Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P0CR74

Protein Details
Accession P0CR74    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
486-512SEDERPSKAKNDKSKTKPVKKAADDDEHydrophilic
549-588MMEELRKKTQAKRTKAKETSGSGSEDEKPKKKKAKKDDDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
495-503KNDKSKTKP
554-584RKKTQAKRTKAKETSGSGSEDEKPKKKKAKK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 15.5, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR013719  RTT106/SPT16-like_middle_dom  
IPR000969  SSRP1/POB3  
IPR035417  SSRP1/POB3_N  
IPR024954  SSRP1_DD  
IPR038167  SSRP1_sf  
Gene Ontology GO:0035101  C:FACT complex  
GO:0031298  C:replication fork protection complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0042393  F:histone binding  
GO:0031491  F:nucleosome binding  
GO:0140719  P:constitutive heterochromatin formation  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006261  P:DNA-templated DNA replication  
GO:0034728  P:nucleosome organization  
GO:0045899  P:positive regulation of RNA polymerase II transcription preinitiation complex assembly  
KEGG cne:CNH02980  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17292  POB3_N  
PF08512  Rtt106  
PF03531  SSrecog  
CDD cd13230  PH1_SSRP1-like  
cd13231  PH2_SSRP1-like  
Amino Acid Sequences MSTVTFENIFHGDSADLGKLRFNPVGFGWKAYQSEDNNPTTYNGSDIRHATWFRVARHFQLRLGMRNSEKPRISFDGFKRDDLDKIKRTLQEYFNITLETRDTSLKGWNWGEAQVKGSDLVFQVQGKTAFDVPLSQVANSNIAGKYEVALEFNPPSNYKFDPKDLNKRPPDEMVEMRFYIPGKSMKKAGSDAGSGGEETELDEEGNEVSAADAFHSLIKEKADIGAVVGDSIVVFEDCLILTPRGRFSIEVYADSIRLVGKSTDHRVPFTSIHRIFLLPKLDDLHVQLVLGLDPPIRQGATRYPFLVAQWPKDEVVNAELNLTDEELAQYPDLEKTYEATTFQVVSRVLKALTGKKVTPPGSLRNAQGLNGIRANVKAVQGELYFLEKGLIFISKQPILIDFSKTDSISFSRVGGGVASARTFDMRVVSKTGGADHVFSAINKQEVGPISSFLQSKNIRLKNEMEEAIVDIDEPFSDDDEEMESPSEDERPSKAKNDKSKTKPVKKAADDDEDESDDEDFEDESSDGGSPSESDSDDDSGMASDASDPMMEELRKKTQAKRTKAKETSGSGSEDEKPKKKKAKKDDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.14
4 0.13
5 0.17
6 0.18
7 0.23
8 0.25
9 0.23
10 0.23
11 0.24
12 0.33
13 0.3
14 0.32
15 0.3
16 0.32
17 0.33
18 0.33
19 0.38
20 0.33
21 0.41
22 0.44
23 0.44
24 0.41
25 0.4
26 0.39
27 0.34
28 0.31
29 0.25
30 0.23
31 0.22
32 0.25
33 0.26
34 0.27
35 0.31
36 0.31
37 0.3
38 0.34
39 0.38
40 0.37
41 0.44
42 0.45
43 0.46
44 0.54
45 0.54
46 0.48
47 0.51
48 0.51
49 0.49
50 0.51
51 0.5
52 0.45
53 0.52
54 0.56
55 0.56
56 0.55
57 0.49
58 0.52
59 0.52
60 0.53
61 0.52
62 0.52
63 0.54
64 0.53
65 0.53
66 0.51
67 0.45
68 0.47
69 0.46
70 0.49
71 0.44
72 0.46
73 0.51
74 0.51
75 0.53
76 0.54
77 0.51
78 0.49
79 0.47
80 0.46
81 0.4
82 0.37
83 0.34
84 0.27
85 0.24
86 0.19
87 0.16
88 0.15
89 0.14
90 0.14
91 0.21
92 0.22
93 0.27
94 0.26
95 0.27
96 0.27
97 0.3
98 0.32
99 0.27
100 0.27
101 0.21
102 0.21
103 0.19
104 0.18
105 0.15
106 0.12
107 0.13
108 0.12
109 0.13
110 0.13
111 0.15
112 0.16
113 0.15
114 0.17
115 0.16
116 0.15
117 0.14
118 0.15
119 0.13
120 0.18
121 0.18
122 0.16
123 0.17
124 0.17
125 0.19
126 0.18
127 0.2
128 0.14
129 0.14
130 0.15
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.1
136 0.1
137 0.12
138 0.13
139 0.16
140 0.17
141 0.16
142 0.17
143 0.19
144 0.22
145 0.25
146 0.26
147 0.28
148 0.37
149 0.43
150 0.53
151 0.58
152 0.66
153 0.67
154 0.67
155 0.66
156 0.6
157 0.57
158 0.51
159 0.47
160 0.41
161 0.38
162 0.35
163 0.32
164 0.3
165 0.25
166 0.2
167 0.19
168 0.22
169 0.22
170 0.23
171 0.27
172 0.28
173 0.3
174 0.31
175 0.3
176 0.25
177 0.23
178 0.21
179 0.19
180 0.17
181 0.14
182 0.12
183 0.09
184 0.07
185 0.06
186 0.06
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.04
194 0.04
195 0.03
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.08
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.02
221 0.02
222 0.02
223 0.03
224 0.03
225 0.04
226 0.06
227 0.06
228 0.08
229 0.09
230 0.11
231 0.12
232 0.13
233 0.12
234 0.13
235 0.2
236 0.2
237 0.2
238 0.2
239 0.19
240 0.19
241 0.18
242 0.16
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.06
247 0.08
248 0.11
249 0.16
250 0.21
251 0.21
252 0.22
253 0.23
254 0.26
255 0.27
256 0.27
257 0.32
258 0.27
259 0.28
260 0.28
261 0.27
262 0.25
263 0.26
264 0.26
265 0.16
266 0.16
267 0.17
268 0.16
269 0.16
270 0.16
271 0.14
272 0.1
273 0.1
274 0.09
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.05
279 0.04
280 0.04
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.06
286 0.13
287 0.16
288 0.17
289 0.18
290 0.18
291 0.19
292 0.19
293 0.25
294 0.2
295 0.19
296 0.2
297 0.2
298 0.19
299 0.19
300 0.19
301 0.12
302 0.14
303 0.13
304 0.11
305 0.1
306 0.1
307 0.1
308 0.1
309 0.09
310 0.06
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.06
315 0.05
316 0.05
317 0.06
318 0.06
319 0.07
320 0.07
321 0.06
322 0.08
323 0.09
324 0.09
325 0.1
326 0.09
327 0.1
328 0.1
329 0.1
330 0.12
331 0.11
332 0.11
333 0.12
334 0.12
335 0.11
336 0.12
337 0.15
338 0.17
339 0.22
340 0.24
341 0.23
342 0.26
343 0.33
344 0.33
345 0.35
346 0.33
347 0.34
348 0.37
349 0.4
350 0.37
351 0.36
352 0.35
353 0.3
354 0.32
355 0.27
356 0.23
357 0.21
358 0.21
359 0.16
360 0.16
361 0.17
362 0.14
363 0.13
364 0.11
365 0.1
366 0.12
367 0.11
368 0.12
369 0.11
370 0.11
371 0.1
372 0.09
373 0.1
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.06
379 0.09
380 0.13
381 0.14
382 0.14
383 0.14
384 0.15
385 0.18
386 0.19
387 0.19
388 0.16
389 0.18
390 0.2
391 0.2
392 0.19
393 0.16
394 0.16
395 0.16
396 0.16
397 0.13
398 0.12
399 0.12
400 0.12
401 0.1
402 0.09
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.07
407 0.07
408 0.08
409 0.08
410 0.08
411 0.11
412 0.12
413 0.14
414 0.17
415 0.17
416 0.19
417 0.19
418 0.19
419 0.19
420 0.17
421 0.16
422 0.13
423 0.15
424 0.14
425 0.13
426 0.15
427 0.13
428 0.13
429 0.13
430 0.12
431 0.14
432 0.15
433 0.18
434 0.15
435 0.15
436 0.16
437 0.19
438 0.2
439 0.17
440 0.24
441 0.23
442 0.28
443 0.37
444 0.4
445 0.39
446 0.42
447 0.46
448 0.43
449 0.47
450 0.42
451 0.32
452 0.28
453 0.26
454 0.24
455 0.19
456 0.14
457 0.08
458 0.07
459 0.06
460 0.07
461 0.06
462 0.06
463 0.07
464 0.07
465 0.08
466 0.1
467 0.1
468 0.1
469 0.11
470 0.1
471 0.1
472 0.1
473 0.12
474 0.11
475 0.12
476 0.15
477 0.19
478 0.22
479 0.31
480 0.38
481 0.45
482 0.55
483 0.63
484 0.7
485 0.73
486 0.82
487 0.85
488 0.87
489 0.88
490 0.87
491 0.87
492 0.83
493 0.83
494 0.79
495 0.76
496 0.69
497 0.62
498 0.56
499 0.47
500 0.42
501 0.33
502 0.26
503 0.18
504 0.15
505 0.12
506 0.08
507 0.07
508 0.08
509 0.07
510 0.07
511 0.08
512 0.08
513 0.07
514 0.07
515 0.07
516 0.06
517 0.08
518 0.1
519 0.1
520 0.11
521 0.13
522 0.15
523 0.15
524 0.15
525 0.13
526 0.12
527 0.11
528 0.1
529 0.07
530 0.06
531 0.06
532 0.07
533 0.07
534 0.06
535 0.08
536 0.13
537 0.14
538 0.17
539 0.22
540 0.29
541 0.37
542 0.41
543 0.49
544 0.54
545 0.63
546 0.7
547 0.76
548 0.78
549 0.81
550 0.84
551 0.83
552 0.81
553 0.77
554 0.73
555 0.66
556 0.6
557 0.5
558 0.47
559 0.46
560 0.46
561 0.48
562 0.51
563 0.54
564 0.61
565 0.7
566 0.75
567 0.79
568 0.82