Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KLM6

Protein Details
Accession Q5KLM6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
288-316LGWEWFKRSAPRMRNKTKKWPNPFGGFGKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
108-127RERAGGRTRDEKKAKSKAKD
300-305MRNKTK
Subcellular Location(s) mito 17, cyto 5, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022801  Ribosomal_S4/S9  
IPR002942  S4_RNA-bd  
IPR036986  S4_RNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005763  C:mitochondrial small ribosomal subunit  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG cne:CNB04730  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01479  S4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50889  S4  
CDD cd00165  S4  
Amino Acid Sequences MPYRPYTTRNVFNHKRAIPRMSWSPENLFNIWQRSSPESPIRREHDFTRTNATPFQLRWIAKRLLRGYHGDHIGYTKFARWYMPEKLPAIHEGGKNDVGEMGKWIEGRERAGGRTRDEKKAKSKAKDSRAPVGTMLFADIERRLDVLIFRSCFAQNVWEARRYVVQGHVKLNGQVMRNPNIMLNPGDVFTVNPSQIVMLQAPKSKFQPPAEEEVEGEASEEKPSEPTGPAASSYFKLPDYASPHLFVPAYLLPSYLTCSAVYVRHPTARPNYSEIPSPYDAGGELMSLGWEWFKRSAPRMRNKTKKWPNPFGGFGKQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.74
3 0.7
4 0.69
5 0.61
6 0.6
7 0.62
8 0.59
9 0.57
10 0.53
11 0.51
12 0.51
13 0.52
14 0.46
15 0.42
16 0.4
17 0.4
18 0.37
19 0.35
20 0.32
21 0.34
22 0.36
23 0.38
24 0.43
25 0.45
26 0.49
27 0.55
28 0.57
29 0.56
30 0.57
31 0.55
32 0.55
33 0.53
34 0.5
35 0.5
36 0.48
37 0.45
38 0.43
39 0.41
40 0.36
41 0.31
42 0.35
43 0.33
44 0.32
45 0.33
46 0.37
47 0.42
48 0.4
49 0.48
50 0.45
51 0.42
52 0.45
53 0.45
54 0.44
55 0.44
56 0.44
57 0.36
58 0.32
59 0.3
60 0.27
61 0.24
62 0.2
63 0.16
64 0.16
65 0.16
66 0.17
67 0.18
68 0.23
69 0.29
70 0.33
71 0.34
72 0.34
73 0.35
74 0.35
75 0.33
76 0.31
77 0.29
78 0.26
79 0.23
80 0.25
81 0.25
82 0.23
83 0.22
84 0.19
85 0.14
86 0.13
87 0.13
88 0.11
89 0.1
90 0.1
91 0.11
92 0.12
93 0.13
94 0.14
95 0.17
96 0.18
97 0.19
98 0.26
99 0.28
100 0.29
101 0.37
102 0.4
103 0.45
104 0.49
105 0.53
106 0.55
107 0.62
108 0.67
109 0.64
110 0.69
111 0.69
112 0.73
113 0.74
114 0.69
115 0.68
116 0.62
117 0.56
118 0.47
119 0.39
120 0.3
121 0.22
122 0.18
123 0.09
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.09
134 0.12
135 0.12
136 0.12
137 0.14
138 0.14
139 0.15
140 0.14
141 0.13
142 0.11
143 0.16
144 0.17
145 0.19
146 0.19
147 0.19
148 0.2
149 0.19
150 0.18
151 0.2
152 0.23
153 0.23
154 0.24
155 0.26
156 0.25
157 0.25
158 0.26
159 0.23
160 0.19
161 0.2
162 0.21
163 0.23
164 0.23
165 0.23
166 0.2
167 0.17
168 0.18
169 0.15
170 0.13
171 0.1
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.09
177 0.1
178 0.09
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.1
184 0.08
185 0.09
186 0.12
187 0.16
188 0.17
189 0.19
190 0.21
191 0.24
192 0.3
193 0.3
194 0.36
195 0.34
196 0.41
197 0.4
198 0.38
199 0.34
200 0.3
201 0.28
202 0.19
203 0.16
204 0.1
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.08
211 0.1
212 0.1
213 0.11
214 0.13
215 0.13
216 0.14
217 0.14
218 0.15
219 0.14
220 0.15
221 0.15
222 0.13
223 0.14
224 0.14
225 0.18
226 0.22
227 0.26
228 0.26
229 0.26
230 0.26
231 0.27
232 0.26
233 0.2
234 0.18
235 0.15
236 0.16
237 0.14
238 0.14
239 0.13
240 0.13
241 0.17
242 0.14
243 0.13
244 0.11
245 0.12
246 0.14
247 0.15
248 0.18
249 0.21
250 0.23
251 0.28
252 0.29
253 0.34
254 0.41
255 0.45
256 0.45
257 0.46
258 0.48
259 0.44
260 0.5
261 0.46
262 0.44
263 0.4
264 0.38
265 0.31
266 0.26
267 0.24
268 0.18
269 0.16
270 0.09
271 0.08
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.07
278 0.1
279 0.13
280 0.18
281 0.24
282 0.32
283 0.42
284 0.5
285 0.6
286 0.69
287 0.77
288 0.83
289 0.86
290 0.89
291 0.91
292 0.91
293 0.91
294 0.9
295 0.88
296 0.85
297 0.83