Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KCI8

Protein Details
Accession Q5KCI8    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MPKNKGKGGKNNRRGKKEDGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-18KNKGKGGKNNRRGKKE
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR006196  RNA-binding_domain_S1_IF1  
IPR001253  TIF_eIF-1A  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006413  P:translational initiation  
KEGG cne:CNH01170  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01176  eIF-1a  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50832  S1_IF1_TYPE  
CDD cd05793  S1_IF1A  
Amino Acid Sequences MPKNKGKGGKNNRRGKKEDGENKRELIFKEDGQEYAQVVKMLGNGRLEAKCQDGESRLAQIRGQMRKKVWIVVGDIILLSLRDFQDDRADVIHRYTPDEARNLKTYGELKDFQLVENQEAGGEEDEEGGIEFEEADIDDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.8
3 0.78
4 0.78
5 0.78
6 0.78
7 0.76
8 0.71
9 0.68
10 0.63
11 0.57
12 0.47
13 0.42
14 0.35
15 0.29
16 0.3
17 0.29
18 0.27
19 0.24
20 0.24
21 0.19
22 0.17
23 0.17
24 0.12
25 0.11
26 0.11
27 0.12
28 0.13
29 0.15
30 0.14
31 0.13
32 0.16
33 0.16
34 0.17
35 0.15
36 0.16
37 0.14
38 0.14
39 0.15
40 0.14
41 0.16
42 0.16
43 0.19
44 0.18
45 0.18
46 0.18
47 0.2
48 0.25
49 0.3
50 0.33
51 0.33
52 0.32
53 0.38
54 0.38
55 0.37
56 0.32
57 0.25
58 0.24
59 0.21
60 0.2
61 0.14
62 0.13
63 0.1
64 0.08
65 0.06
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.06
70 0.06
71 0.07
72 0.12
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.14
77 0.13
78 0.15
79 0.18
80 0.14
81 0.16
82 0.18
83 0.19
84 0.21
85 0.26
86 0.28
87 0.28
88 0.32
89 0.29
90 0.27
91 0.29
92 0.3
93 0.28
94 0.3
95 0.28
96 0.25
97 0.31
98 0.31
99 0.27
100 0.29
101 0.26
102 0.23
103 0.22
104 0.21
105 0.14
106 0.15
107 0.16
108 0.11
109 0.1
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.04
120 0.05