Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KHC8

Protein Details
Accession Q5KHC8    Localization Confidence Low Confidence Score 7.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
256-278GTEKETEERRRQRQEKRFQLLTKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 10.5, cyto_nucl 9.833, nucl 9.5, cyto_mito 9.499, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
KEGG cne:CNE00490  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51782  LYSM  
CDD cd00118  LysM  
Amino Acid Sequences MSTLSCQTCSSTLLPSHLASAFSPTCCNNPICSRCLEKNPRLREYVPCLRCGDPRNAMSGGASSHQDRRGQRGEVVFDVTDLGLDLGLGLDEHNGAEEDEIDALPPPPGYDEVVVETERMEFTPTAGVPSIEKVENNIGDSIGGSSSSSEPSRLDSFVPTKNVQDSSHIQKKANTNTETVQVIHKIQRGDTLLSIARKYAADPHEIIYLNSLPPSALTSYPRILQTRKSLIISQRSIPWIPSSGSPTEHMHIGEEGTEKETEERRRQRQEKRFQLLTKSTDPEIGRAYIGVEEIEEKNLYSSLDTNPNPRHPLEYSTGESLDRPHHQSNPIKHIVGGIENEMEKSKKMVVPEEGNREERALGRFWDDELWEVENGTSLDKERRKIGKWNVVGGDIAINFTPPGLSSKAVKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.26
3 0.28
4 0.26
5 0.26
6 0.2
7 0.25
8 0.24
9 0.22
10 0.25
11 0.23
12 0.25
13 0.28
14 0.29
15 0.28
16 0.35
17 0.39
18 0.39
19 0.42
20 0.46
21 0.48
22 0.58
23 0.62
24 0.62
25 0.67
26 0.73
27 0.73
28 0.72
29 0.68
30 0.65
31 0.64
32 0.66
33 0.58
34 0.54
35 0.52
36 0.49
37 0.53
38 0.5
39 0.48
40 0.46
41 0.44
42 0.45
43 0.42
44 0.39
45 0.33
46 0.29
47 0.23
48 0.17
49 0.18
50 0.16
51 0.2
52 0.24
53 0.3
54 0.31
55 0.38
56 0.42
57 0.42
58 0.44
59 0.43
60 0.43
61 0.38
62 0.39
63 0.31
64 0.25
65 0.23
66 0.18
67 0.13
68 0.1
69 0.08
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.03
74 0.03
75 0.03
76 0.03
77 0.03
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.06
94 0.07
95 0.08
96 0.09
97 0.09
98 0.1
99 0.12
100 0.14
101 0.14
102 0.12
103 0.12
104 0.11
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.08
109 0.08
110 0.12
111 0.11
112 0.12
113 0.12
114 0.13
115 0.11
116 0.12
117 0.15
118 0.12
119 0.12
120 0.12
121 0.16
122 0.16
123 0.17
124 0.16
125 0.13
126 0.12
127 0.12
128 0.11
129 0.07
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.06
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.13
139 0.15
140 0.14
141 0.14
142 0.16
143 0.2
144 0.22
145 0.26
146 0.24
147 0.24
148 0.25
149 0.27
150 0.24
151 0.25
152 0.25
153 0.3
154 0.37
155 0.38
156 0.36
157 0.38
158 0.45
159 0.48
160 0.52
161 0.44
162 0.38
163 0.37
164 0.39
165 0.36
166 0.3
167 0.23
168 0.17
169 0.17
170 0.18
171 0.2
172 0.17
173 0.17
174 0.19
175 0.2
176 0.19
177 0.17
178 0.16
179 0.16
180 0.16
181 0.16
182 0.13
183 0.12
184 0.11
185 0.11
186 0.15
187 0.14
188 0.16
189 0.16
190 0.17
191 0.2
192 0.2
193 0.2
194 0.15
195 0.14
196 0.12
197 0.11
198 0.1
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.09
205 0.12
206 0.13
207 0.15
208 0.18
209 0.19
210 0.19
211 0.22
212 0.27
213 0.29
214 0.3
215 0.3
216 0.31
217 0.34
218 0.4
219 0.38
220 0.33
221 0.31
222 0.32
223 0.3
224 0.27
225 0.23
226 0.18
227 0.17
228 0.17
229 0.17
230 0.16
231 0.17
232 0.19
233 0.19
234 0.18
235 0.19
236 0.17
237 0.14
238 0.13
239 0.12
240 0.1
241 0.1
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.12
247 0.17
248 0.22
249 0.31
250 0.4
251 0.47
252 0.57
253 0.66
254 0.74
255 0.79
256 0.83
257 0.84
258 0.83
259 0.82
260 0.74
261 0.73
262 0.69
263 0.64
264 0.58
265 0.5
266 0.42
267 0.41
268 0.38
269 0.32
270 0.28
271 0.24
272 0.19
273 0.16
274 0.16
275 0.11
276 0.1
277 0.08
278 0.06
279 0.08
280 0.08
281 0.1
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.1
286 0.1
287 0.08
288 0.1
289 0.12
290 0.2
291 0.21
292 0.27
293 0.32
294 0.37
295 0.39
296 0.38
297 0.39
298 0.33
299 0.36
300 0.35
301 0.35
302 0.33
303 0.32
304 0.32
305 0.28
306 0.27
307 0.25
308 0.24
309 0.24
310 0.27
311 0.28
312 0.32
313 0.39
314 0.47
315 0.52
316 0.56
317 0.57
318 0.51
319 0.48
320 0.45
321 0.39
322 0.34
323 0.27
324 0.19
325 0.17
326 0.16
327 0.17
328 0.17
329 0.16
330 0.14
331 0.15
332 0.18
333 0.18
334 0.2
335 0.25
336 0.29
337 0.37
338 0.44
339 0.51
340 0.5
341 0.51
342 0.49
343 0.45
344 0.4
345 0.35
346 0.3
347 0.24
348 0.21
349 0.22
350 0.22
351 0.22
352 0.23
353 0.2
354 0.2
355 0.19
356 0.2
357 0.16
358 0.16
359 0.15
360 0.14
361 0.14
362 0.13
363 0.12
364 0.13
365 0.22
366 0.26
367 0.3
368 0.36
369 0.44
370 0.47
371 0.56
372 0.64
373 0.65
374 0.65
375 0.7
376 0.63
377 0.57
378 0.53
379 0.43
380 0.36
381 0.26
382 0.22
383 0.14
384 0.13
385 0.11
386 0.11
387 0.1
388 0.07
389 0.11
390 0.12
391 0.14