Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F9XPN3

Protein Details
Accession A0A0F9XPN3    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
79-103KAYQPRDPKKWYKVWEKYKNEHDTAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
196-202KAPSRRP
364-379PRKRKAVDIFMRPKRR
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 7, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MSFLKSLRELAIMACVKNIRDIDNIGFLSYETVREILIKVDNPAQLRQIELNSPQIEGQTAEIWLKFIERDFPLESKTKAYQPRDPKKWYKVWEKYKNEHDTALQESENKLKSALAGLRQDKEKNTSKIVSGKALPSSAKFAIRRYTGPREGSSNALMFGGGSRTKTANGASVMRKVRREVKEIANIHGSLSRPIKAPSRRPIPMKAPAAMINDHKRAAQPAYRPAPKEKVSHLEAALEEFERRATFVSDSEDDDGVNDDYDNSSKSKQPTPKAVVKAAPKAPTSSLQRKFGGFKPSVKPAVITKAPESKPSKVPPKVSSSYLPQTRTTPPMDEENSPQSVEELLADVDARHEAAGASASASAPRKRKAVDIFMRPKRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.23
4 0.28
5 0.29
6 0.23
7 0.24
8 0.27
9 0.26
10 0.3
11 0.3
12 0.25
13 0.23
14 0.2
15 0.21
16 0.18
17 0.16
18 0.11
19 0.11
20 0.11
21 0.12
22 0.13
23 0.12
24 0.16
25 0.16
26 0.18
27 0.23
28 0.26
29 0.27
30 0.29
31 0.3
32 0.26
33 0.27
34 0.27
35 0.24
36 0.25
37 0.25
38 0.3
39 0.27
40 0.27
41 0.26
42 0.23
43 0.21
44 0.18
45 0.17
46 0.11
47 0.11
48 0.12
49 0.11
50 0.12
51 0.11
52 0.11
53 0.1
54 0.1
55 0.15
56 0.14
57 0.18
58 0.21
59 0.22
60 0.25
61 0.28
62 0.29
63 0.28
64 0.3
65 0.34
66 0.39
67 0.44
68 0.49
69 0.56
70 0.66
71 0.7
72 0.75
73 0.77
74 0.77
75 0.8
76 0.79
77 0.79
78 0.79
79 0.81
80 0.83
81 0.83
82 0.82
83 0.83
84 0.82
85 0.73
86 0.64
87 0.55
88 0.47
89 0.43
90 0.37
91 0.28
92 0.22
93 0.22
94 0.26
95 0.25
96 0.22
97 0.18
98 0.16
99 0.16
100 0.19
101 0.2
102 0.2
103 0.25
104 0.28
105 0.31
106 0.35
107 0.37
108 0.34
109 0.38
110 0.41
111 0.37
112 0.39
113 0.37
114 0.37
115 0.41
116 0.41
117 0.37
118 0.31
119 0.3
120 0.26
121 0.26
122 0.24
123 0.18
124 0.21
125 0.19
126 0.23
127 0.22
128 0.23
129 0.27
130 0.28
131 0.31
132 0.33
133 0.39
134 0.4
135 0.41
136 0.4
137 0.39
138 0.38
139 0.37
140 0.32
141 0.24
142 0.18
143 0.15
144 0.14
145 0.1
146 0.08
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.11
154 0.11
155 0.12
156 0.13
157 0.17
158 0.17
159 0.23
160 0.27
161 0.29
162 0.3
163 0.29
164 0.36
165 0.36
166 0.39
167 0.37
168 0.39
169 0.45
170 0.45
171 0.45
172 0.38
173 0.35
174 0.3
175 0.27
176 0.21
177 0.16
178 0.16
179 0.15
180 0.14
181 0.16
182 0.23
183 0.26
184 0.34
185 0.39
186 0.45
187 0.48
188 0.5
189 0.54
190 0.53
191 0.55
192 0.5
193 0.43
194 0.37
195 0.36
196 0.35
197 0.31
198 0.3
199 0.26
200 0.25
201 0.24
202 0.23
203 0.21
204 0.21
205 0.22
206 0.21
207 0.2
208 0.27
209 0.34
210 0.38
211 0.4
212 0.42
213 0.46
214 0.46
215 0.45
216 0.4
217 0.39
218 0.38
219 0.38
220 0.34
221 0.29
222 0.25
223 0.23
224 0.2
225 0.14
226 0.11
227 0.08
228 0.09
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.14
236 0.14
237 0.16
238 0.18
239 0.17
240 0.15
241 0.14
242 0.15
243 0.11
244 0.1
245 0.08
246 0.06
247 0.07
248 0.08
249 0.09
250 0.09
251 0.11
252 0.15
253 0.19
254 0.27
255 0.33
256 0.39
257 0.47
258 0.53
259 0.59
260 0.6
261 0.6
262 0.58
263 0.56
264 0.58
265 0.53
266 0.5
267 0.43
268 0.41
269 0.39
270 0.4
271 0.42
272 0.45
273 0.46
274 0.47
275 0.48
276 0.49
277 0.51
278 0.5
279 0.5
280 0.43
281 0.44
282 0.44
283 0.49
284 0.5
285 0.46
286 0.42
287 0.37
288 0.42
289 0.38
290 0.36
291 0.33
292 0.39
293 0.4
294 0.47
295 0.49
296 0.46
297 0.5
298 0.56
299 0.62
300 0.6
301 0.66
302 0.63
303 0.66
304 0.64
305 0.61
306 0.56
307 0.53
308 0.56
309 0.55
310 0.52
311 0.46
312 0.46
313 0.47
314 0.48
315 0.43
316 0.37
317 0.34
318 0.39
319 0.4
320 0.39
321 0.39
322 0.39
323 0.38
324 0.34
325 0.32
326 0.24
327 0.21
328 0.18
329 0.14
330 0.1
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.08
338 0.06
339 0.07
340 0.06
341 0.07
342 0.08
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.08
347 0.13
348 0.18
349 0.24
350 0.29
351 0.34
352 0.38
353 0.4
354 0.48
355 0.51
356 0.58
357 0.6
358 0.65
359 0.71