Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F9XLJ6

Protein Details
Accession A0A0F9XLJ6    Localization Confidence High Confidence Score 20.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-129AKAWLTGQKKRQKKIDKARKLEEELAHydrophilic
279-306LAPSEIKVKKPKKKKGSKGTRQKQHDEDBasic
353-376AIQRKNALKKRKRTRPEDIARQLKHydrophilic
609-633KGSGKGKTEKRLKKIDDEKRREAQSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
64-82AKKRREEKAAAVRKAREKA
112-122KKRQKKIDKAR
285-299KVKKPKKKKGSKGTR
357-367KNALKKRKRTR
609-624KGSGKGKTEKRLKKID
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 10.333, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MDAATIEETNRIRVSLGMKPLPVPGAAASPQAETSDGEEPASTVETRQAQAYDNYKKVQDDEAAKKRREEKAAAVRKAREKAQRFALLEGKGLGEEDEGGDMDAKAWLTGQKKRQKKIDKARKLEEELAAAEAAAAAAIQYTSKDLAGIKVAHDSTSFLDGDEQVLTLKDTTIDENEEEGDELENLNIKEQEKLTERLDLKKKLKGYNPNDYDDGEGTILAQYDEEINGKKAKKFTLDDNGAIAELSDILGQPERKGKKIQSISLDDIIDGAAPSSDYLAPSEIKVKKPKKKKGSKGTRQKQHDEDDIFPIEAAPVDTGAMDVDSKETLMAKKRKATTSDAFADDDDLQASLAIQRKNALKKRKRTRPEDIARQLKEDEEEPEETQSGGLVIGEISEFVAGLSKPDDEDRQSRRQKQATKSPELEEDRHMGDEDEDAEMDDYAAEHQEALLAAQKEEEEKIKREKNEEDDDAGIEDEKVVGAGMGAALALLRERGLLESSDRGNYEDFKAREDFLAKKRVLEGELDEQTRQQRERDRMSGRLDRMSVREREEWARQQNTHRDHQQSKRMAELFNAGYKPNVELKYVDDHGRRLDQKEAFKHLSHQFHGKGSGKGKTEKRLKKIDDEKRREAQSMFDASQNAGMNLATAQQLKKRREAGVRLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.33
4 0.33
5 0.33
6 0.34
7 0.36
8 0.34
9 0.3
10 0.24
11 0.17
12 0.18
13 0.18
14 0.19
15 0.18
16 0.18
17 0.18
18 0.17
19 0.17
20 0.14
21 0.16
22 0.18
23 0.17
24 0.16
25 0.16
26 0.15
27 0.15
28 0.17
29 0.13
30 0.1
31 0.15
32 0.18
33 0.19
34 0.21
35 0.21
36 0.21
37 0.27
38 0.36
39 0.38
40 0.39
41 0.41
42 0.42
43 0.42
44 0.41
45 0.4
46 0.38
47 0.38
48 0.44
49 0.52
50 0.58
51 0.59
52 0.63
53 0.67
54 0.68
55 0.66
56 0.6
57 0.6
58 0.63
59 0.71
60 0.72
61 0.7
62 0.69
63 0.71
64 0.71
65 0.68
66 0.67
67 0.63
68 0.63
69 0.65
70 0.66
71 0.6
72 0.6
73 0.58
74 0.49
75 0.44
76 0.38
77 0.29
78 0.2
79 0.19
80 0.15
81 0.08
82 0.08
83 0.07
84 0.07
85 0.06
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.08
91 0.07
92 0.06
93 0.07
94 0.12
95 0.16
96 0.24
97 0.33
98 0.41
99 0.5
100 0.58
101 0.67
102 0.73
103 0.79
104 0.83
105 0.85
106 0.87
107 0.87
108 0.88
109 0.86
110 0.81
111 0.75
112 0.65
113 0.56
114 0.46
115 0.39
116 0.3
117 0.21
118 0.15
119 0.1
120 0.07
121 0.05
122 0.03
123 0.02
124 0.02
125 0.02
126 0.03
127 0.03
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.08
133 0.09
134 0.13
135 0.14
136 0.13
137 0.17
138 0.18
139 0.17
140 0.17
141 0.17
142 0.14
143 0.17
144 0.16
145 0.11
146 0.12
147 0.12
148 0.13
149 0.12
150 0.1
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.09
159 0.1
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.13
164 0.12
165 0.11
166 0.1
167 0.09
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.09
172 0.09
173 0.1
174 0.12
175 0.12
176 0.14
177 0.15
178 0.2
179 0.21
180 0.25
181 0.24
182 0.3
183 0.31
184 0.38
185 0.45
186 0.49
187 0.49
188 0.5
189 0.55
190 0.54
191 0.6
192 0.61
193 0.61
194 0.63
195 0.63
196 0.62
197 0.57
198 0.51
199 0.45
200 0.35
201 0.29
202 0.18
203 0.13
204 0.1
205 0.09
206 0.08
207 0.06
208 0.05
209 0.04
210 0.05
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.09
215 0.14
216 0.17
217 0.2
218 0.22
219 0.24
220 0.29
221 0.3
222 0.35
223 0.4
224 0.41
225 0.39
226 0.37
227 0.34
228 0.28
229 0.25
230 0.19
231 0.09
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.03
236 0.04
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.16
241 0.17
242 0.2
243 0.25
244 0.27
245 0.34
246 0.39
247 0.43
248 0.42
249 0.46
250 0.46
251 0.45
252 0.42
253 0.32
254 0.27
255 0.22
256 0.15
257 0.09
258 0.06
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.04
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.07
267 0.07
268 0.08
269 0.16
270 0.18
271 0.23
272 0.32
273 0.41
274 0.48
275 0.58
276 0.68
277 0.71
278 0.79
279 0.85
280 0.86
281 0.89
282 0.91
283 0.92
284 0.92
285 0.9
286 0.86
287 0.82
288 0.76
289 0.69
290 0.65
291 0.56
292 0.48
293 0.42
294 0.36
295 0.29
296 0.24
297 0.19
298 0.12
299 0.09
300 0.08
301 0.04
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.05
315 0.07
316 0.15
317 0.2
318 0.23
319 0.29
320 0.33
321 0.36
322 0.39
323 0.44
324 0.39
325 0.39
326 0.4
327 0.35
328 0.32
329 0.28
330 0.27
331 0.2
332 0.17
333 0.11
334 0.08
335 0.06
336 0.05
337 0.05
338 0.06
339 0.1
340 0.11
341 0.11
342 0.14
343 0.19
344 0.27
345 0.34
346 0.42
347 0.46
348 0.57
349 0.67
350 0.75
351 0.79
352 0.79
353 0.82
354 0.82
355 0.83
356 0.83
357 0.81
358 0.79
359 0.71
360 0.65
361 0.56
362 0.45
363 0.37
364 0.27
365 0.2
366 0.15
367 0.16
368 0.14
369 0.15
370 0.14
371 0.13
372 0.12
373 0.1
374 0.07
375 0.05
376 0.04
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.02
386 0.04
387 0.04
388 0.05
389 0.05
390 0.06
391 0.06
392 0.08
393 0.1
394 0.12
395 0.19
396 0.25
397 0.34
398 0.43
399 0.5
400 0.56
401 0.62
402 0.67
403 0.68
404 0.72
405 0.71
406 0.7
407 0.66
408 0.6
409 0.6
410 0.56
411 0.5
412 0.42
413 0.36
414 0.29
415 0.27
416 0.25
417 0.17
418 0.13
419 0.12
420 0.1
421 0.08
422 0.07
423 0.07
424 0.07
425 0.06
426 0.06
427 0.05
428 0.04
429 0.04
430 0.05
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.05
436 0.05
437 0.09
438 0.09
439 0.09
440 0.1
441 0.1
442 0.11
443 0.12
444 0.17
445 0.16
446 0.2
447 0.28
448 0.34
449 0.37
450 0.41
451 0.45
452 0.48
453 0.51
454 0.5
455 0.43
456 0.38
457 0.36
458 0.31
459 0.26
460 0.19
461 0.11
462 0.08
463 0.06
464 0.05
465 0.04
466 0.03
467 0.03
468 0.03
469 0.03
470 0.03
471 0.02
472 0.02
473 0.02
474 0.02
475 0.02
476 0.02
477 0.03
478 0.03
479 0.03
480 0.04
481 0.05
482 0.06
483 0.07
484 0.09
485 0.13
486 0.15
487 0.16
488 0.17
489 0.17
490 0.17
491 0.18
492 0.21
493 0.25
494 0.24
495 0.25
496 0.27
497 0.26
498 0.27
499 0.28
500 0.31
501 0.29
502 0.38
503 0.34
504 0.34
505 0.36
506 0.36
507 0.34
508 0.29
509 0.28
510 0.26
511 0.31
512 0.31
513 0.28
514 0.28
515 0.32
516 0.35
517 0.32
518 0.3
519 0.34
520 0.41
521 0.48
522 0.55
523 0.55
524 0.56
525 0.62
526 0.65
527 0.6
528 0.56
529 0.51
530 0.45
531 0.45
532 0.46
533 0.42
534 0.39
535 0.39
536 0.38
537 0.42
538 0.47
539 0.5
540 0.52
541 0.55
542 0.53
543 0.58
544 0.64
545 0.64
546 0.65
547 0.64
548 0.64
549 0.67
550 0.72
551 0.73
552 0.72
553 0.68
554 0.67
555 0.62
556 0.54
557 0.47
558 0.44
559 0.37
560 0.35
561 0.34
562 0.26
563 0.25
564 0.25
565 0.26
566 0.27
567 0.26
568 0.22
569 0.21
570 0.24
571 0.3
572 0.32
573 0.36
574 0.31
575 0.32
576 0.35
577 0.42
578 0.43
579 0.39
580 0.44
581 0.44
582 0.5
583 0.54
584 0.58
585 0.54
586 0.52
587 0.56
588 0.56
589 0.57
590 0.52
591 0.53
592 0.48
593 0.47
594 0.54
595 0.5
596 0.49
597 0.47
598 0.5
599 0.47
600 0.53
601 0.57
602 0.59
603 0.65
604 0.68
605 0.71
606 0.75
607 0.75
608 0.77
609 0.81
610 0.82
611 0.82
612 0.82
613 0.82
614 0.8
615 0.79
616 0.72
617 0.62
618 0.57
619 0.53
620 0.51
621 0.43
622 0.38
623 0.35
624 0.32
625 0.36
626 0.31
627 0.24
628 0.17
629 0.16
630 0.13
631 0.12
632 0.13
633 0.11
634 0.13
635 0.16
636 0.23
637 0.32
638 0.36
639 0.44
640 0.48
641 0.53
642 0.59