Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F9XL78

Protein Details
Accession A0A0F9XL78    Localization Confidence High Confidence Score 19
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MLRQVKPRNARSKRALEKREPKAVEHydrophilic
51-71SMRQPLSKKFTKKNPIHPFEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-21PRNARSKRALEKREP
315-317AKK
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0004812  F:aminoacyl-tRNA ligase activity  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MLRQVKPRNARSKRALEKREPKAVENPKTCLFLRGNNCSQVVQDAMNDLFSMRQPLSKKFTKKNPIHPFEDAASIEFFSEKNDASLFVFGSTQKKRPHSLTFIRTFSHKVLDMLELYLDNESYRSISQFKTKKFAIGMRPMILFAGSAFESPVPNEYTLAKSFFIDFFKGEPSDKIDVEGLQYIVSVAAEDTTGEGDAKPPIHIRVYVISTKRSGQKLPRVEVEEIGPRMDLRVGRMQEADEAMLKEAMKKPRGVEERTKKNVTMDSMGDKLGRVHLGKQDLSQMQTRKMKGLKRSRDDGIEPEDIIAEEVPKKAKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.86
3 0.85
4 0.88
5 0.86
6 0.87
7 0.79
8 0.73
9 0.72
10 0.73
11 0.73
12 0.67
13 0.64
14 0.58
15 0.59
16 0.55
17 0.51
18 0.44
19 0.42
20 0.45
21 0.48
22 0.49
23 0.49
24 0.49
25 0.43
26 0.41
27 0.35
28 0.29
29 0.2
30 0.16
31 0.15
32 0.14
33 0.13
34 0.13
35 0.1
36 0.1
37 0.09
38 0.13
39 0.11
40 0.15
41 0.18
42 0.24
43 0.32
44 0.39
45 0.47
46 0.52
47 0.62
48 0.68
49 0.74
50 0.79
51 0.83
52 0.81
53 0.78
54 0.72
55 0.65
56 0.55
57 0.51
58 0.4
59 0.3
60 0.24
61 0.19
62 0.16
63 0.13
64 0.11
65 0.09
66 0.1
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.1
71 0.1
72 0.12
73 0.1
74 0.09
75 0.1
76 0.11
77 0.18
78 0.2
79 0.26
80 0.32
81 0.36
82 0.39
83 0.44
84 0.49
85 0.51
86 0.56
87 0.58
88 0.58
89 0.56
90 0.52
91 0.49
92 0.45
93 0.37
94 0.31
95 0.24
96 0.18
97 0.17
98 0.18
99 0.16
100 0.14
101 0.13
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.07
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.07
112 0.09
113 0.11
114 0.19
115 0.25
116 0.27
117 0.32
118 0.32
119 0.33
120 0.33
121 0.38
122 0.36
123 0.38
124 0.38
125 0.34
126 0.34
127 0.31
128 0.28
129 0.23
130 0.16
131 0.07
132 0.07
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.08
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.09
144 0.11
145 0.12
146 0.13
147 0.12
148 0.11
149 0.12
150 0.12
151 0.13
152 0.11
153 0.1
154 0.1
155 0.11
156 0.12
157 0.12
158 0.11
159 0.14
160 0.16
161 0.15
162 0.15
163 0.14
164 0.13
165 0.14
166 0.14
167 0.09
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.04
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.05
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.09
188 0.11
189 0.12
190 0.13
191 0.13
192 0.15
193 0.19
194 0.23
195 0.24
196 0.24
197 0.24
198 0.28
199 0.32
200 0.31
201 0.33
202 0.35
203 0.43
204 0.48
205 0.5
206 0.52
207 0.51
208 0.49
209 0.45
210 0.4
211 0.36
212 0.3
213 0.26
214 0.21
215 0.16
216 0.15
217 0.17
218 0.14
219 0.13
220 0.2
221 0.2
222 0.22
223 0.23
224 0.22
225 0.22
226 0.22
227 0.19
228 0.13
229 0.13
230 0.12
231 0.13
232 0.12
233 0.15
234 0.21
235 0.27
236 0.28
237 0.3
238 0.31
239 0.39
240 0.46
241 0.48
242 0.53
243 0.56
244 0.64
245 0.7
246 0.71
247 0.62
248 0.6
249 0.58
250 0.51
251 0.45
252 0.37
253 0.33
254 0.31
255 0.31
256 0.27
257 0.23
258 0.2
259 0.19
260 0.2
261 0.17
262 0.19
263 0.24
264 0.29
265 0.3
266 0.3
267 0.35
268 0.34
269 0.35
270 0.38
271 0.36
272 0.4
273 0.46
274 0.46
275 0.46
276 0.5
277 0.53
278 0.57
279 0.64
280 0.66
281 0.67
282 0.72
283 0.69
284 0.7
285 0.66
286 0.62
287 0.57
288 0.49
289 0.41
290 0.35
291 0.31
292 0.25
293 0.22
294 0.17
295 0.13
296 0.12
297 0.15