Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KFH4

Protein Details
Accession Q5KFH4    Localization Confidence Low Confidence Score 8.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-39IPPQHAESKRDRKRRETVNKIEMLHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10.5, cyto 7.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0070822  C:Sin3-type complex  
GO:0042826  F:histone deacetylase binding  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG cne:CNF01740  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MSRYLPQQGTIPTIIPPQHAESKRDRKRRETVNKIEMLHDESWRTRDEKFGAMYKEYHAENKLVNSQPPTSAKYLLHAYPVSVERDARLEAAEEEYQYKVSQARKMYEQERESIEAQYWEARDQIRQRLLGAIEDRRKRLREEKEGGEIITESLLEADVRKPKRRSFFTTSTSTPRSTSPSGTNASSRDKSPSTARVNPADLMHHSQLTPTLALISTDDILSNDSSLHVRPAPAGSTTYVPTQAGKRGGPRGKAAEITGEGKELAAPGTSAALGIAAAQSNNRSRGVGGTRDQTLTLGRSLAELAKMTQAAQLEVDGDWARMQGNQGRGRRARGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.25
3 0.26
4 0.26
5 0.35
6 0.38
7 0.41
8 0.47
9 0.57
10 0.65
11 0.72
12 0.74
13 0.73
14 0.79
15 0.85
16 0.85
17 0.85
18 0.85
19 0.85
20 0.83
21 0.76
22 0.69
23 0.6
24 0.54
25 0.45
26 0.37
27 0.31
28 0.28
29 0.28
30 0.28
31 0.28
32 0.23
33 0.27
34 0.28
35 0.29
36 0.31
37 0.35
38 0.35
39 0.36
40 0.37
41 0.33
42 0.34
43 0.3
44 0.3
45 0.25
46 0.24
47 0.23
48 0.25
49 0.31
50 0.29
51 0.31
52 0.31
53 0.31
54 0.34
55 0.35
56 0.36
57 0.3
58 0.32
59 0.29
60 0.29
61 0.32
62 0.27
63 0.28
64 0.24
65 0.22
66 0.21
67 0.24
68 0.22
69 0.19
70 0.19
71 0.15
72 0.17
73 0.18
74 0.14
75 0.12
76 0.11
77 0.1
78 0.14
79 0.13
80 0.12
81 0.13
82 0.13
83 0.13
84 0.12
85 0.12
86 0.13
87 0.16
88 0.21
89 0.24
90 0.26
91 0.31
92 0.37
93 0.4
94 0.44
95 0.42
96 0.4
97 0.38
98 0.39
99 0.35
100 0.3
101 0.26
102 0.18
103 0.17
104 0.17
105 0.15
106 0.12
107 0.12
108 0.12
109 0.16
110 0.19
111 0.26
112 0.27
113 0.26
114 0.26
115 0.27
116 0.27
117 0.26
118 0.25
119 0.24
120 0.29
121 0.31
122 0.34
123 0.35
124 0.37
125 0.38
126 0.44
127 0.46
128 0.48
129 0.51
130 0.51
131 0.53
132 0.52
133 0.47
134 0.39
135 0.3
136 0.2
137 0.14
138 0.1
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.03
143 0.04
144 0.07
145 0.13
146 0.17
147 0.24
148 0.28
149 0.33
150 0.41
151 0.46
152 0.52
153 0.54
154 0.57
155 0.55
156 0.57
157 0.54
158 0.52
159 0.48
160 0.41
161 0.34
162 0.28
163 0.28
164 0.25
165 0.25
166 0.22
167 0.23
168 0.24
169 0.24
170 0.25
171 0.23
172 0.26
173 0.25
174 0.23
175 0.23
176 0.22
177 0.23
178 0.25
179 0.31
180 0.32
181 0.37
182 0.39
183 0.38
184 0.39
185 0.38
186 0.35
187 0.28
188 0.23
189 0.23
190 0.2
191 0.18
192 0.16
193 0.15
194 0.16
195 0.15
196 0.13
197 0.08
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.1
215 0.09
216 0.09
217 0.1
218 0.11
219 0.12
220 0.12
221 0.13
222 0.12
223 0.13
224 0.15
225 0.15
226 0.15
227 0.14
228 0.15
229 0.16
230 0.2
231 0.21
232 0.22
233 0.25
234 0.34
235 0.38
236 0.39
237 0.42
238 0.42
239 0.41
240 0.4
241 0.36
242 0.3
243 0.27
244 0.27
245 0.22
246 0.18
247 0.16
248 0.14
249 0.14
250 0.1
251 0.08
252 0.06
253 0.06
254 0.05
255 0.06
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.04
264 0.05
265 0.06
266 0.1
267 0.14
268 0.17
269 0.17
270 0.17
271 0.17
272 0.24
273 0.28
274 0.3
275 0.3
276 0.32
277 0.34
278 0.34
279 0.34
280 0.29
281 0.26
282 0.22
283 0.19
284 0.15
285 0.13
286 0.13
287 0.14
288 0.14
289 0.13
290 0.12
291 0.12
292 0.15
293 0.15
294 0.15
295 0.16
296 0.15
297 0.14
298 0.14
299 0.13
300 0.11
301 0.1
302 0.13
303 0.11
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.11
309 0.15
310 0.18
311 0.26
312 0.34
313 0.39
314 0.48
315 0.51