Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F9X4N0

Protein Details
Accession A0A0F9X4N0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
296-318AEPVKAHRNRPKRPRKDDLDDHYBasic
390-419LASWKTNRRANYHRKRRRWARTRQIVDATRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
301-311AHRNRPKRPRK
402-409HRKRRRWA
560-568KFQRKKPKT
Subcellular Location(s) mito 19.5, cyto_mito 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0008168  F:methyltransferase activity  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MSRNTVQPNGWVAIRLPSEVTRVLQVVPNTTISLGKYGSFPSNLIIERPYHLTYEIQDKREGESFPRLRVVPGTELNADKLADVSATESAEGDDVIEPANGEELTLVDESGKVVARSNREVIDESARQTLTMAEIDQLKREGASAGKELIAKLMLSHTAIDQKTAYSLAKYKLLKERKYMRRFTVLPLDVAQLGQWMLVERDASKVMEMRQEMIGLLGCWADVHFGGLPIEGEQSPHGGRWLAVDDTGGLLVAAMAERMGLLHAEAPEEEGTSTDAAQQEQNPELQPNDEAGTAAAEPVKAHRNRPKRPRKDDLDDHYALTNSITLIHANSQPNLSLLRHFDYDFSDPNPPYPYHPLFTNLLPISWLQLLDPEADPTYAEPAPEVDSETLASWKTNRRANYHRKRRRWARTRQIVDATRAGGFSGLAVASTMDPISVLRHALPLLAGGAPVAIYSPTIEPLTQLADCFSISRRGAWVSNPPAEAEGKTTTELENWAGTPDFPINPSLLIGAQVQTSRARRWQVLPGRTHPFMTERGGAVGFVFTGWRAIPAEGNIMARGKFQRKKPKTG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.24
3 0.22
4 0.21
5 0.24
6 0.25
7 0.25
8 0.21
9 0.21
10 0.21
11 0.23
12 0.23
13 0.24
14 0.24
15 0.24
16 0.22
17 0.21
18 0.22
19 0.18
20 0.2
21 0.16
22 0.15
23 0.15
24 0.18
25 0.21
26 0.2
27 0.2
28 0.19
29 0.23
30 0.23
31 0.23
32 0.22
33 0.2
34 0.21
35 0.26
36 0.25
37 0.21
38 0.22
39 0.22
40 0.22
41 0.32
42 0.35
43 0.33
44 0.36
45 0.35
46 0.38
47 0.4
48 0.39
49 0.33
50 0.38
51 0.38
52 0.37
53 0.42
54 0.38
55 0.35
56 0.37
57 0.36
58 0.32
59 0.31
60 0.32
61 0.3
62 0.31
63 0.31
64 0.29
65 0.25
66 0.19
67 0.16
68 0.12
69 0.09
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.09
74 0.09
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.06
81 0.06
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.06
86 0.08
87 0.07
88 0.06
89 0.06
90 0.05
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.06
95 0.07
96 0.07
97 0.09
98 0.1
99 0.08
100 0.12
101 0.16
102 0.21
103 0.25
104 0.28
105 0.28
106 0.29
107 0.31
108 0.29
109 0.32
110 0.29
111 0.27
112 0.28
113 0.26
114 0.24
115 0.22
116 0.2
117 0.15
118 0.13
119 0.12
120 0.1
121 0.15
122 0.16
123 0.17
124 0.17
125 0.16
126 0.15
127 0.15
128 0.14
129 0.11
130 0.13
131 0.13
132 0.14
133 0.15
134 0.16
135 0.15
136 0.15
137 0.14
138 0.11
139 0.09
140 0.1
141 0.09
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.15
146 0.15
147 0.16
148 0.15
149 0.14
150 0.15
151 0.16
152 0.15
153 0.11
154 0.15
155 0.16
156 0.23
157 0.24
158 0.28
159 0.36
160 0.45
161 0.46
162 0.51
163 0.59
164 0.63
165 0.71
166 0.72
167 0.67
168 0.67
169 0.64
170 0.6
171 0.6
172 0.5
173 0.42
174 0.37
175 0.34
176 0.25
177 0.24
178 0.19
179 0.09
180 0.08
181 0.07
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.06
188 0.08
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.11
193 0.11
194 0.16
195 0.15
196 0.16
197 0.15
198 0.15
199 0.14
200 0.13
201 0.12
202 0.07
203 0.07
204 0.05
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.04
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.1
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.02
240 0.02
241 0.02
242 0.02
243 0.02
244 0.02
245 0.02
246 0.02
247 0.02
248 0.02
249 0.04
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.06
257 0.05
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.09
265 0.1
266 0.11
267 0.11
268 0.12
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.09
274 0.08
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.06
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.07
286 0.14
287 0.15
288 0.21
289 0.3
290 0.4
291 0.49
292 0.6
293 0.69
294 0.72
295 0.8
296 0.83
297 0.83
298 0.82
299 0.81
300 0.77
301 0.74
302 0.64
303 0.56
304 0.47
305 0.39
306 0.3
307 0.21
308 0.15
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.05
313 0.06
314 0.08
315 0.12
316 0.13
317 0.14
318 0.13
319 0.13
320 0.14
321 0.15
322 0.13
323 0.11
324 0.12
325 0.14
326 0.15
327 0.15
328 0.15
329 0.17
330 0.19
331 0.18
332 0.18
333 0.21
334 0.19
335 0.21
336 0.23
337 0.21
338 0.22
339 0.28
340 0.28
341 0.24
342 0.25
343 0.27
344 0.25
345 0.25
346 0.28
347 0.21
348 0.19
349 0.18
350 0.17
351 0.15
352 0.14
353 0.14
354 0.07
355 0.08
356 0.09
357 0.1
358 0.11
359 0.1
360 0.1
361 0.1
362 0.1
363 0.08
364 0.12
365 0.1
366 0.1
367 0.08
368 0.09
369 0.11
370 0.11
371 0.13
372 0.09
373 0.09
374 0.1
375 0.1
376 0.1
377 0.09
378 0.09
379 0.11
380 0.18
381 0.23
382 0.27
383 0.31
384 0.37
385 0.47
386 0.58
387 0.67
388 0.71
389 0.76
390 0.81
391 0.88
392 0.91
393 0.92
394 0.91
395 0.91
396 0.91
397 0.91
398 0.87
399 0.83
400 0.8
401 0.73
402 0.66
403 0.58
404 0.48
405 0.37
406 0.32
407 0.25
408 0.16
409 0.12
410 0.08
411 0.07
412 0.05
413 0.04
414 0.04
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.04
420 0.04
421 0.05
422 0.06
423 0.07
424 0.08
425 0.08
426 0.09
427 0.09
428 0.1
429 0.09
430 0.08
431 0.08
432 0.07
433 0.07
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.04
439 0.03
440 0.03
441 0.05
442 0.06
443 0.08
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.11
448 0.14
449 0.12
450 0.12
451 0.11
452 0.11
453 0.11
454 0.12
455 0.13
456 0.17
457 0.17
458 0.18
459 0.19
460 0.22
461 0.23
462 0.25
463 0.33
464 0.32
465 0.36
466 0.35
467 0.34
468 0.33
469 0.33
470 0.3
471 0.24
472 0.21
473 0.18
474 0.19
475 0.19
476 0.18
477 0.17
478 0.19
479 0.16
480 0.15
481 0.14
482 0.14
483 0.14
484 0.13
485 0.14
486 0.15
487 0.15
488 0.14
489 0.15
490 0.14
491 0.14
492 0.14
493 0.13
494 0.1
495 0.11
496 0.11
497 0.1
498 0.12
499 0.12
500 0.13
501 0.19
502 0.22
503 0.25
504 0.3
505 0.35
506 0.37
507 0.41
508 0.5
509 0.53
510 0.58
511 0.61
512 0.62
513 0.64
514 0.62
515 0.58
516 0.5
517 0.44
518 0.4
519 0.37
520 0.34
521 0.27
522 0.27
523 0.27
524 0.24
525 0.21
526 0.18
527 0.12
528 0.09
529 0.08
530 0.06
531 0.07
532 0.07
533 0.09
534 0.1
535 0.11
536 0.14
537 0.15
538 0.19
539 0.19
540 0.21
541 0.21
542 0.21
543 0.21
544 0.23
545 0.3
546 0.36
547 0.41
548 0.5
549 0.59