Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KNH9

Protein Details
Accession Q5KNH9    Localization Confidence Low Confidence Score 6.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
134-157DFYASRPVKKTQPKPKTKSSAEPVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cysk 13, cyto 6.5, cyto_nucl 6, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039900  Pat1-like  
IPR019167  PAT1_dom  
Gene Ontology GO:0000932  C:P-body  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
GO:0033962  P:P-body assembly  
KEGG cne:CNA06430  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09770  PAT1  
Amino Acid Sequences MSGGFFGFDTALPEHRQAADRPNDAADTSKFQNASSLLNPFNLEAPEDEEMEVYTWGQGLDKDVEAADELNDATFGVDVNAIRGGQFSFGNEESFSSPAKPSKQSQSQRGPIASTASRYRPKVAADPFAFSEDDFYASRPVKKTQPKPKTKSSAEPVWTKPAGQVTSWGAAPSSTVKPSLGSNHAQVEAPGHIKSLEEIEAEFASMPAPSAAQAQAAFQAPAQLSGPPPANAVVTLEELERQMMEEVPQPLAQHQAQQQGPPREVTPTQIPGLAQSGYASQKAVLDSMFPDLGKSPGPVPPGQQQGQTRQSPAPIVPSHEELARQEHFQKVFEAKVQAMSKYNNLMGSSDKDFITRIQLSQLATSDPYISDFYAQVFSAMERSRRAHESGQMDRPTVVQIAAGFGFGVGGPSGNRFGKMGQNTMQKLSTQVKKLVESRTAHQKSTNTAALQGALGRVTRGGAAAPRPVLAIPTNTKLENRPASHLNQSTGIQRPPLTRKQIMYALEDLYTDVLELEQFRREAPPSTSVDDIEIWNAKCQVKVDQIWAKLMVQEPIEVSNPHPFISLLNPPKGQRILGRIILQLPDQKIYTLLSLLVVKFHQLDVVARAPPPPVTDASLLTKADRLDRAKREADTDGFLYNLVPAMDMAINKCKLGLLGGLLVAAVQRLDVVKIASTRPGVVLFTALLSKAQSLIRAPPPDPLNPHSGTHPDQIELEHFPRQFSVFLDALLPSLPDLFPSSIAAKHAFGPSAYLMSGENLPEKEGLEMERREAEVWGLAAALAVNSAEEEQTALVAALREKILHTVQGARNPMVGPVRAEMKLRNVNMFLNGLGLDAAMIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.24
3 0.27
4 0.27
5 0.34
6 0.39
7 0.4
8 0.4
9 0.4
10 0.38
11 0.35
12 0.36
13 0.3
14 0.27
15 0.27
16 0.3
17 0.28
18 0.27
19 0.31
20 0.28
21 0.3
22 0.27
23 0.3
24 0.26
25 0.28
26 0.29
27 0.25
28 0.26
29 0.22
30 0.2
31 0.15
32 0.18
33 0.18
34 0.19
35 0.18
36 0.15
37 0.15
38 0.15
39 0.14
40 0.1
41 0.08
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.11
47 0.13
48 0.13
49 0.14
50 0.13
51 0.13
52 0.13
53 0.13
54 0.1
55 0.08
56 0.08
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.06
61 0.06
62 0.05
63 0.05
64 0.07
65 0.07
66 0.08
67 0.1
68 0.09
69 0.09
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.11
74 0.11
75 0.14
76 0.15
77 0.17
78 0.16
79 0.17
80 0.17
81 0.18
82 0.18
83 0.15
84 0.18
85 0.22
86 0.28
87 0.31
88 0.35
89 0.44
90 0.53
91 0.6
92 0.66
93 0.71
94 0.74
95 0.75
96 0.7
97 0.62
98 0.53
99 0.5
100 0.42
101 0.36
102 0.34
103 0.36
104 0.41
105 0.41
106 0.44
107 0.41
108 0.43
109 0.47
110 0.47
111 0.49
112 0.44
113 0.45
114 0.42
115 0.41
116 0.38
117 0.29
118 0.27
119 0.17
120 0.18
121 0.15
122 0.15
123 0.19
124 0.21
125 0.27
126 0.27
127 0.31
128 0.37
129 0.47
130 0.57
131 0.62
132 0.7
133 0.76
134 0.8
135 0.86
136 0.87
137 0.83
138 0.82
139 0.79
140 0.77
141 0.71
142 0.71
143 0.64
144 0.61
145 0.56
146 0.46
147 0.41
148 0.38
149 0.34
150 0.27
151 0.28
152 0.23
153 0.25
154 0.25
155 0.22
156 0.15
157 0.14
158 0.15
159 0.15
160 0.15
161 0.14
162 0.15
163 0.15
164 0.16
165 0.18
166 0.23
167 0.23
168 0.23
169 0.24
170 0.26
171 0.27
172 0.26
173 0.24
174 0.21
175 0.19
176 0.18
177 0.15
178 0.13
179 0.12
180 0.12
181 0.12
182 0.12
183 0.11
184 0.09
185 0.09
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.1
190 0.08
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.04
195 0.04
196 0.05
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.11
203 0.12
204 0.11
205 0.09
206 0.13
207 0.12
208 0.13
209 0.13
210 0.11
211 0.11
212 0.14
213 0.16
214 0.13
215 0.14
216 0.13
217 0.13
218 0.12
219 0.12
220 0.11
221 0.1
222 0.1
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.08
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.11
233 0.13
234 0.14
235 0.15
236 0.14
237 0.14
238 0.19
239 0.18
240 0.18
241 0.2
242 0.27
243 0.27
244 0.31
245 0.38
246 0.38
247 0.39
248 0.36
249 0.33
250 0.29
251 0.29
252 0.28
253 0.25
254 0.24
255 0.23
256 0.23
257 0.22
258 0.19
259 0.21
260 0.17
261 0.12
262 0.09
263 0.11
264 0.11
265 0.12
266 0.11
267 0.09
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.1
275 0.1
276 0.08
277 0.09
278 0.09
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.11
284 0.14
285 0.15
286 0.17
287 0.22
288 0.28
289 0.28
290 0.32
291 0.32
292 0.37
293 0.43
294 0.42
295 0.39
296 0.33
297 0.33
298 0.3
299 0.27
300 0.26
301 0.19
302 0.21
303 0.21
304 0.22
305 0.22
306 0.21
307 0.21
308 0.16
309 0.2
310 0.18
311 0.18
312 0.17
313 0.21
314 0.21
315 0.21
316 0.22
317 0.19
318 0.19
319 0.2
320 0.2
321 0.16
322 0.21
323 0.21
324 0.2
325 0.2
326 0.21
327 0.2
328 0.2
329 0.21
330 0.16
331 0.15
332 0.15
333 0.14
334 0.16
335 0.17
336 0.16
337 0.15
338 0.14
339 0.15
340 0.14
341 0.18
342 0.16
343 0.14
344 0.14
345 0.16
346 0.16
347 0.16
348 0.16
349 0.11
350 0.11
351 0.11
352 0.1
353 0.07
354 0.09
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.09
361 0.09
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.1
366 0.11
367 0.12
368 0.13
369 0.15
370 0.18
371 0.2
372 0.23
373 0.21
374 0.26
375 0.31
376 0.33
377 0.39
378 0.37
379 0.35
380 0.32
381 0.3
382 0.25
383 0.19
384 0.14
385 0.07
386 0.06
387 0.07
388 0.06
389 0.06
390 0.05
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.04
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.09
404 0.14
405 0.15
406 0.17
407 0.2
408 0.25
409 0.26
410 0.27
411 0.26
412 0.21
413 0.24
414 0.27
415 0.27
416 0.23
417 0.27
418 0.27
419 0.3
420 0.34
421 0.33
422 0.34
423 0.31
424 0.32
425 0.39
426 0.39
427 0.37
428 0.36
429 0.34
430 0.3
431 0.33
432 0.33
433 0.21
434 0.21
435 0.2
436 0.17
437 0.16
438 0.14
439 0.09
440 0.06
441 0.06
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.04
446 0.04
447 0.05
448 0.06
449 0.07
450 0.09
451 0.09
452 0.09
453 0.09
454 0.09
455 0.1
456 0.09
457 0.11
458 0.12
459 0.15
460 0.16
461 0.16
462 0.18
463 0.18
464 0.24
465 0.27
466 0.26
467 0.27
468 0.29
469 0.31
470 0.36
471 0.36
472 0.31
473 0.26
474 0.26
475 0.26
476 0.26
477 0.24
478 0.19
479 0.19
480 0.23
481 0.27
482 0.33
483 0.36
484 0.36
485 0.36
486 0.39
487 0.42
488 0.39
489 0.35
490 0.3
491 0.25
492 0.22
493 0.2
494 0.17
495 0.12
496 0.09
497 0.06
498 0.05
499 0.04
500 0.04
501 0.05
502 0.06
503 0.08
504 0.08
505 0.08
506 0.1
507 0.12
508 0.14
509 0.16
510 0.2
511 0.21
512 0.23
513 0.24
514 0.22
515 0.22
516 0.2
517 0.18
518 0.14
519 0.15
520 0.13
521 0.14
522 0.17
523 0.17
524 0.16
525 0.17
526 0.2
527 0.22
528 0.23
529 0.29
530 0.31
531 0.31
532 0.32
533 0.31
534 0.27
535 0.24
536 0.23
537 0.18
538 0.13
539 0.13
540 0.12
541 0.12
542 0.14
543 0.12
544 0.12
545 0.17
546 0.17
547 0.16
548 0.16
549 0.15
550 0.14
551 0.18
552 0.25
553 0.24
554 0.27
555 0.29
556 0.29
557 0.33
558 0.33
559 0.31
560 0.26
561 0.26
562 0.27
563 0.29
564 0.31
565 0.27
566 0.28
567 0.28
568 0.26
569 0.24
570 0.21
571 0.19
572 0.17
573 0.16
574 0.15
575 0.15
576 0.14
577 0.1
578 0.09
579 0.08
580 0.1
581 0.1
582 0.1
583 0.09
584 0.1
585 0.1
586 0.1
587 0.09
588 0.08
589 0.09
590 0.11
591 0.14
592 0.15
593 0.14
594 0.15
595 0.15
596 0.16
597 0.16
598 0.15
599 0.13
600 0.15
601 0.16
602 0.18
603 0.21
604 0.23
605 0.22
606 0.2
607 0.21
608 0.19
609 0.21
610 0.25
611 0.26
612 0.31
613 0.37
614 0.42
615 0.44
616 0.44
617 0.44
618 0.42
619 0.39
620 0.34
621 0.29
622 0.24
623 0.2
624 0.19
625 0.15
626 0.11
627 0.1
628 0.07
629 0.06
630 0.05
631 0.07
632 0.08
633 0.09
634 0.11
635 0.16
636 0.17
637 0.16
638 0.17
639 0.15
640 0.14
641 0.14
642 0.13
643 0.08
644 0.08
645 0.08
646 0.08
647 0.08
648 0.07
649 0.06
650 0.05
651 0.04
652 0.03
653 0.03
654 0.04
655 0.05
656 0.06
657 0.06
658 0.08
659 0.11
660 0.12
661 0.15
662 0.15
663 0.16
664 0.16
665 0.16
666 0.15
667 0.13
668 0.13
669 0.1
670 0.1
671 0.1
672 0.09
673 0.08
674 0.08
675 0.08
676 0.1
677 0.1
678 0.12
679 0.13
680 0.19
681 0.26
682 0.3
683 0.3
684 0.34
685 0.36
686 0.39
687 0.42
688 0.39
689 0.39
690 0.37
691 0.38
692 0.34
693 0.36
694 0.36
695 0.36
696 0.34
697 0.28
698 0.26
699 0.26
700 0.26
701 0.26
702 0.24
703 0.25
704 0.24
705 0.23
706 0.24
707 0.24
708 0.22
709 0.19
710 0.22
711 0.17
712 0.17
713 0.17
714 0.16
715 0.15
716 0.14
717 0.12
718 0.07
719 0.08
720 0.07
721 0.07
722 0.1
723 0.11
724 0.11
725 0.14
726 0.16
727 0.16
728 0.19
729 0.19
730 0.17
731 0.2
732 0.21
733 0.19
734 0.18
735 0.19
736 0.18
737 0.17
738 0.16
739 0.13
740 0.11
741 0.13
742 0.14
743 0.13
744 0.15
745 0.14
746 0.16
747 0.16
748 0.16
749 0.15
750 0.15
751 0.16
752 0.2
753 0.21
754 0.22
755 0.25
756 0.25
757 0.25
758 0.24
759 0.22
760 0.16
761 0.16
762 0.13
763 0.1
764 0.09
765 0.08
766 0.07
767 0.06
768 0.04
769 0.04
770 0.04
771 0.04
772 0.05
773 0.05
774 0.05
775 0.06
776 0.05
777 0.06
778 0.06
779 0.06
780 0.06
781 0.08
782 0.09
783 0.11
784 0.11
785 0.12
786 0.12
787 0.17
788 0.17
789 0.18
790 0.2
791 0.26
792 0.3
793 0.37
794 0.4
795 0.37
796 0.38
797 0.35
798 0.38
799 0.33
800 0.3
801 0.26
802 0.25
803 0.29
804 0.28
805 0.3
806 0.29
807 0.34
808 0.4
809 0.4
810 0.42
811 0.39
812 0.39
813 0.39
814 0.38
815 0.28
816 0.21
817 0.19
818 0.15
819 0.12
820 0.1