FuNGI

Q5KL58

Protein Details

Accession

Q5KL58

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-28	MSDATLFLRKNKDKQRRRNVSGASRIAS	Hydrophilic
172-195	GQAPGGGRKKRVKRGTKEVFHQDI	Basic
665-691	VSTPSADAPPRPKKHKKTGSLTPAPAP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
177-186	GGRKKRVKRG
441-448	KLRKIMRR
479-533	EKEKEKDKEKEKAKEKDSSRNPSQPPSRPSSRPPTARTSSPSGSNPRYPSPKKGK
673-681	PPRPKKHKK

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 11, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005674 C:transcription factor TFIIF complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0016251 F:RNA polymerase II general transcription initiation factor activity GO:0001096 F:TFIIF-class transcription factor complex binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	cne:CNC00680 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSDATLFLRKNKDKQRRRNVSGASRIASTSNSSLASRPGASKGQPVAGPSSSGAPSSAAPSPSSVSIKPEPDSSNNPNITEIKIFSTGSNSALRYNLMRLNSVKDVDPTQITAPVLMNRKKPGPKDPPTFALDENGKIVGRYVYDEEGKPILDEEGQPVVERKEVVDMSLVGQAPGGGRKKRVKRGTKEVFHQDIEIMRLRREEALPWVLESGNPQDKPAQPEQWVGRMLEQGQLSTVLLSNDGTRDGFEMMPLGRSYKFEPARPFKPLDSDAANKLFELQAKNKIHDRWAFRPADNQSGEASSASTPIQVKAEPNELEQRASRMETRIKMHKGVTVDRKAKVERYEDDYQREGHRVERGMEGGVDEELDFDEAEEFQDDDDNNTFYRDAQEEEEARELEERLKKEFRVANANVGDRPQIDAEDDEDDLFGDKSLDDEGKKLRKIMRRRMRENGEDYDIDDDSDSDSDDESTTSTQNKEKEKEKDKEKEKAKEKDSSRNPSQPPSRPSSRPPTARTSSPSGSNPRYPSPKKGKASTAPPPVSGASLIAQRATSRGASPRPSTHGGHVAGRASSPLGRVPSPAEGRGPGVTGQSQPASRATSPAVRESSPASGGAAATGGASPASGGPSTRDVSPAPPAGRPSPRKENAAVSTSSSSAKRKSSPSVSTPSADAPPRPKKHKKTGSLTPAPAPEDIPPFSGMITKQDVLGWFQRNKKKAVPMNEAIGAFRKRIVDAGPNRDANQKLFLGWIRMVADQENGNLSLKPEFRQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.82
2	0.88
3	0.89
4	0.89
5	0.89
6	0.88
7	0.87
8	0.86
9	0.81
10	0.72
11	0.62
12	0.56
13	0.47
14	0.39
15	0.33
16	0.25
17	0.21
18	0.2
19	0.2
20	0.2
21	0.22
22	0.24
23	0.22
24	0.22
25	0.24
26	0.27
27	0.28
28	0.33
29	0.33
30	0.35
31	0.34
32	0.34
33	0.34
34	0.3
35	0.3
36	0.24
37	0.25
38	0.21
39	0.2
40	0.18
41	0.15
42	0.15
43	0.17
44	0.2
45	0.17
46	0.17
47	0.18
48	0.2
49	0.23
50	0.26
51	0.23
52	0.26
53	0.3
54	0.33
55	0.33
56	0.37
57	0.37
58	0.39
59	0.46
60	0.46
61	0.5
62	0.49
63	0.48
64	0.46
65	0.43
66	0.41
67	0.35
68	0.3
69	0.24
70	0.24
71	0.24
72	0.21
73	0.23
74	0.22
75	0.22
76	0.24
77	0.21
78	0.21
79	0.21
80	0.22
81	0.2
82	0.22
83	0.24
84	0.21
85	0.24
86	0.25
87	0.29
88	0.31
89	0.31
90	0.29
91	0.27
92	0.27
93	0.26
94	0.26
95	0.22
96	0.2
97	0.21
98	0.2
99	0.19
100	0.19
101	0.22
102	0.29
103	0.32
104	0.35
105	0.37
106	0.45
107	0.5
108	0.53
109	0.58
110	0.61
111	0.66
112	0.69
113	0.7
114	0.67
115	0.64
116	0.61
117	0.51
118	0.47
119	0.39
120	0.32
121	0.28
122	0.24
123	0.21
124	0.18
125	0.18
126	0.13
127	0.11
128	0.13
129	0.14
130	0.16
131	0.19
132	0.2
133	0.21
134	0.21
135	0.21
136	0.18
137	0.16
138	0.13
139	0.12
140	0.12
141	0.12
142	0.14
143	0.14
144	0.14
145	0.15
146	0.15
147	0.15
148	0.15
149	0.12
150	0.15
151	0.15
152	0.15
153	0.15
154	0.15
155	0.15
156	0.19
157	0.18
158	0.12
159	0.12
160	0.12
161	0.11
162	0.17
163	0.21
164	0.19
165	0.26
166	0.36
167	0.45
168	0.55
169	0.65
170	0.69
171	0.72
172	0.81
173	0.85
174	0.83
175	0.81
176	0.8
177	0.75
178	0.65
179	0.57
180	0.47
181	0.38
182	0.34
183	0.32
184	0.24
185	0.2
186	0.2
187	0.21
188	0.22
189	0.21
190	0.2
191	0.19
192	0.22
193	0.22
194	0.21
195	0.21
196	0.18
197	0.17
198	0.18
199	0.19
200	0.21
201	0.21
202	0.22
203	0.26
204	0.29
205	0.35
206	0.38
207	0.36
208	0.31
209	0.37
210	0.39
211	0.38
212	0.37
213	0.31
214	0.28
215	0.25
216	0.24
217	0.22
218	0.2
219	0.15
220	0.14
221	0.14
222	0.12
223	0.1
224	0.1
225	0.06
226	0.07
227	0.07
228	0.07
229	0.07
230	0.08
231	0.07
232	0.07
233	0.08
234	0.09
235	0.08
236	0.08
237	0.09
238	0.08
239	0.1
240	0.1
241	0.11
242	0.1
243	0.12
244	0.14
245	0.21
246	0.24
247	0.27
248	0.36
249	0.42
250	0.45
251	0.47
252	0.48
253	0.4
254	0.42
255	0.39
256	0.33
257	0.31
258	0.3
259	0.29
260	0.29
261	0.28
262	0.22
263	0.22
264	0.19
265	0.18
266	0.19
267	0.19
268	0.26
269	0.28
270	0.3
271	0.34
272	0.35
273	0.37
274	0.39
275	0.43
276	0.39
277	0.46
278	0.47
279	0.42
280	0.47
281	0.44
282	0.46
283	0.39
284	0.35
285	0.27
286	0.25
287	0.25
288	0.18
289	0.16
290	0.08
291	0.09
292	0.08
293	0.09
294	0.09
295	0.09
296	0.1
297	0.1
298	0.11
299	0.12
300	0.18
301	0.16
302	0.18
303	0.23
304	0.23
305	0.23
306	0.22
307	0.22
308	0.18
309	0.19
310	0.18
311	0.16
312	0.2
313	0.23
314	0.27
315	0.33
316	0.34
317	0.36
318	0.35
319	0.34
320	0.32
321	0.35
322	0.39
323	0.4
324	0.41
325	0.41
326	0.43
327	0.41
328	0.42
329	0.4
330	0.36
331	0.3
332	0.33
333	0.39
334	0.38
335	0.4
336	0.37
337	0.35
338	0.32
339	0.32
340	0.25
341	0.2
342	0.21
343	0.19
344	0.19
345	0.18
346	0.17
347	0.15
348	0.15
349	0.12
350	0.09
351	0.08
352	0.06
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.03
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.06
366	0.05
367	0.07
368	0.07
369	0.08
370	0.08
371	0.08
372	0.08
373	0.07
374	0.09
375	0.08
376	0.09
377	0.1
378	0.12
379	0.12
380	0.14
381	0.15
382	0.13
383	0.13
384	0.12
385	0.11
386	0.13
387	0.16
388	0.16
389	0.19
390	0.21
391	0.21
392	0.26
393	0.29
394	0.26
395	0.31
396	0.31
397	0.33
398	0.34
399	0.35
400	0.29
401	0.27
402	0.25
403	0.16
404	0.17
405	0.11
406	0.08
407	0.08
408	0.08
409	0.08
410	0.09
411	0.09
412	0.08
413	0.07
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.05
418	0.04
419	0.04
420	0.04
421	0.06
422	0.07
423	0.06
424	0.08
425	0.14
426	0.2
427	0.21
428	0.24
429	0.29
430	0.36
431	0.45
432	0.55
433	0.59
434	0.63
435	0.69
436	0.75
437	0.75
438	0.73
439	0.69
440	0.62
441	0.55
442	0.45
443	0.4
444	0.32
445	0.25
446	0.19
447	0.14
448	0.1
449	0.07
450	0.07
451	0.07
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.06
456	0.06
457	0.06
458	0.07
459	0.07
460	0.09
461	0.11
462	0.14
463	0.2
464	0.25
465	0.3
466	0.36
467	0.45
468	0.52
469	0.58
470	0.64
471	0.68
472	0.69
473	0.73
474	0.74
475	0.75
476	0.75
477	0.76
478	0.71
479	0.7
480	0.67
481	0.69
482	0.69
483	0.68
484	0.65
485	0.65
486	0.63
487	0.63
488	0.66
489	0.63
490	0.6
491	0.58
492	0.58
493	0.54
494	0.58
495	0.59
496	0.6
497	0.59
498	0.58
499	0.6
500	0.57
501	0.57
502	0.55
503	0.52
504	0.46
505	0.43
506	0.43
507	0.42
508	0.43
509	0.45
510	0.43
511	0.43
512	0.5
513	0.49
514	0.54
515	0.57
516	0.63
517	0.63
518	0.65
519	0.66
520	0.63
521	0.68
522	0.67
523	0.67
524	0.58
525	0.53
526	0.5
527	0.43
528	0.36
529	0.29
530	0.2
531	0.12
532	0.13
533	0.12
534	0.11
535	0.11
536	0.1
537	0.11
538	0.12
539	0.11
540	0.11
541	0.16
542	0.2
543	0.25
544	0.29
545	0.32
546	0.36
547	0.39
548	0.39
549	0.37
550	0.4
551	0.36
552	0.35
553	0.34
554	0.29
555	0.25
556	0.23
557	0.2
558	0.14
559	0.13
560	0.11
561	0.12
562	0.14
563	0.14
564	0.15
565	0.17
566	0.23
567	0.24
568	0.25
569	0.23
570	0.22
571	0.23
572	0.23
573	0.21
574	0.15
575	0.15
576	0.15
577	0.14
578	0.16
579	0.16
580	0.16
581	0.17
582	0.18
583	0.21
584	0.19
585	0.2
586	0.21
587	0.24
588	0.26
589	0.3
590	0.3
591	0.26
592	0.27
593	0.28
594	0.27
595	0.23
596	0.21
597	0.16
598	0.14
599	0.13
600	0.12
601	0.09
602	0.06
603	0.06
604	0.05
605	0.05
606	0.04
607	0.04
608	0.04
609	0.04
610	0.06
611	0.06
612	0.06
613	0.09
614	0.13
615	0.15
616	0.15
617	0.17
618	0.16
619	0.19
620	0.24
621	0.28
622	0.26
623	0.27
624	0.3
625	0.35
626	0.43
627	0.47
628	0.5
629	0.55
630	0.58
631	0.6
632	0.59
633	0.61
634	0.56
635	0.54
636	0.47
637	0.4
638	0.37
639	0.34
640	0.33
641	0.29
642	0.28
643	0.28
644	0.32
645	0.34
646	0.37
647	0.44
648	0.5
649	0.53
650	0.55
651	0.58
652	0.57
653	0.53
654	0.49
655	0.44
656	0.41
657	0.37
658	0.35
659	0.38
660	0.45
661	0.52
662	0.6
663	0.68
664	0.72
665	0.81
666	0.87
667	0.87
668	0.85
669	0.88
670	0.88
671	0.87
672	0.8
673	0.74
674	0.68
675	0.6
676	0.51
677	0.42
678	0.35
679	0.3
680	0.28
681	0.25
682	0.22
683	0.2
684	0.19
685	0.21
686	0.18
687	0.18
688	0.22
689	0.2
690	0.2
691	0.22
692	0.22
693	0.24
694	0.3
695	0.33
696	0.34
697	0.43
698	0.51
699	0.54
700	0.58
701	0.6
702	0.63
703	0.64
704	0.67
705	0.68
706	0.64
707	0.65
708	0.64
709	0.57
710	0.49
711	0.47
712	0.39
713	0.31
714	0.29
715	0.25
716	0.21
717	0.23
718	0.25
719	0.29
720	0.35
721	0.43
722	0.48
723	0.49
724	0.5
725	0.55
726	0.54
727	0.47
728	0.44
729	0.36
730	0.29
731	0.31
732	0.31
733	0.29
734	0.27
735	0.28
736	0.24
737	0.25
738	0.25
739	0.22
740	0.22
741	0.19
742	0.2
743	0.19
744	0.18
745	0.18
746	0.18
747	0.18
748	0.22

Q5KL58

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer