FuNGI

A0A0F9XT01

Protein Details

Accession

A0A0F9XT01

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
7-53	NPNGAPRSQKPNPLRPLRKKPVNPLVASSRKPGPKPNRPPANSAPST	Hydrophilic
185-208	VAKEVVPKRPKKQKEEKTMFNRAP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-45	RSQKPNPLRPLRKKPVNPLVASSRKPGPKPNRP
191-202	PKRPKKQKEEKT
499-507	KKGKSLKRA
522-527	RKKQKK
665-670	RLRRRK

Subcellular Location(s)

nucl 19, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPAGNPNGAPRSQKPNPLRPLRKKPVNPLVASSRKPGPKPNRPPANSAPSTSAQGAANGAKPNIEELRKQYGGWSEPPPPYTFSDIPIMTTKKALLDGIRYHLMRFSQTKLGDKPIDPTDQDEFARPVTLHRRDARQPPPGRAVKEEEPERPPVDEQEAERLAQIKAEREAQRAIDQAKIAPVAKEVVPKRPKKQKEEKTMFNRAPKTSAAKKESDLRYEEALPWHLEDADGKNVWVGSYVAALSESSVAFMIDKSVFRMIPLEKSYKFNAKPPFQPFTIDQAEAFMNRKVDVGRWVMKDEEKKAGLNDLEATRRMLYGRGQMIKSESDTFKAASRAEKMEHDELDVSGDEFQDDDETPHFERNDDEDAKESKDRIRREQLGANLFGEGDEQEVDKELQEQLREELERQKYGKTTKKALIKRDREEIYESDNSSSNPWSSSSAEDSSDEEEEAGKEDEKKDGDNKDSQGDAKDKSKLQNAKGSTTPQGKQKLSEMVKKGKSLKRAGSPALSESSGNESTRKKQKKASAAALGSRPSTPGLSQTTVRRPKITAGSGSDGEVTAGEMSDGAMQKKKIKLVGSSRGTPSASRAGSPNPAPAGGSSPLTGGLIEPWEILEKIPVDGITIGELIGLFQGRVGDGPGRMPRGEWITLVRQLCDFGSDKRLRRRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.54
3	0.58
4	0.64
5	0.72
6	0.77
7	0.83
8	0.84
9	0.9
10	0.9
11	0.92
12	0.9
13	0.9
14	0.9
15	0.87
16	0.79
17	0.74
18	0.73
19	0.71
20	0.65
21	0.59
22	0.57
23	0.55
24	0.56
25	0.61
26	0.61
27	0.64
28	0.73
29	0.79
30	0.81
31	0.78
32	0.83
33	0.81
34	0.81
35	0.73
36	0.64
37	0.59
38	0.5
39	0.5
40	0.43
41	0.36
42	0.26
43	0.24
44	0.24
45	0.21
46	0.23
47	0.21
48	0.21
49	0.19
50	0.18
51	0.22
52	0.26
53	0.26
54	0.26
55	0.29
56	0.38
57	0.38
58	0.38
59	0.38
60	0.38
61	0.39
62	0.39
63	0.39
64	0.37
65	0.39
66	0.42
67	0.4
68	0.36
69	0.36
70	0.39
71	0.35
72	0.31
73	0.34
74	0.31
75	0.32
76	0.35
77	0.34
78	0.27
79	0.28
80	0.26
81	0.21
82	0.22
83	0.21
84	0.17
85	0.21
86	0.24
87	0.27
88	0.32
89	0.31
90	0.3
91	0.31
92	0.29
93	0.28
94	0.28
95	0.27
96	0.29
97	0.32
98	0.38
99	0.38
100	0.44
101	0.43
102	0.41
103	0.42
104	0.39
105	0.4
106	0.35
107	0.36
108	0.32
109	0.31
110	0.31
111	0.28
112	0.25
113	0.21
114	0.23
115	0.19
116	0.21
117	0.28
118	0.33
119	0.38
120	0.41
121	0.48
122	0.52
123	0.62
124	0.64
125	0.65
126	0.64
127	0.63
128	0.68
129	0.67
130	0.62
131	0.57
132	0.56
133	0.52
134	0.55
135	0.53
136	0.49
137	0.46
138	0.48
139	0.45
140	0.4
141	0.34
142	0.29
143	0.29
144	0.27
145	0.24
146	0.28
147	0.27
148	0.26
149	0.25
150	0.25
151	0.2
152	0.2
153	0.2
154	0.16
155	0.17
156	0.25
157	0.26
158	0.27
159	0.3
160	0.29
161	0.3
162	0.31
163	0.3
164	0.24
165	0.22
166	0.21
167	0.2
168	0.2
169	0.18
170	0.15
171	0.14
172	0.14
173	0.14
174	0.21
175	0.21
176	0.29
177	0.38
178	0.44
179	0.52
180	0.6
181	0.67
182	0.7
183	0.8
184	0.8
185	0.82
186	0.84
187	0.85
188	0.84
189	0.85
190	0.8
191	0.76
192	0.72
193	0.61
194	0.56
195	0.49
196	0.47
197	0.45
198	0.49
199	0.46
200	0.42
201	0.43
202	0.5
203	0.51
204	0.47
205	0.42
206	0.36
207	0.34
208	0.33
209	0.33
210	0.25
211	0.24
212	0.2
213	0.17
214	0.16
215	0.13
216	0.11
217	0.11
218	0.12
219	0.14
220	0.13
221	0.12
222	0.12
223	0.12
224	0.12
225	0.11
226	0.09
227	0.05
228	0.06
229	0.06
230	0.05
231	0.06
232	0.06
233	0.05
234	0.06
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.07
242	0.07
243	0.07
244	0.09
245	0.1
246	0.1
247	0.1
248	0.14
249	0.13
250	0.17
251	0.2
252	0.23
253	0.23
254	0.26
255	0.29
256	0.33
257	0.34
258	0.35
259	0.41
260	0.41
261	0.47
262	0.49
263	0.5
264	0.43
265	0.45
266	0.4
267	0.38
268	0.36
269	0.29
270	0.23
271	0.2
272	0.2
273	0.18
274	0.18
275	0.13
276	0.1
277	0.1
278	0.11
279	0.1
280	0.11
281	0.14
282	0.16
283	0.2
284	0.21
285	0.22
286	0.22
287	0.25
288	0.28
289	0.27
290	0.27
291	0.23
292	0.23
293	0.22
294	0.24
295	0.2
296	0.17
297	0.17
298	0.14
299	0.14
300	0.14
301	0.15
302	0.12
303	0.12
304	0.12
305	0.11
306	0.11
307	0.14
308	0.18
309	0.21
310	0.21
311	0.21
312	0.22
313	0.22
314	0.21
315	0.2
316	0.16
317	0.14
318	0.14
319	0.15
320	0.15
321	0.16
322	0.15
323	0.14
324	0.16
325	0.16
326	0.16
327	0.18
328	0.2
329	0.21
330	0.2
331	0.18
332	0.16
333	0.14
334	0.14
335	0.12
336	0.08
337	0.06
338	0.06
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.06
345	0.06
346	0.08
347	0.09
348	0.12
349	0.12
350	0.11
351	0.12
352	0.14
353	0.2
354	0.19
355	0.18
356	0.19
357	0.2
358	0.22
359	0.23
360	0.2
361	0.2
362	0.25
363	0.28
364	0.32
365	0.39
366	0.41
367	0.44
368	0.47
369	0.47
370	0.45
371	0.42
372	0.35
373	0.27
374	0.22
375	0.18
376	0.14
377	0.09
378	0.05
379	0.05
380	0.04
381	0.04
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.07
386	0.08
387	0.09
388	0.1
389	0.1
390	0.11
391	0.13
392	0.14
393	0.14
394	0.21
395	0.22
396	0.25
397	0.25
398	0.26
399	0.28
400	0.35
401	0.42
402	0.39
403	0.43
404	0.45
405	0.54
406	0.57
407	0.63
408	0.66
409	0.67
410	0.66
411	0.67
412	0.63
413	0.56
414	0.54
415	0.45
416	0.41
417	0.35
418	0.32
419	0.25
420	0.25
421	0.23
422	0.2
423	0.2
424	0.14
425	0.12
426	0.12
427	0.13
428	0.13
429	0.15
430	0.17
431	0.17
432	0.18
433	0.18
434	0.18
435	0.17
436	0.17
437	0.14
438	0.11
439	0.1
440	0.09
441	0.1
442	0.1
443	0.09
444	0.11
445	0.11
446	0.15
447	0.15
448	0.17
449	0.21
450	0.24
451	0.27
452	0.3
453	0.31
454	0.31
455	0.31
456	0.3
457	0.29
458	0.28
459	0.27
460	0.26
461	0.29
462	0.29
463	0.32
464	0.4
465	0.42
466	0.43
467	0.47
468	0.46
469	0.45
470	0.45
471	0.44
472	0.42
473	0.42
474	0.41
475	0.41
476	0.47
477	0.44
478	0.43
479	0.43
480	0.46
481	0.45
482	0.49
483	0.49
484	0.5
485	0.52
486	0.56
487	0.61
488	0.56
489	0.59
490	0.58
491	0.59
492	0.58
493	0.6
494	0.58
495	0.52
496	0.49
497	0.44
498	0.39
499	0.33
500	0.25
501	0.21
502	0.23
503	0.22
504	0.21
505	0.23
506	0.23
507	0.31
508	0.42
509	0.49
510	0.47
511	0.53
512	0.61
513	0.67
514	0.72
515	0.73
516	0.71
517	0.66
518	0.67
519	0.62
520	0.55
521	0.46
522	0.37
523	0.3
524	0.22
525	0.19
526	0.15
527	0.17
528	0.2
529	0.21
530	0.25
531	0.31
532	0.4
533	0.48
534	0.5
535	0.47
536	0.44
537	0.48
538	0.52
539	0.49
540	0.44
541	0.4
542	0.43
543	0.41
544	0.4
545	0.34
546	0.26
547	0.22
548	0.16
549	0.12
550	0.07
551	0.06
552	0.05
553	0.04
554	0.05
555	0.08
556	0.1
557	0.12
558	0.16
559	0.18
560	0.25
561	0.29
562	0.33
563	0.34
564	0.36
565	0.42
566	0.48
567	0.56
568	0.56
569	0.57
570	0.56
571	0.55
572	0.52
573	0.44
574	0.39
575	0.37
576	0.32
577	0.28
578	0.28
579	0.28
580	0.33
581	0.34
582	0.35
583	0.28
584	0.27
585	0.26
586	0.24
587	0.25
588	0.21
589	0.2
590	0.16
591	0.14
592	0.15
593	0.14
594	0.13
595	0.09
596	0.09
597	0.09
598	0.09
599	0.09
600	0.09
601	0.11
602	0.11
603	0.11
604	0.13
605	0.13
606	0.13
607	0.14
608	0.13
609	0.13
610	0.13
611	0.13
612	0.11
613	0.1
614	0.09
615	0.08
616	0.08
617	0.06
618	0.07
619	0.07
620	0.05
621	0.06
622	0.07
623	0.07
624	0.07
625	0.1
626	0.11
627	0.12
628	0.18
629	0.23
630	0.26
631	0.26
632	0.26
633	0.29
634	0.32
635	0.33
636	0.29
637	0.29
638	0.31
639	0.38
640	0.38
641	0.34
642	0.29
643	0.29
644	0.28
645	0.27
646	0.23
647	0.2
648	0.3
649	0.36
650	0.44

A0A0F9XT01

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer