Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KDR1

Protein Details
Accession Q5KDR1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
570-596DVMSGEMKKRARKDDKRGKEKAEKFKFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-48AKSRGALKRLKAKARAGGGGGKG
577-596KKRARKDDKRGKEKAEKFKF
Subcellular Location(s) mito 12, cyto_nucl 8.5, nucl 8, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007180  DUF382  
IPR006568  PSP_pro-rich  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0005689  C:U12-type spliceosomal complex  
GO:0005686  C:U2 snRNP  
GO:0005684  C:U2-type spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG cne:CNG03090  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04037  DUF382  
PF04046  PSP  
Amino Acid Sequences MPTPSITTNGTGPHTTVATPVKSSAAKSRGALKRLKAKARAGGGGGKGSNRMSETPTDTESEAESTTSTVDLSTLEIDPSDPRFSAFSNIFAHFQGGEGDEIAEQLAGPAKGEIYYSDEEDDDQEAKENAVKRAQEQEGLTRRQRRQAAKLTVAELKQLVDRPEVVDWYDCDARDPRLLVNLKSHRNTVPVPNHWNAKRDYLAGKRGIEKPPYLLPSWIAETGIGEQRDAVKAKEAEQSLRQKTRERVQPKMGKIDIDYQKLHDAFFKFQGKPSMSKFGEAYYEGKELETDLRTKKPGELSQELIEALSIPPLAPPPWLIAMQRFGPPPSYPNLRIRGLNAPIPPGAQWGFHPGGWGKPPMDDFNRPLYGDVFGVLQGAEIAHQNEVDRSLWGEIEHVEEESEEESEEEEEEEEEEAEKPAANVPADGLETPSGLATPSGYNSVVSTVPGGLETPDFMDLRKNTRAQAEDVPSGPKELYQVIPERETTSRGLMGSSTAYDIGAVGKGSGIAVLGAEDSGRKRKAGDVDISIDTDEELTQEQLRAKYEASRTQQNRVYVPGADADRSGFDDVMSGEMKKRARKDDKRGKEKAEKFKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.2
3 0.23
4 0.25
5 0.23
6 0.24
7 0.24
8 0.26
9 0.27
10 0.3
11 0.34
12 0.32
13 0.34
14 0.34
15 0.43
16 0.46
17 0.51
18 0.54
19 0.53
20 0.59
21 0.65
22 0.72
23 0.69
24 0.68
25 0.7
26 0.69
27 0.64
28 0.57
29 0.54
30 0.47
31 0.44
32 0.39
33 0.32
34 0.29
35 0.27
36 0.26
37 0.23
38 0.23
39 0.21
40 0.25
41 0.29
42 0.3
43 0.31
44 0.31
45 0.28
46 0.27
47 0.25
48 0.22
49 0.17
50 0.14
51 0.12
52 0.1
53 0.1
54 0.1
55 0.08
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.07
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.09
64 0.1
65 0.12
66 0.15
67 0.16
68 0.14
69 0.15
70 0.16
71 0.17
72 0.23
73 0.21
74 0.22
75 0.24
76 0.26
77 0.26
78 0.25
79 0.25
80 0.19
81 0.18
82 0.15
83 0.12
84 0.11
85 0.09
86 0.1
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.06
91 0.05
92 0.05
93 0.08
94 0.07
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.09
100 0.09
101 0.11
102 0.13
103 0.14
104 0.15
105 0.15
106 0.15
107 0.16
108 0.17
109 0.13
110 0.11
111 0.12
112 0.11
113 0.12
114 0.15
115 0.18
116 0.18
117 0.22
118 0.23
119 0.24
120 0.31
121 0.32
122 0.33
123 0.3
124 0.37
125 0.4
126 0.45
127 0.5
128 0.51
129 0.53
130 0.57
131 0.63
132 0.61
133 0.62
134 0.66
135 0.68
136 0.66
137 0.65
138 0.6
139 0.57
140 0.51
141 0.43
142 0.33
143 0.25
144 0.21
145 0.21
146 0.2
147 0.16
148 0.17
149 0.17
150 0.17
151 0.17
152 0.16
153 0.14
154 0.13
155 0.17
156 0.18
157 0.16
158 0.18
159 0.19
160 0.2
161 0.21
162 0.21
163 0.17
164 0.23
165 0.26
166 0.24
167 0.32
168 0.37
169 0.42
170 0.43
171 0.45
172 0.38
173 0.39
174 0.41
175 0.4
176 0.41
177 0.4
178 0.45
179 0.45
180 0.52
181 0.5
182 0.52
183 0.45
184 0.41
185 0.36
186 0.33
187 0.36
188 0.34
189 0.37
190 0.37
191 0.37
192 0.38
193 0.42
194 0.44
195 0.41
196 0.36
197 0.33
198 0.34
199 0.34
200 0.3
201 0.25
202 0.22
203 0.21
204 0.22
205 0.19
206 0.14
207 0.11
208 0.11
209 0.13
210 0.16
211 0.13
212 0.11
213 0.11
214 0.12
215 0.15
216 0.15
217 0.13
218 0.15
219 0.15
220 0.18
221 0.23
222 0.22
223 0.22
224 0.28
225 0.36
226 0.38
227 0.43
228 0.42
229 0.43
230 0.47
231 0.53
232 0.56
233 0.52
234 0.52
235 0.57
236 0.62
237 0.59
238 0.62
239 0.54
240 0.46
241 0.42
242 0.45
243 0.4
244 0.36
245 0.33
246 0.27
247 0.31
248 0.3
249 0.28
250 0.23
251 0.2
252 0.18
253 0.24
254 0.28
255 0.24
256 0.26
257 0.32
258 0.3
259 0.32
260 0.33
261 0.36
262 0.31
263 0.31
264 0.3
265 0.24
266 0.24
267 0.22
268 0.21
269 0.13
270 0.14
271 0.13
272 0.12
273 0.11
274 0.1
275 0.11
276 0.11
277 0.11
278 0.13
279 0.15
280 0.17
281 0.17
282 0.19
283 0.22
284 0.24
285 0.27
286 0.28
287 0.28
288 0.28
289 0.28
290 0.25
291 0.2
292 0.17
293 0.11
294 0.08
295 0.05
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.06
304 0.08
305 0.09
306 0.09
307 0.1
308 0.12
309 0.14
310 0.16
311 0.15
312 0.14
313 0.15
314 0.15
315 0.15
316 0.17
317 0.21
318 0.22
319 0.27
320 0.32
321 0.32
322 0.32
323 0.33
324 0.35
325 0.32
326 0.32
327 0.27
328 0.24
329 0.22
330 0.22
331 0.19
332 0.15
333 0.13
334 0.1
335 0.1
336 0.14
337 0.15
338 0.14
339 0.16
340 0.14
341 0.16
342 0.17
343 0.19
344 0.13
345 0.14
346 0.16
347 0.18
348 0.22
349 0.23
350 0.24
351 0.29
352 0.3
353 0.29
354 0.28
355 0.24
356 0.21
357 0.17
358 0.15
359 0.09
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.05
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.06
371 0.06
372 0.07
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.09
379 0.08
380 0.09
381 0.08
382 0.1
383 0.1
384 0.09
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.05
391 0.05
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.05
397 0.05
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.07
405 0.07
406 0.07
407 0.09
408 0.11
409 0.11
410 0.1
411 0.1
412 0.11
413 0.12
414 0.12
415 0.1
416 0.08
417 0.08
418 0.08
419 0.07
420 0.06
421 0.06
422 0.05
423 0.05
424 0.06
425 0.07
426 0.09
427 0.09
428 0.09
429 0.09
430 0.11
431 0.1
432 0.1
433 0.1
434 0.08
435 0.08
436 0.08
437 0.08
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.07
442 0.09
443 0.09
444 0.09
445 0.15
446 0.17
447 0.22
448 0.28
449 0.29
450 0.29
451 0.35
452 0.37
453 0.34
454 0.4
455 0.39
456 0.36
457 0.36
458 0.36
459 0.31
460 0.3
461 0.26
462 0.19
463 0.15
464 0.15
465 0.15
466 0.17
467 0.23
468 0.24
469 0.26
470 0.26
471 0.28
472 0.27
473 0.28
474 0.25
475 0.22
476 0.21
477 0.19
478 0.19
479 0.15
480 0.15
481 0.14
482 0.13
483 0.11
484 0.09
485 0.09
486 0.08
487 0.08
488 0.08
489 0.08
490 0.07
491 0.06
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.06
496 0.05
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.06
504 0.09
505 0.17
506 0.18
507 0.18
508 0.2
509 0.26
510 0.33
511 0.38
512 0.41
513 0.39
514 0.43
515 0.44
516 0.43
517 0.37
518 0.3
519 0.23
520 0.17
521 0.12
522 0.08
523 0.08
524 0.09
525 0.1
526 0.13
527 0.17
528 0.18
529 0.21
530 0.22
531 0.22
532 0.28
533 0.33
534 0.39
535 0.41
536 0.49
537 0.5
538 0.57
539 0.62
540 0.59
541 0.55
542 0.51
543 0.48
544 0.38
545 0.36
546 0.33
547 0.3
548 0.26
549 0.24
550 0.2
551 0.19
552 0.2
553 0.2
554 0.15
555 0.12
556 0.13
557 0.13
558 0.15
559 0.15
560 0.13
561 0.15
562 0.21
563 0.26
564 0.32
565 0.39
566 0.47
567 0.57
568 0.66
569 0.74
570 0.8
571 0.86
572 0.9
573 0.91
574 0.9
575 0.9
576 0.89