Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KPZ5

Protein Details
Accession Q5KPZ5    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
248-272EARNRAEWEKTRRKRENERAKEEEEBasic
473-494EAERKRREEEERQKRREREKIVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
259-262RRKR
476-490RKRREEEERQKRRER
Subcellular Location(s) cyto 11, nucl 10, pero 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045146  SF3A1  
IPR022030  SF3A1_dom  
IPR000061  Surp  
IPR035967  SWAP/Surp_sf  
IPR000626  Ubiquitin-like_dom  
IPR029071  Ubiquitin-like_domsf  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0005686  C:U2 snRNP  
GO:0071004  C:U2-type prespliceosome  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG cne:CNA01020  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12230  PRP21_like_P  
PF01805  Surp  
PF00240  ubiquitin  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50128  SURP  
PS50053  UBIQUITIN_2  
Amino Acid Sequences MSALNLPKPVNTYAGEDELRNPNGVAGVANGQAVQENEDAEEEWVPPKASDKLKIGIIYPPKEIRNIVDKTAIHISKSPTPLLLEEKIREHQKTDPKFAFLNDADPYHQYYRYMIVKSQEDAEDAAKGIVKPQEEKKMEKKDEGPKATEPKPWEFKVDLPGVTAMDLDILRLTALFHARRGRSFLSSLSVKEGRNYQFDFLRPTHSLYGYYNRMVESYQKIMQPPPGLIDGVIKEANDPDWKWHILDEARNRAEWEKTRRKRENERAKEEEEEAKAFAAIDWQDFVTVETIEFTQNDEQLELPPPTSVEKLKSMSMAEKRMAAMVMEETGAGPTGETAPPAEEMEMEEDEEEEEARLQRIKAEQEQARAREVQRAAMEQRGMKIKKDYVPRGIQRTNAVATAICPNCGQSIPENELTEHMRIELLDPKWKEQKKQLELRRAQAQQLQQGADVVSSLKNLASARTDIFGDDVDEAERKRREEEERQKRREREKIVWDGHTASAAKTAETFQSQFSLDEQIKKLHNRAGLTDQPSNAPGPQIGPGITQQAHVPTPLAAGLSTPGGGTAYAGATISAAPTGPTTKEYISTPYDPSFGGTPPPPPGSAPSIHPSRLAAMGGNTPYLGSATPPMAGQVHPRAEDEGAGDRPVFKRPKIEKLPYGQLYTEIDWQSLHPEPISIAVQLPSMPEKPEWKLDGSIITVPDLPVSTLFSTIRERIRRILDTDVPISRMRLDYNNKPMSNSSTLASVNLDEGDMLSLVVKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.32
3 0.29
4 0.33
5 0.37
6 0.36
7 0.32
8 0.28
9 0.23
10 0.22
11 0.22
12 0.17
13 0.11
14 0.12
15 0.12
16 0.12
17 0.12
18 0.11
19 0.12
20 0.12
21 0.13
22 0.11
23 0.11
24 0.11
25 0.12
26 0.13
27 0.13
28 0.13
29 0.11
30 0.12
31 0.13
32 0.14
33 0.13
34 0.16
35 0.23
36 0.27
37 0.32
38 0.36
39 0.38
40 0.41
41 0.42
42 0.4
43 0.4
44 0.43
45 0.4
46 0.41
47 0.42
48 0.4
49 0.42
50 0.41
51 0.39
52 0.39
53 0.39
54 0.36
55 0.38
56 0.37
57 0.39
58 0.46
59 0.42
60 0.35
61 0.36
62 0.38
63 0.38
64 0.41
65 0.38
66 0.3
67 0.31
68 0.32
69 0.33
70 0.33
71 0.31
72 0.31
73 0.34
74 0.39
75 0.44
76 0.42
77 0.39
78 0.42
79 0.48
80 0.52
81 0.57
82 0.53
83 0.51
84 0.51
85 0.49
86 0.49
87 0.39
88 0.36
89 0.29
90 0.28
91 0.26
92 0.26
93 0.3
94 0.25
95 0.25
96 0.22
97 0.21
98 0.26
99 0.3
100 0.3
101 0.28
102 0.31
103 0.33
104 0.33
105 0.35
106 0.3
107 0.25
108 0.24
109 0.22
110 0.17
111 0.15
112 0.14
113 0.13
114 0.12
115 0.15
116 0.16
117 0.17
118 0.21
119 0.28
120 0.37
121 0.39
122 0.46
123 0.52
124 0.6
125 0.62
126 0.63
127 0.65
128 0.64
129 0.71
130 0.69
131 0.64
132 0.6
133 0.63
134 0.61
135 0.58
136 0.53
137 0.51
138 0.54
139 0.5
140 0.48
141 0.42
142 0.42
143 0.44
144 0.43
145 0.35
146 0.29
147 0.28
148 0.23
149 0.22
150 0.18
151 0.11
152 0.09
153 0.08
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.07
161 0.13
162 0.13
163 0.17
164 0.25
165 0.27
166 0.28
167 0.33
168 0.33
169 0.31
170 0.32
171 0.29
172 0.27
173 0.28
174 0.27
175 0.28
176 0.3
177 0.27
178 0.27
179 0.33
180 0.3
181 0.33
182 0.34
183 0.3
184 0.3
185 0.31
186 0.35
187 0.29
188 0.32
189 0.28
190 0.29
191 0.3
192 0.27
193 0.28
194 0.25
195 0.31
196 0.28
197 0.28
198 0.25
199 0.22
200 0.22
201 0.21
202 0.23
203 0.2
204 0.21
205 0.23
206 0.24
207 0.25
208 0.27
209 0.31
210 0.28
211 0.24
212 0.22
213 0.19
214 0.17
215 0.16
216 0.17
217 0.13
218 0.14
219 0.14
220 0.12
221 0.11
222 0.11
223 0.13
224 0.13
225 0.13
226 0.14
227 0.18
228 0.19
229 0.19
230 0.19
231 0.21
232 0.21
233 0.28
234 0.31
235 0.36
236 0.37
237 0.37
238 0.38
239 0.35
240 0.38
241 0.38
242 0.41
243 0.43
244 0.51
245 0.62
246 0.69
247 0.75
248 0.81
249 0.85
250 0.86
251 0.85
252 0.85
253 0.8
254 0.74
255 0.69
256 0.6
257 0.54
258 0.44
259 0.35
260 0.26
261 0.2
262 0.18
263 0.15
264 0.12
265 0.09
266 0.08
267 0.07
268 0.08
269 0.07
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.09
281 0.09
282 0.1
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.11
287 0.14
288 0.12
289 0.11
290 0.1
291 0.1
292 0.11
293 0.13
294 0.13
295 0.12
296 0.16
297 0.17
298 0.18
299 0.19
300 0.18
301 0.22
302 0.25
303 0.26
304 0.22
305 0.22
306 0.21
307 0.21
308 0.2
309 0.13
310 0.1
311 0.07
312 0.07
313 0.05
314 0.05
315 0.04
316 0.04
317 0.05
318 0.04
319 0.03
320 0.03
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.06
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.05
330 0.06
331 0.08
332 0.08
333 0.07
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.04
340 0.04
341 0.05
342 0.05
343 0.07
344 0.06
345 0.09
346 0.11
347 0.14
348 0.17
349 0.24
350 0.25
351 0.3
352 0.35
353 0.34
354 0.33
355 0.33
356 0.3
357 0.29
358 0.27
359 0.24
360 0.21
361 0.22
362 0.21
363 0.21
364 0.22
365 0.16
366 0.18
367 0.22
368 0.22
369 0.21
370 0.23
371 0.24
372 0.28
373 0.36
374 0.37
375 0.36
376 0.43
377 0.46
378 0.5
379 0.48
380 0.45
381 0.39
382 0.37
383 0.31
384 0.24
385 0.2
386 0.13
387 0.12
388 0.17
389 0.15
390 0.14
391 0.13
392 0.13
393 0.13
394 0.14
395 0.13
396 0.09
397 0.12
398 0.15
399 0.18
400 0.18
401 0.17
402 0.19
403 0.2
404 0.18
405 0.14
406 0.11
407 0.09
408 0.08
409 0.09
410 0.14
411 0.13
412 0.19
413 0.19
414 0.22
415 0.31
416 0.33
417 0.35
418 0.38
419 0.47
420 0.49
421 0.58
422 0.63
423 0.65
424 0.66
425 0.68
426 0.68
427 0.59
428 0.52
429 0.48
430 0.43
431 0.37
432 0.36
433 0.31
434 0.22
435 0.22
436 0.19
437 0.14
438 0.12
439 0.08
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.07
445 0.07
446 0.08
447 0.09
448 0.1
449 0.11
450 0.12
451 0.12
452 0.1
453 0.1
454 0.09
455 0.08
456 0.07
457 0.07
458 0.07
459 0.08
460 0.08
461 0.13
462 0.15
463 0.15
464 0.17
465 0.22
466 0.28
467 0.38
468 0.49
469 0.55
470 0.64
471 0.71
472 0.78
473 0.81
474 0.82
475 0.8
476 0.76
477 0.73
478 0.72
479 0.73
480 0.69
481 0.63
482 0.56
483 0.49
484 0.42
485 0.36
486 0.27
487 0.17
488 0.18
489 0.16
490 0.14
491 0.13
492 0.13
493 0.13
494 0.14
495 0.15
496 0.11
497 0.13
498 0.13
499 0.13
500 0.13
501 0.17
502 0.16
503 0.2
504 0.21
505 0.24
506 0.27
507 0.29
508 0.31
509 0.3
510 0.32
511 0.29
512 0.3
513 0.33
514 0.35
515 0.37
516 0.37
517 0.34
518 0.31
519 0.31
520 0.29
521 0.22
522 0.17
523 0.12
524 0.1
525 0.12
526 0.12
527 0.11
528 0.11
529 0.11
530 0.15
531 0.15
532 0.14
533 0.13
534 0.15
535 0.15
536 0.14
537 0.14
538 0.1
539 0.1
540 0.1
541 0.09
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.06
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.05
551 0.05
552 0.05
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.05
558 0.05
559 0.05
560 0.04
561 0.04
562 0.04
563 0.05
564 0.07
565 0.08
566 0.09
567 0.12
568 0.12
569 0.15
570 0.15
571 0.19
572 0.23
573 0.24
574 0.26
575 0.25
576 0.26
577 0.24
578 0.24
579 0.21
580 0.17
581 0.18
582 0.16
583 0.17
584 0.2
585 0.22
586 0.21
587 0.2
588 0.23
589 0.24
590 0.24
591 0.26
592 0.28
593 0.3
594 0.3
595 0.3
596 0.27
597 0.25
598 0.25
599 0.21
600 0.16
601 0.13
602 0.16
603 0.16
604 0.16
605 0.14
606 0.12
607 0.11
608 0.11
609 0.09
610 0.06
611 0.08
612 0.09
613 0.09
614 0.09
615 0.11
616 0.11
617 0.12
618 0.17
619 0.22
620 0.24
621 0.25
622 0.26
623 0.27
624 0.26
625 0.26
626 0.23
627 0.2
628 0.18
629 0.18
630 0.17
631 0.18
632 0.19
633 0.27
634 0.29
635 0.26
636 0.35
637 0.4
638 0.51
639 0.58
640 0.65
641 0.65
642 0.68
643 0.76
644 0.69
645 0.66
646 0.56
647 0.48
648 0.44
649 0.38
650 0.37
651 0.28
652 0.24
653 0.21
654 0.21
655 0.23
656 0.23
657 0.22
658 0.15
659 0.15
660 0.15
661 0.18
662 0.19
663 0.14
664 0.13
665 0.13
666 0.13
667 0.13
668 0.14
669 0.15
670 0.15
671 0.17
672 0.18
673 0.23
674 0.26
675 0.33
676 0.34
677 0.33
678 0.34
679 0.33
680 0.33
681 0.31
682 0.3
683 0.24
684 0.23
685 0.2
686 0.18
687 0.18
688 0.15
689 0.13
690 0.1
691 0.13
692 0.12
693 0.14
694 0.15
695 0.16
696 0.21
697 0.26
698 0.34
699 0.37
700 0.39
701 0.43
702 0.5
703 0.52
704 0.5
705 0.53
706 0.51
707 0.5
708 0.52
709 0.47
710 0.43
711 0.39
712 0.37
713 0.32
714 0.28
715 0.25
716 0.29
717 0.35
718 0.41
719 0.51
720 0.59
721 0.57
722 0.57
723 0.57
724 0.55
725 0.52
726 0.44
727 0.35
728 0.3
729 0.29
730 0.28
731 0.26
732 0.2
733 0.16
734 0.15
735 0.14
736 0.09
737 0.09
738 0.09
739 0.08
740 0.07
741 0.08