Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F9Y1I7

Protein Details
Accession A0A0F9Y1I7    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
225-246AASGGKKQRERERKVKQTVDFDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
87-111PRDGPRGGQGARVRGGRGGRFPRDR
230-238KKQRERERK
254-284RTRGGGRGGRGGPRGGRGGERGRGGNFRGGR
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 11.5, cyto 8, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSQVASQNRFAYLGNDSDGEEKPVVPVKTVDKATTRTTKRNVEPQAPQAPVRTGGNRRGGPGGNEGAFRDRAAGRERNQGRSTEETPRDGPRGGQGARVRGGRGGRFPRDRDDRHPHKSGTTTGSDKQAAQSWGATEGNAELKDEQAGEAIAESEKKDEQPEEAAEPEEPEDKSISYTDYLAQQAEKKAALESELNIRSANEGSKLDKKWANAKPLEKEEDDFIAASGGKKQRERERKVKQTVDFDPRFVEPERTRGGGRGGRGGPRGGRGGERGRGGNFRGGRGGQGASINTSDQSAFPSLGGN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.18
4 0.2
5 0.2
6 0.21
7 0.19
8 0.17
9 0.18
10 0.24
11 0.23
12 0.21
13 0.24
14 0.25
15 0.32
16 0.34
17 0.35
18 0.32
19 0.36
20 0.42
21 0.48
22 0.5
23 0.51
24 0.56
25 0.62
26 0.64
27 0.7
28 0.69
29 0.67
30 0.67
31 0.67
32 0.67
33 0.61
34 0.55
35 0.48
36 0.43
37 0.38
38 0.36
39 0.34
40 0.32
41 0.37
42 0.45
43 0.43
44 0.43
45 0.44
46 0.42
47 0.38
48 0.37
49 0.34
50 0.26
51 0.26
52 0.25
53 0.24
54 0.23
55 0.2
56 0.19
57 0.15
58 0.18
59 0.23
60 0.28
61 0.28
62 0.38
63 0.42
64 0.46
65 0.47
66 0.46
67 0.45
68 0.45
69 0.45
70 0.45
71 0.44
72 0.4
73 0.4
74 0.42
75 0.4
76 0.34
77 0.31
78 0.25
79 0.29
80 0.26
81 0.3
82 0.29
83 0.3
84 0.33
85 0.33
86 0.29
87 0.26
88 0.29
89 0.24
90 0.29
91 0.32
92 0.36
93 0.41
94 0.42
95 0.47
96 0.53
97 0.55
98 0.56
99 0.6
100 0.61
101 0.62
102 0.65
103 0.58
104 0.52
105 0.51
106 0.45
107 0.39
108 0.34
109 0.31
110 0.28
111 0.31
112 0.29
113 0.26
114 0.24
115 0.24
116 0.21
117 0.18
118 0.16
119 0.13
120 0.14
121 0.14
122 0.13
123 0.08
124 0.08
125 0.1
126 0.09
127 0.09
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.06
143 0.06
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.1
148 0.11
149 0.11
150 0.12
151 0.12
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.1
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.1
167 0.11
168 0.11
169 0.11
170 0.13
171 0.13
172 0.14
173 0.13
174 0.12
175 0.11
176 0.11
177 0.12
178 0.1
179 0.1
180 0.16
181 0.17
182 0.17
183 0.17
184 0.16
185 0.16
186 0.16
187 0.16
188 0.11
189 0.11
190 0.15
191 0.21
192 0.22
193 0.27
194 0.28
195 0.3
196 0.37
197 0.41
198 0.46
199 0.45
200 0.5
201 0.51
202 0.54
203 0.57
204 0.48
205 0.44
206 0.37
207 0.33
208 0.28
209 0.21
210 0.16
211 0.12
212 0.11
213 0.1
214 0.15
215 0.18
216 0.21
217 0.25
218 0.32
219 0.42
220 0.52
221 0.6
222 0.65
223 0.71
224 0.78
225 0.84
226 0.85
227 0.8
228 0.77
229 0.77
230 0.76
231 0.67
232 0.57
233 0.5
234 0.43
235 0.4
236 0.34
237 0.35
238 0.26
239 0.31
240 0.34
241 0.34
242 0.33
243 0.32
244 0.38
245 0.32
246 0.33
247 0.34
248 0.34
249 0.36
250 0.38
251 0.39
252 0.34
253 0.34
254 0.36
255 0.29
256 0.29
257 0.3
258 0.34
259 0.36
260 0.37
261 0.36
262 0.36
263 0.39
264 0.39
265 0.41
266 0.36
267 0.33
268 0.35
269 0.32
270 0.31
271 0.29
272 0.27
273 0.21
274 0.22
275 0.21
276 0.19
277 0.19
278 0.18
279 0.16
280 0.16
281 0.15
282 0.12
283 0.15
284 0.15
285 0.14