FuNGI

Q5KHR9

Protein Details

Accession

Q5KHR9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
30-50	IEELERKKRLRKLAVPTDDKK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
36-41	KKRLRK

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020472 G-protein_beta_WD-40_rep IPR014906 PRP4-like IPR036285 PRP4-like_sf IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR019775 WD40_repeat_CS IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0046540 C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex GO:0030621 F:U4 snRNA binding GO:0017070 F:U6 snRNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
KEGG	cne:CND05530 -
Pfam	View protein in Pfam PF08799 PRP4 PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS00678 WD_REPEATS_1 PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION
CDD	cd00200 WD40

Amino Acid Sequences

MDLDDLITDNTYQLGGIDDERERAQNAAIIEELERKKRLRKLAVPTDDKKVRERLRAYGEPITLFGEGPGDRRDRLKYVQEQIEQAKGEGGMVIDESEESSDEDEEGEFYTEGADDLLEARRKIARYSLSKARARIARQRREYSVPLGKLVNARKELFKELKSFNNFGSQFGDDRPLSTIRFSPSSQYVLTTSWTGDTKLWDLPNLNPISTKRGHTEKVGGAAWHPFATVGASEEAVNFATGGGEGDVKLWSLSGEKPLSTLSGHTSRVGRLAFHPSGAYLASAGFDGTWRLWDVESSKELMIQEGHSKEVYALGCQDDGALIASGGFDAIGRVWDLRTGRTAMVLDGHVKEILAMDFAPNGYQIATGSGDDTVRIWDLRALKTQYIIPAHKSSVADVKFFRSSGEMPPVGIQGLPLSSRSANVDGMDVDKSNDTEDNEKEEKLSRSGMFLVTAGFDCNVRIWSADEWNMVRNLSTDAGKVMSVDVSGDGKFVASASYSRSFHLFGGENSL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.08
2	0.09
3	0.1
4	0.13
5	0.14
6	0.16
7	0.18
8	0.2
9	0.19
10	0.18
11	0.18
12	0.17
13	0.17
14	0.16
15	0.15
16	0.14
17	0.14
18	0.22
19	0.25
20	0.28
21	0.32
22	0.34
23	0.42
24	0.48
25	0.57
26	0.59
27	0.64
28	0.69
29	0.76
30	0.82
31	0.83
32	0.79
33	0.79
34	0.75
35	0.69
36	0.63
37	0.63
38	0.6
39	0.6
40	0.6
41	0.59
42	0.62
43	0.65
44	0.65
45	0.61
46	0.56
47	0.47
48	0.44
49	0.37
50	0.29
51	0.23
52	0.17
53	0.14
54	0.13
55	0.15
56	0.18
57	0.19
58	0.19
59	0.23
60	0.27
61	0.29
62	0.34
63	0.41
64	0.45
65	0.51
66	0.58
67	0.57
68	0.58
69	0.56
70	0.55
71	0.46
72	0.38
73	0.3
74	0.22
75	0.19
76	0.15
77	0.12
78	0.07
79	0.07
80	0.07
81	0.05
82	0.05
83	0.05
84	0.05
85	0.06
86	0.06
87	0.07
88	0.07
89	0.07
90	0.07
91	0.07
92	0.07
93	0.07
94	0.08
95	0.07
96	0.07
97	0.07
98	0.07
99	0.07
100	0.06
101	0.05
102	0.04
103	0.05
104	0.1
105	0.13
106	0.13
107	0.15
108	0.19
109	0.2
110	0.21
111	0.25
112	0.29
113	0.32
114	0.39
115	0.47
116	0.52
117	0.55
118	0.56
119	0.57
120	0.55
121	0.54
122	0.58
123	0.59
124	0.6
125	0.65
126	0.68
127	0.66
128	0.66
129	0.64
130	0.62
131	0.59
132	0.5
133	0.44
134	0.39
135	0.36
136	0.36
137	0.38
138	0.36
139	0.32
140	0.32
141	0.33
142	0.35
143	0.4
144	0.38
145	0.36
146	0.36
147	0.36
148	0.42
149	0.44
150	0.43
151	0.37
152	0.41
153	0.38
154	0.33
155	0.33
156	0.26
157	0.23
158	0.22
159	0.26
160	0.17
161	0.17
162	0.19
163	0.17
164	0.16
165	0.17
166	0.19
167	0.16
168	0.2
169	0.19
170	0.2
171	0.21
172	0.23
173	0.22
174	0.2
175	0.19
176	0.16
177	0.17
178	0.14
179	0.12
180	0.11
181	0.12
182	0.11
183	0.11
184	0.12
185	0.13
186	0.15
187	0.15
188	0.15
189	0.16
190	0.16
191	0.23
192	0.22
193	0.2
194	0.19
195	0.19
196	0.23
197	0.24
198	0.25
199	0.21
200	0.25
201	0.27
202	0.27
203	0.31
204	0.27
205	0.28
206	0.27
207	0.23
208	0.19
209	0.19
210	0.17
211	0.12
212	0.11
213	0.07
214	0.06
215	0.07
216	0.06
217	0.06
218	0.05
219	0.06
220	0.06
221	0.06
222	0.06
223	0.06
224	0.06
225	0.04
226	0.04
227	0.03
228	0.03
229	0.04
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.04
234	0.04
235	0.04
236	0.04
237	0.04
238	0.04
239	0.05
240	0.06
241	0.09
242	0.1
243	0.1
244	0.11
245	0.11
246	0.11
247	0.1
248	0.11
249	0.1
250	0.13
251	0.14
252	0.15
253	0.16
254	0.15
255	0.18
256	0.18
257	0.15
258	0.13
259	0.2
260	0.18
261	0.18
262	0.17
263	0.14
264	0.15
265	0.14
266	0.12
267	0.05
268	0.05
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.03
273	0.03
274	0.04
275	0.04
276	0.05
277	0.05
278	0.06
279	0.06
280	0.07
281	0.09
282	0.11
283	0.12
284	0.13
285	0.12
286	0.13
287	0.13
288	0.13
289	0.12
290	0.11
291	0.15
292	0.14
293	0.15
294	0.13
295	0.13
296	0.12
297	0.15
298	0.14
299	0.1
300	0.1
301	0.1
302	0.1
303	0.1
304	0.1
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.05
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.03
314	0.03
315	0.02
316	0.02
317	0.03
318	0.03
319	0.04
320	0.04
321	0.05
322	0.08
323	0.09
324	0.1
325	0.12
326	0.14
327	0.13
328	0.15
329	0.15
330	0.12
331	0.13
332	0.13
333	0.13
334	0.12
335	0.13
336	0.11
337	0.11
338	0.1
339	0.09
340	0.09
341	0.07
342	0.06
343	0.05
344	0.06
345	0.06
346	0.06
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.06
353	0.07
354	0.07
355	0.07
356	0.08
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.08
363	0.08
364	0.11
365	0.15
366	0.17
367	0.24
368	0.26
369	0.25
370	0.27
371	0.28
372	0.3
373	0.32
374	0.31
375	0.29
376	0.29
377	0.3
378	0.32
379	0.31
380	0.27
381	0.3
382	0.29
383	0.27
384	0.25
385	0.29
386	0.26
387	0.26
388	0.25
389	0.2
390	0.21
391	0.23
392	0.29
393	0.25
394	0.24
395	0.25
396	0.25
397	0.22
398	0.19
399	0.15
400	0.08
401	0.09
402	0.09
403	0.08
404	0.1
405	0.1
406	0.12
407	0.15
408	0.16
409	0.16
410	0.16
411	0.16
412	0.14
413	0.15
414	0.16
415	0.13
416	0.12
417	0.12
418	0.12
419	0.13
420	0.15
421	0.15
422	0.19
423	0.2
424	0.26
425	0.27
426	0.27
427	0.27
428	0.31
429	0.31
430	0.29
431	0.33
432	0.25
433	0.26
434	0.28
435	0.27
436	0.22
437	0.19
438	0.17
439	0.14
440	0.14
441	0.12
442	0.1
443	0.1
444	0.09
445	0.1
446	0.11
447	0.1
448	0.1
449	0.12
450	0.14
451	0.19
452	0.21
453	0.24
454	0.24
455	0.27
456	0.28
457	0.25
458	0.23
459	0.19
460	0.19
461	0.18
462	0.18
463	0.15
464	0.15
465	0.16
466	0.16
467	0.15
468	0.13
469	0.1
470	0.09
471	0.09
472	0.09
473	0.1
474	0.1
475	0.1
476	0.09
477	0.09
478	0.09
479	0.08
480	0.07
481	0.07
482	0.08
483	0.14
484	0.21
485	0.21
486	0.23
487	0.25
488	0.26
489	0.25
490	0.3
491	0.27

Q5KHR9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer