Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F4GVH9

Protein Details
Accession A0A0F4GVH9    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-49MARSRPAIYRKRSKPNDTRRATKPTVGGRKPPPTKKVKTKPNTYQCTSCHydrophilic
177-200QSHEAKRIPSPKKKSRFGKKWFGYHydrophilic
252-276LELIRKETKKCPNPKCGKAIEKNGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-40IYRKRSKPNDTRRATKPTVGGRKPPPTKKVKTK
182-196KRIPSPKKKSRFGKK
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 6.5, cyto_mito 6.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031127  E3_UB_ligase_RBR  
IPR002867  IBR_dom  
IPR044066  TRIAD_supradom  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF01485  IBR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51873  TRIAD  
CDD cd20335  BRcat_RBR  
Amino Acid Sequences MARSRPAIYRKRSKPNDTRRATKPTVGGRKPPPTKKVKTKPNTYQCTSCLSQRGAKAFPDSNPSIECQHLINTCTVCLRKWVQAQVEQGKTVVVPDGKQEEKEDGGEEEEDEEADEEEKTVLGIRCPECEKVMKSFDVQIAGTDKVFKRFDELERRHIGDSTPNWRWCLNPACDAGQSHEAKRIPSPKKKSRFGKKWFGYAVEPHGVEDKCVCVKCGAVACVVCDRPWHEGEKCAEYQERVKGRVEEEDRTLELIRKETKKCPNPKCGKAIEKNGGCPSMICSLCSTNFCWNCLHIWRLQEYCACHTPRH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.9
3 0.91
4 0.88
5 0.87
6 0.83
7 0.83
8 0.77
9 0.71
10 0.68
11 0.67
12 0.7
13 0.67
14 0.68
15 0.67
16 0.74
17 0.78
18 0.79
19 0.77
20 0.77
21 0.82
22 0.84
23 0.86
24 0.86
25 0.86
26 0.88
27 0.9
28 0.9
29 0.89
30 0.83
31 0.78
32 0.69
33 0.66
34 0.57
35 0.51
36 0.46
37 0.41
38 0.41
39 0.4
40 0.43
41 0.38
42 0.38
43 0.39
44 0.36
45 0.34
46 0.36
47 0.33
48 0.31
49 0.3
50 0.3
51 0.26
52 0.24
53 0.23
54 0.17
55 0.19
56 0.19
57 0.2
58 0.21
59 0.19
60 0.19
61 0.22
62 0.22
63 0.18
64 0.21
65 0.23
66 0.26
67 0.3
68 0.36
69 0.35
70 0.4
71 0.47
72 0.5
73 0.48
74 0.42
75 0.37
76 0.31
77 0.27
78 0.22
79 0.18
80 0.1
81 0.09
82 0.12
83 0.17
84 0.17
85 0.18
86 0.19
87 0.18
88 0.19
89 0.19
90 0.17
91 0.12
92 0.13
93 0.12
94 0.11
95 0.09
96 0.08
97 0.07
98 0.06
99 0.06
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.14
111 0.14
112 0.17
113 0.19
114 0.2
115 0.19
116 0.22
117 0.23
118 0.22
119 0.25
120 0.23
121 0.22
122 0.23
123 0.22
124 0.2
125 0.18
126 0.15
127 0.14
128 0.14
129 0.12
130 0.14
131 0.13
132 0.17
133 0.18
134 0.16
135 0.18
136 0.21
137 0.27
138 0.34
139 0.36
140 0.38
141 0.4
142 0.42
143 0.38
144 0.36
145 0.31
146 0.25
147 0.25
148 0.25
149 0.28
150 0.28
151 0.29
152 0.29
153 0.29
154 0.28
155 0.32
156 0.27
157 0.25
158 0.26
159 0.26
160 0.27
161 0.27
162 0.24
163 0.24
164 0.23
165 0.2
166 0.24
167 0.24
168 0.23
169 0.28
170 0.34
171 0.36
172 0.44
173 0.53
174 0.57
175 0.66
176 0.74
177 0.8
178 0.82
179 0.84
180 0.83
181 0.84
182 0.78
183 0.75
184 0.68
185 0.6
186 0.52
187 0.44
188 0.4
189 0.32
190 0.29
191 0.22
192 0.26
193 0.23
194 0.21
195 0.19
196 0.17
197 0.17
198 0.18
199 0.18
200 0.13
201 0.13
202 0.16
203 0.19
204 0.17
205 0.15
206 0.15
207 0.16
208 0.19
209 0.2
210 0.17
211 0.16
212 0.17
213 0.19
214 0.21
215 0.24
216 0.21
217 0.27
218 0.3
219 0.34
220 0.33
221 0.32
222 0.32
223 0.29
224 0.33
225 0.35
226 0.36
227 0.33
228 0.35
229 0.35
230 0.35
231 0.41
232 0.41
233 0.35
234 0.34
235 0.35
236 0.32
237 0.32
238 0.31
239 0.26
240 0.24
241 0.26
242 0.3
243 0.34
244 0.38
245 0.45
246 0.55
247 0.6
248 0.69
249 0.73
250 0.76
251 0.8
252 0.83
253 0.83
254 0.81
255 0.82
256 0.8
257 0.8
258 0.79
259 0.73
260 0.71
261 0.67
262 0.59
263 0.49
264 0.4
265 0.34
266 0.32
267 0.29
268 0.24
269 0.22
270 0.25
271 0.27
272 0.29
273 0.29
274 0.31
275 0.32
276 0.33
277 0.32
278 0.3
279 0.32
280 0.35
281 0.35
282 0.29
283 0.32
284 0.36
285 0.36
286 0.38
287 0.37
288 0.37
289 0.4
290 0.44