Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5K7D5

Protein Details
Accession Q5K7D5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
153-181FEEHTKRRLEEKKLKRKNNPLRQKAQAKLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
156-180HTKRRLEEKKLKRKNNPLRQKAQAK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 15, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0030619  F:U1 snRNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12247  RRM2_U1A_like  
Amino Acid Sequences MAEVQAPPPAMNPEQTQSPLAEQIPAENGDAEVKAEEGAKQAQEEGEEDPNKIPDNACETLYLQNLNEKVRIPVMKETLYNLFKPYRPLQPIIAHHNIRMRGQAFVSFSDIESANEARKDVNEFPLYGKSIQIKFAKGLSDSIVKRKGDEKEFEEHTKRRLEEKKLKRKNNPLRQKAQAKLRADTTAGTAGPAAKKQRLQMPDEYLPPNSVLFVQNLPDGTTSEDLREVFEVHPGLIEIRTIPAKKDIAFVEFADEGAATIAKDALHNFKIDGETKMKVTYARK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.3
3 0.29
4 0.25
5 0.26
6 0.27
7 0.24
8 0.23
9 0.19
10 0.19
11 0.21
12 0.2
13 0.19
14 0.15
15 0.15
16 0.13
17 0.14
18 0.12
19 0.09
20 0.08
21 0.08
22 0.09
23 0.09
24 0.1
25 0.12
26 0.12
27 0.13
28 0.13
29 0.13
30 0.14
31 0.14
32 0.15
33 0.2
34 0.2
35 0.21
36 0.21
37 0.23
38 0.23
39 0.22
40 0.2
41 0.15
42 0.21
43 0.21
44 0.21
45 0.21
46 0.21
47 0.24
48 0.25
49 0.23
50 0.16
51 0.19
52 0.21
53 0.21
54 0.21
55 0.18
56 0.18
57 0.22
58 0.23
59 0.22
60 0.25
61 0.28
62 0.28
63 0.27
64 0.29
65 0.31
66 0.32
67 0.3
68 0.27
69 0.27
70 0.26
71 0.31
72 0.32
73 0.33
74 0.35
75 0.36
76 0.38
77 0.42
78 0.45
79 0.47
80 0.5
81 0.43
82 0.41
83 0.43
84 0.4
85 0.34
86 0.34
87 0.27
88 0.2
89 0.2
90 0.21
91 0.17
92 0.17
93 0.18
94 0.14
95 0.13
96 0.14
97 0.14
98 0.11
99 0.12
100 0.12
101 0.1
102 0.1
103 0.11
104 0.09
105 0.09
106 0.13
107 0.13
108 0.17
109 0.17
110 0.17
111 0.19
112 0.21
113 0.22
114 0.18
115 0.18
116 0.17
117 0.17
118 0.22
119 0.22
120 0.21
121 0.2
122 0.21
123 0.21
124 0.17
125 0.17
126 0.13
127 0.17
128 0.17
129 0.21
130 0.25
131 0.24
132 0.24
133 0.29
134 0.32
135 0.3
136 0.33
137 0.32
138 0.32
139 0.36
140 0.39
141 0.39
142 0.36
143 0.36
144 0.37
145 0.34
146 0.37
147 0.41
148 0.46
149 0.51
150 0.61
151 0.68
152 0.74
153 0.81
154 0.82
155 0.86
156 0.87
157 0.88
158 0.88
159 0.85
160 0.82
161 0.82
162 0.81
163 0.76
164 0.74
165 0.71
166 0.63
167 0.57
168 0.52
169 0.45
170 0.37
171 0.31
172 0.24
173 0.19
174 0.15
175 0.13
176 0.11
177 0.12
178 0.12
179 0.15
180 0.16
181 0.17
182 0.2
183 0.23
184 0.3
185 0.32
186 0.36
187 0.38
188 0.42
189 0.43
190 0.45
191 0.43
192 0.37
193 0.34
194 0.3
195 0.24
196 0.17
197 0.15
198 0.12
199 0.11
200 0.12
201 0.12
202 0.12
203 0.13
204 0.13
205 0.12
206 0.12
207 0.13
208 0.14
209 0.13
210 0.13
211 0.15
212 0.14
213 0.14
214 0.15
215 0.14
216 0.12
217 0.15
218 0.15
219 0.13
220 0.13
221 0.12
222 0.12
223 0.1
224 0.1
225 0.07
226 0.1
227 0.15
228 0.15
229 0.17
230 0.21
231 0.24
232 0.24
233 0.28
234 0.27
235 0.25
236 0.27
237 0.25
238 0.24
239 0.22
240 0.21
241 0.16
242 0.14
243 0.11
244 0.1
245 0.1
246 0.05
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.08
251 0.1
252 0.16
253 0.18
254 0.19
255 0.19
256 0.2
257 0.25
258 0.26
259 0.28
260 0.26
261 0.27
262 0.28
263 0.29
264 0.28