Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5K9N5

Protein Details
Accession Q5K9N5    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-54APNATASSSKHKKDKSKEKHGKEKHHHDKSKSKKDKKSKSEKHEKGEKSPFEBasic
301-331ARELKAYRKEEEKKKRDARKARKEGRVDDDABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-52KHKKDKSKEKHGKEKHHHDKSKSKKDKKSKSEKHEKGEKSP
305-325KAYRKEEEKKKRDARKARKEG
345-360RKADEQEGEKRKKKKE
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041901  RNAP_I_Rpa43_N  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0005840  C:ribosome  
GO:0005736  C:RNA polymerase I complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
KEGG cne:CNK01350  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
CDD cd04328  RNAP_I_Rpa43_N  
Amino Acid Sequences MSAPNATASSSKHKKDKSKEKHGKEKHHHDKSKSKKDKKSKSEKHEKGEKSPFEHREMRMRLSVPPKFAGDVMAGVRDQLDGMIMQYVPEVKGVLIAHWDHSFDDDTAKIINECPFEVVNVEFHAIYWAPKIGQKLRGIHSISSPSHLSLIFAGAFNVSIPIQHIPADLYEFEETDEVVETESLDGSEVEYVDKNEMEVKETGRWRNKKTGEFFGKRELVKFTVIGMQVTNQMLSLTGSLLEDPSNPPPAPEIVAVPIMPSPSPSPEPQQLRPAKKARTQAQSQVKQVDIKDEVDTSKMTARELKAYRKEEEKKKRDARKARKEGRVDDDAEGEEQEEGSAGTKRKADEQEGEKRKKKKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.74
3 0.81
4 0.81
5 0.85
6 0.88
7 0.9
8 0.93
9 0.93
10 0.93
11 0.93
12 0.93
13 0.93
14 0.93
15 0.91
16 0.88
17 0.89
18 0.89
19 0.9
20 0.89
21 0.88
22 0.88
23 0.9
24 0.93
25 0.93
26 0.94
27 0.93
28 0.93
29 0.94
30 0.92
31 0.91
32 0.9
33 0.84
34 0.82
35 0.82
36 0.76
37 0.71
38 0.72
39 0.67
40 0.64
41 0.65
42 0.59
43 0.59
44 0.57
45 0.55
46 0.51
47 0.47
48 0.47
49 0.5
50 0.5
51 0.44
52 0.42
53 0.39
54 0.35
55 0.33
56 0.28
57 0.2
58 0.18
59 0.15
60 0.14
61 0.12
62 0.11
63 0.11
64 0.09
65 0.08
66 0.06
67 0.06
68 0.04
69 0.05
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.08
75 0.07
76 0.08
77 0.08
78 0.06
79 0.09
80 0.1
81 0.09
82 0.12
83 0.12
84 0.14
85 0.14
86 0.15
87 0.11
88 0.13
89 0.14
90 0.11
91 0.13
92 0.11
93 0.11
94 0.11
95 0.11
96 0.1
97 0.1
98 0.13
99 0.13
100 0.13
101 0.14
102 0.13
103 0.13
104 0.14
105 0.12
106 0.1
107 0.09
108 0.1
109 0.08
110 0.08
111 0.09
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.1
118 0.14
119 0.17
120 0.23
121 0.28
122 0.32
123 0.34
124 0.4
125 0.4
126 0.37
127 0.35
128 0.35
129 0.3
130 0.28
131 0.25
132 0.19
133 0.18
134 0.17
135 0.15
136 0.09
137 0.1
138 0.08
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.06
143 0.05
144 0.06
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.07
152 0.06
153 0.07
154 0.08
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.07
159 0.08
160 0.07
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.09
183 0.09
184 0.11
185 0.12
186 0.13
187 0.17
188 0.22
189 0.28
190 0.34
191 0.4
192 0.41
193 0.5
194 0.54
195 0.56
196 0.57
197 0.61
198 0.62
199 0.6
200 0.58
201 0.56
202 0.55
203 0.48
204 0.45
205 0.38
206 0.3
207 0.26
208 0.24
209 0.18
210 0.17
211 0.17
212 0.16
213 0.13
214 0.12
215 0.14
216 0.14
217 0.13
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.07
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.08
231 0.11
232 0.15
233 0.14
234 0.14
235 0.15
236 0.16
237 0.17
238 0.15
239 0.14
240 0.11
241 0.13
242 0.12
243 0.11
244 0.11
245 0.1
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.12
250 0.16
251 0.17
252 0.22
253 0.29
254 0.35
255 0.37
256 0.46
257 0.51
258 0.54
259 0.61
260 0.64
261 0.63
262 0.63
263 0.69
264 0.67
265 0.67
266 0.66
267 0.67
268 0.7
269 0.7
270 0.68
271 0.63
272 0.56
273 0.52
274 0.47
275 0.43
276 0.35
277 0.3
278 0.27
279 0.24
280 0.23
281 0.2
282 0.2
283 0.16
284 0.18
285 0.17
286 0.17
287 0.21
288 0.23
289 0.3
290 0.35
291 0.43
292 0.48
293 0.52
294 0.55
295 0.59
296 0.67
297 0.68
298 0.74
299 0.73
300 0.74
301 0.8
302 0.86
303 0.87
304 0.89
305 0.89
306 0.89
307 0.93
308 0.92
309 0.91
310 0.89
311 0.86
312 0.82
313 0.77
314 0.69
315 0.59
316 0.52
317 0.43
318 0.36
319 0.29
320 0.22
321 0.15
322 0.12
323 0.1
324 0.07
325 0.06
326 0.07
327 0.12
328 0.13
329 0.17
330 0.2
331 0.22
332 0.3
333 0.35
334 0.4
335 0.44
336 0.5
337 0.58
338 0.65
339 0.74
340 0.74