Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P0CR20

Protein Details
Accession P0CR20    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
253-284GGKTAVKKLVEKKRKKLASKEKKSRPFAKGAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
209-238KAKKEEREKRTQGKAAWFMKKGESPKCEKK
250-296EKQGGKTAVKKLVEKKRKKLASKEKKSRPFAKGAEGMGRDTKRRRVA
Subcellular Location(s) mito 17.5, mito_nucl 13.5, nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009292  RRP36  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0000469  P:cleavage involved in rRNA processing  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF06102  RRP36  
Amino Acid Sequences MFADLNSLPLSTLAKAQKSLSRKSSSSSSNGRSKEEKLALMKSKLAQMQRSKGKAVAVPDTDSHRFGSRAQESDEESDSGPETTSSTKRGSKHAPAALSTKKQVSRKRQVIEVPKPERRDPRFSSVSAGHANADLHSKSYSFLPDLLRQEFSGLKEAVAAAKKAEKNCPWAEKPMRTAERERLEVQMGQVRTKLVRTEKEAMEREVLAKAKKEEREKRTQGKAAWFMKKGESPKCEKKDLLLKARFETLEKQGGKTAVKKLVEKKRKKLASKEKKSRPFAKGAEGMGRDTKRRRVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.25
3 0.28
4 0.34
5 0.38
6 0.46
7 0.47
8 0.49
9 0.47
10 0.5
11 0.54
12 0.52
13 0.54
14 0.54
15 0.53
16 0.55
17 0.56
18 0.57
19 0.54
20 0.52
21 0.54
22 0.49
23 0.47
24 0.43
25 0.49
26 0.5
27 0.48
28 0.48
29 0.41
30 0.42
31 0.42
32 0.42
33 0.41
34 0.43
35 0.5
36 0.55
37 0.56
38 0.53
39 0.5
40 0.49
41 0.44
42 0.4
43 0.38
44 0.31
45 0.3
46 0.3
47 0.34
48 0.33
49 0.31
50 0.29
51 0.24
52 0.23
53 0.22
54 0.3
55 0.28
56 0.29
57 0.3
58 0.31
59 0.32
60 0.34
61 0.34
62 0.25
63 0.21
64 0.19
65 0.17
66 0.14
67 0.12
68 0.09
69 0.09
70 0.11
71 0.13
72 0.15
73 0.19
74 0.23
75 0.25
76 0.32
77 0.37
78 0.41
79 0.47
80 0.48
81 0.45
82 0.43
83 0.46
84 0.45
85 0.42
86 0.37
87 0.34
88 0.35
89 0.41
90 0.48
91 0.52
92 0.58
93 0.63
94 0.63
95 0.63
96 0.65
97 0.68
98 0.68
99 0.68
100 0.65
101 0.62
102 0.63
103 0.63
104 0.65
105 0.61
106 0.6
107 0.55
108 0.55
109 0.53
110 0.5
111 0.49
112 0.41
113 0.39
114 0.31
115 0.27
116 0.19
117 0.16
118 0.16
119 0.12
120 0.13
121 0.1
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.1
128 0.08
129 0.11
130 0.12
131 0.17
132 0.19
133 0.2
134 0.2
135 0.19
136 0.19
137 0.18
138 0.17
139 0.16
140 0.13
141 0.12
142 0.11
143 0.11
144 0.12
145 0.12
146 0.11
147 0.08
148 0.13
149 0.16
150 0.17
151 0.23
152 0.23
153 0.28
154 0.32
155 0.38
156 0.34
157 0.41
158 0.45
159 0.43
160 0.45
161 0.48
162 0.48
163 0.45
164 0.47
165 0.46
166 0.44
167 0.44
168 0.41
169 0.34
170 0.32
171 0.29
172 0.27
173 0.24
174 0.2
175 0.18
176 0.17
177 0.16
178 0.15
179 0.16
180 0.19
181 0.19
182 0.23
183 0.28
184 0.34
185 0.35
186 0.43
187 0.44
188 0.41
189 0.37
190 0.34
191 0.29
192 0.26
193 0.26
194 0.19
195 0.2
196 0.22
197 0.27
198 0.33
199 0.42
200 0.48
201 0.54
202 0.63
203 0.69
204 0.73
205 0.75
206 0.75
207 0.69
208 0.68
209 0.69
210 0.66
211 0.65
212 0.58
213 0.52
214 0.5
215 0.51
216 0.48
217 0.47
218 0.45
219 0.47
220 0.55
221 0.59
222 0.6
223 0.55
224 0.56
225 0.58
226 0.61
227 0.63
228 0.59
229 0.56
230 0.53
231 0.57
232 0.51
233 0.44
234 0.4
235 0.35
236 0.37
237 0.35
238 0.34
239 0.33
240 0.36
241 0.37
242 0.38
243 0.39
244 0.38
245 0.41
246 0.46
247 0.52
248 0.6
249 0.67
250 0.71
251 0.74
252 0.77
253 0.83
254 0.85
255 0.86
256 0.87
257 0.87
258 0.89
259 0.91
260 0.91
261 0.91
262 0.92
263 0.91
264 0.86
265 0.84
266 0.76
267 0.74
268 0.69
269 0.62
270 0.61
271 0.53
272 0.5
273 0.48
274 0.47
275 0.46
276 0.46