Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KPL9

Protein Details
Accession Q5KPL9    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
470-495PPRSRGQAPPRRRSRSPNRRDGSRDNBasic
578-602PTPSNSTSRSRKGRGKEQERDWENEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
421-448KGAGTPRNNPRGGRGGKRPWDSEMRGKE
458-461RASR
465-489DRDREPPRSRGQAPPRRRSRSPNRR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito 9, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0031499  C:TRAMP complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0043629  P:ncRNA polyadenylation  
GO:0071031  P:nuclear mRNA surveillance of mRNA 3'-end processing  
GO:0071039  P:nuclear polyadenylation-dependent CUT catabolic process  
GO:0071035  P:nuclear polyadenylation-dependent rRNA catabolic process  
GO:0071036  P:nuclear polyadenylation-dependent snoRNA catabolic process  
GO:0071037  P:nuclear polyadenylation-dependent snRNA catabolic process  
GO:0071038  P:nuclear polyadenylation-dependent tRNA catabolic process  
KEGG cne:CNA02330  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MAHYVPTSFKPMRSLVAAAGIQLSPSPSSDHNEGTFETEDGELLLGNIIIDEFPADGDRPPVKGEHFQPPGLFNTSMMPTIVTTDGKLHVELKTKDDKAAISEKGQGEGLMLPQHVLLETSSAVQAAEDGGDDGEEGDHSLGGDDFWEGLHFVDDDIIRGSRRYFNPEPEDNLEVEATFLATADSRKVCQNCKRPGHQASKCPHIICTTCGAMDEHERRDCPLSKVCYGCGRRGHHKSECPDPISRNKRWAGCERCGSREHTDKNCPTLWRIYTYRSDSGRRETIKLKEKAEGWVKEAIGGDAMEDWCYNCARTGHFGDDCPQRRGSLVRLTAPSAFSREIARRGPFFSAPKSFLPNPTHSRWEDDDPSAIPYTSAYDSFAGSNAGRRGREKEKQQMMARDTDFNDEDDWFSGDRNRNIGKGAGTPRNNPRGGRGGKRPWDSEMRGKEWDRDRYDRERASREFFDRDREPPRSRGQAPPRRRSRSPNRRDGSRDNAVQETAPNSAPPKAVYRPAINIRDRAIDSPSVREGERGAKAGSKALVSRALSGQNSSNSTPRGQRSSNSPSALPSLLSRIESPTPSNSTSRSRKGRGKEQERDWENEWRRRGNGGGKVANWGKDLDKETEGLSLKKKTKDDISRGSSGQKYYGGYM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.27
3 0.3
4 0.28
5 0.24
6 0.24
7 0.2
8 0.17
9 0.15
10 0.16
11 0.1
12 0.11
13 0.13
14 0.13
15 0.19
16 0.23
17 0.26
18 0.26
19 0.28
20 0.28
21 0.29
22 0.28
23 0.23
24 0.21
25 0.17
26 0.15
27 0.13
28 0.12
29 0.07
30 0.06
31 0.07
32 0.05
33 0.05
34 0.04
35 0.04
36 0.04
37 0.04
38 0.04
39 0.04
40 0.05
41 0.06
42 0.07
43 0.08
44 0.14
45 0.16
46 0.17
47 0.18
48 0.2
49 0.23
50 0.29
51 0.33
52 0.38
53 0.41
54 0.42
55 0.42
56 0.42
57 0.42
58 0.39
59 0.35
60 0.25
61 0.24
62 0.24
63 0.23
64 0.2
65 0.17
66 0.12
67 0.14
68 0.16
69 0.13
70 0.12
71 0.14
72 0.16
73 0.17
74 0.18
75 0.18
76 0.19
77 0.27
78 0.28
79 0.32
80 0.38
81 0.38
82 0.39
83 0.39
84 0.36
85 0.32
86 0.37
87 0.34
88 0.27
89 0.33
90 0.32
91 0.31
92 0.3
93 0.25
94 0.19
95 0.18
96 0.17
97 0.13
98 0.12
99 0.11
100 0.11
101 0.11
102 0.1
103 0.09
104 0.08
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.08
111 0.07
112 0.07
113 0.06
114 0.05
115 0.04
116 0.05
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.05
124 0.04
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.04
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.06
139 0.05
140 0.08
141 0.08
142 0.09
143 0.1
144 0.11
145 0.11
146 0.11
147 0.14
148 0.19
149 0.21
150 0.29
151 0.32
152 0.39
153 0.46
154 0.49
155 0.52
156 0.48
157 0.48
158 0.39
159 0.36
160 0.28
161 0.21
162 0.17
163 0.12
164 0.08
165 0.05
166 0.05
167 0.04
168 0.05
169 0.05
170 0.09
171 0.1
172 0.11
173 0.17
174 0.2
175 0.28
176 0.37
177 0.46
178 0.53
179 0.6
180 0.65
181 0.69
182 0.74
183 0.77
184 0.74
185 0.73
186 0.67
187 0.67
188 0.65
189 0.56
190 0.49
191 0.42
192 0.37
193 0.3
194 0.29
195 0.22
196 0.18
197 0.19
198 0.18
199 0.15
200 0.21
201 0.24
202 0.24
203 0.25
204 0.25
205 0.26
206 0.31
207 0.32
208 0.29
209 0.32
210 0.32
211 0.34
212 0.35
213 0.36
214 0.4
215 0.39
216 0.41
217 0.41
218 0.42
219 0.47
220 0.52
221 0.58
222 0.55
223 0.6
224 0.58
225 0.59
226 0.59
227 0.53
228 0.5
229 0.47
230 0.51
231 0.52
232 0.51
233 0.5
234 0.49
235 0.5
236 0.52
237 0.57
238 0.53
239 0.51
240 0.57
241 0.52
242 0.51
243 0.49
244 0.48
245 0.44
246 0.46
247 0.46
248 0.44
249 0.5
250 0.48
251 0.5
252 0.48
253 0.44
254 0.38
255 0.37
256 0.32
257 0.29
258 0.29
259 0.29
260 0.32
261 0.35
262 0.38
263 0.35
264 0.39
265 0.35
266 0.39
267 0.42
268 0.38
269 0.37
270 0.37
271 0.42
272 0.47
273 0.49
274 0.45
275 0.42
276 0.41
277 0.44
278 0.47
279 0.4
280 0.32
281 0.31
282 0.29
283 0.28
284 0.27
285 0.21
286 0.13
287 0.12
288 0.09
289 0.07
290 0.07
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.07
298 0.08
299 0.08
300 0.12
301 0.14
302 0.17
303 0.17
304 0.17
305 0.21
306 0.29
307 0.31
308 0.3
309 0.28
310 0.25
311 0.25
312 0.26
313 0.25
314 0.23
315 0.22
316 0.22
317 0.23
318 0.24
319 0.24
320 0.24
321 0.21
322 0.16
323 0.15
324 0.12
325 0.14
326 0.15
327 0.17
328 0.2
329 0.21
330 0.2
331 0.21
332 0.23
333 0.23
334 0.23
335 0.24
336 0.23
337 0.25
338 0.25
339 0.28
340 0.27
341 0.31
342 0.33
343 0.35
344 0.37
345 0.37
346 0.41
347 0.36
348 0.4
349 0.36
350 0.36
351 0.33
352 0.29
353 0.27
354 0.23
355 0.24
356 0.2
357 0.17
358 0.12
359 0.09
360 0.1
361 0.1
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.1
367 0.1
368 0.09
369 0.08
370 0.11
371 0.14
372 0.16
373 0.16
374 0.18
375 0.24
376 0.3
377 0.37
378 0.41
379 0.47
380 0.52
381 0.59
382 0.61
383 0.62
384 0.57
385 0.56
386 0.5
387 0.44
388 0.37
389 0.33
390 0.29
391 0.23
392 0.22
393 0.16
394 0.15
395 0.12
396 0.13
397 0.09
398 0.09
399 0.14
400 0.18
401 0.19
402 0.23
403 0.24
404 0.23
405 0.24
406 0.25
407 0.21
408 0.23
409 0.28
410 0.31
411 0.32
412 0.37
413 0.44
414 0.5
415 0.5
416 0.44
417 0.42
418 0.44
419 0.47
420 0.48
421 0.49
422 0.51
423 0.57
424 0.61
425 0.58
426 0.53
427 0.55
428 0.53
429 0.52
430 0.49
431 0.45
432 0.47
433 0.46
434 0.49
435 0.49
436 0.53
437 0.5
438 0.5
439 0.53
440 0.54
441 0.61
442 0.6
443 0.58
444 0.57
445 0.54
446 0.55
447 0.53
448 0.5
449 0.48
450 0.43
451 0.45
452 0.41
453 0.43
454 0.44
455 0.47
456 0.47
457 0.47
458 0.52
459 0.53
460 0.53
461 0.57
462 0.61
463 0.64
464 0.7
465 0.75
466 0.79
467 0.78
468 0.79
469 0.8
470 0.8
471 0.81
472 0.81
473 0.82
474 0.77
475 0.77
476 0.8
477 0.77
478 0.74
479 0.7
480 0.64
481 0.56
482 0.52
483 0.45
484 0.37
485 0.32
486 0.25
487 0.19
488 0.16
489 0.14
490 0.14
491 0.16
492 0.16
493 0.16
494 0.2
495 0.21
496 0.27
497 0.3
498 0.32
499 0.37
500 0.45
501 0.51
502 0.49
503 0.48
504 0.45
505 0.45
506 0.44
507 0.38
508 0.33
509 0.3
510 0.28
511 0.29
512 0.3
513 0.26
514 0.25
515 0.24
516 0.23
517 0.24
518 0.26
519 0.24
520 0.22
521 0.24
522 0.24
523 0.27
524 0.26
525 0.21
526 0.19
527 0.2
528 0.25
529 0.22
530 0.24
531 0.24
532 0.27
533 0.25
534 0.26
535 0.28
536 0.26
537 0.29
538 0.28
539 0.3
540 0.27
541 0.3
542 0.35
543 0.37
544 0.4
545 0.38
546 0.39
547 0.43
548 0.5
549 0.54
550 0.5
551 0.45
552 0.4
553 0.41
554 0.39
555 0.31
556 0.23
557 0.21
558 0.2
559 0.21
560 0.19
561 0.2
562 0.23
563 0.24
564 0.26
565 0.27
566 0.3
567 0.32
568 0.33
569 0.33
570 0.39
571 0.46
572 0.53
573 0.57
574 0.6
575 0.66
576 0.72
577 0.78
578 0.8
579 0.82
580 0.82
581 0.82
582 0.85
583 0.81
584 0.78
585 0.71
586 0.71
587 0.69
588 0.67
589 0.65
590 0.59
591 0.57
592 0.54
593 0.57
594 0.54
595 0.54
596 0.55
597 0.53
598 0.48
599 0.55
600 0.55
601 0.51
602 0.43
603 0.37
604 0.3
605 0.31
606 0.34
607 0.31
608 0.28
609 0.27
610 0.26
611 0.31
612 0.31
613 0.29
614 0.31
615 0.36
616 0.41
617 0.48
618 0.5
619 0.5
620 0.58
621 0.65
622 0.68
623 0.69
624 0.7
625 0.68
626 0.67
627 0.68
628 0.62
629 0.53
630 0.47
631 0.4