Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F9XDK0

Protein Details
Accession A0A0F9XDK0    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
428-455DSEVRARERARREKRKEDERKLRQTRMGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
260-277PPKFKHKKIPRGPPSPPP
432-453RARERARREKRKEDERKLRQTR
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MHNPCNQPHLHRHTWNFSTRSWHRNLQAATSSHATPKMTSMAASLQASLPKPKYTGEDEEAPSRTQQRGPRIVGPGQLDETQIVLKRSGPPPYGQRAGWRPRSQEDFGDGGAFPEIPIAQYPLDMGKKGAKTSNALALQVDAEGKVKYDAIARQGHGEGRIIHTSFKDLIPLRQRADAGEIDLSRPDKESVEATTERTKNALAALVSGAVAAQKPKNLNIGQRKDPTFVRYTPANQMGDNSKKQDRIMKIVERQRDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAEDQEMWRIPPPVSNWKNPKGFTVPLDKRLAADGRGLQDITINDKHAQFAEAIKMAERHARDEVQQRALMQQRLAEKEKAQKEENLRSLAQKAREDRAAAGQRGRRDSRDSRDSRESGSRSPSRSSYSGSESRGGSDSEDSEVRARERARREKRKEDERKLRQTRMGAERRIQVMAREQNRDISEKIALGIAKPSQSKETMYDSRLFNQSSGFDSGFNEDNPYDKPLFAAQDAINSIYRPRANMDDEDAEAGDKEMAKIQKSSRFGEALGKGTFKGASEAEAREGPVQFEKDAVDPFNVDKFLSEVDQNSSSKRGYGLQDEDRKAKKARVEEDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.74
3 0.67
4 0.6
5 0.61
6 0.59
7 0.6
8 0.58
9 0.58
10 0.54
11 0.59
12 0.58
13 0.55
14 0.55
15 0.49
16 0.47
17 0.42
18 0.4
19 0.35
20 0.36
21 0.31
22 0.24
23 0.26
24 0.25
25 0.22
26 0.21
27 0.19
28 0.19
29 0.23
30 0.22
31 0.2
32 0.19
33 0.22
34 0.24
35 0.29
36 0.29
37 0.27
38 0.27
39 0.28
40 0.32
41 0.34
42 0.4
43 0.38
44 0.43
45 0.43
46 0.48
47 0.48
48 0.44
49 0.41
50 0.37
51 0.35
52 0.33
53 0.37
54 0.41
55 0.48
56 0.52
57 0.55
58 0.57
59 0.56
60 0.56
61 0.52
62 0.45
63 0.39
64 0.35
65 0.29
66 0.24
67 0.22
68 0.19
69 0.19
70 0.17
71 0.15
72 0.17
73 0.23
74 0.27
75 0.33
76 0.32
77 0.35
78 0.41
79 0.48
80 0.5
81 0.43
82 0.48
83 0.5
84 0.58
85 0.63
86 0.61
87 0.58
88 0.6
89 0.66
90 0.61
91 0.54
92 0.49
93 0.41
94 0.36
95 0.33
96 0.26
97 0.2
98 0.18
99 0.14
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.06
104 0.07
105 0.09
106 0.08
107 0.08
108 0.09
109 0.13
110 0.15
111 0.15
112 0.16
113 0.2
114 0.23
115 0.25
116 0.28
117 0.26
118 0.28
119 0.3
120 0.37
121 0.31
122 0.3
123 0.27
124 0.24
125 0.22
126 0.19
127 0.16
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.12
136 0.14
137 0.18
138 0.23
139 0.23
140 0.25
141 0.26
142 0.27
143 0.24
144 0.24
145 0.19
146 0.19
147 0.22
148 0.2
149 0.2
150 0.19
151 0.21
152 0.2
153 0.19
154 0.21
155 0.19
156 0.25
157 0.32
158 0.36
159 0.35
160 0.36
161 0.36
162 0.31
163 0.34
164 0.27
165 0.21
166 0.2
167 0.18
168 0.16
169 0.18
170 0.18
171 0.14
172 0.15
173 0.15
174 0.12
175 0.13
176 0.14
177 0.13
178 0.18
179 0.18
180 0.2
181 0.27
182 0.27
183 0.26
184 0.26
185 0.24
186 0.19
187 0.19
188 0.18
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.09
193 0.09
194 0.08
195 0.07
196 0.05
197 0.05
198 0.07
199 0.07
200 0.1
201 0.11
202 0.13
203 0.19
204 0.21
205 0.3
206 0.38
207 0.43
208 0.48
209 0.53
210 0.53
211 0.5
212 0.5
213 0.45
214 0.39
215 0.34
216 0.31
217 0.27
218 0.28
219 0.31
220 0.35
221 0.32
222 0.27
223 0.28
224 0.31
225 0.34
226 0.33
227 0.31
228 0.29
229 0.3
230 0.32
231 0.37
232 0.33
233 0.34
234 0.38
235 0.4
236 0.45
237 0.49
238 0.54
239 0.49
240 0.49
241 0.45
242 0.41
243 0.39
244 0.41
245 0.44
246 0.42
247 0.42
248 0.5
249 0.54
250 0.53
251 0.6
252 0.6
253 0.62
254 0.67
255 0.76
256 0.74
257 0.76
258 0.78
259 0.77
260 0.75
261 0.7
262 0.64
263 0.54
264 0.5
265 0.47
266 0.48
267 0.48
268 0.48
269 0.46
270 0.46
271 0.49
272 0.44
273 0.41
274 0.41
275 0.39
276 0.38
277 0.35
278 0.33
279 0.32
280 0.31
281 0.3
282 0.27
283 0.2
284 0.14
285 0.15
286 0.17
287 0.25
288 0.28
289 0.35
290 0.4
291 0.46
292 0.5
293 0.48
294 0.47
295 0.4
296 0.38
297 0.34
298 0.38
299 0.33
300 0.34
301 0.36
302 0.33
303 0.29
304 0.3
305 0.28
306 0.18
307 0.18
308 0.14
309 0.14
310 0.14
311 0.14
312 0.11
313 0.12
314 0.12
315 0.15
316 0.14
317 0.14
318 0.15
319 0.15
320 0.16
321 0.14
322 0.14
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.1
327 0.1
328 0.1
329 0.11
330 0.11
331 0.14
332 0.13
333 0.14
334 0.14
335 0.15
336 0.18
337 0.25
338 0.28
339 0.28
340 0.28
341 0.26
342 0.28
343 0.32
344 0.3
345 0.23
346 0.22
347 0.23
348 0.27
349 0.3
350 0.27
351 0.26
352 0.33
353 0.38
354 0.39
355 0.36
356 0.37
357 0.4
358 0.47
359 0.48
360 0.43
361 0.38
362 0.35
363 0.38
364 0.37
365 0.35
366 0.31
367 0.31
368 0.3
369 0.32
370 0.31
371 0.28
372 0.33
373 0.34
374 0.31
375 0.33
376 0.33
377 0.35
378 0.4
379 0.41
380 0.35
381 0.37
382 0.42
383 0.45
384 0.52
385 0.51
386 0.52
387 0.57
388 0.56
389 0.52
390 0.53
391 0.47
392 0.4
393 0.45
394 0.43
395 0.38
396 0.4
397 0.39
398 0.36
399 0.35
400 0.35
401 0.3
402 0.32
403 0.34
404 0.33
405 0.34
406 0.3
407 0.3
408 0.28
409 0.25
410 0.19
411 0.16
412 0.14
413 0.13
414 0.13
415 0.13
416 0.13
417 0.15
418 0.14
419 0.17
420 0.19
421 0.24
422 0.34
423 0.44
424 0.53
425 0.62
426 0.7
427 0.77
428 0.84
429 0.88
430 0.89
431 0.89
432 0.9
433 0.89
434 0.91
435 0.89
436 0.85
437 0.79
438 0.72
439 0.7
440 0.69
441 0.67
442 0.6
443 0.56
444 0.56
445 0.52
446 0.5
447 0.42
448 0.33
449 0.34
450 0.38
451 0.38
452 0.38
453 0.36
454 0.4
455 0.41
456 0.42
457 0.34
458 0.28
459 0.24
460 0.2
461 0.2
462 0.17
463 0.15
464 0.12
465 0.14
466 0.14
467 0.16
468 0.17
469 0.18
470 0.19
471 0.21
472 0.22
473 0.23
474 0.29
475 0.31
476 0.32
477 0.36
478 0.35
479 0.38
480 0.4
481 0.38
482 0.3
483 0.27
484 0.25
485 0.23
486 0.25
487 0.21
488 0.17
489 0.17
490 0.2
491 0.2
492 0.19
493 0.18
494 0.14
495 0.16
496 0.17
497 0.21
498 0.19
499 0.17
500 0.18
501 0.18
502 0.2
503 0.19
504 0.22
505 0.17
506 0.2
507 0.21
508 0.22
509 0.2
510 0.18
511 0.18
512 0.2
513 0.2
514 0.18
515 0.2
516 0.23
517 0.26
518 0.28
519 0.33
520 0.29
521 0.29
522 0.29
523 0.26
524 0.21
525 0.17
526 0.15
527 0.11
528 0.09
529 0.09
530 0.13
531 0.16
532 0.18
533 0.22
534 0.27
535 0.34
536 0.38
537 0.41
538 0.4
539 0.38
540 0.38
541 0.42
542 0.4
543 0.37
544 0.35
545 0.32
546 0.28
547 0.27
548 0.27
549 0.19
550 0.18
551 0.14
552 0.15
553 0.18
554 0.19
555 0.21
556 0.21
557 0.22
558 0.23
559 0.23
560 0.22
561 0.23
562 0.24
563 0.21
564 0.21
565 0.21
566 0.2
567 0.22
568 0.22
569 0.18
570 0.18
571 0.19
572 0.22
573 0.21
574 0.19
575 0.16
576 0.16
577 0.17
578 0.17
579 0.18
580 0.16
581 0.2
582 0.25
583 0.25
584 0.27
585 0.28
586 0.26
587 0.26
588 0.25
589 0.26
590 0.26
591 0.33
592 0.38
593 0.45
594 0.54
595 0.57
596 0.64
597 0.62
598 0.63
599 0.59
600 0.57
601 0.54
602 0.54
603 0.58