Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F9Y0P2

Protein Details
Accession A0A0F9Y0P2    Localization Confidence High Confidence Score 19.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-62SPEPAISKSEKKHKKDKKDKSSKSEKKRDREEDALTDRTRKHKKSKSASVEENQDEBasic
73-122DDAEVTQKKKKKEHKKKHKEEEHDAEDAGEEKPKKKKKSKKHADEEAENDBasic
382-405TAALRKGTKGARKVQRRRAPEFAMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-52KSEKKHKKDKKDKSSKSEKKRDREEDALTDRTRKHKKSK
80-114KKKKKEHKKKHKEEEHDAEDAGEEKPKKKKKSKKH
386-399RKGTKGARKVQRRR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 11.999, mito_nucl 9.999, cyto 8.5, cyto_mito 7.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MSASIASPEPAISKSEKKHKKDKKDKSSKSEKKRDREEDALTDRTRKHKKSKSASVEENQDEEIEASQLLDNDDAEVTQKKKKKEHKKKHKEEEHDAEDAGEEKPKKKKKSKKHADEEAENDDAPEAADADASVMDVEQPAQQTSSEIYQPPDIPANPQYPFYSQTVSLYEPIYPIGWSQPVTNSEYQHLQHLKNKYVPSLRGVLMNYKNVALGENPGRKGAAASDDDPTTLKSVNEFAVGFGWITAEVDLFVPSRGAWMEGSINLQTEGHIGVVCFGQFNASIEARRLPSAWKWVSNEDPVAYGMEETASVITADDHGVVRQIHSTGFWVDGDGKKVKGKIRFRIRNFDVGVSGDTSYLSLEGTMLDREAEKALVKEEAATAALRKGTKGARKVQRRRAPEFAMTRFMDEAEQPTEAPAAEVEAATA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.44
3 0.54
4 0.6
5 0.7
6 0.77
7 0.84
8 0.87
9 0.9
10 0.91
11 0.92
12 0.95
13 0.94
14 0.95
15 0.94
16 0.94
17 0.94
18 0.92
19 0.91
20 0.91
21 0.89
22 0.86
23 0.83
24 0.78
25 0.76
26 0.73
27 0.7
28 0.61
29 0.59
30 0.54
31 0.57
32 0.6
33 0.59
34 0.64
35 0.66
36 0.75
37 0.79
38 0.86
39 0.87
40 0.86
41 0.86
42 0.82
43 0.81
44 0.73
45 0.64
46 0.53
47 0.43
48 0.34
49 0.26
50 0.2
51 0.11
52 0.09
53 0.08
54 0.08
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.08
62 0.09
63 0.13
64 0.15
65 0.23
66 0.28
67 0.34
68 0.43
69 0.54
70 0.64
71 0.71
72 0.8
73 0.83
74 0.9
75 0.94
76 0.96
77 0.96
78 0.93
79 0.92
80 0.9
81 0.83
82 0.73
83 0.62
84 0.51
85 0.41
86 0.33
87 0.23
88 0.19
89 0.16
90 0.19
91 0.29
92 0.37
93 0.47
94 0.56
95 0.66
96 0.72
97 0.82
98 0.88
99 0.9
100 0.92
101 0.92
102 0.9
103 0.86
104 0.8
105 0.73
106 0.63
107 0.51
108 0.41
109 0.3
110 0.22
111 0.15
112 0.1
113 0.06
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.04
125 0.05
126 0.06
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.08
131 0.09
132 0.11
133 0.12
134 0.12
135 0.13
136 0.15
137 0.16
138 0.17
139 0.19
140 0.17
141 0.17
142 0.2
143 0.23
144 0.21
145 0.22
146 0.22
147 0.21
148 0.23
149 0.22
150 0.2
151 0.16
152 0.17
153 0.17
154 0.17
155 0.17
156 0.15
157 0.13
158 0.11
159 0.12
160 0.1
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.08
165 0.08
166 0.09
167 0.11
168 0.13
169 0.17
170 0.19
171 0.18
172 0.19
173 0.22
174 0.21
175 0.24
176 0.26
177 0.25
178 0.28
179 0.31
180 0.33
181 0.35
182 0.35
183 0.33
184 0.33
185 0.32
186 0.29
187 0.29
188 0.26
189 0.24
190 0.23
191 0.26
192 0.24
193 0.24
194 0.22
195 0.18
196 0.18
197 0.15
198 0.15
199 0.09
200 0.1
201 0.14
202 0.17
203 0.18
204 0.18
205 0.17
206 0.17
207 0.17
208 0.15
209 0.12
210 0.11
211 0.11
212 0.13
213 0.13
214 0.13
215 0.13
216 0.13
217 0.1
218 0.09
219 0.08
220 0.07
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.1
225 0.09
226 0.08
227 0.09
228 0.08
229 0.06
230 0.06
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.03
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.05
244 0.06
245 0.05
246 0.06
247 0.07
248 0.08
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.08
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.06
258 0.06
259 0.05
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.07
268 0.1
269 0.1
270 0.11
271 0.12
272 0.15
273 0.15
274 0.16
275 0.15
276 0.14
277 0.17
278 0.25
279 0.27
280 0.28
281 0.3
282 0.34
283 0.37
284 0.37
285 0.35
286 0.26
287 0.24
288 0.2
289 0.18
290 0.14
291 0.11
292 0.08
293 0.07
294 0.06
295 0.05
296 0.05
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.05
302 0.05
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.09
307 0.09
308 0.1
309 0.11
310 0.11
311 0.1
312 0.1
313 0.12
314 0.1
315 0.12
316 0.11
317 0.1
318 0.14
319 0.15
320 0.2
321 0.2
322 0.21
323 0.23
324 0.28
325 0.32
326 0.38
327 0.45
328 0.5
329 0.6
330 0.68
331 0.71
332 0.77
333 0.76
334 0.75
335 0.68
336 0.6
337 0.5
338 0.41
339 0.37
340 0.27
341 0.24
342 0.15
343 0.13
344 0.11
345 0.1
346 0.08
347 0.07
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.08
356 0.09
357 0.1
358 0.11
359 0.11
360 0.11
361 0.13
362 0.14
363 0.13
364 0.13
365 0.13
366 0.13
367 0.12
368 0.12
369 0.12
370 0.13
371 0.16
372 0.16
373 0.16
374 0.2
375 0.27
376 0.34
377 0.41
378 0.48
379 0.55
380 0.66
381 0.76
382 0.82
383 0.84
384 0.84
385 0.84
386 0.83
387 0.79
388 0.77
389 0.75
390 0.68
391 0.67
392 0.59
393 0.54
394 0.46
395 0.4
396 0.32
397 0.25
398 0.25
399 0.19
400 0.19
401 0.17
402 0.17
403 0.17
404 0.15
405 0.14
406 0.1
407 0.1
408 0.1