
389 0.2
390 0.24
391 0.33
392 0.39
393 0.49
394 0.57
395 0.67
396 0.73
397 0.75
398 0.81
399 0.81
400 0.84
401 0.77
402 0.78
403 0.72
404 0.71
405 0.64
406 0.55
407 0.46
408 0.36
409 0.32
410 0.21
411 0.16
412 0.08
413 0.05
414 0.04
415 0.02
416 0.02
417 0.03
418 0.03
419 0.03
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.04
424 0.04
425 0.05
426 0.06
427 0.07
428 0.08
429 0.07
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.07
434 0.07
435 0.06
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.04
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.03
444 0.02
445 0.02
446 0.02
447 0.02
448 0.02
449 0.02
450 0.03
451 0.03
452 0.05
453 0.07
454 0.09
455 0.12
456 0.13
457 0.17
458 0.18
459 0.21
460 0.26
461 0.29
462 0.31
463 0.33
464 0.35
465 0.34
466 0.36
467 0.34
468 0.32
469 0.32
470 0.36
471 0.39
472 0.42
473 0.47
474 0.49
475 0.51
476 0.56
477 0.54
478 0.52
479 0.51
480 0.5
481 0.51
482 0.51
483 0.54
484 0.46
485 0.48
486 0.43
487 0.42
488 0.44
489 0.44
490 0.47
491 0.5
492 0.56
493 0.56
494 0.61
495 0.6
496 0.53
497 0.45
498 0.38
499 0.28
500 0.22
501 0.19
502 0.13
503 0.11
504 0.1
505 0.1
506 0.11
507 0.11
508 0.14
509 0.16
510 0.21
511 0.23
512 0.26
513 0.26
514 0.25
515 0.26
516 0.27
517 0.29
518 0.29
519 0.26
520 0.27
521 0.27
522 0.3
523 0.3
524 0.25
525 0.22
526 0.2
527 0.25
528 0.25
529 0.25
530 0.22
531 0.21
532 0.21
533 0.21
534 0.17
535 0.11
536 0.08
537 0.07
538 0.06
539 0.06
540 0.06
541 0.05
542 0.06
543 0.07
544 0.07
545 0.07
546 0.08
547 0.14
548 0.17
549 0.18
550 0.18
551 0.16
552 0.18
553 0.19
554 0.2
555 0.15
556 0.13
557 0.13
558 0.14
559 0.15
560 0.14
561 0.12
562 0.12
563 0.11
564 0.1
565 0.1
566 0.09
567 0.08
568 0.07
569 0.07
570 0.05
571 0.05
572 0.05
573 0.04
574 0.04
575 0.03
576 0.04
577 0.04
578 0.04
579 0.05
580 0.06
581 0.07
582 0.08
583 0.09
584 0.1
585 0.09
586 0.09
587 0.09
588 0.09
589 0.08
590 0.08
591 0.1
592 0.1
593 0.11
594 0.13
595 0.13
596 0.13
597 0.14
598 0.17
599 0.14
600 0.16
601 0.17
602 0.16
603 0.15
604 0.14
605 0.15
606 0.13
607 0.13
608 0.1
609 0.14
610 0.15
611 0.15
612 0.17
613 0.21
614 0.25
615 0.26
616 0.26
617 0.23
618 0.23
619 0.24
620 0.22
621 0.18
622 0.12
623 0.1
624 0.1
625 0.09
626 0.12
627 0.13
628 0.14
629 0.14
630 0.13
631 0.14
632 0.16
633 0.16
634 0.11
635 0.1
636 0.09
637 0.14
638 0.14
639 0.15
640 0.14
641 0.14
642 0.14
643 0.14
644 0.19
645 0.21
646 0.24
647 0.24
648 0.25
649 0.25
650 0.24
651 0.26
652 0.21
653 0.14
654 0.12
655 0.13
656 0.12
657 0.12
658 0.13
659 0.13
660 0.15
661 0.17
662 0.22
663 0.24
664 0.25
665 0.25
666 0.31
667 0.33
668 0.36
669 0.37
670 0.34
671 0.32
672 0.32
673 0.35
674 0.33
675 0.35
676 0.3
677 0.31
678 0.33
679 0.37
680 0.36
681 0.37
682 0.37
683 0.31
684 0.32
685 0.32
686 0.31
687 0.27
688 0.29
689 0.27
690 0.23
691 0.23
692 0.24
693 0.26
694 0.24
695 0.25
696 0.23
697 0.22
698 0.24
699 0.26
700 0.24
701 0.19
702 0.25
703 0.28
704 0.28
705 0.27
706 0.26
707 0.26
708 0.27
709 0.27
710 0.22
711 0.16
712 0.18
713 0.17
714 0.17
715 0.18
716 0.17
717 0.15
718 0.15
719 0.15
720 0.13
721 0.15
722 0.14
723 0.12
724 0.12
725 0.17
726 0.15
727 0.14
728 0.14
729 0.14
730 0.14
731 0.14
732 0.14
733 0.1
734 0.09
735 0.09
736 0.08
737 0.11
738 0.11
739 0.14
740 0.17
741 0.17
742 0.18
743 0.19
744 0.19
745 0.16
746 0.19
747 0.21
748 0.23
749 0.28
750 0.35
751 0.37
752 0.37
753 0.36
754 0.33
755 0.27
756 0.24
757 0.18
758 0.12
759 0.08
760 0.08
761 0.08
762 0.07
763 0.06
764 0.08
765 0.08
766 0.07
767 0.07
768 0.07
769 0.07
770 0.07
771 0.08
772 0.05
773 0.05
774 0.05
775 0.04
776 0.05
777 0.05
778 0.08
779 0.11
780 0.14
781 0.16
782 0.16
783 0.17
784 0.19
785 0.25
786 0.23
787 0.22
788 0.23
789 0.23
790 0.24
791 0.24
792 0.22
793 0.17
794 0.21
795 0.23
796 0.22
797 0.28
798 0.34
799 0.4
800 0.45
801 0.49
802 0.49
803 0.53
804 0.58
805 0.57
806 0.59
807 0.61
808 0.64
809 0.65
810 0.67
811 0.64
812 0.59
813 0.6
814 0.6
815 0.6
816 0.56
817 0.54
818 0.54
819 0.54
820 0.6
821 0.6
822 0.62
823 0.62
824 0.65
825 0.65
826 0.65
827 0.63
828 0.6
829 0.56
830 0.49
831 0.42
832 0.37
833 0.38
834 0.36
835 0.36
836 0.33
837 0.29
838 0.28
839 0.32
840 0.29
841 0.24
842 0.21
843 0.17
844 0.18
845 0.22
846 0.2
847 0.17
848 0.21
849 0.21
850 0.21
851 0.24
852 0.24
853 0.21
854 0.22
855 0.23
856 0.29
857 0.27
858 0.27
859 0.24
860 0.22
861 0.21
862 0.22
863 0.2
864 0.15
865 0.17
866 0.17
867 0.16
868 0.15
869 0.15
870 0.13
871 0.14
872 0.12
873 0.11
874 0.1
875 0.1
876 0.11
877 0.13
878 0.15
879 0.14
880 0.14
881 0.14
882 0.14
883 0.15
884 0.15
885 0.12
886 0.1
887 0.11
888 0.11
889 0.11
890 0.12
891 0.1
892 0.1
893 0.1
894 0.09
895 0.08
896 0.08
897 0.07
898 0.07
899 0.08
900 0.09
901 0.14
902 0.15
903 0.19
904 0.22
905 0.27
906 0.32
907 0.4
908 0.45
909 0.48
910 0.54
911 0.58
912 0.59
913 0.59
914 0.57
915 0.54
916 0.49
917 0.45
918 0.39
919 0.35
920 0.31
921 0.29
922 0.25
923 0.25
924 0.23
925 0.21
926 0.2
927 0.18
928 0.18
929 0.18
930 0.19
931 0.19
932 0.2
933 0.23
934 0.23
935 0.21
936 0.22
937 0.19
938 0.22
939 0.17
940 0.19
941 0.15
942 0.15
943 0.16
944 0.16
945 0.16
946 0.16
947 0.16
948 0.2
949 0.24
950 0.24
951 0.24
952 0.24
953 0.25
954 0.24
955 0.24
956 0.19
957 0.17
958 0.17
959 0.2
960 0.19
961 0.2
962 0.18
963 0.2
964 0.2
965 0.2
966 0.19
967 0.18
968 0.17
969 0.18
970 0.19
971 0.2
972 0.2
973 0.23
974 0.23
975 0.24
976 0.26
977 0.27
978 0.28
979 0.33
980 0.33
981 0.29
982 0.32
983 0.3
984 0.29
985 0.27
986 0.27
987 0.2
988 0.2
989 0.2
990 0.17
991 0.19
992 0.18
993 0.18
994 0.2
995 0.19
996 0.2
997 0.19
998 0.2
999 0.19
1000 0.22
1001 0.24
1002 0.23
1003 0.21
1004 0.2
1005 0.19
1006 0.17
1007 0.18
1008 0.15
1009 0.12
1010 0.1
1011 0.1
1012 0.1
1013 0.11
1014 0.14
1015 0.11
1016 0.15
1017 0.18
1018 0.2
1019 0.21
1020 0.21
1021 0.22
1022 0.22
1023 0.26
1024 0.26
1025 0.28
1026 0.29
1027 0.33
1028 0.37
1029 0.37
1030 0.43
1031 0.46
1032 0.52
1033 0.49
1034 0.54
1035 0.51
1036 0.49
1037 0.52
1038 0.46
1039 0.38
1040 0.37
1041 0.36
1042 0.35
1043 0.43
1044 0.47
1045 0.47
1046 0.54
1047 0.6
1048 0.62
1049 0.67
1050 0.7
1051 0.69
1052 0.64
1053 0.61
1054 0.57
1055 0.57
1056 0.54
1057 0.5
1058 0.48
1059 0.47
1060 0.51
1061 0.54
1062 0.5
1063 0.44
1064 0.4
1065 0.39
1066 0.33
1067 0.26
1068 0.2
1069 0.15
1070 0.14
1071 0.13
1072 0.1
1073 0.06