Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KNN4

Protein Details
Accession Q5KNN4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
278-303HGITPPMKHVRKRRFRKRMSRLAIEVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
80-109RGRGRGRGRGRGRGSRGGRGSRGARGGMRA
285-296KHVRKRRFRKRM
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11.5, cyto 8.5, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037817  TAF7  
IPR006751  TAFII55_prot_cons_reg  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04658  TAFII55_N  
CDD cd08047  TAF7  
Amino Acid Sequences MDPHQIPTPNTADPGHSSITFSSEPYPPEHTPTFTVPAAPPASFASADAGPSPRISAEQIGAELSGYSYQNTGDANGLARGRGRGRGRGRGRGSRGGRGSRGARGGMRASTRLSERNASGSGGVAKLKLSFKSGGVTEASGGRMSSFLGEYDRELDENPEEPLCFEEQFILRVPKDVAEGKNGVTGLRDMVKGKGKGLDGVEFKFLDPRRAAFKVNNMTYAAKLVDLPNIIEAQKTFDSRHLFKIADISQMLIVENPVADEASITEKPLKIDEYIWPHGITPPMKHVRKRRFRKRMSRLAIEVVEESVEDLLKKDDEAEDTAFDLIEVHQDPDIDDQYYIDYDPNGTWQNYNQGDMGSEYGGSEMYDDPGSVAPSQMEDWGEGGTDWGTEMGDEGEGDYERGEEDDGDDGTLDQELAAALMEGTGGSEFTGISEDDGATSGSEDDDDDDEGDKSEYDEETLEKRAKIKQFTSEIKALEAVIDKKRAGFTGGNPIMVKRFEETIAGLQADVTAKIGARQALVDELGKAEEGATVEAANQKEKAAEVTAVGEGAEHRDVKESTVTTETPMDVDLDEGGDGYSEAPTPVAVKDGEQASSPHYSDGDDLFGDDDDDENAEAVQVHHGEGGVVEQGDDEEDEMARLLRAELDGLDPNAVDETPDMPEDQAQVDAAASAALDSFAMSDAFGQFPAQEDSGSLGGFDFTDGMEQITVPGFVEGGVGRRRLAMGAEAGDIEDESSEDSDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.29
3 0.25
4 0.25
5 0.23
6 0.27
7 0.25
8 0.22
9 0.22
10 0.22
11 0.24
12 0.26
13 0.32
14 0.29
15 0.35
16 0.36
17 0.35
18 0.36
19 0.38
20 0.4
21 0.33
22 0.35
23 0.29
24 0.33
25 0.33
26 0.28
27 0.25
28 0.22
29 0.25
30 0.21
31 0.21
32 0.18
33 0.16
34 0.16
35 0.17
36 0.17
37 0.16
38 0.16
39 0.16
40 0.13
41 0.14
42 0.15
43 0.16
44 0.16
45 0.17
46 0.17
47 0.16
48 0.16
49 0.14
50 0.12
51 0.1
52 0.1
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.1
57 0.11
58 0.11
59 0.12
60 0.11
61 0.11
62 0.12
63 0.15
64 0.15
65 0.15
66 0.16
67 0.19
68 0.2
69 0.27
70 0.3
71 0.36
72 0.43
73 0.52
74 0.58
75 0.64
76 0.69
77 0.71
78 0.73
79 0.74
80 0.71
81 0.7
82 0.7
83 0.66
84 0.61
85 0.59
86 0.55
87 0.51
88 0.5
89 0.43
90 0.37
91 0.35
92 0.35
93 0.33
94 0.33
95 0.29
96 0.28
97 0.28
98 0.3
99 0.31
100 0.32
101 0.32
102 0.3
103 0.32
104 0.31
105 0.28
106 0.25
107 0.22
108 0.2
109 0.17
110 0.16
111 0.13
112 0.12
113 0.16
114 0.18
115 0.17
116 0.19
117 0.19
118 0.2
119 0.23
120 0.23
121 0.21
122 0.2
123 0.19
124 0.16
125 0.16
126 0.16
127 0.13
128 0.12
129 0.1
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.07
135 0.09
136 0.1
137 0.1
138 0.13
139 0.14
140 0.13
141 0.13
142 0.14
143 0.14
144 0.15
145 0.15
146 0.13
147 0.12
148 0.12
149 0.14
150 0.13
151 0.12
152 0.11
153 0.13
154 0.13
155 0.15
156 0.18
157 0.2
158 0.18
159 0.2
160 0.21
161 0.18
162 0.21
163 0.25
164 0.23
165 0.23
166 0.24
167 0.23
168 0.25
169 0.24
170 0.2
171 0.16
172 0.15
173 0.12
174 0.13
175 0.14
176 0.13
177 0.17
178 0.24
179 0.24
180 0.25
181 0.28
182 0.26
183 0.28
184 0.28
185 0.3
186 0.25
187 0.26
188 0.27
189 0.23
190 0.22
191 0.25
192 0.24
193 0.24
194 0.23
195 0.23
196 0.27
197 0.29
198 0.32
199 0.28
200 0.36
201 0.4
202 0.4
203 0.4
204 0.36
205 0.35
206 0.32
207 0.31
208 0.22
209 0.13
210 0.13
211 0.12
212 0.12
213 0.11
214 0.11
215 0.11
216 0.12
217 0.11
218 0.11
219 0.1
220 0.12
221 0.14
222 0.15
223 0.15
224 0.19
225 0.25
226 0.27
227 0.32
228 0.3
229 0.28
230 0.27
231 0.33
232 0.29
233 0.26
234 0.24
235 0.2
236 0.17
237 0.17
238 0.17
239 0.1
240 0.09
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.03
247 0.03
248 0.04
249 0.09
250 0.09
251 0.1
252 0.12
253 0.13
254 0.14
255 0.15
256 0.16
257 0.12
258 0.14
259 0.18
260 0.23
261 0.25
262 0.26
263 0.25
264 0.24
265 0.24
266 0.27
267 0.23
268 0.17
269 0.23
270 0.31
271 0.35
272 0.41
273 0.5
274 0.56
275 0.66
276 0.76
277 0.78
278 0.8
279 0.86
280 0.91
281 0.92
282 0.92
283 0.88
284 0.83
285 0.74
286 0.67
287 0.57
288 0.47
289 0.37
290 0.26
291 0.18
292 0.12
293 0.1
294 0.06
295 0.05
296 0.04
297 0.04
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.06
302 0.06
303 0.08
304 0.1
305 0.1
306 0.09
307 0.1
308 0.1
309 0.09
310 0.08
311 0.07
312 0.05
313 0.06
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.09
320 0.1
321 0.09
322 0.08
323 0.07
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.06
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.08
332 0.09
333 0.09
334 0.1
335 0.1
336 0.18
337 0.17
338 0.19
339 0.16
340 0.14
341 0.14
342 0.14
343 0.14
344 0.07
345 0.06
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.04
350 0.05
351 0.04
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.06
357 0.07
358 0.06
359 0.06
360 0.05
361 0.06
362 0.06
363 0.07
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.05
370 0.05
371 0.04
372 0.04
373 0.03
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.03
391 0.04
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.04
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.02
406 0.02
407 0.02
408 0.02
409 0.02
410 0.02
411 0.02
412 0.02
413 0.02
414 0.03
415 0.03
416 0.03
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.04
426 0.05
427 0.05
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.05
432 0.05
433 0.06
434 0.06
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.08
439 0.06
440 0.06
441 0.07
442 0.07
443 0.06
444 0.07
445 0.08
446 0.1
447 0.13
448 0.15
449 0.15
450 0.17
451 0.23
452 0.27
453 0.31
454 0.32
455 0.36
456 0.41
457 0.45
458 0.48
459 0.46
460 0.41
461 0.36
462 0.34
463 0.27
464 0.2
465 0.18
466 0.17
467 0.16
468 0.18
469 0.17
470 0.18
471 0.19
472 0.18
473 0.19
474 0.17
475 0.16
476 0.25
477 0.26
478 0.27
479 0.26
480 0.26
481 0.25
482 0.23
483 0.22
484 0.12
485 0.13
486 0.11
487 0.12
488 0.13
489 0.13
490 0.14
491 0.13
492 0.12
493 0.1
494 0.11
495 0.1
496 0.09
497 0.07
498 0.06
499 0.06
500 0.07
501 0.09
502 0.09
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.09
507 0.1
508 0.09
509 0.08
510 0.08
511 0.08
512 0.07
513 0.07
514 0.06
515 0.06
516 0.06
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.07
521 0.11
522 0.11
523 0.12
524 0.12
525 0.12
526 0.12
527 0.12
528 0.13
529 0.1
530 0.1
531 0.09
532 0.11
533 0.1
534 0.1
535 0.09
536 0.08
537 0.06
538 0.08
539 0.1
540 0.09
541 0.09
542 0.13
543 0.13
544 0.15
545 0.19
546 0.17
547 0.17
548 0.2
549 0.2
550 0.18
551 0.2
552 0.18
553 0.15
554 0.14
555 0.12
556 0.09
557 0.09
558 0.07
559 0.06
560 0.06
561 0.06
562 0.05
563 0.04
564 0.04
565 0.04
566 0.05
567 0.05
568 0.05
569 0.05
570 0.05
571 0.06
572 0.06
573 0.08
574 0.08
575 0.08
576 0.13
577 0.14
578 0.15
579 0.15
580 0.15
581 0.16
582 0.2
583 0.19
584 0.16
585 0.15
586 0.15
587 0.16
588 0.16
589 0.14
590 0.11
591 0.1
592 0.1
593 0.1
594 0.1
595 0.08
596 0.08
597 0.06
598 0.07
599 0.07
600 0.06
601 0.06
602 0.06
603 0.06
604 0.06
605 0.08
606 0.08
607 0.08
608 0.09
609 0.09
610 0.08
611 0.08
612 0.08
613 0.07
614 0.06
615 0.06
616 0.06
617 0.06
618 0.06
619 0.07
620 0.06
621 0.05
622 0.05
623 0.06
624 0.06
625 0.07
626 0.06
627 0.06
628 0.06
629 0.07
630 0.07
631 0.08
632 0.08
633 0.1
634 0.13
635 0.13
636 0.13
637 0.12
638 0.12
639 0.12
640 0.11
641 0.09
642 0.07
643 0.08
644 0.1
645 0.1
646 0.11
647 0.1
648 0.12
649 0.13
650 0.13
651 0.12
652 0.1
653 0.1
654 0.09
655 0.08
656 0.07
657 0.06
658 0.04
659 0.04
660 0.04
661 0.04
662 0.03
663 0.03
664 0.04
665 0.05
666 0.05
667 0.05
668 0.06
669 0.08
670 0.08
671 0.09
672 0.08
673 0.08
674 0.1
675 0.14
676 0.13
677 0.12
678 0.12
679 0.15
680 0.15
681 0.15
682 0.12
683 0.09
684 0.09
685 0.09
686 0.09
687 0.06
688 0.05
689 0.07
690 0.07
691 0.08
692 0.07
693 0.07
694 0.08
695 0.09
696 0.09
697 0.08
698 0.08
699 0.07
700 0.06
701 0.08
702 0.08
703 0.13
704 0.17
705 0.17
706 0.18
707 0.19
708 0.2
709 0.19
710 0.2
711 0.17
712 0.16
713 0.17
714 0.18
715 0.17
716 0.16
717 0.15
718 0.14
719 0.11
720 0.08
721 0.06
722 0.07