Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KBM9

Protein Details
Accession Q5KBM9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
368-393IVTRGAGFRKEKNKKKRGSYVGGEITHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
374-384GFRKEKNKKKR
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 12.5, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
KEGG cne:CNI02020  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08513  LisH  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MPTKPSTELDAAVLAYLVKRGYTKAVKSLEKEAGVKLLPGQEDKLENAWAATDVAAVAATSDEAEDSSSSESESEDSDSDSDSDSDDEKSTKAVDPATVPLPESSSSESGSDSGSDSDSSSSSSGSSSSSSTLKSSGKTSGFLDIEAEVSSDEEVSSDEESEDESESGSESDSSSSSSSSSSSSSSSGSSSSSGSSSSSGSSSSSSSSSSSDSSSSSSKSKSEFKEEQEARPVIGKRKARSPSTSSSSSSSSSSSSSASESLPKSPAVTVVTTKKRKLEDGTETITSTATITPAPKANSSRETSTPASAVGTPVGGKGKRVQGQRFERIKADSVTFHDPGLMDNSFEARERTGANANDYGAKASRDLIVTRGAGFRKEKNKKKRGSYVGGEITLQTHSIKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.09
3 0.1
4 0.08
5 0.08
6 0.09
7 0.11
8 0.19
9 0.27
10 0.3
11 0.37
12 0.45
13 0.49
14 0.52
15 0.58
16 0.55
17 0.52
18 0.5
19 0.43
20 0.39
21 0.34
22 0.3
23 0.26
24 0.24
25 0.22
26 0.22
27 0.23
28 0.22
29 0.23
30 0.25
31 0.24
32 0.2
33 0.19
34 0.17
35 0.16
36 0.13
37 0.11
38 0.09
39 0.07
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.05
44 0.04
45 0.04
46 0.04
47 0.04
48 0.04
49 0.04
50 0.04
51 0.05
52 0.05
53 0.06
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.11
62 0.09
63 0.1
64 0.11
65 0.11
66 0.11
67 0.12
68 0.11
69 0.1
70 0.11
71 0.11
72 0.12
73 0.12
74 0.13
75 0.11
76 0.12
77 0.14
78 0.15
79 0.15
80 0.15
81 0.15
82 0.16
83 0.19
84 0.21
85 0.19
86 0.18
87 0.16
88 0.17
89 0.16
90 0.16
91 0.16
92 0.15
93 0.15
94 0.15
95 0.15
96 0.14
97 0.13
98 0.12
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.1
107 0.09
108 0.08
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.09
114 0.08
115 0.1
116 0.11
117 0.12
118 0.12
119 0.16
120 0.16
121 0.17
122 0.18
123 0.22
124 0.22
125 0.23
126 0.23
127 0.25
128 0.24
129 0.22
130 0.21
131 0.15
132 0.15
133 0.13
134 0.12
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.05
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.08
166 0.08
167 0.09
168 0.08
169 0.09
170 0.1
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.09
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.11
198 0.1
199 0.1
200 0.11
201 0.12
202 0.13
203 0.14
204 0.14
205 0.15
206 0.17
207 0.24
208 0.25
209 0.32
210 0.35
211 0.37
212 0.46
213 0.46
214 0.46
215 0.46
216 0.43
217 0.35
218 0.36
219 0.35
220 0.3
221 0.35
222 0.38
223 0.33
224 0.41
225 0.47
226 0.45
227 0.49
228 0.49
229 0.49
230 0.5
231 0.51
232 0.44
233 0.41
234 0.38
235 0.34
236 0.29
237 0.23
238 0.18
239 0.16
240 0.15
241 0.13
242 0.12
243 0.11
244 0.12
245 0.11
246 0.15
247 0.16
248 0.17
249 0.18
250 0.17
251 0.17
252 0.16
253 0.18
254 0.15
255 0.15
256 0.17
257 0.24
258 0.33
259 0.38
260 0.4
261 0.42
262 0.43
263 0.45
264 0.46
265 0.45
266 0.44
267 0.45
268 0.46
269 0.42
270 0.41
271 0.37
272 0.32
273 0.24
274 0.17
275 0.11
276 0.08
277 0.08
278 0.09
279 0.11
280 0.15
281 0.16
282 0.2
283 0.23
284 0.27
285 0.32
286 0.35
287 0.37
288 0.35
289 0.39
290 0.38
291 0.36
292 0.31
293 0.26
294 0.23
295 0.19
296 0.18
297 0.12
298 0.1
299 0.09
300 0.1
301 0.15
302 0.14
303 0.15
304 0.2
305 0.27
306 0.33
307 0.4
308 0.45
309 0.5
310 0.59
311 0.68
312 0.68
313 0.63
314 0.61
315 0.56
316 0.54
317 0.47
318 0.4
319 0.33
320 0.32
321 0.35
322 0.32
323 0.29
324 0.26
325 0.23
326 0.22
327 0.23
328 0.18
329 0.13
330 0.13
331 0.14
332 0.14
333 0.15
334 0.15
335 0.11
336 0.13
337 0.14
338 0.17
339 0.22
340 0.24
341 0.27
342 0.28
343 0.28
344 0.3
345 0.29
346 0.28
347 0.23
348 0.21
349 0.18
350 0.17
351 0.19
352 0.18
353 0.18
354 0.17
355 0.2
356 0.2
357 0.22
358 0.26
359 0.24
360 0.27
361 0.31
362 0.38
363 0.45
364 0.55
365 0.63
366 0.69
367 0.78
368 0.82
369 0.88
370 0.9
371 0.89
372 0.87
373 0.84
374 0.82
375 0.79
376 0.7
377 0.6
378 0.5
379 0.42
380 0.33
381 0.27
382 0.18
383 0.13