Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P0CN42

Protein Details
Accession P0CN42    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
752-778KAQLREKVIKRKREEKERKLKEAREAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
558-559RR
741-783KEEARRKIEEEKAQLREKVIKRKREEKERKLKEAREAEERKRK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, mito_nucl 11, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027512  EIF3A  
IPR000717  PCI_dom  
Gene Ontology GO:0010494  C:cytoplasmic stress granule  
GO:0016282  C:eukaryotic 43S preinitiation complex  
GO:0033290  C:eukaryotic 48S preinitiation complex  
GO:0071540  C:eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3e  
GO:0071541  C:eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3m  
GO:0043614  C:multi-eIF complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0001732  P:formation of cytoplasmic translation initiation complex  
GO:0002188  P:translation reinitiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01399  PCI  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50250  PCI  
Amino Acid Sequences MPPIYVKPENALKRSEELLALGTPQSQQQAFDNLVEVFQSKRFKQTPINVLEPIVTKFIDLCVVLSRKAHAKSGLLVFKSAAQTTNVGAIERVLNHFIAKAEARLAAAVEQAKKEVAALPDVPVVDDDLPLQPASLMLDCFVDSAGDRERIERRLIAPAQKFCWDSYDICLDIAKSNDRLEVIYQSIAHRAFHFCKIHQRKADFRRLCEQRLRKDLANAAKYSHQQHAINLSDPETLGRFLDTRFLQLETAVELELWQEAFRSIEDVHGLIAGRKGTKPSMMANYYEKLTQIFKAEGGKQTAVFHAAAWARYFQHAERAGIVNDKASGCVLLSALAVPLGEVEVKQRLVALLNLPKTPTREALVQDAAAKHLKRVPADIRQIYKILEVDFEPTTASKVLAPLITSLSPEYQPYLPALRDVVLSRLLQALAQVYDSVTLSHILDLVKPLDNTPWATDMSSLEKFLVTACRRGDIRASVDHVAQTITFVSTPPDANGLQTLAVCLYNTIQYLNPSRLAPVSRSDAFAAAIAQAEEERKAASHKRQIVIRRRELLEEAKLRREKEASTALAERLKIKAEEDARRAKEEAKQAEIDRVRKQIHETKQAEAKQLAASLAAQGALKVDISSIEDLDSSKLVAMQVEQLAKEKKELSERLRIVGKRVDHLERAMRKEERPLLAQDYERQKAEDRAAHDRANQIAREQAIEQQRAARELKQRLGRMLEDYEAVKERIESQMQEELKAAKEEARRKIEEEKAQLREKVIKRKREEKERKLKEAREAEERKRKEEEEAAQKAEEEARAAAALEAEAAAAEQRRAEREAQRQSDLERIRAQQEREEEALRRRQAEKAAATSGGSAYRPPARAGTTPPTASPAPSSGGPSWLARRKAMEAQSAGGAPVASSPKPVPSNSAAASAPASNGPESIAGEAEKPALTGSVWRRGMGARRGMPSTRGGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.41
3 0.32
4 0.25
5 0.24
6 0.21
7 0.19
8 0.16
9 0.15
10 0.14
11 0.15
12 0.18
13 0.16
14 0.17
15 0.19
16 0.23
17 0.24
18 0.24
19 0.24
20 0.2
21 0.19
22 0.18
23 0.16
24 0.13
25 0.18
26 0.24
27 0.23
28 0.32
29 0.35
30 0.4
31 0.48
32 0.56
33 0.6
34 0.6
35 0.64
36 0.56
37 0.53
38 0.51
39 0.43
40 0.36
41 0.28
42 0.21
43 0.16
44 0.15
45 0.15
46 0.15
47 0.13
48 0.12
49 0.17
50 0.19
51 0.21
52 0.21
53 0.24
54 0.28
55 0.31
56 0.34
57 0.3
58 0.3
59 0.35
60 0.42
61 0.46
62 0.39
63 0.38
64 0.34
65 0.35
66 0.36
67 0.31
68 0.24
69 0.19
70 0.19
71 0.19
72 0.24
73 0.2
74 0.17
75 0.16
76 0.16
77 0.17
78 0.18
79 0.19
80 0.16
81 0.15
82 0.16
83 0.17
84 0.16
85 0.17
86 0.17
87 0.15
88 0.15
89 0.16
90 0.16
91 0.15
92 0.15
93 0.11
94 0.14
95 0.17
96 0.18
97 0.17
98 0.18
99 0.18
100 0.17
101 0.17
102 0.18
103 0.15
104 0.17
105 0.17
106 0.18
107 0.2
108 0.2
109 0.19
110 0.15
111 0.16
112 0.12
113 0.12
114 0.11
115 0.1
116 0.12
117 0.11
118 0.11
119 0.08
120 0.08
121 0.1
122 0.1
123 0.09
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.07
130 0.06
131 0.09
132 0.12
133 0.15
134 0.15
135 0.19
136 0.24
137 0.26
138 0.29
139 0.3
140 0.28
141 0.34
142 0.38
143 0.43
144 0.45
145 0.47
146 0.47
147 0.48
148 0.48
149 0.39
150 0.38
151 0.33
152 0.27
153 0.26
154 0.28
155 0.24
156 0.23
157 0.23
158 0.2
159 0.2
160 0.21
161 0.2
162 0.17
163 0.18
164 0.19
165 0.19
166 0.19
167 0.18
168 0.19
169 0.17
170 0.16
171 0.17
172 0.16
173 0.2
174 0.2
175 0.19
176 0.18
177 0.22
178 0.24
179 0.31
180 0.33
181 0.31
182 0.42
183 0.5
184 0.57
185 0.59
186 0.61
187 0.63
188 0.69
189 0.78
190 0.72
191 0.67
192 0.69
193 0.67
194 0.68
195 0.68
196 0.67
197 0.65
198 0.69
199 0.69
200 0.61
201 0.6
202 0.6
203 0.59
204 0.56
205 0.47
206 0.41
207 0.4
208 0.42
209 0.41
210 0.38
211 0.35
212 0.31
213 0.32
214 0.37
215 0.35
216 0.34
217 0.3
218 0.27
219 0.22
220 0.21
221 0.2
222 0.14
223 0.12
224 0.1
225 0.1
226 0.09
227 0.09
228 0.15
229 0.15
230 0.16
231 0.17
232 0.17
233 0.16
234 0.16
235 0.16
236 0.11
237 0.11
238 0.09
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.08
250 0.07
251 0.08
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.1
257 0.08
258 0.1
259 0.1
260 0.11
261 0.12
262 0.14
263 0.15
264 0.16
265 0.18
266 0.2
267 0.26
268 0.26
269 0.28
270 0.29
271 0.3
272 0.29
273 0.27
274 0.23
275 0.17
276 0.17
277 0.16
278 0.15
279 0.14
280 0.14
281 0.18
282 0.21
283 0.23
284 0.25
285 0.24
286 0.23
287 0.23
288 0.22
289 0.2
290 0.17
291 0.13
292 0.14
293 0.15
294 0.15
295 0.14
296 0.15
297 0.14
298 0.15
299 0.17
300 0.13
301 0.2
302 0.21
303 0.21
304 0.22
305 0.23
306 0.22
307 0.23
308 0.23
309 0.15
310 0.15
311 0.14
312 0.12
313 0.1
314 0.09
315 0.07
316 0.07
317 0.06
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.03
327 0.03
328 0.03
329 0.05
330 0.07
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.08
335 0.09
336 0.1
337 0.13
338 0.16
339 0.18
340 0.18
341 0.19
342 0.2
343 0.22
344 0.23
345 0.2
346 0.17
347 0.19
348 0.2
349 0.23
350 0.23
351 0.21
352 0.21
353 0.19
354 0.19
355 0.2
356 0.18
357 0.15
358 0.17
359 0.19
360 0.17
361 0.22
362 0.25
363 0.29
364 0.37
365 0.4
366 0.4
367 0.39
368 0.39
369 0.35
370 0.31
371 0.24
372 0.17
373 0.13
374 0.11
375 0.12
376 0.11
377 0.11
378 0.1
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.09
383 0.06
384 0.07
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.09
390 0.09
391 0.09
392 0.09
393 0.09
394 0.09
395 0.09
396 0.1
397 0.09
398 0.09
399 0.1
400 0.12
401 0.11
402 0.11
403 0.11
404 0.1
405 0.1
406 0.1
407 0.1
408 0.1
409 0.1
410 0.1
411 0.11
412 0.1
413 0.09
414 0.09
415 0.08
416 0.06
417 0.06
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.07
428 0.06
429 0.06
430 0.07
431 0.08
432 0.09
433 0.09
434 0.09
435 0.09
436 0.1
437 0.11
438 0.11
439 0.11
440 0.1
441 0.1
442 0.1
443 0.1
444 0.13
445 0.13
446 0.12
447 0.11
448 0.1
449 0.1
450 0.1
451 0.16
452 0.13
453 0.17
454 0.17
455 0.19
456 0.2
457 0.2
458 0.22
459 0.17
460 0.19
461 0.16
462 0.19
463 0.18
464 0.18
465 0.17
466 0.15
467 0.13
468 0.1
469 0.08
470 0.06
471 0.05
472 0.04
473 0.05
474 0.06
475 0.06
476 0.07
477 0.07
478 0.09
479 0.09
480 0.09
481 0.09
482 0.08
483 0.07
484 0.07
485 0.07
486 0.05
487 0.05
488 0.05
489 0.04
490 0.05
491 0.05
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.09
496 0.11
497 0.13
498 0.14
499 0.13
500 0.13
501 0.14
502 0.15
503 0.14
504 0.15
505 0.18
506 0.17
507 0.18
508 0.18
509 0.17
510 0.16
511 0.15
512 0.12
513 0.07
514 0.07
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.05
521 0.05
522 0.05
523 0.08
524 0.13
525 0.19
526 0.26
527 0.31
528 0.34
529 0.39
530 0.48
531 0.56
532 0.6
533 0.6
534 0.58
535 0.54
536 0.52
537 0.5
538 0.45
539 0.41
540 0.39
541 0.35
542 0.37
543 0.39
544 0.38
545 0.37
546 0.35
547 0.29
548 0.27
549 0.3
550 0.24
551 0.24
552 0.25
553 0.24
554 0.25
555 0.24
556 0.21
557 0.16
558 0.16
559 0.14
560 0.13
561 0.16
562 0.21
563 0.26
564 0.3
565 0.37
566 0.37
567 0.39
568 0.39
569 0.36
570 0.35
571 0.38
572 0.35
573 0.3
574 0.32
575 0.3
576 0.37
577 0.39
578 0.37
579 0.33
580 0.36
581 0.34
582 0.32
583 0.37
584 0.38
585 0.41
586 0.48
587 0.46
588 0.45
589 0.51
590 0.52
591 0.49
592 0.41
593 0.35
594 0.25
595 0.24
596 0.2
597 0.13
598 0.11
599 0.08
600 0.08
601 0.07
602 0.06
603 0.05
604 0.05
605 0.05
606 0.05
607 0.05
608 0.04
609 0.04
610 0.06
611 0.07
612 0.06
613 0.06
614 0.07
615 0.07
616 0.08
617 0.08
618 0.06
619 0.06
620 0.06
621 0.06
622 0.06
623 0.06
624 0.08
625 0.1
626 0.11
627 0.11
628 0.15
629 0.17
630 0.17
631 0.19
632 0.19
633 0.19
634 0.26
635 0.32
636 0.33
637 0.4
638 0.41
639 0.42
640 0.47
641 0.45
642 0.41
643 0.4
644 0.37
645 0.31
646 0.34
647 0.34
648 0.29
649 0.31
650 0.36
651 0.36
652 0.39
653 0.41
654 0.4
655 0.38
656 0.44
657 0.47
658 0.41
659 0.39
660 0.38
661 0.36
662 0.36
663 0.36
664 0.35
665 0.36
666 0.36
667 0.34
668 0.32
669 0.3
670 0.31
671 0.34
672 0.32
673 0.29
674 0.34
675 0.38
676 0.38
677 0.38
678 0.37
679 0.36
680 0.36
681 0.32
682 0.25
683 0.24
684 0.23
685 0.22
686 0.2
687 0.21
688 0.24
689 0.25
690 0.25
691 0.26
692 0.27
693 0.29
694 0.3
695 0.29
696 0.31
697 0.35
698 0.42
699 0.45
700 0.46
701 0.46
702 0.48
703 0.44
704 0.39
705 0.35
706 0.29
707 0.23
708 0.22
709 0.2
710 0.19
711 0.18
712 0.15
713 0.13
714 0.14
715 0.17
716 0.18
717 0.16
718 0.17
719 0.25
720 0.25
721 0.25
722 0.25
723 0.22
724 0.22
725 0.22
726 0.19
727 0.17
728 0.24
729 0.31
730 0.38
731 0.44
732 0.44
733 0.46
734 0.54
735 0.56
736 0.57
737 0.58
738 0.57
739 0.57
740 0.59
741 0.58
742 0.53
743 0.54
744 0.54
745 0.56
746 0.56
747 0.59
748 0.63
749 0.71
750 0.78
751 0.8
752 0.84
753 0.84
754 0.87
755 0.87
756 0.9
757 0.89
758 0.84
759 0.82
760 0.8
761 0.73
762 0.72
763 0.71
764 0.7
765 0.71
766 0.69
767 0.64
768 0.6
769 0.57
770 0.52
771 0.52
772 0.51
773 0.51
774 0.53
775 0.51
776 0.46
777 0.45
778 0.4
779 0.35
780 0.26
781 0.17
782 0.13
783 0.1
784 0.1
785 0.1
786 0.09
787 0.07
788 0.07
789 0.05
790 0.05
791 0.04
792 0.04
793 0.04
794 0.05
795 0.05
796 0.06
797 0.08
798 0.1
799 0.13
800 0.16
801 0.22
802 0.29
803 0.37
804 0.47
805 0.5
806 0.52
807 0.51
808 0.51
809 0.54
810 0.48
811 0.43
812 0.39
813 0.37
814 0.4
815 0.44
816 0.44
817 0.41
818 0.43
819 0.44
820 0.41
821 0.42
822 0.4
823 0.42
824 0.49
825 0.46
826 0.46
827 0.43
828 0.44
829 0.47
830 0.5
831 0.47
832 0.43
833 0.42
834 0.38
835 0.36
836 0.33
837 0.28
838 0.22
839 0.18
840 0.14
841 0.15
842 0.2
843 0.22
844 0.22
845 0.24
846 0.26
847 0.29
848 0.35
849 0.38
850 0.39
851 0.38
852 0.37
853 0.39
854 0.35
855 0.33
856 0.29
857 0.25
858 0.21
859 0.21
860 0.26
861 0.22
862 0.24
863 0.24
864 0.25
865 0.32
866 0.36
867 0.38
868 0.36
869 0.39
870 0.41
871 0.48
872 0.5
873 0.48
874 0.42
875 0.41
876 0.41
877 0.37
878 0.32
879 0.25
880 0.19
881 0.11
882 0.14
883 0.15
884 0.13
885 0.16
886 0.17
887 0.24
888 0.27
889 0.28
890 0.3
891 0.31
892 0.37
893 0.35
894 0.38
895 0.31
896 0.29
897 0.3
898 0.25
899 0.21
900 0.17
901 0.17
902 0.14
903 0.14
904 0.13
905 0.13
906 0.13
907 0.13
908 0.13
909 0.11
910 0.12
911 0.13
912 0.14
913 0.12
914 0.11
915 0.1
916 0.1
917 0.09
918 0.16
919 0.21
920 0.29
921 0.3
922 0.31
923 0.32
924 0.36
925 0.45
926 0.45
927 0.49
928 0.45
929 0.49
930 0.53
931 0.54
932 0.52