FuNGI

A0A0F9XC39

Protein Details

Accession

A0A0F9XC39

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
460-487	ALATPKSTKKEKKGKKEDAKKKKDADVA	Basic
491-515	NTTDVKSSKTDRKGKRKHTTSEDDA	Hydrophilic
586-611	VTPSTAKKSTKKTKPETPVPAPRQTA	Hydrophilic
633-656	LATPVQSKSKKSKKSKDEVTATGS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
465-482	KSTKKEKKGKKEDAKKKK
503-505	KGK

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013240 DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34
Gene Ontology	GO:0006360 P:transcription by RNA polymerase I
Pfam	View protein in Pfam PF08208 RNA_polI_A34

Amino Acid Sequences

MAPKEPFKIHSLSKHVEDTKKGLSASAQYNRRPVSKPAAAIIKNEPGVALFPNNNDSDESSESSDSDSDSDEGNSADFLKKIGANGAKPLTTPKRRSRDEEIADSDVERNASAKRNAAAKKEQLVKKEPSSSESSSESSSESESEQSEPKKTNGAGAKQAAAVQESSSSSSEEESEEEEESSDEEEEAPKPTPKPISKAPAAPAATNGTPKTPAKAVPAKASTSSSSSEEESSEEESSEDEEEVPEQPEASKKPAEESSSDSEDSDAEVDDSMHISAREMNNQVGTPNFIAPDFALRKGDDGANGQDVARICNEANLQGKQFWYFTVPSNIPISVIENIEIPMDRSQIGNRVFSHDGQDYGVSFDTIATKSSIQILIPSASDSKYQSTRKQIDQTMHIKRIANLGGAAASSVSPAPRRAARPQPKGLRARYQPFGVNTPMGNIGADADDEDVDMAEAPAALATPKSTKKEKKGKKEDAKKKKDADVAAESNTTDVKSSKTDRKGKRKHTTSEDDAITAEQQLRDENQSAETKSKKQKTARVSSPDLGAELPSAAKKQTPIAPPAIPSSAFPSSATAISTPSKAVAVTPSTAKKSTKKTKPETPVPAPRQTAVPLPNIPLTSRPKESPVPLPLLATPVQSKSKKSKKSKDEVTATGSSQQSPPPSAQGGDKKKSTIKAKGSS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.6
3	0.6
4	0.58
5	0.55
6	0.51
7	0.5
8	0.45
9	0.38
10	0.34
11	0.35
12	0.39
13	0.43
14	0.45
15	0.45
16	0.52
17	0.55
18	0.57
19	0.55
20	0.52
21	0.53
22	0.51
23	0.5
24	0.49
25	0.55
26	0.51
27	0.51
28	0.5
29	0.47
30	0.41
31	0.39
32	0.32
33	0.23
34	0.23
35	0.22
36	0.21
37	0.16
38	0.17
39	0.21
40	0.22
41	0.23
42	0.23
43	0.22
44	0.23
45	0.24
46	0.25
47	0.23
48	0.23
49	0.22
50	0.22
51	0.21
52	0.17
53	0.14
54	0.13
55	0.11
56	0.12
57	0.12
58	0.11
59	0.11
60	0.11
61	0.1
62	0.1
63	0.11
64	0.1
65	0.1
66	0.12
67	0.13
68	0.14
69	0.21
70	0.24
71	0.23
72	0.3
73	0.32
74	0.3
75	0.29
76	0.37
77	0.4
78	0.45
79	0.52
80	0.56
81	0.64
82	0.69
83	0.76
84	0.76
85	0.77
86	0.74
87	0.73
88	0.68
89	0.6
90	0.55
91	0.49
92	0.41
93	0.31
94	0.25
95	0.17
96	0.13
97	0.13
98	0.19
99	0.21
100	0.23
101	0.25
102	0.33
103	0.38
104	0.43
105	0.47
106	0.46
107	0.52
108	0.58
109	0.59
110	0.57
111	0.6
112	0.59
113	0.57
114	0.6
115	0.53
116	0.48
117	0.51
118	0.47
119	0.43
120	0.4
121	0.36
122	0.29
123	0.28
124	0.25
125	0.19
126	0.18
127	0.15
128	0.13
129	0.13
130	0.13
131	0.15
132	0.19
133	0.2
134	0.24
135	0.25
136	0.25
137	0.3
138	0.28
139	0.33
140	0.35
141	0.37
142	0.39
143	0.39
144	0.39
145	0.34
146	0.35
147	0.28
148	0.23
149	0.18
150	0.12
151	0.12
152	0.11
153	0.13
154	0.12
155	0.12
156	0.11
157	0.11
158	0.12
159	0.11
160	0.11
161	0.11
162	0.11
163	0.11
164	0.11
165	0.11
166	0.1
167	0.1
168	0.1
169	0.08
170	0.07
171	0.07
172	0.08
173	0.09
174	0.11
175	0.12
176	0.14
177	0.15
178	0.19
179	0.27
180	0.29
181	0.34
182	0.39
183	0.44
184	0.45
185	0.49
186	0.47
187	0.47
188	0.45
189	0.39
190	0.34
191	0.3
192	0.27
193	0.26
194	0.24
195	0.17
196	0.2
197	0.2
198	0.21
199	0.19
200	0.2
201	0.25
202	0.32
203	0.33
204	0.36
205	0.38
206	0.37
207	0.36
208	0.36
209	0.3
210	0.26
211	0.25
212	0.2
213	0.19
214	0.19
215	0.18
216	0.16
217	0.16
218	0.15
219	0.15
220	0.13
221	0.12
222	0.1
223	0.1
224	0.1
225	0.1
226	0.09
227	0.07
228	0.06
229	0.07
230	0.08
231	0.09
232	0.08
233	0.07
234	0.08
235	0.11
236	0.13
237	0.15
238	0.16
239	0.15
240	0.19
241	0.22
242	0.24
243	0.22
244	0.25
245	0.27
246	0.28
247	0.28
248	0.25
249	0.22
250	0.2
251	0.18
252	0.13
253	0.08
254	0.05
255	0.05
256	0.05
257	0.05
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.05
263	0.09
264	0.1
265	0.13
266	0.14
267	0.15
268	0.15
269	0.15
270	0.15
271	0.12
272	0.13
273	0.1
274	0.09
275	0.09
276	0.08
277	0.08
278	0.07
279	0.13
280	0.13
281	0.13
282	0.14
283	0.14
284	0.15
285	0.16
286	0.17
287	0.11
288	0.12
289	0.12
290	0.12
291	0.12
292	0.11
293	0.12
294	0.11
295	0.11
296	0.1
297	0.09
298	0.08
299	0.1
300	0.1
301	0.11
302	0.14
303	0.15
304	0.15
305	0.15
306	0.16
307	0.14
308	0.14
309	0.12
310	0.11
311	0.11
312	0.12
313	0.16
314	0.16
315	0.17
316	0.18
317	0.17
318	0.15
319	0.14
320	0.14
321	0.1
322	0.1
323	0.09
324	0.08
325	0.08
326	0.08
327	0.08
328	0.07
329	0.06
330	0.07
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.14
335	0.15
336	0.17
337	0.16
338	0.21
339	0.22
340	0.22
341	0.25
342	0.19
343	0.18
344	0.15
345	0.15
346	0.11
347	0.1
348	0.1
349	0.06
350	0.06
351	0.06
352	0.07
353	0.07
354	0.08
355	0.07
356	0.08
357	0.08
358	0.1
359	0.1
360	0.08
361	0.09
362	0.09
363	0.09
364	0.09
365	0.09
366	0.09
367	0.09
368	0.1
369	0.1
370	0.12
371	0.18
372	0.22
373	0.26
374	0.35
375	0.38
376	0.42
377	0.47
378	0.48
379	0.45
380	0.48
381	0.52
382	0.5
383	0.48
384	0.46
385	0.41
386	0.38
387	0.39
388	0.32
389	0.24
390	0.17
391	0.14
392	0.11
393	0.1
394	0.09
395	0.05
396	0.04
397	0.04
398	0.04
399	0.05
400	0.06
401	0.07
402	0.1
403	0.14
404	0.18
405	0.25
406	0.35
407	0.45
408	0.52
409	0.6
410	0.66
411	0.7
412	0.74
413	0.71
414	0.69
415	0.66
416	0.64
417	0.58
418	0.52
419	0.47
420	0.42
421	0.4
422	0.33
423	0.27
424	0.22
425	0.2
426	0.18
427	0.15
428	0.13
429	0.09
430	0.08
431	0.06
432	0.06
433	0.05
434	0.05
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.04
439	0.04
440	0.04
441	0.03
442	0.03
443	0.03
444	0.03
445	0.03
446	0.03
447	0.03
448	0.03
449	0.04
450	0.09
451	0.13
452	0.18
453	0.27
454	0.35
455	0.45
456	0.56
457	0.65
458	0.71
459	0.79
460	0.85
461	0.88
462	0.91
463	0.92
464	0.93
465	0.93
466	0.9
467	0.84
468	0.8
469	0.75
470	0.66
471	0.62
472	0.58
473	0.51
474	0.44
475	0.39
476	0.32
477	0.26
478	0.24
479	0.18
480	0.11
481	0.09
482	0.09
483	0.14
484	0.2
485	0.28
486	0.37
487	0.47
488	0.57
489	0.67
490	0.76
491	0.82
492	0.87
493	0.87
494	0.85
495	0.85
496	0.83
497	0.79
498	0.75
499	0.65
500	0.55
501	0.47
502	0.39
503	0.3
504	0.22
505	0.18
506	0.11
507	0.11
508	0.11
509	0.13
510	0.15
511	0.17
512	0.16
513	0.18
514	0.21
515	0.23
516	0.27
517	0.29
518	0.35
519	0.43
520	0.5
521	0.55
522	0.59
523	0.65
524	0.69
525	0.76
526	0.76
527	0.74
528	0.73
529	0.66
530	0.62
531	0.54
532	0.45
533	0.34
534	0.26
535	0.18
536	0.12
537	0.11
538	0.09
539	0.1
540	0.1
541	0.11
542	0.12
543	0.17
544	0.23
545	0.27
546	0.3
547	0.34
548	0.35
549	0.36
550	0.38
551	0.35
552	0.28
553	0.24
554	0.26
555	0.23
556	0.22
557	0.2
558	0.19
559	0.19
560	0.19
561	0.19
562	0.14
563	0.15
564	0.16
565	0.16
566	0.14
567	0.13
568	0.13
569	0.12
570	0.13
571	0.14
572	0.15
573	0.16
574	0.21
575	0.25
576	0.29
577	0.33
578	0.37
579	0.4
580	0.48
581	0.57
582	0.61
583	0.67
584	0.72
585	0.78
586	0.84
587	0.86
588	0.85
589	0.84
590	0.86
591	0.82
592	0.81
593	0.73
594	0.64
595	0.57
596	0.49
597	0.46
598	0.39
599	0.38
600	0.32
601	0.33
602	0.35
603	0.33
604	0.32
605	0.32
606	0.37
607	0.37
608	0.4
609	0.39
610	0.42
611	0.46
612	0.5
613	0.51
614	0.49
615	0.49
616	0.44
617	0.44
618	0.39
619	0.37
620	0.34
621	0.28
622	0.25
623	0.23
624	0.32
625	0.33
626	0.38
627	0.45
628	0.55
629	0.62
630	0.71
631	0.77
632	0.78
633	0.86
634	0.9
635	0.9
636	0.88
637	0.82
638	0.78
639	0.71
640	0.62
641	0.58
642	0.48
643	0.4
644	0.34
645	0.33
646	0.3
647	0.29
648	0.29
649	0.27
650	0.28
651	0.28
652	0.34
653	0.41
654	0.46
655	0.51
656	0.52
657	0.53
658	0.57
659	0.64
660	0.64
661	0.64

A0A0F9XC39

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer