FuNGI

P0CM78

Protein Details

Accession

P0CM78

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
31-62	SGALTLPSPKRRKTRQTSPKPRSKARYSDDVP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
39-54	PKRRKTRQTSPKPRSK
736-737	RK

Subcellular Location(s)

mito 11, nucl 9.5, cyto_nucl 7, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045116 Clp1/Grc3 IPR032319 CLP1_P IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0005634 C:nucleus GO:0005524 F:ATP binding GO:0051731 F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity GO:0000448 P:cleavage in ITS2 between 5.8S rRNA and LSU-rRNA of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0016310 P:phosphorylation GO:0006396 P:RNA processing GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF16575 CLP1_P

Amino Acid Sequences

MSALAARRATAAAASPKPEQPESSIEEVSVSGALTLPSPKRRKTRQTSPKPRSKARYSDDVPTSRQFFQATESLAEQRTGRFSPSAPDSDGGTSSSSVGDSDEDMAQEDEFEDRREVDGERDQRKVSVAANMSSSGPFKSLDLMPVDITSQFNPKDNVNFCRITEGQLASAEMNDGHPGPGVIVSLARNESLTIAGLFLLTPLQNTLSIYSTALSPSMSSFPVYAPTSHPLPVISPASTQAPGKESDKTLLLIRENRCGIDGLRNGAVPGFSNIWLEDNGPWGLRGVHPVVGSFPVPVYPYCTPPSWSHAISSLSSSDVNLQTPFVGLVKGPKRSGKSTFARALLNNLLRRFRKVAWLECDLGQGEFGSGAVVGLWILDKPALGPPFTHPLLPSRSHYLGTYTPLTCPDEYLVAIRHLIEHYKYELQYTSEYSALHTTVHDKISTHVPLVINTQGWMKGLGEELLNVIESMAQPTRVFSFESQSEEVYSGQGWTSTPPWQATQLPYDPAYPTTEPVETEVTQTYSLETAPVSALQARYTPADLRVLSAITYFHASLHPTQSVPVTWDISSPLVCTIPWEVELGIGKALEKVYLIGEGSEGVLEEDLPIALNGAIVALAEMLGSYEDEPTVYEQGRSPPPTDLVNILGLAVIRSLSSGNSVNPGLKLQLLTPLPPSYLSRARILIKSGALELPLPGMIDWRRGGINEEGMLGKGWEEIPFLDVGGLDVIGGERRRFRKNIMRKGM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.31
3	0.34
4	0.39
5	0.4
6	0.36
7	0.32
8	0.35
9	0.37
10	0.38
11	0.35
12	0.3
13	0.29
14	0.27
15	0.23
16	0.17
17	0.12
18	0.07
19	0.07
20	0.07
21	0.08
22	0.14
23	0.19
24	0.29
25	0.36
26	0.44
27	0.53
28	0.64
29	0.74
30	0.78
31	0.83
32	0.85
33	0.89
34	0.93
35	0.94
36	0.94
37	0.92
38	0.92
39	0.9
40	0.88
41	0.86
42	0.81
43	0.81
44	0.74
45	0.74
46	0.73
47	0.67
48	0.63
49	0.58
50	0.56
51	0.47
52	0.46
53	0.38
54	0.3
55	0.3
56	0.3
57	0.26
58	0.24
59	0.25
60	0.26
61	0.25
62	0.26
63	0.23
64	0.2
65	0.23
66	0.21
67	0.22
68	0.2
69	0.2
70	0.25
71	0.3
72	0.31
73	0.28
74	0.28
75	0.28
76	0.28
77	0.28
78	0.23
79	0.18
80	0.15
81	0.14
82	0.13
83	0.11
84	0.09
85	0.09
86	0.09
87	0.08
88	0.1
89	0.1
90	0.1
91	0.11
92	0.12
93	0.11
94	0.1
95	0.09
96	0.1
97	0.1
98	0.12
99	0.11
100	0.12
101	0.13
102	0.15
103	0.15
104	0.17
105	0.25
106	0.32
107	0.35
108	0.38
109	0.37
110	0.37
111	0.38
112	0.36
113	0.29
114	0.28
115	0.26
116	0.24
117	0.25
118	0.25
119	0.24
120	0.23
121	0.22
122	0.15
123	0.13
124	0.12
125	0.11
126	0.14
127	0.14
128	0.16
129	0.17
130	0.18
131	0.17
132	0.17
133	0.17
134	0.15
135	0.15
136	0.13
137	0.17
138	0.16
139	0.19
140	0.2
141	0.22
142	0.28
143	0.32
144	0.35
145	0.35
146	0.36
147	0.33
148	0.38
149	0.36
150	0.33
151	0.33
152	0.29
153	0.25
154	0.24
155	0.24
156	0.18
157	0.17
158	0.13
159	0.09
160	0.08
161	0.08
162	0.08
163	0.07
164	0.07
165	0.07
166	0.07
167	0.07
168	0.06
169	0.05
170	0.06
171	0.07
172	0.09
173	0.09
174	0.09
175	0.09
176	0.09
177	0.09
178	0.09
179	0.09
180	0.07
181	0.06
182	0.06
183	0.06
184	0.05
185	0.05
186	0.06
187	0.05
188	0.05
189	0.05
190	0.06
191	0.07
192	0.08
193	0.09
194	0.1
195	0.1
196	0.1
197	0.1
198	0.1
199	0.1
200	0.09
201	0.08
202	0.06
203	0.07
204	0.09
205	0.09
206	0.09
207	0.09
208	0.09
209	0.14
210	0.15
211	0.14
212	0.16
213	0.18
214	0.2
215	0.2
216	0.2
217	0.15
218	0.15
219	0.18
220	0.17
221	0.15
222	0.14
223	0.14
224	0.16
225	0.17
226	0.16
227	0.14
228	0.14
229	0.15
230	0.16
231	0.18
232	0.17
233	0.18
234	0.18
235	0.18
236	0.19
237	0.2
238	0.22
239	0.26
240	0.26
241	0.31
242	0.3
243	0.29
244	0.27
245	0.25
246	0.22
247	0.23
248	0.23
249	0.19
250	0.2
251	0.19
252	0.19
253	0.18
254	0.17
255	0.1
256	0.1
257	0.09
258	0.08
259	0.09
260	0.09
261	0.1
262	0.1
263	0.11
264	0.09
265	0.1
266	0.1
267	0.09
268	0.09
269	0.09
270	0.09
271	0.09
272	0.11
273	0.1
274	0.12
275	0.12
276	0.12
277	0.13
278	0.13
279	0.13
280	0.1
281	0.09
282	0.07
283	0.08
284	0.08
285	0.13
286	0.13
287	0.16
288	0.18
289	0.19
290	0.21
291	0.21
292	0.27
293	0.25
294	0.24
295	0.22
296	0.23
297	0.23
298	0.21
299	0.21
300	0.16
301	0.13
302	0.12
303	0.12
304	0.12
305	0.11
306	0.11
307	0.1
308	0.1
309	0.09
310	0.09
311	0.09
312	0.06
313	0.06
314	0.05
315	0.12
316	0.16
317	0.19
318	0.2
319	0.24
320	0.27
321	0.31
322	0.36
323	0.37
324	0.38
325	0.41
326	0.44
327	0.42
328	0.41
329	0.37
330	0.36
331	0.33
332	0.32
333	0.29
334	0.26
335	0.29
336	0.28
337	0.3
338	0.3
339	0.26
340	0.3
341	0.31
342	0.36
343	0.35
344	0.38
345	0.36
346	0.34
347	0.34
348	0.25
349	0.21
350	0.15
351	0.1
352	0.06
353	0.05
354	0.04
355	0.03
356	0.03
357	0.02
358	0.02
359	0.02
360	0.02
361	0.02
362	0.02
363	0.02
364	0.02
365	0.03
366	0.02
367	0.03
368	0.07
369	0.08
370	0.08
371	0.09
372	0.11
373	0.16
374	0.17
375	0.17
376	0.14
377	0.17
378	0.21
379	0.22
380	0.22
381	0.22
382	0.23
383	0.23
384	0.23
385	0.22
386	0.19
387	0.2
388	0.22
389	0.17
390	0.16
391	0.17
392	0.19
393	0.16
394	0.15
395	0.13
396	0.1
397	0.1
398	0.11
399	0.1
400	0.09
401	0.09
402	0.08
403	0.09
404	0.08
405	0.09
406	0.09
407	0.09
408	0.12
409	0.15
410	0.15
411	0.15
412	0.16
413	0.16
414	0.16
415	0.17
416	0.15
417	0.13
418	0.13
419	0.13
420	0.13
421	0.12
422	0.11
423	0.09
424	0.11
425	0.12
426	0.13
427	0.13
428	0.12
429	0.13
430	0.19
431	0.19
432	0.17
433	0.17
434	0.17
435	0.17
436	0.19
437	0.18
438	0.13
439	0.13
440	0.13
441	0.1
442	0.1
443	0.1
444	0.08
445	0.07
446	0.08
447	0.08
448	0.07
449	0.07
450	0.07
451	0.06
452	0.06
453	0.05
454	0.04
455	0.04
456	0.04
457	0.07
458	0.07
459	0.07
460	0.07
461	0.08
462	0.1
463	0.1
464	0.12
465	0.1
466	0.14
467	0.15
468	0.2
469	0.2
470	0.19
471	0.18
472	0.18
473	0.17
474	0.13
475	0.12
476	0.08
477	0.07
478	0.07
479	0.06
480	0.07
481	0.09
482	0.12
483	0.14
484	0.15
485	0.16
486	0.18
487	0.21
488	0.22
489	0.25
490	0.24
491	0.24
492	0.23
493	0.24
494	0.21
495	0.2
496	0.22
497	0.17
498	0.17
499	0.17
500	0.17
501	0.16
502	0.17
503	0.19
504	0.15
505	0.17
506	0.16
507	0.15
508	0.15
509	0.15
510	0.13
511	0.1
512	0.09
513	0.08
514	0.07
515	0.06
516	0.06
517	0.07
518	0.07
519	0.08
520	0.09
521	0.09
522	0.1
523	0.11
524	0.12
525	0.13
526	0.14
527	0.13
528	0.17
529	0.16
530	0.17
531	0.16
532	0.15
533	0.14
534	0.13
535	0.12
536	0.08
537	0.1
538	0.09
539	0.09
540	0.1
541	0.12
542	0.14
543	0.17
544	0.17
545	0.15
546	0.16
547	0.17
548	0.16
549	0.17
550	0.17
551	0.15
552	0.14
553	0.15
554	0.15
555	0.15
556	0.15
557	0.13
558	0.12
559	0.1
560	0.1
561	0.11
562	0.11
563	0.11
564	0.11
565	0.12
566	0.1
567	0.12
568	0.13
569	0.12
570	0.11
571	0.1
572	0.09
573	0.1
574	0.1
575	0.08
576	0.07
577	0.07
578	0.07
579	0.09
580	0.08
581	0.07
582	0.07
583	0.07
584	0.07
585	0.06
586	0.06
587	0.05
588	0.05
589	0.04
590	0.04
591	0.04
592	0.04
593	0.05
594	0.04
595	0.05
596	0.05
597	0.05
598	0.04
599	0.04
600	0.04
601	0.03
602	0.03
603	0.03
604	0.03
605	0.02
606	0.02
607	0.03
608	0.03
609	0.04
610	0.04
611	0.05
612	0.05
613	0.05
614	0.06
615	0.09
616	0.12
617	0.12
618	0.13
619	0.15
620	0.21
621	0.29
622	0.3
623	0.3
624	0.29
625	0.31
626	0.32
627	0.31
628	0.27
629	0.22
630	0.21
631	0.19
632	0.16
633	0.14
634	0.12
635	0.1
636	0.08
637	0.06
638	0.05
639	0.05
640	0.06
641	0.05
642	0.09
643	0.1
644	0.11
645	0.15
646	0.16
647	0.17
648	0.17
649	0.18
650	0.16
651	0.16
652	0.16
653	0.13
654	0.2
655	0.19
656	0.2
657	0.23
658	0.23
659	0.22
660	0.23
661	0.25
662	0.25
663	0.31
664	0.32
665	0.32
666	0.36
667	0.39
668	0.4
669	0.41
670	0.38
671	0.33
672	0.31
673	0.3
674	0.26
675	0.22
676	0.2
677	0.16
678	0.14
679	0.12
680	0.11
681	0.09
682	0.13
683	0.13
684	0.17
685	0.18
686	0.19
687	0.19
688	0.2
689	0.24
690	0.23
691	0.25
692	0.22
693	0.23
694	0.21
695	0.21
696	0.21
697	0.17
698	0.13
699	0.11
700	0.11
701	0.1
702	0.1
703	0.1
704	0.11
705	0.11
706	0.11
707	0.1
708	0.09
709	0.09
710	0.08
711	0.07
712	0.05
713	0.05
714	0.06
715	0.1
716	0.13
717	0.15
718	0.22
719	0.28
720	0.36
721	0.39
722	0.47
723	0.54
724	0.63

P0CM78

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer