Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KC32

Protein Details
Accession Q5KC32    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
253-297DDAPRPPATDDKKKKGKKRSNEEEEEKPKPKKKKKQPAASSATAABasic
305-329KKKPAVKKEKGAASEKKKKVEKKKDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
263-329DKKKKGKKRSNEEEEEKPKPKKKKKQPAASSATAAGDAADGEKKKPAVKKEKGAASEKKKKVEKKKD
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
KEGG cne:CNI00430  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MASASGYNHHRFARAVLKKSRKWEPSLTVQLFSNHWRFENSPLNFQYDGPMKPFLLAIRSQVIPASLIPFLYDIQPPISFVDGCLVVELQDYRRSPESRSRVVMRPAAETLAQTIDVMLERKGHGWDEQLAMELESRIITATSPPLYLGTSIMATRNATLALALTSPAHPNLSADGALRQPMAMESDAQSSLEKMRKLIAAGSRAGAGAAPFQPDWLVLRAKEQYEAVRLHRERGGFLPQGSQGPAPSTAGGDDAPRPPATDDKKKKGKKRSNEEEEEKPKPKKKKKQPAASSATAAGDAADGEKKKPAVKKEKGAASEKKKKVEKKKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.47
3 0.53
4 0.62
5 0.65
6 0.72
7 0.77
8 0.73
9 0.71
10 0.71
11 0.68
12 0.68
13 0.73
14 0.67
15 0.59
16 0.54
17 0.5
18 0.44
19 0.43
20 0.39
21 0.29
22 0.28
23 0.3
24 0.3
25 0.35
26 0.43
27 0.39
28 0.42
29 0.42
30 0.46
31 0.43
32 0.41
33 0.39
34 0.34
35 0.33
36 0.27
37 0.28
38 0.24
39 0.23
40 0.24
41 0.19
42 0.18
43 0.17
44 0.17
45 0.19
46 0.19
47 0.19
48 0.18
49 0.17
50 0.14
51 0.14
52 0.13
53 0.1
54 0.09
55 0.09
56 0.1
57 0.1
58 0.11
59 0.12
60 0.1
61 0.12
62 0.12
63 0.13
64 0.13
65 0.14
66 0.12
67 0.11
68 0.13
69 0.11
70 0.11
71 0.1
72 0.09
73 0.07
74 0.09
75 0.1
76 0.09
77 0.14
78 0.15
79 0.18
80 0.23
81 0.25
82 0.27
83 0.36
84 0.41
85 0.41
86 0.46
87 0.48
88 0.48
89 0.51
90 0.52
91 0.44
92 0.39
93 0.34
94 0.3
95 0.25
96 0.2
97 0.16
98 0.13
99 0.11
100 0.08
101 0.07
102 0.06
103 0.07
104 0.08
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.09
109 0.1
110 0.11
111 0.11
112 0.12
113 0.13
114 0.13
115 0.13
116 0.13
117 0.12
118 0.11
119 0.11
120 0.09
121 0.07
122 0.05
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.06
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.05
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.08
178 0.12
179 0.15
180 0.14
181 0.13
182 0.15
183 0.16
184 0.16
185 0.19
186 0.19
187 0.18
188 0.19
189 0.19
190 0.17
191 0.16
192 0.15
193 0.12
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.1
203 0.11
204 0.12
205 0.1
206 0.14
207 0.17
208 0.18
209 0.19
210 0.19
211 0.18
212 0.21
213 0.23
214 0.22
215 0.29
216 0.29
217 0.31
218 0.32
219 0.31
220 0.28
221 0.29
222 0.32
223 0.24
224 0.25
225 0.24
226 0.23
227 0.24
228 0.23
229 0.21
230 0.15
231 0.15
232 0.15
233 0.13
234 0.12
235 0.11
236 0.09
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.11
241 0.12
242 0.15
243 0.15
244 0.16
245 0.16
246 0.24
247 0.31
248 0.39
249 0.47
250 0.55
251 0.65
252 0.73
253 0.81
254 0.84
255 0.86
256 0.86
257 0.88
258 0.89
259 0.88
260 0.9
261 0.86
262 0.86
263 0.83
264 0.81
265 0.77
266 0.75
267 0.73
268 0.74
269 0.79
270 0.79
271 0.83
272 0.86
273 0.89
274 0.92
275 0.94
276 0.93
277 0.91
278 0.84
279 0.75
280 0.66
281 0.55
282 0.44
283 0.33
284 0.23
285 0.14
286 0.1
287 0.09
288 0.12
289 0.12
290 0.13
291 0.17
292 0.2
293 0.25
294 0.32
295 0.41
296 0.47
297 0.56
298 0.64
299 0.69
300 0.76
301 0.76
302 0.79
303 0.79
304 0.78
305 0.8
306 0.77
307 0.77
308 0.78
309 0.81