Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KCI4

Protein Details
Accession Q5KCI4    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
395-418RIDGDRKKKEFKEIRKPQVKNFEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-91KKKGKE
232-240KRRSRGRGR
400-412RKKKEFKEIRKPQ
447-450KKRK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG cne:CNH01130  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MPDPLEYAEEEDLFGSEGEYDTTDPFTLENVNPSVPIATPTTLPIASISRPATQRTRQQVYPHISRSAVSGRNDGEARLQELRNLKKKGKEEPPKFGVRSLKNIAMGVVQANSGRIWDIGDLEYSLVKPFIDEVPMEQLAEIEANSPHIKKDTDWLYELFMLQDYRLFHERCRERQGEPRTTGWRKMYKKAKEDAAERQLQAADRVAARYKQLEEEKKSKSIVVLDRVVPDKRRSRGRGRGGSSIGSSSSSRTAGAASAIAKARAEAQRARIALTHASGRYVPPAQTQTHAQRVASSQLFKNPFLPSGSTSTSSTGYPPAPSPPQSRLPPPKSLRNSLDRISSIPKSRKQLQHPLSSPISGSFPTSQHSQMRAALPAHLSGRTGTSSPQPSERFRIDGDRKKKEFKEIRKPQVKNFEAPKLENEKSKEKVDFFGGAGADGGGIFRVKKRKLGTEAGAGGAKRQQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.08
3 0.07
4 0.07
5 0.07
6 0.08
7 0.09
8 0.09
9 0.11
10 0.11
11 0.11
12 0.11
13 0.11
14 0.14
15 0.14
16 0.18
17 0.18
18 0.19
19 0.19
20 0.19
21 0.19
22 0.15
23 0.16
24 0.14
25 0.14
26 0.14
27 0.15
28 0.18
29 0.17
30 0.17
31 0.16
32 0.16
33 0.16
34 0.21
35 0.22
36 0.25
37 0.27
38 0.32
39 0.38
40 0.42
41 0.5
42 0.55
43 0.59
44 0.58
45 0.62
46 0.66
47 0.66
48 0.67
49 0.62
50 0.56
51 0.49
52 0.45
53 0.43
54 0.41
55 0.39
56 0.33
57 0.33
58 0.31
59 0.35
60 0.35
61 0.32
62 0.29
63 0.25
64 0.26
65 0.27
66 0.26
67 0.26
68 0.34
69 0.43
70 0.47
71 0.51
72 0.52
73 0.55
74 0.6
75 0.65
76 0.68
77 0.7
78 0.69
79 0.73
80 0.74
81 0.75
82 0.7
83 0.66
84 0.64
85 0.57
86 0.57
87 0.53
88 0.5
89 0.43
90 0.42
91 0.37
92 0.28
93 0.25
94 0.18
95 0.13
96 0.1
97 0.08
98 0.09
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.07
114 0.06
115 0.06
116 0.08
117 0.08
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.15
122 0.15
123 0.15
124 0.13
125 0.12
126 0.11
127 0.11
128 0.09
129 0.05
130 0.05
131 0.08
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.12
136 0.13
137 0.13
138 0.2
139 0.23
140 0.25
141 0.27
142 0.26
143 0.26
144 0.26
145 0.26
146 0.19
147 0.14
148 0.11
149 0.09
150 0.11
151 0.09
152 0.13
153 0.18
154 0.18
155 0.19
156 0.28
157 0.34
158 0.37
159 0.44
160 0.43
161 0.41
162 0.5
163 0.57
164 0.56
165 0.53
166 0.53
167 0.54
168 0.54
169 0.56
170 0.54
171 0.54
172 0.5
173 0.56
174 0.6
175 0.59
176 0.63
177 0.63
178 0.62
179 0.58
180 0.58
181 0.58
182 0.55
183 0.5
184 0.44
185 0.4
186 0.34
187 0.29
188 0.26
189 0.18
190 0.13
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.12
196 0.13
197 0.13
198 0.17
199 0.23
200 0.29
201 0.33
202 0.39
203 0.41
204 0.41
205 0.41
206 0.36
207 0.3
208 0.29
209 0.28
210 0.25
211 0.25
212 0.24
213 0.25
214 0.27
215 0.27
216 0.24
217 0.26
218 0.28
219 0.31
220 0.38
221 0.42
222 0.48
223 0.57
224 0.64
225 0.66
226 0.64
227 0.64
228 0.57
229 0.52
230 0.44
231 0.34
232 0.25
233 0.18
234 0.15
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.09
239 0.09
240 0.09
241 0.07
242 0.08
243 0.08
244 0.07
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.13
251 0.14
252 0.17
253 0.17
254 0.2
255 0.25
256 0.25
257 0.26
258 0.22
259 0.21
260 0.19
261 0.18
262 0.18
263 0.13
264 0.14
265 0.14
266 0.13
267 0.15
268 0.15
269 0.15
270 0.15
271 0.18
272 0.18
273 0.2
274 0.25
275 0.27
276 0.32
277 0.33
278 0.29
279 0.27
280 0.28
281 0.31
282 0.28
283 0.26
284 0.2
285 0.26
286 0.29
287 0.27
288 0.29
289 0.25
290 0.25
291 0.23
292 0.24
293 0.19
294 0.21
295 0.23
296 0.21
297 0.21
298 0.21
299 0.21
300 0.19
301 0.18
302 0.16
303 0.15
304 0.14
305 0.14
306 0.17
307 0.2
308 0.24
309 0.27
310 0.29
311 0.36
312 0.38
313 0.46
314 0.52
315 0.54
316 0.59
317 0.61
318 0.66
319 0.64
320 0.69
321 0.65
322 0.62
323 0.62
324 0.54
325 0.54
326 0.45
327 0.41
328 0.39
329 0.38
330 0.39
331 0.42
332 0.45
333 0.47
334 0.55
335 0.61
336 0.64
337 0.7
338 0.69
339 0.71
340 0.68
341 0.68
342 0.61
343 0.53
344 0.45
345 0.36
346 0.3
347 0.2
348 0.21
349 0.17
350 0.16
351 0.18
352 0.2
353 0.23
354 0.26
355 0.28
356 0.28
357 0.3
358 0.31
359 0.32
360 0.3
361 0.28
362 0.25
363 0.25
364 0.24
365 0.2
366 0.18
367 0.15
368 0.16
369 0.15
370 0.15
371 0.14
372 0.2
373 0.25
374 0.27
375 0.34
376 0.36
377 0.39
378 0.45
379 0.46
380 0.42
381 0.38
382 0.47
383 0.49
384 0.55
385 0.61
386 0.65
387 0.67
388 0.73
389 0.74
390 0.74
391 0.75
392 0.75
393 0.77
394 0.77
395 0.83
396 0.84
397 0.85
398 0.83
399 0.84
400 0.77
401 0.74
402 0.7
403 0.68
404 0.63
405 0.61
406 0.6
407 0.57
408 0.56
409 0.55
410 0.53
411 0.52
412 0.51
413 0.55
414 0.53
415 0.47
416 0.47
417 0.45
418 0.42
419 0.35
420 0.34
421 0.28
422 0.22
423 0.2
424 0.17
425 0.12
426 0.09
427 0.09
428 0.05
429 0.06
430 0.07
431 0.13
432 0.22
433 0.25
434 0.32
435 0.38
436 0.47
437 0.53
438 0.61
439 0.6
440 0.6
441 0.6
442 0.56
443 0.53
444 0.43