Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F9Y5N0

Protein Details
Accession A0A0F9Y5N0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
261-281EKEAERQRQERQRQIEKQQAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
238-266RKRKEEEERKEKEEKEKQERVEREKEAER
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019258  Mediator_Med4  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF10018  Med4  
Amino Acid Sequences MDTYIDGRFERLEKALATLIDSVTKYHPSAIQAEELKAADNELCKGLEQVEIHQNNHLKILQLRQLSASLDAQIRETLTCLATTRKDIVNTQVTIYPTEPNFPIVYEELLGHARRISKTSMPPAAILNAMAATQESQTPLPDSQAQSAMTPSAQTPNPMQSPAPTNGTIEQSAQQAQAALHTTLPDTMTQFLNPLSGQLFFPWPLEDKIRSGALASNQILLEQGIDPRGYDPVAEEDRKRKEEEERKEKEEKEKQERVEREKEAERQRQERQRQIEKQQAEWRRASMAVGASGEAAVAAPPSAKAEKKQFQFTNLDDLDDDDDED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.24
3 0.21
4 0.22
5 0.2
6 0.19
7 0.19
8 0.19
9 0.18
10 0.18
11 0.21
12 0.19
13 0.2
14 0.22
15 0.21
16 0.25
17 0.25
18 0.29
19 0.28
20 0.29
21 0.29
22 0.26
23 0.25
24 0.2
25 0.19
26 0.15
27 0.14
28 0.14
29 0.13
30 0.14
31 0.12
32 0.13
33 0.13
34 0.15
35 0.15
36 0.18
37 0.26
38 0.29
39 0.29
40 0.34
41 0.36
42 0.33
43 0.35
44 0.31
45 0.24
46 0.24
47 0.3
48 0.3
49 0.29
50 0.29
51 0.27
52 0.28
53 0.26
54 0.26
55 0.2
56 0.17
57 0.17
58 0.16
59 0.16
60 0.15
61 0.15
62 0.12
63 0.13
64 0.11
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.13
69 0.14
70 0.17
71 0.19
72 0.2
73 0.22
74 0.23
75 0.28
76 0.31
77 0.3
78 0.29
79 0.29
80 0.27
81 0.27
82 0.26
83 0.23
84 0.17
85 0.19
86 0.18
87 0.16
88 0.16
89 0.14
90 0.16
91 0.13
92 0.13
93 0.11
94 0.11
95 0.1
96 0.12
97 0.12
98 0.1
99 0.11
100 0.14
101 0.14
102 0.16
103 0.18
104 0.21
105 0.26
106 0.32
107 0.34
108 0.31
109 0.31
110 0.3
111 0.28
112 0.23
113 0.17
114 0.11
115 0.07
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.04
120 0.04
121 0.05
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.09
126 0.09
127 0.1
128 0.13
129 0.14
130 0.14
131 0.16
132 0.16
133 0.14
134 0.14
135 0.13
136 0.1
137 0.09
138 0.08
139 0.09
140 0.09
141 0.1
142 0.11
143 0.15
144 0.15
145 0.16
146 0.16
147 0.13
148 0.17
149 0.18
150 0.2
151 0.16
152 0.16
153 0.17
154 0.19
155 0.17
156 0.14
157 0.14
158 0.12
159 0.12
160 0.11
161 0.1
162 0.09
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.09
172 0.08
173 0.07
174 0.08
175 0.09
176 0.08
177 0.09
178 0.08
179 0.09
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.09
188 0.1
189 0.1
190 0.11
191 0.12
192 0.15
193 0.15
194 0.15
195 0.17
196 0.17
197 0.16
198 0.15
199 0.15
200 0.14
201 0.19
202 0.18
203 0.17
204 0.16
205 0.16
206 0.16
207 0.13
208 0.12
209 0.07
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.09
216 0.08
217 0.07
218 0.08
219 0.12
220 0.17
221 0.2
222 0.22
223 0.29
224 0.36
225 0.39
226 0.39
227 0.36
228 0.42
229 0.5
230 0.58
231 0.61
232 0.61
233 0.64
234 0.7
235 0.71
236 0.71
237 0.7
238 0.69
239 0.68
240 0.69
241 0.69
242 0.71
243 0.75
244 0.72
245 0.72
246 0.65
247 0.61
248 0.6
249 0.63
250 0.63
251 0.65
252 0.64
253 0.63
254 0.69
255 0.73
256 0.76
257 0.76
258 0.76
259 0.78
260 0.79
261 0.81
262 0.8
263 0.73
264 0.72
265 0.72
266 0.7
267 0.65
268 0.58
269 0.51
270 0.44
271 0.42
272 0.35
273 0.29
274 0.23
275 0.2
276 0.18
277 0.16
278 0.14
279 0.13
280 0.12
281 0.08
282 0.06
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.05
288 0.09
289 0.13
290 0.16
291 0.22
292 0.33
293 0.41
294 0.47
295 0.57
296 0.56
297 0.58
298 0.62
299 0.58
300 0.58
301 0.5
302 0.45
303 0.35
304 0.34
305 0.31