FuNGI

A0A0F4GKD7

Protein Details

Accession

A0A0F4GKD7

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
131-152	AEDKENQKTNKSRQKKLAELGF	Hydrophilic
715-738	TELGPAGKKERKKREGRPKGETGG	Basic
927-948	KIQMAGEKRKRDKQEELKKAEE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
180-183	GRRR
219-230	RKPGRARAKSGK
591-638	PPKRRAKKETPPPASPPPPPETPPYEARKRPIEKKVQIKAGRRAIRKP
700-734	RAGRKAKDKAGNSSETELGPAGKKERKKREGRPKG
933-957	EKRKRDKQEELKKAEEAKKGKKGGK

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 11, cyto 8.5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR034104 Lsm1 IPR010920 LSM_dom_sf IPR044642 PTHR15588 IPR047575 Sm IPR001163 Sm_dom_euk/arc
Gene Ontology	GO:0000932 C:P-body GO:1990904 C:ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0006397 P:mRNA processing GO:0000956 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process
Pfam	View protein in Pfam PF01423 LSM
PROSITE	View protein in PROSITE PS52002 SM
CDD	cd01728 LSm1

Amino Acid Sequences

MENLSLHDAGPPGGPGMQTGPPPVPQLPPQMFTTAAQLLDLTDKKLLVSLRDGRKLIGVLRSWDQFGNLVLQDTIERFFVKNLYADIERGLFLVRGENVLLLGEIDLDKDEYVPAPYEAAPVETVFAMKKAEDKENQKTNKSRQKKLAELGFEGEHAGEPQKKRTMAKASASDAPTRSSGRRRKPTIAADTIAVKQKLSSITISDSSDELVAPDVGPSRKPGRARAKSGKAPMISAASKSMDDDAVEEYQFTDGDYYYTDEEEGDDWEDTMSVISLSSSDSNDGVGLDERPWSDFSTEMRRQWEFMYAEVTVRQLSNDWEVTEYYQLQKDNEMLRYMEDFPLPQWLIPQEVAQQAYFRLLERTRWRGQGMPIYGRHVHPSEFAPGGTAVSSTLQPLVASQHQIFNEPARSAPPSAKRSEKEDQSSQQRLEQKPVSVPPQQPRQSTAHNDEPTTQSQGKDLVRQIQHEQQQFQPKHPQAQTQLPPPPAQHHGGPSMMHPQQMHMNPQQFHQQQQMHQQQMHHQHMMLQQQMHPPMGPLPPHLQHPPQNPPYPFHLGYYPGMGRPGGMPPNVPFGMQQTYSPMPPSAQQAPEPPKRRAKKETPPPASPPPPPETPPYEARKRPIEKKVQIKAGRRAIRKPAEAEDFPWARQIDYKAEKEKATWDLSIYDPETLRQMEATRQRNIPVIDDIDTKIQEQQRMARAGRKAKDKAGNSSETELGPAGKKERKKREGRPKGETGGDPYHSGNFAYVGPEDEAIAKKLGYELPDDLLDAAEEGKIDPGVQATIKICWNPGKKGMTENLEQGKFSVRDTIATRKQLDERPILTRVAAECIVDFCPDMLWRSMLLRITSEAGYGNKDVRDRFCYNGCYCDKATITKRISAALGQKQTQPKSKGYQPGEWEWYDENVKDFSKYIDFFGMRTSHRNMLKIQMAGEKRKRDKQEELKKAEEAKKGKKGGKDGEDGQDEDGDDNKQGDGDVMDVDGEDEPVEADVDGDAADGSGDESDDSNAVSAQDSDILDKMED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.11
3	0.14
4	0.17
5	0.17
6	0.2
7	0.21
8	0.22
9	0.26
10	0.27
11	0.28
12	0.29
13	0.37
14	0.38
15	0.39
16	0.39
17	0.37
18	0.37
19	0.33
20	0.34
21	0.27
22	0.22
23	0.19
24	0.17
25	0.16
26	0.21
27	0.21
28	0.18
29	0.17
30	0.17
31	0.17
32	0.21
33	0.21
34	0.18
35	0.25
36	0.32
37	0.39
38	0.46
39	0.47
40	0.44
41	0.46
42	0.45
43	0.4
44	0.38
45	0.32
46	0.3
47	0.34
48	0.35
49	0.34
50	0.32
51	0.29
52	0.23
53	0.21
54	0.22
55	0.17
56	0.17
57	0.15
58	0.15
59	0.15
60	0.15
61	0.15
62	0.12
63	0.13
64	0.12
65	0.14
66	0.15
67	0.16
68	0.17
69	0.17
70	0.2
71	0.2
72	0.2
73	0.2
74	0.19
75	0.18
76	0.16
77	0.16
78	0.12
79	0.11
80	0.14
81	0.13
82	0.13
83	0.13
84	0.12
85	0.11
86	0.11
87	0.11
88	0.07
89	0.06
90	0.06
91	0.06
92	0.06
93	0.06
94	0.07
95	0.07
96	0.07
97	0.08
98	0.08
99	0.1
100	0.11
101	0.11
102	0.12
103	0.12
104	0.14
105	0.13
106	0.14
107	0.13
108	0.11
109	0.12
110	0.1
111	0.11
112	0.09
113	0.1
114	0.1
115	0.09
116	0.14
117	0.18
118	0.25
119	0.32
120	0.39
121	0.48
122	0.57
123	0.63
124	0.66
125	0.7
126	0.74
127	0.77
128	0.78
129	0.78
130	0.78
131	0.81
132	0.81
133	0.81
134	0.77
135	0.71
136	0.64
137	0.58
138	0.48
139	0.39
140	0.32
141	0.24
142	0.16
143	0.13
144	0.14
145	0.17
146	0.18
147	0.25
148	0.3
149	0.34
150	0.36
151	0.43
152	0.49
153	0.5
154	0.56
155	0.56
156	0.53
157	0.56
158	0.56
159	0.52
160	0.44
161	0.39
162	0.34
163	0.31
164	0.33
165	0.36
166	0.43
167	0.5
168	0.6
169	0.64
170	0.69
171	0.74
172	0.78
173	0.77
174	0.72
175	0.63
176	0.54
177	0.51
178	0.47
179	0.45
180	0.36
181	0.27
182	0.21
183	0.23
184	0.24
185	0.22
186	0.2
187	0.16
188	0.19
189	0.22
190	0.23
191	0.2
192	0.18
193	0.17
194	0.16
195	0.13
196	0.1
197	0.09
198	0.08
199	0.07
200	0.08
201	0.11
202	0.12
203	0.12
204	0.17
205	0.2
206	0.25
207	0.28
208	0.37
209	0.44
210	0.52
211	0.61
212	0.67
213	0.72
214	0.74
215	0.78
216	0.74
217	0.64
218	0.56
219	0.48
220	0.43
221	0.35
222	0.28
223	0.24
224	0.19
225	0.18
226	0.18
227	0.17
228	0.12
229	0.11
230	0.12
231	0.11
232	0.11
233	0.11
234	0.11
235	0.1
236	0.1
237	0.09
238	0.08
239	0.07
240	0.06
241	0.06
242	0.07
243	0.08
244	0.09
245	0.09
246	0.09
247	0.08
248	0.09
249	0.09
250	0.09
251	0.09
252	0.08
253	0.08
254	0.08
255	0.08
256	0.07
257	0.07
258	0.06
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.05
264	0.06
265	0.07
266	0.08
267	0.08
268	0.08
269	0.08
270	0.08
271	0.08
272	0.08
273	0.08
274	0.08
275	0.09
276	0.09
277	0.11
278	0.12
279	0.12
280	0.12
281	0.13
282	0.16
283	0.24
284	0.28
285	0.3
286	0.33
287	0.32
288	0.33
289	0.32
290	0.36
291	0.27
292	0.23
293	0.23
294	0.18
295	0.19
296	0.18
297	0.18
298	0.11
299	0.1
300	0.1
301	0.08
302	0.1
303	0.12
304	0.13
305	0.13
306	0.13
307	0.13
308	0.14
309	0.15
310	0.15
311	0.13
312	0.15
313	0.16
314	0.15
315	0.16
316	0.19
317	0.21
318	0.22
319	0.21
320	0.18
321	0.18
322	0.21
323	0.21
324	0.19
325	0.15
326	0.14
327	0.12
328	0.18
329	0.17
330	0.14
331	0.14
332	0.13
333	0.15
334	0.15
335	0.16
336	0.12
337	0.15
338	0.16
339	0.14
340	0.14
341	0.12
342	0.14
343	0.13
344	0.11
345	0.13
346	0.13
347	0.19
348	0.25
349	0.32
350	0.34
351	0.37
352	0.38
353	0.37
354	0.4
355	0.4
356	0.37
357	0.36
358	0.33
359	0.35
360	0.35
361	0.32
362	0.32
363	0.26
364	0.23
365	0.19
366	0.2
367	0.19
368	0.17
369	0.16
370	0.14
371	0.13
372	0.12
373	0.1
374	0.09
375	0.06
376	0.06
377	0.06
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.09
384	0.09
385	0.12
386	0.12
387	0.15
388	0.16
389	0.18
390	0.18
391	0.17
392	0.18
393	0.16
394	0.16
395	0.14
396	0.15
397	0.15
398	0.2
399	0.25
400	0.27
401	0.31
402	0.37
403	0.37
404	0.42
405	0.48
406	0.48
407	0.46
408	0.47
409	0.5
410	0.52
411	0.55
412	0.48
413	0.47
414	0.49
415	0.44
416	0.44
417	0.4
418	0.33
419	0.32
420	0.34
421	0.34
422	0.32
423	0.36
424	0.36
425	0.44
426	0.47
427	0.45
428	0.46
429	0.45
430	0.44
431	0.45
432	0.45
433	0.43
434	0.4
435	0.4
436	0.38
437	0.37
438	0.33
439	0.33
440	0.28
441	0.19
442	0.18
443	0.23
444	0.22
445	0.23
446	0.23
447	0.25
448	0.25
449	0.27
450	0.29
451	0.31
452	0.36
453	0.34
454	0.34
455	0.32
456	0.4
457	0.39
458	0.39
459	0.42
460	0.38
461	0.43
462	0.42
463	0.42
464	0.37
465	0.44
466	0.45
467	0.42
468	0.45
469	0.39
470	0.38
471	0.35
472	0.34
473	0.28
474	0.27
475	0.22
476	0.19
477	0.19
478	0.19
479	0.19
480	0.16
481	0.19
482	0.18
483	0.18
484	0.16
485	0.16
486	0.2
487	0.21
488	0.25
489	0.23
490	0.27
491	0.26
492	0.27
493	0.35
494	0.3
495	0.3
496	0.33
497	0.31
498	0.28
499	0.38
500	0.43
501	0.37
502	0.38
503	0.37
504	0.36
505	0.42
506	0.43
507	0.34
508	0.27
509	0.28
510	0.3
511	0.32
512	0.28
513	0.2
514	0.19
515	0.21
516	0.23
517	0.19
518	0.16
519	0.13
520	0.14
521	0.15
522	0.13
523	0.12
524	0.15
525	0.16
526	0.19
527	0.21
528	0.22
529	0.26
530	0.3
531	0.37
532	0.39
533	0.44
534	0.42
535	0.42
536	0.43
537	0.44
538	0.4
539	0.32
540	0.28
541	0.24
542	0.24
543	0.24
544	0.19
545	0.13
546	0.13
547	0.12
548	0.11
549	0.09
550	0.12
551	0.11
552	0.11
553	0.11
554	0.12
555	0.17
556	0.17
557	0.16
558	0.14
559	0.14
560	0.16
561	0.16
562	0.15
563	0.14
564	0.15
565	0.15
566	0.16
567	0.14
568	0.12
569	0.13
570	0.17
571	0.17
572	0.17
573	0.18
574	0.24
575	0.31
576	0.39
577	0.43
578	0.44
579	0.5
580	0.55
581	0.61
582	0.63
583	0.65
584	0.67
585	0.73
586	0.78
587	0.76
588	0.74
589	0.73
590	0.72
591	0.67
592	0.59
593	0.53
594	0.47
595	0.43
596	0.41
597	0.39
598	0.36
599	0.35
600	0.39
601	0.41
602	0.44
603	0.44
604	0.47
605	0.52
606	0.54
607	0.58
608	0.6
609	0.63
610	0.63
611	0.7
612	0.72
613	0.72
614	0.73
615	0.72
616	0.72
617	0.71
618	0.71
619	0.64
620	0.62
621	0.62
622	0.61
623	0.57
624	0.51
625	0.47
626	0.45
627	0.42
628	0.39
629	0.37
630	0.31
631	0.28
632	0.3
633	0.25
634	0.19
635	0.22
636	0.22
637	0.23
638	0.27
639	0.32
640	0.33
641	0.36
642	0.36
643	0.34
644	0.35
645	0.32
646	0.29
647	0.25
648	0.2
649	0.19
650	0.2
651	0.22
652	0.18
653	0.16
654	0.13
655	0.13
656	0.15
657	0.13
658	0.12
659	0.11
660	0.11
661	0.16
662	0.24
663	0.29
664	0.31
665	0.32
666	0.33
667	0.37
668	0.36
669	0.32
670	0.26
671	0.23
672	0.2
673	0.21
674	0.2
675	0.18
676	0.18
677	0.16
678	0.19
679	0.19
680	0.2
681	0.2
682	0.25
683	0.29
684	0.34
685	0.34
686	0.35
687	0.39
688	0.44
689	0.48
690	0.51
691	0.49
692	0.51
693	0.58
694	0.55
695	0.57
696	0.55
697	0.53
698	0.46
699	0.46
700	0.4
701	0.31
702	0.29
703	0.21
704	0.17
705	0.14
706	0.13
707	0.17
708	0.21
709	0.27
710	0.37
711	0.47
712	0.56
713	0.65
714	0.74
715	0.8
716	0.86
717	0.87
718	0.86
719	0.81
720	0.76
721	0.7
722	0.6
723	0.55
724	0.48
725	0.41
726	0.35
727	0.29
728	0.26
729	0.22
730	0.21
731	0.15
732	0.11
733	0.1
734	0.1
735	0.09
736	0.1
737	0.1
738	0.1
739	0.1
740	0.11
741	0.12
742	0.12
743	0.12
744	0.1
745	0.09
746	0.11
747	0.12
748	0.11
749	0.13
750	0.13
751	0.14
752	0.14
753	0.14
754	0.13
755	0.11
756	0.1
757	0.07
758	0.06
759	0.05
760	0.05
761	0.05
762	0.05
763	0.05
764	0.05
765	0.05
766	0.06
767	0.07
768	0.07
769	0.09
770	0.1
771	0.12
772	0.14
773	0.14
774	0.16
775	0.23
776	0.28
777	0.29
778	0.35
779	0.37
780	0.36
781	0.41
782	0.45
783	0.41
784	0.39
785	0.42
786	0.42
787	0.39
788	0.38
789	0.33
790	0.34
791	0.29
792	0.27
793	0.28
794	0.2
795	0.23
796	0.27
797	0.36
798	0.36
799	0.42
800	0.43
801	0.4
802	0.46
803	0.48
804	0.5
805	0.47
806	0.43
807	0.42
808	0.43
809	0.4
810	0.34
811	0.3
812	0.26
813	0.23
814	0.2
815	0.16
816	0.14
817	0.15
818	0.16
819	0.13
820	0.12
821	0.08
822	0.09
823	0.1
824	0.12
825	0.11
826	0.11
827	0.12
828	0.13
829	0.16
830	0.18
831	0.18
832	0.17
833	0.17
834	0.19
835	0.18
836	0.17
837	0.16
838	0.14
839	0.16
840	0.17
841	0.18
842	0.18
843	0.21
844	0.24
845	0.26
846	0.33
847	0.33
848	0.36
849	0.38
850	0.42
851	0.41
852	0.47
853	0.45
854	0.42
855	0.4
856	0.41
857	0.37
858	0.39
859	0.43
860	0.44
861	0.45
862	0.44
863	0.44
864	0.41
865	0.4
866	0.37
867	0.4
868	0.38
869	0.41
870	0.38
871	0.44
872	0.5
873	0.54
874	0.59
875	0.55
876	0.52
877	0.53
878	0.59
879	0.63
880	0.6
881	0.62
882	0.59
883	0.61
884	0.61
885	0.55
886	0.5
887	0.41
888	0.4
889	0.35
890	0.3
891	0.25
892	0.22
893	0.23
894	0.21
895	0.2
896	0.19
897	0.22
898	0.22
899	0.22
900	0.27
901	0.26
902	0.25
903	0.3
904	0.32
905	0.28
906	0.32
907	0.35
908	0.35
909	0.38
910	0.41
911	0.38
912	0.41
913	0.44
914	0.41
915	0.39
916	0.39
917	0.42
918	0.49
919	0.55
920	0.57
921	0.6
922	0.67
923	0.73
924	0.72
925	0.77
926	0.78
927	0.82
928	0.82
929	0.82
930	0.77
931	0.73
932	0.75
933	0.72
934	0.69
935	0.67
936	0.65
937	0.67
938	0.71
939	0.72
940	0.69
941	0.71
942	0.72
943	0.7
944	0.68
945	0.64
946	0.63
947	0.61
948	0.56
949	0.48
950	0.4
951	0.33
952	0.27
953	0.24
954	0.17
955	0.14
956	0.14
957	0.13
958	0.11
959	0.1
960	0.1
961	0.09
962	0.09
963	0.08
964	0.07
965	0.07
966	0.07
967	0.08
968	0.07
969	0.07
970	0.06
971	0.06
972	0.06
973	0.06
974	0.07
975	0.06
976	0.06
977	0.05
978	0.05
979	0.05
980	0.05
981	0.05
982	0.04
983	0.04
984	0.04
985	0.04
986	0.04
987	0.05
988	0.05
989	0.06
990	0.07
991	0.08
992	0.08
993	0.08
994	0.08
995	0.08
996	0.09
997	0.09
998	0.09
999	0.12
1000	0.12
1001	0.14
1002	0.15

A0A0F4GKD7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer