FuNGI

Q5KDU5

Protein Details

Accession

Q5KDU5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
551-571	AVKAERSARRAEKKSHKETFS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
290-298	GGKKRHGKR
542-576	AEERKARKAAVKAERSARRAEKKSHKETFSTERKR

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0005634 C:nucleus GO:0030688 C:preribosome, small subunit precursor GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus
KEGG	cne:CNG02750 -
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPKGSIFRGPNAQHFQLVHRSQQDPLINDPEASQRVLKPMGRGNDSRKTEISLAELEATIDKSKIRANEGEAALYGITYDDSAYDYMQHLKPVGGPGGAVESFLIAAPSGGSGVASGMKGGKGKFKARADDEMFQLPDSVLPSRQEISVQEARARNEAIPLELQGLQPDMDPHLRQVLEALEDDAFVDDEDDDEGWFNQLVKGGERNEHEEVPWEFAEWGVDDSGKPVQRQAEQDGEREETWEDRFKAFKREQARVSEEPSEFDPEEMSEMADTVGSLTSNLADMMVRGGKKRHGKRGPSDASGMSMSSSSMFRNQGLRDLDDRFDKIERDYEYDDDEEEEEYEDWSDDDGTASIAASNFSVSSRFSLASHASRASTAVPPELSREDFNSIMDDFLENYEVVGRRLRPALGGTTMSGPEKLKVLRSAIEGEGDFKDDNRKRIKEIEKEEMGKGRTKLREEKVKIVGEEEQKWDVETILTTRTNTENHPALIRDPTRKIRTVPPPPAPPVQREEESEDDSGSETEREGGPRVTVARTKGESAEERKARKAAVKAERSARRAEKKSHKETFSTERKRQLKSHNKMVGDGRAADVPAGREGVFALR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.47
3	0.47
4	0.48
5	0.48
6	0.45
7	0.43
8	0.43
9	0.41
10	0.47
11	0.47
12	0.4
13	0.42
14	0.42
15	0.36
16	0.35
17	0.35
18	0.34
19	0.3
20	0.29
21	0.27
22	0.23
23	0.27
24	0.33
25	0.34
26	0.33
27	0.38
28	0.43
29	0.46
30	0.5
31	0.53
32	0.57
33	0.6
34	0.59
35	0.53
36	0.5
37	0.47
38	0.42
39	0.38
40	0.3
41	0.26
42	0.23
43	0.21
44	0.17
45	0.16
46	0.17
47	0.14
48	0.13
49	0.12
50	0.12
51	0.16
52	0.19
53	0.23
54	0.25
55	0.28
56	0.36
57	0.37
58	0.36
59	0.32
60	0.29
61	0.24
62	0.2
63	0.15
64	0.07
65	0.06
66	0.05
67	0.05
68	0.04
69	0.06
70	0.07
71	0.07
72	0.08
73	0.1
74	0.16
75	0.17
76	0.18
77	0.18
78	0.18
79	0.2
80	0.21
81	0.22
82	0.15
83	0.14
84	0.13
85	0.16
86	0.16
87	0.13
88	0.1
89	0.08
90	0.08
91	0.09
92	0.08
93	0.04
94	0.04
95	0.04
96	0.04
97	0.04
98	0.04
99	0.04
100	0.04
101	0.04
102	0.06
103	0.05
104	0.06
105	0.07
106	0.08
107	0.11
108	0.12
109	0.19
110	0.24
111	0.29
112	0.37
113	0.42
114	0.48
115	0.5
116	0.58
117	0.56
118	0.54
119	0.52
120	0.48
121	0.43
122	0.35
123	0.31
124	0.22
125	0.18
126	0.16
127	0.15
128	0.12
129	0.13
130	0.15
131	0.16
132	0.16
133	0.16
134	0.15
135	0.22
136	0.25
137	0.25
138	0.28
139	0.31
140	0.32
141	0.33
142	0.33
143	0.26
144	0.25
145	0.24
146	0.19
147	0.17
148	0.15
149	0.16
150	0.16
151	0.15
152	0.12
153	0.12
154	0.11
155	0.1
156	0.1
157	0.11
158	0.12
159	0.12
160	0.13
161	0.17
162	0.16
163	0.16
164	0.16
165	0.15
166	0.13
167	0.13
168	0.13
169	0.09
170	0.09
171	0.09
172	0.08
173	0.07
174	0.05
175	0.05
176	0.04
177	0.04
178	0.05
179	0.05
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.06
184	0.06
185	0.06
186	0.06
187	0.1
188	0.1
189	0.11
190	0.15
191	0.16
192	0.2
193	0.21
194	0.26
195	0.26
196	0.25
197	0.24
198	0.25
199	0.24
200	0.24
201	0.22
202	0.17
203	0.14
204	0.14
205	0.14
206	0.1
207	0.09
208	0.06
209	0.06
210	0.06
211	0.07
212	0.12
213	0.13
214	0.13
215	0.14
216	0.17
217	0.21
218	0.24
219	0.26
220	0.31
221	0.3
222	0.32
223	0.32
224	0.31
225	0.27
226	0.25
227	0.22
228	0.15
229	0.16
230	0.19
231	0.18
232	0.17
233	0.21
234	0.21
235	0.3
236	0.3
237	0.33
238	0.34
239	0.39
240	0.41
241	0.44
242	0.49
243	0.43
244	0.44
245	0.44
246	0.38
247	0.34
248	0.31
249	0.28
250	0.21
251	0.19
252	0.16
253	0.11
254	0.12
255	0.1
256	0.09
257	0.05
258	0.05
259	0.05
260	0.04
261	0.04
262	0.03
263	0.03
264	0.03
265	0.03
266	0.03
267	0.03
268	0.04
269	0.04
270	0.03
271	0.03
272	0.03
273	0.04
274	0.07
275	0.07
276	0.08
277	0.1
278	0.16
279	0.25
280	0.31
281	0.41
282	0.46
283	0.53
284	0.58
285	0.67
286	0.65
287	0.58
288	0.55
289	0.44
290	0.38
291	0.31
292	0.25
293	0.14
294	0.1
295	0.08
296	0.06
297	0.07
298	0.06
299	0.08
300	0.09
301	0.1
302	0.14
303	0.14
304	0.19
305	0.2
306	0.21
307	0.21
308	0.22
309	0.23
310	0.21
311	0.21
312	0.17
313	0.16
314	0.15
315	0.14
316	0.16
317	0.16
318	0.18
319	0.2
320	0.19
321	0.19
322	0.19
323	0.18
324	0.14
325	0.13
326	0.1
327	0.08
328	0.09
329	0.07
330	0.07
331	0.07
332	0.06
333	0.05
334	0.05
335	0.05
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.05
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.05
349	0.06
350	0.05
351	0.07
352	0.08
353	0.09
354	0.09
355	0.11
356	0.14
357	0.16
358	0.17
359	0.17
360	0.16
361	0.15
362	0.16
363	0.15
364	0.14
365	0.13
366	0.12
367	0.12
368	0.12
369	0.15
370	0.16
371	0.16
372	0.15
373	0.16
374	0.17
375	0.17
376	0.17
377	0.16
378	0.14
379	0.12
380	0.12
381	0.1
382	0.07
383	0.07
384	0.08
385	0.06
386	0.06
387	0.09
388	0.09
389	0.1
390	0.13
391	0.13
392	0.15
393	0.16
394	0.16
395	0.14
396	0.16
397	0.17
398	0.16
399	0.16
400	0.15
401	0.15
402	0.16
403	0.15
404	0.15
405	0.13
406	0.12
407	0.14
408	0.14
409	0.16
410	0.18
411	0.19
412	0.19
413	0.21
414	0.23
415	0.21
416	0.22
417	0.19
418	0.19
419	0.17
420	0.17
421	0.15
422	0.12
423	0.22
424	0.23
425	0.3
426	0.37
427	0.38
428	0.4
429	0.49
430	0.57
431	0.57
432	0.6
433	0.62
434	0.6
435	0.61
436	0.6
437	0.56
438	0.49
439	0.45
440	0.4
441	0.39
442	0.38
443	0.41
444	0.47
445	0.5
446	0.59
447	0.58
448	0.64
449	0.64
450	0.63
451	0.57
452	0.5
453	0.49
454	0.43
455	0.42
456	0.37
457	0.31
458	0.27
459	0.28
460	0.26
461	0.19
462	0.14
463	0.12
464	0.1
465	0.13
466	0.14
467	0.14
468	0.16
469	0.19
470	0.2
471	0.21
472	0.26
473	0.25
474	0.25
475	0.27
476	0.26
477	0.25
478	0.32
479	0.34
480	0.34
481	0.37
482	0.46
483	0.49
484	0.51
485	0.53
486	0.54
487	0.6
488	0.64
489	0.67
490	0.66
491	0.67
492	0.69
493	0.73
494	0.67
495	0.61
496	0.56
497	0.53
498	0.46
499	0.43
500	0.45
501	0.41
502	0.41
503	0.37
504	0.32
505	0.26
506	0.25
507	0.21
508	0.16
509	0.12
510	0.08
511	0.1
512	0.12
513	0.13
514	0.14
515	0.15
516	0.15
517	0.17
518	0.19
519	0.21
520	0.23
521	0.25
522	0.29
523	0.31
524	0.32
525	0.32
526	0.35
527	0.38
528	0.4
529	0.48
530	0.48
531	0.49
532	0.52
533	0.52
534	0.5
535	0.49
536	0.5
537	0.5
538	0.54
539	0.58
540	0.6
541	0.67
542	0.72
543	0.68
544	0.7
545	0.7
546	0.69
547	0.69
548	0.73
549	0.74
550	0.76
551	0.84
552	0.84
553	0.79
554	0.73
555	0.73
556	0.73
557	0.73
558	0.72
559	0.69
560	0.7
561	0.73
562	0.75
563	0.76
564	0.77
565	0.77
566	0.76
567	0.8
568	0.77
569	0.72
570	0.71
571	0.68
572	0.64
573	0.57
574	0.49
575	0.4
576	0.33
577	0.32
578	0.28
579	0.24
580	0.19
581	0.16
582	0.17
583	0.15
584	0.13

Q5KDU5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer