Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KME6

Protein Details
Accession Q5KME6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
439-458NTMGRRRKGKLKTGEAGRVVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
187-187K
443-450RRRKGKLK
Subcellular Location(s) nucl 9.5, mito 8, cyto_nucl 8, cyto 5.5, cysk 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036483  PWI_dom_sf  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003713  F:transcription coactivator activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0045893  P:positive regulation of DNA-templated transcription  
KEGG cne:CNB01980  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MLPQRPPWVVKDIANILGLDDESVKQMIVPDLESQNIEPRLRTHLQDFLGPSQAAKDFTSRYLALRFPSLTNTPSSVPNTQLTPDADILKSKAKAKTPAHVSTPTAGSSSGISTKEFEAAFGPGGKVYMKNRNADDTSFQIGRSSQPGGSRSGSNTPLSRQRQGGAISVSIVEKPKSSAGVGSGKGKGKVEKIWDVPKSKEVKKIEAIIASLRSIQESGPKPGEGYNCFCQARMHPLSPYTPICQTCALIICKLHAPHLPCPSCAQPLYNPAQLTRLILKVETDLEDQMEKERVEELERERERQEMLQAESGGGQFPSLASGSASATGTNNVPLGGARKVISIGAKDKGKGRATVTTTTYRTGSSAPSPRLTTPPPENIMPRPRSIPVDRIKAEKELTKVLSWRKEEGKPWGDMKAEKRGNAMKYVGVDVIVMSQVNENTMGRRRKGKLKTGEAGRVVPGAQTKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.33
3 0.27
4 0.24
5 0.21
6 0.14
7 0.12
8 0.1
9 0.1
10 0.11
11 0.1
12 0.09
13 0.11
14 0.13
15 0.13
16 0.14
17 0.17
18 0.18
19 0.2
20 0.21
21 0.2
22 0.25
23 0.29
24 0.28
25 0.25
26 0.25
27 0.32
28 0.34
29 0.36
30 0.32
31 0.34
32 0.34
33 0.38
34 0.39
35 0.34
36 0.36
37 0.33
38 0.29
39 0.26
40 0.26
41 0.24
42 0.21
43 0.22
44 0.19
45 0.21
46 0.26
47 0.24
48 0.24
49 0.26
50 0.27
51 0.25
52 0.27
53 0.28
54 0.24
55 0.28
56 0.28
57 0.26
58 0.26
59 0.27
60 0.24
61 0.27
62 0.3
63 0.27
64 0.28
65 0.28
66 0.27
67 0.26
68 0.28
69 0.25
70 0.24
71 0.24
72 0.23
73 0.22
74 0.22
75 0.23
76 0.25
77 0.27
78 0.29
79 0.32
80 0.35
81 0.44
82 0.46
83 0.53
84 0.55
85 0.57
86 0.56
87 0.54
88 0.5
89 0.44
90 0.42
91 0.34
92 0.26
93 0.21
94 0.17
95 0.14
96 0.14
97 0.14
98 0.13
99 0.13
100 0.14
101 0.15
102 0.18
103 0.17
104 0.15
105 0.13
106 0.13
107 0.14
108 0.13
109 0.12
110 0.09
111 0.1
112 0.1
113 0.12
114 0.16
115 0.25
116 0.28
117 0.32
118 0.34
119 0.39
120 0.4
121 0.39
122 0.37
123 0.31
124 0.31
125 0.27
126 0.26
127 0.21
128 0.2
129 0.19
130 0.19
131 0.17
132 0.14
133 0.18
134 0.19
135 0.22
136 0.23
137 0.23
138 0.23
139 0.26
140 0.27
141 0.25
142 0.25
143 0.25
144 0.33
145 0.36
146 0.37
147 0.33
148 0.32
149 0.33
150 0.33
151 0.33
152 0.25
153 0.2
154 0.17
155 0.16
156 0.16
157 0.13
158 0.13
159 0.1
160 0.09
161 0.1
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.1
166 0.12
167 0.17
168 0.18
169 0.2
170 0.23
171 0.24
172 0.25
173 0.26
174 0.25
175 0.22
176 0.25
177 0.26
178 0.27
179 0.3
180 0.35
181 0.39
182 0.4
183 0.39
184 0.42
185 0.44
186 0.42
187 0.46
188 0.42
189 0.41
190 0.41
191 0.44
192 0.39
193 0.33
194 0.3
195 0.24
196 0.22
197 0.17
198 0.15
199 0.11
200 0.09
201 0.08
202 0.08
203 0.14
204 0.15
205 0.18
206 0.19
207 0.19
208 0.19
209 0.21
210 0.24
211 0.2
212 0.22
213 0.21
214 0.25
215 0.25
216 0.25
217 0.23
218 0.22
219 0.27
220 0.26
221 0.24
222 0.2
223 0.21
224 0.22
225 0.25
226 0.25
227 0.19
228 0.19
229 0.19
230 0.19
231 0.19
232 0.18
233 0.15
234 0.18
235 0.17
236 0.14
237 0.13
238 0.13
239 0.15
240 0.15
241 0.16
242 0.15
243 0.17
244 0.22
245 0.31
246 0.31
247 0.29
248 0.31
249 0.31
250 0.32
251 0.29
252 0.25
253 0.18
254 0.23
255 0.26
256 0.27
257 0.25
258 0.22
259 0.24
260 0.23
261 0.22
262 0.18
263 0.15
264 0.13
265 0.12
266 0.13
267 0.11
268 0.12
269 0.12
270 0.11
271 0.1
272 0.1
273 0.11
274 0.1
275 0.11
276 0.13
277 0.11
278 0.11
279 0.12
280 0.12
281 0.13
282 0.17
283 0.18
284 0.26
285 0.27
286 0.29
287 0.28
288 0.29
289 0.29
290 0.26
291 0.27
292 0.2
293 0.21
294 0.22
295 0.21
296 0.2
297 0.19
298 0.18
299 0.15
300 0.1
301 0.08
302 0.05
303 0.05
304 0.06
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.06
309 0.06
310 0.08
311 0.08
312 0.07
313 0.08
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.1
322 0.1
323 0.11
324 0.1
325 0.11
326 0.11
327 0.13
328 0.14
329 0.14
330 0.17
331 0.21
332 0.23
333 0.24
334 0.29
335 0.35
336 0.36
337 0.36
338 0.36
339 0.38
340 0.4
341 0.43
342 0.43
343 0.42
344 0.4
345 0.39
346 0.37
347 0.29
348 0.26
349 0.23
350 0.22
351 0.23
352 0.29
353 0.3
354 0.33
355 0.35
356 0.36
357 0.4
358 0.4
359 0.39
360 0.38
361 0.41
362 0.41
363 0.42
364 0.44
365 0.47
366 0.54
367 0.5
368 0.46
369 0.43
370 0.42
371 0.46
372 0.46
373 0.47
374 0.45
375 0.51
376 0.51
377 0.52
378 0.52
379 0.49
380 0.49
381 0.44
382 0.39
383 0.36
384 0.37
385 0.35
386 0.38
387 0.42
388 0.47
389 0.46
390 0.48
391 0.49
392 0.52
393 0.54
394 0.58
395 0.56
396 0.52
397 0.52
398 0.5
399 0.47
400 0.47
401 0.47
402 0.47
403 0.46
404 0.43
405 0.47
406 0.48
407 0.48
408 0.47
409 0.44
410 0.35
411 0.33
412 0.34
413 0.28
414 0.22
415 0.19
416 0.14
417 0.13
418 0.11
419 0.09
420 0.07
421 0.1
422 0.1
423 0.11
424 0.12
425 0.12
426 0.16
427 0.25
428 0.32
429 0.34
430 0.43
431 0.49
432 0.57
433 0.66
434 0.71
435 0.73
436 0.75
437 0.8
438 0.79
439 0.81
440 0.75
441 0.68
442 0.59
443 0.5
444 0.4
445 0.34