Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F4GLM2

Protein Details
Accession A0A0F4GLM2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
194-224KAVVKHKSKAKDRSRKHRHHHRSRKEDGDKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
196-219VVKHKSKAKDRSRKHRHHHRSRKE
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001715  CH_dom  
IPR036872  CH_dom_sf  
IPR004953  EB1_C  
IPR036133  EB1_C_sf  
IPR027328  MAPRE  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR045844  RRM_Ist3-like  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005874  C:microtubule  
GO:0008017  F:microtubule binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0051301  P:cell division  
GO:0016043  P:cellular component organization  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00307  CH  
PF03271  EB1  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50021  CH  
PS51230  EB1_C  
PS50102  RRM  
CDD cd12411  RRM_ist3_like  
Amino Acid Sequences MQSIRQIERLNQIELEKVIPSNASWHTDYRDTAYLYIGGLPFELSEGDILTIFSQYGNPVHINLVRDKETGKSRGFCFLKYEDQRSCDLAVDNLSGAGVMGKVLSVDHTRYKKKEGEVEGIGDEEADEVDDTDKEGDDRRKRRRTASISESEEERPLIKEEIELAKLIKDIEEDDPMKEFLVKEKRAEVEEALKAVVKHKSKAKDRSRKHRHHHRSRKEDGDKESRDKQELLQWLNGLLQLNLTKVEQCGTGAALCQIYDSIFLDVPMGRVKFNVNAEYAYLENFKILSNTFRKHHVDRPIPVEMLVKCKMQDNLEFLQWSKRYWDQYYPGGDYDAVSRRKGLGAGAAPALPPTSRAPAAAATARRPAGGAAAPRSGSRQAAPASSLLQQKNAELTETVQGLERERDFYFSKLRDIELLIQQAMDADPALEEDEGSLLKQIQTILYSTEEGFEIPQEADGELAGEEETF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.31
3 0.23
4 0.19
5 0.17
6 0.15
7 0.14
8 0.17
9 0.19
10 0.22
11 0.23
12 0.26
13 0.3
14 0.32
15 0.34
16 0.33
17 0.35
18 0.31
19 0.3
20 0.28
21 0.24
22 0.21
23 0.23
24 0.18
25 0.13
26 0.12
27 0.11
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.06
32 0.06
33 0.06
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.08
43 0.1
44 0.12
45 0.12
46 0.13
47 0.16
48 0.19
49 0.21
50 0.24
51 0.28
52 0.28
53 0.28
54 0.28
55 0.31
56 0.35
57 0.38
58 0.39
59 0.4
60 0.38
61 0.48
62 0.48
63 0.43
64 0.42
65 0.4
66 0.45
67 0.46
68 0.51
69 0.45
70 0.47
71 0.48
72 0.45
73 0.41
74 0.33
75 0.28
76 0.22
77 0.2
78 0.17
79 0.15
80 0.13
81 0.11
82 0.08
83 0.08
84 0.06
85 0.04
86 0.03
87 0.03
88 0.03
89 0.03
90 0.04
91 0.06
92 0.08
93 0.11
94 0.19
95 0.27
96 0.34
97 0.37
98 0.43
99 0.46
100 0.49
101 0.55
102 0.52
103 0.52
104 0.47
105 0.46
106 0.4
107 0.35
108 0.3
109 0.21
110 0.15
111 0.09
112 0.06
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.05
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.07
122 0.12
123 0.21
124 0.3
125 0.39
126 0.49
127 0.58
128 0.63
129 0.69
130 0.74
131 0.74
132 0.74
133 0.73
134 0.71
135 0.67
136 0.64
137 0.6
138 0.5
139 0.43
140 0.34
141 0.26
142 0.19
143 0.15
144 0.15
145 0.12
146 0.11
147 0.14
148 0.16
149 0.16
150 0.15
151 0.13
152 0.13
153 0.13
154 0.13
155 0.1
156 0.07
157 0.09
158 0.1
159 0.14
160 0.14
161 0.14
162 0.16
163 0.16
164 0.15
165 0.14
166 0.13
167 0.16
168 0.24
169 0.25
170 0.25
171 0.28
172 0.3
173 0.3
174 0.31
175 0.25
176 0.22
177 0.21
178 0.2
179 0.17
180 0.16
181 0.15
182 0.17
183 0.21
184 0.18
185 0.21
186 0.27
187 0.35
188 0.43
189 0.53
190 0.61
191 0.65
192 0.72
193 0.8
194 0.85
195 0.87
196 0.88
197 0.89
198 0.89
199 0.91
200 0.93
201 0.92
202 0.9
203 0.87
204 0.87
205 0.83
206 0.77
207 0.72
208 0.71
209 0.64
210 0.59
211 0.6
212 0.51
213 0.46
214 0.41
215 0.35
216 0.31
217 0.32
218 0.29
219 0.23
220 0.22
221 0.2
222 0.19
223 0.19
224 0.14
225 0.09
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.06
232 0.06
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.1
255 0.1
256 0.09
257 0.09
258 0.11
259 0.14
260 0.16
261 0.17
262 0.14
263 0.14
264 0.14
265 0.15
266 0.14
267 0.11
268 0.1
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.07
274 0.08
275 0.13
276 0.17
277 0.21
278 0.22
279 0.28
280 0.33
281 0.37
282 0.43
283 0.47
284 0.48
285 0.49
286 0.53
287 0.5
288 0.45
289 0.41
290 0.39
291 0.3
292 0.29
293 0.26
294 0.22
295 0.19
296 0.22
297 0.23
298 0.22
299 0.24
300 0.24
301 0.24
302 0.25
303 0.25
304 0.23
305 0.28
306 0.26
307 0.23
308 0.22
309 0.24
310 0.27
311 0.3
312 0.36
313 0.33
314 0.38
315 0.42
316 0.4
317 0.36
318 0.32
319 0.28
320 0.23
321 0.23
322 0.25
323 0.22
324 0.21
325 0.21
326 0.21
327 0.22
328 0.22
329 0.18
330 0.16
331 0.15
332 0.16
333 0.17
334 0.16
335 0.15
336 0.14
337 0.14
338 0.09
339 0.1
340 0.1
341 0.13
342 0.13
343 0.14
344 0.15
345 0.16
346 0.19
347 0.22
348 0.22
349 0.21
350 0.25
351 0.25
352 0.23
353 0.22
354 0.19
355 0.17
356 0.18
357 0.2
358 0.18
359 0.21
360 0.21
361 0.22
362 0.25
363 0.24
364 0.22
365 0.19
366 0.21
367 0.2
368 0.21
369 0.22
370 0.2
371 0.2
372 0.24
373 0.3
374 0.25
375 0.28
376 0.27
377 0.27
378 0.3
379 0.28
380 0.24
381 0.18
382 0.19
383 0.18
384 0.18
385 0.17
386 0.16
387 0.17
388 0.18
389 0.22
390 0.21
391 0.2
392 0.2
393 0.24
394 0.23
395 0.26
396 0.32
397 0.29
398 0.33
399 0.32
400 0.32
401 0.3
402 0.32
403 0.34
404 0.31
405 0.32
406 0.26
407 0.24
408 0.23
409 0.22
410 0.19
411 0.14
412 0.08
413 0.05
414 0.05
415 0.06
416 0.07
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.07
421 0.07
422 0.07
423 0.08
424 0.09
425 0.09
426 0.11
427 0.11
428 0.12
429 0.13
430 0.14
431 0.15
432 0.16
433 0.17
434 0.15
435 0.16
436 0.15
437 0.14
438 0.13
439 0.12
440 0.12
441 0.1
442 0.12
443 0.11
444 0.11
445 0.11
446 0.1
447 0.1
448 0.08
449 0.08