Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KJM2

Protein Details
Accession Q5KJM2    Localization Confidence High Confidence Score 18.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-47SYLSRSRSPSRSRSRSPLPRKASLRDHydrophilic
145-170PSPRRRSPSRSRSRSPPPARRRRSLSBasic
184-206PSYGRRRSYSRSRSPPRHRGGRDBasic
304-352RASVSRSRSPVRRRSRSRARSYSRGRSVSMSRSRSRSPLPRKRYSLSRSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-375PSPRRRSPSRSRSRSPPPARRRRSLSRSRSPSPRKGDRVPSYGRRRSYSRSRSPPRHRGGRDSFPGRNGNGYGPGPSGGRGGGGGRGGFSRGGGPPPPGGRDNGWRRERSPPVPVRKWGERGAPRRPSPEYGRGARSASRSVSPRGPRGGVRSRSPVRRRASVSRSRSPVRRRSRSRARSYSRGRSVSMSRSRSRSPLPRKRYSLSRSRSRSSTRSMSIDRSRSGTRSPRK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0061574  C:ASAP complex  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MPSRGRSTTPKSLTPDRSPARSYLSRSRSPSRSRSRSPLPRKASLRDADMDAPGDGLYKVIVVSGLSKNVMKGHLDEIFSEYGRITGIDLPLFKVSGLNKGKAAIEFDTPAAASKAVKCMDGGQLDGSFLNVQISEHPLPPPQAPSPRRRSPSRSRSRSPPPARRRRSLSRSRSPSPRKGDRVPSYGRRRSYSRSRSPPRHRGGRDSFPGRNGNGYGPGPSGGRGGGGGRGGFSRGGGPPPPGGRDNGWRRERSPPVPVRKWGERGAPRRPSPEYGRGARSASRSVSPRGPRGGVRSRSPVRRRASVSRSRSPVRRRSRSRARSYSRGRSVSMSRSRSRSPLPRKRYSLSRSRSRSSTRSMSIDRSRSGTRSPRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.71
3 0.66
4 0.67
5 0.62
6 0.58
7 0.57
8 0.54
9 0.54
10 0.54
11 0.56
12 0.58
13 0.62
14 0.68
15 0.69
16 0.71
17 0.75
18 0.75
19 0.77
20 0.77
21 0.79
22 0.81
23 0.83
24 0.86
25 0.85
26 0.82
27 0.82
28 0.8
29 0.77
30 0.75
31 0.68
32 0.63
33 0.55
34 0.52
35 0.44
36 0.4
37 0.35
38 0.25
39 0.21
40 0.16
41 0.14
42 0.1
43 0.08
44 0.06
45 0.05
46 0.05
47 0.05
48 0.05
49 0.04
50 0.09
51 0.1
52 0.12
53 0.13
54 0.14
55 0.15
56 0.17
57 0.19
58 0.16
59 0.16
60 0.19
61 0.22
62 0.22
63 0.21
64 0.22
65 0.22
66 0.21
67 0.19
68 0.15
69 0.11
70 0.11
71 0.1
72 0.08
73 0.09
74 0.1
75 0.12
76 0.12
77 0.14
78 0.14
79 0.14
80 0.13
81 0.13
82 0.13
83 0.21
84 0.24
85 0.24
86 0.24
87 0.25
88 0.27
89 0.24
90 0.26
91 0.18
92 0.17
93 0.16
94 0.16
95 0.14
96 0.13
97 0.13
98 0.11
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.14
103 0.14
104 0.15
105 0.14
106 0.15
107 0.19
108 0.19
109 0.18
110 0.14
111 0.13
112 0.14
113 0.13
114 0.12
115 0.07
116 0.07
117 0.06
118 0.05
119 0.05
120 0.06
121 0.11
122 0.12
123 0.13
124 0.14
125 0.15
126 0.17
127 0.18
128 0.21
129 0.19
130 0.27
131 0.32
132 0.4
133 0.47
134 0.53
135 0.58
136 0.6
137 0.65
138 0.66
139 0.73
140 0.75
141 0.74
142 0.71
143 0.74
144 0.78
145 0.81
146 0.8
147 0.79
148 0.79
149 0.82
150 0.83
151 0.81
152 0.79
153 0.78
154 0.78
155 0.78
156 0.77
157 0.76
158 0.77
159 0.76
160 0.78
161 0.76
162 0.75
163 0.73
164 0.71
165 0.67
166 0.65
167 0.69
168 0.64
169 0.63
170 0.59
171 0.6
172 0.62
173 0.61
174 0.58
175 0.52
176 0.5
177 0.51
178 0.56
179 0.56
180 0.56
181 0.61
182 0.68
183 0.75
184 0.81
185 0.85
186 0.82
187 0.81
188 0.74
189 0.73
190 0.7
191 0.67
192 0.64
193 0.6
194 0.54
195 0.48
196 0.49
197 0.4
198 0.35
199 0.28
200 0.22
201 0.2
202 0.18
203 0.15
204 0.13
205 0.13
206 0.12
207 0.11
208 0.1
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.08
223 0.11
224 0.11
225 0.13
226 0.15
227 0.16
228 0.19
229 0.18
230 0.19
231 0.2
232 0.28
233 0.35
234 0.42
235 0.46
236 0.46
237 0.47
238 0.54
239 0.59
240 0.54
241 0.55
242 0.54
243 0.59
244 0.62
245 0.65
246 0.63
247 0.62
248 0.63
249 0.57
250 0.57
251 0.56
252 0.58
253 0.62
254 0.64
255 0.61
256 0.61
257 0.61
258 0.58
259 0.56
260 0.58
261 0.55
262 0.51
263 0.52
264 0.49
265 0.47
266 0.45
267 0.41
268 0.35
269 0.31
270 0.31
271 0.3
272 0.32
273 0.38
274 0.4
275 0.42
276 0.43
277 0.43
278 0.41
279 0.46
280 0.52
281 0.49
282 0.49
283 0.53
284 0.56
285 0.64
286 0.68
287 0.68
288 0.64
289 0.66
290 0.68
291 0.68
292 0.7
293 0.7
294 0.72
295 0.72
296 0.74
297 0.72
298 0.75
299 0.74
300 0.75
301 0.76
302 0.79
303 0.79
304 0.83
305 0.87
306 0.89
307 0.9
308 0.91
309 0.88
310 0.88
311 0.88
312 0.88
313 0.86
314 0.79
315 0.7
316 0.65
317 0.62
318 0.62
319 0.61
320 0.58
321 0.55
322 0.57
323 0.59
324 0.59
325 0.62
326 0.63
327 0.65
328 0.68
329 0.72
330 0.76
331 0.79
332 0.8
333 0.81
334 0.79
335 0.78
336 0.77
337 0.78
338 0.76
339 0.75
340 0.76
341 0.74
342 0.72
343 0.7
344 0.69
345 0.64
346 0.64
347 0.63
348 0.64
349 0.65
350 0.65
351 0.59
352 0.56
353 0.54
354 0.49
355 0.53