FuNGI

P0CR06

Protein Details

Accession

P0CR06

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
643-667	QKASQLSWDRKKHKFIKKNGSADGE	Hydrophilic
682-705	YSSGKYQEWKSKRRHMPDGPVEAL	Hydrophilic
749-802	KGKDDFKQKSPGKPGKKGIKQSSGLKSAMDIRKQREIAQKRKEKNARKPQKFRK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
128-134	KGKGKGK
552-557	KKRRKT
654-656	KHK
708-802	GGGRRGRHGPPGQKRKAEDGDGGEDAGGKGRKDQGKSKGTGKGKDDFKQKSPGKPGKKGIKQSSGLKSAMDIRKQREIAQKRKEKNARKPQKFRK

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto 9, mito_nucl 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012541 DBP10_C IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0006364 P:rRNA processing
KEGG	cne:CNB00610 -
Pfam	View protein in Pfam PF08147 DBP10CT PF00270 DEAD PF00271 Helicase_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER PS51195 Q_MOTIF
CDD	cd18787 SF2_C_DEAD

Amino Acid Sequences

MAAITPSWALETTADGEVKEKTSGPGGQWRALNVGPDLIRSLLIRKFKTPTPIQRAAIPPALSTPPRDILGMARTGSGKTLAYLIPLLQRTGSTHHGQGPRALILCPSRELAVQIYTVGKDLARGMNKGKGKGKNKNEDEEDEEGKGKEGLRWALIIGGEGMDAQFEKMSSNPDIVIATPGRFLHLIVEMHMDLRHLQTVIYDEADRLFEMGFDVQLQEILHRLPSTRQNLLFSATLPSSVAEFAKAGLVNPLLVRLDAEQKISPDLALKFFSVKPGEKEASLLVLLREVIGKPNQPEPADPSSAPQAIVFVATKHHVDYVAELLRTTGYRTSLIYSSLDQVARQQQLAGFRSHQSDVLVVTDVAARGLDIPIMDHVINYDFPAGPRIFVHRVGRTARAGRKGTAYSLIVKEDFPYLCDLHTFLGTERMGEPADVLRSLPIEQLSENVEYVFHNLDETAPHITALRNVMRKGQGMFERSRTKANPTSYRQAKSLASALSNNPPRIDDMFEDAMEVEVNEEKARLLAKVAAFTPSETVFEVGKRESESAIIMKKRRKTVDERQKRVSKAEAEKSTASGMEKAPVKELPAPQLPSKNFKDPSFYLDHTQRGAEAEKGYSLKSGVESLSGAITDMTADEGTGPKAQKASQLSWDRKKHKFIKKNGSADGEKMIKSESGALLPASYSSGKYQEWKSKRRHMPDGPVEALALGGGRRGRHGPPGQKRKAEDGDGGEDAGGKGRKDQGKSKGTGKGKDDFKQKSPGKPGKKGIKQSSGLKSAMDIRKQREIAQKRKEKNARKPQKFRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.16
3	0.17
4	0.18
5	0.2
6	0.19
7	0.17
8	0.15
9	0.2
10	0.23
11	0.25
12	0.32
13	0.34
14	0.38
15	0.38
16	0.38
17	0.37
18	0.35
19	0.34
20	0.25
21	0.26
22	0.21
23	0.21
24	0.21
25	0.18
26	0.18
27	0.16
28	0.2
29	0.21
30	0.28
31	0.3
32	0.33
33	0.37
34	0.41
35	0.49
36	0.54
37	0.59
38	0.61
39	0.67
40	0.64
41	0.67
42	0.67
43	0.63
44	0.59
45	0.49
46	0.4
47	0.35
48	0.39
49	0.33
50	0.31
51	0.3
52	0.27
53	0.28
54	0.28
55	0.25
56	0.24
57	0.27
58	0.27
59	0.23
60	0.21
61	0.21
62	0.21
63	0.21
64	0.19
65	0.15
66	0.12
67	0.14
68	0.13
69	0.13
70	0.14
71	0.14
72	0.18
73	0.19
74	0.19
75	0.17
76	0.17
77	0.18
78	0.22
79	0.25
80	0.23
81	0.25
82	0.33
83	0.37
84	0.37
85	0.39
86	0.38
87	0.36
88	0.33
89	0.3
90	0.26
91	0.25
92	0.26
93	0.24
94	0.22
95	0.2
96	0.19
97	0.21
98	0.19
99	0.17
100	0.15
101	0.15
102	0.15
103	0.14
104	0.14
105	0.13
106	0.11
107	0.1
108	0.13
109	0.18
110	0.19
111	0.21
112	0.24
113	0.31
114	0.35
115	0.41
116	0.46
117	0.49
118	0.56
119	0.64
120	0.71
121	0.74
122	0.76
123	0.78
124	0.75
125	0.7
126	0.66
127	0.61
128	0.53
129	0.44
130	0.4
131	0.31
132	0.27
133	0.24
134	0.19
135	0.16
136	0.18
137	0.18
138	0.17
139	0.17
140	0.17
141	0.17
142	0.16
143	0.14
144	0.1
145	0.08
146	0.07
147	0.06
148	0.06
149	0.04
150	0.05
151	0.05
152	0.05
153	0.05
154	0.06
155	0.07
156	0.11
157	0.11
158	0.12
159	0.12
160	0.13
161	0.13
162	0.13
163	0.16
164	0.13
165	0.13
166	0.14
167	0.14
168	0.15
169	0.14
170	0.14
171	0.12
172	0.15
173	0.15
174	0.13
175	0.17
176	0.15
177	0.16
178	0.16
179	0.14
180	0.11
181	0.12
182	0.12
183	0.09
184	0.09
185	0.09
186	0.12
187	0.12
188	0.13
189	0.12
190	0.11
191	0.12
192	0.12
193	0.11
194	0.09
195	0.08
196	0.06
197	0.07
198	0.07
199	0.06
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.07
204	0.07
205	0.06
206	0.07
207	0.07
208	0.08
209	0.08
210	0.09
211	0.12
212	0.21
213	0.26
214	0.3
215	0.31
216	0.33
217	0.33
218	0.35
219	0.31
220	0.24
221	0.22
222	0.17
223	0.15
224	0.13
225	0.12
226	0.1
227	0.1
228	0.09
229	0.07
230	0.07
231	0.07
232	0.09
233	0.09
234	0.08
235	0.09
236	0.09
237	0.09
238	0.09
239	0.1
240	0.08
241	0.08
242	0.08
243	0.08
244	0.14
245	0.14
246	0.16
247	0.16
248	0.16
249	0.18
250	0.17
251	0.16
252	0.14
253	0.14
254	0.14
255	0.14
256	0.14
257	0.15
258	0.16
259	0.2
260	0.2
261	0.2
262	0.22
263	0.26
264	0.27
265	0.24
266	0.25
267	0.21
268	0.19
269	0.17
270	0.14
271	0.08
272	0.08
273	0.08
274	0.07
275	0.07
276	0.06
277	0.09
278	0.1
279	0.13
280	0.14
281	0.19
282	0.22
283	0.22
284	0.23
285	0.26
286	0.28
287	0.28
288	0.26
289	0.24
290	0.24
291	0.24
292	0.23
293	0.17
294	0.13
295	0.1
296	0.11
297	0.1
298	0.06
299	0.07
300	0.08
301	0.09
302	0.09
303	0.09
304	0.08
305	0.08
306	0.09
307	0.12
308	0.13
309	0.13
310	0.12
311	0.12
312	0.12
313	0.13
314	0.12
315	0.09
316	0.08
317	0.09
318	0.1
319	0.12
320	0.12
321	0.13
322	0.13
323	0.12
324	0.13
325	0.15
326	0.14
327	0.12
328	0.14
329	0.19
330	0.18
331	0.18
332	0.16
333	0.15
334	0.21
335	0.22
336	0.21
337	0.17
338	0.18
339	0.2
340	0.2
341	0.19
342	0.14
343	0.13
344	0.12
345	0.11
346	0.1
347	0.07
348	0.07
349	0.07
350	0.06
351	0.06
352	0.05
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.03
358	0.04
359	0.04
360	0.06
361	0.06
362	0.05
363	0.05
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.07
368	0.06
369	0.06
370	0.1
371	0.1
372	0.09
373	0.09
374	0.14
375	0.14
376	0.18
377	0.22
378	0.2
379	0.24
380	0.25
381	0.27
382	0.26
383	0.3
384	0.31
385	0.34
386	0.34
387	0.31
388	0.32
389	0.3
390	0.28
391	0.25
392	0.22
393	0.17
394	0.17
395	0.17
396	0.14
397	0.13
398	0.13
399	0.13
400	0.12
401	0.1
402	0.11
403	0.1
404	0.1
405	0.1
406	0.1
407	0.08
408	0.09
409	0.08
410	0.06
411	0.11
412	0.11
413	0.11
414	0.11
415	0.11
416	0.11
417	0.1
418	0.11
419	0.07
420	0.07
421	0.07
422	0.06
423	0.06
424	0.06
425	0.07
426	0.08
427	0.07
428	0.07
429	0.07
430	0.08
431	0.1
432	0.1
433	0.09
434	0.08
435	0.08
436	0.08
437	0.09
438	0.08
439	0.06
440	0.06
441	0.06
442	0.06
443	0.06
444	0.07
445	0.08
446	0.07
447	0.07
448	0.08
449	0.08
450	0.1
451	0.13
452	0.17
453	0.18
454	0.18
455	0.22
456	0.23
457	0.25
458	0.24
459	0.25
460	0.24
461	0.26
462	0.27
463	0.3
464	0.34
465	0.34
466	0.37
467	0.34
468	0.36
469	0.39
470	0.44
471	0.46
472	0.46
473	0.55
474	0.57
475	0.58
476	0.52
477	0.49
478	0.43
479	0.36
480	0.34
481	0.25
482	0.2
483	0.19
484	0.2
485	0.24
486	0.28
487	0.27
488	0.24
489	0.23
490	0.24
491	0.23
492	0.24
493	0.17
494	0.17
495	0.18
496	0.18
497	0.17
498	0.15
499	0.14
500	0.11
501	0.1
502	0.05
503	0.05
504	0.06
505	0.05
506	0.05
507	0.05
508	0.06
509	0.07
510	0.06
511	0.07
512	0.1
513	0.1
514	0.12
515	0.13
516	0.14
517	0.14
518	0.14
519	0.15
520	0.12
521	0.12
522	0.1
523	0.11
524	0.1
525	0.1
526	0.12
527	0.11
528	0.12
529	0.12
530	0.12
531	0.11
532	0.12
533	0.12
534	0.14
535	0.19
536	0.23
537	0.27
538	0.32
539	0.38
540	0.45
541	0.48
542	0.5
543	0.54
544	0.6
545	0.66
546	0.71
547	0.72
548	0.75
549	0.77
550	0.73
551	0.67
552	0.62
553	0.59
554	0.57
555	0.59
556	0.53
557	0.5
558	0.49
559	0.46
560	0.41
561	0.34
562	0.26
563	0.2
564	0.16
565	0.17
566	0.21
567	0.2
568	0.22
569	0.21
570	0.22
571	0.25
572	0.27
573	0.27
574	0.29
575	0.32
576	0.33
577	0.4
578	0.4
579	0.42
580	0.45
581	0.47
582	0.46
583	0.43
584	0.47
585	0.41
586	0.44
587	0.43
588	0.4
589	0.38
590	0.38
591	0.4
592	0.33
593	0.32
594	0.27
595	0.23
596	0.23
597	0.19
598	0.16
599	0.15
600	0.16
601	0.17
602	0.16
603	0.15
604	0.14
605	0.12
606	0.12
607	0.13
608	0.1
609	0.1
610	0.1
611	0.1
612	0.1
613	0.09
614	0.08
615	0.06
616	0.06
617	0.05
618	0.05
619	0.05
620	0.05
621	0.05
622	0.05
623	0.06
624	0.08
625	0.12
626	0.13
627	0.13
628	0.15
629	0.16
630	0.21
631	0.25
632	0.27
633	0.33
634	0.42
635	0.5
636	0.58
637	0.67
638	0.69
639	0.7
640	0.77
641	0.78
642	0.79
643	0.8
644	0.81
645	0.83
646	0.85
647	0.86
648	0.81
649	0.78
650	0.69
651	0.61
652	0.57
653	0.49
654	0.39
655	0.32
656	0.27
657	0.2
658	0.19
659	0.21
660	0.15
661	0.13
662	0.13
663	0.13
664	0.12
665	0.12
666	0.11
667	0.1
668	0.1
669	0.1
670	0.11
671	0.15
672	0.16
673	0.22
674	0.29
675	0.37
676	0.45
677	0.53
678	0.6
679	0.67
680	0.76
681	0.79
682	0.82
683	0.8
684	0.82
685	0.83
686	0.81
687	0.72
688	0.63
689	0.54
690	0.43
691	0.35
692	0.24
693	0.15
694	0.07
695	0.07
696	0.09
697	0.1
698	0.13
699	0.16
700	0.19
701	0.28
702	0.36
703	0.44
704	0.53
705	0.64
706	0.7
707	0.74
708	0.75
709	0.74
710	0.72
711	0.66
712	0.6
713	0.54
714	0.5
715	0.44
716	0.41
717	0.31
718	0.26
719	0.21
720	0.22
721	0.19
722	0.14
723	0.17
724	0.25
725	0.31
726	0.36
727	0.44
728	0.49
729	0.55
730	0.6
731	0.63
732	0.65
733	0.66
734	0.68
735	0.64
736	0.63
737	0.61
738	0.64
739	0.67
740	0.64
741	0.62
742	0.66
743	0.67
744	0.67
745	0.71
746	0.74
747	0.74
748	0.77
749	0.82
750	0.82
751	0.86
752	0.87
753	0.85
754	0.85
755	0.82
756	0.81
757	0.8
758	0.75
759	0.66
760	0.56
761	0.49
762	0.49
763	0.49
764	0.49
765	0.47
766	0.46
767	0.55
768	0.57
769	0.62
770	0.63
771	0.66
772	0.68
773	0.72
774	0.77
775	0.75
776	0.84
777	0.87
778	0.87
779	0.88
780	0.89
781	0.9
782	0.91

P0CR06

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer