FuNGI

A0A0S2LI92

Protein Details

Accession

A0A0S2LI92

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
472-506	IEARNIKEDRRRKHSRAGREKPKAERKKTVVVEQR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
454-455	RR
465-499	TKLKREMIEARNIKEDRRRKHSRAGREKPKAERKK

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto_nucl 9.5, mito 7, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007287 Sof1 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0000462 P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Pfam	View protein in Pfam PF04158 Sof1 PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION

Amino Acid Sequences

MKIKTISRSLDDHLPSSSSAPHPLSHNLAPHLHPFAKPREYTRAVTAVKMERMFAKPFVDALGGHQDGVYCLGKDSRRAGVVAGGGGDGEVIVHSLGLRRPLLKIPGAHRGMVSGICWTSEAQDRRRGLITCGKLDGTIKLWRSEAFAPGLRDKDAFQGNEFGLGQGEGSGFLDQAGAIGESGYDEEEGGGLSLDSAKRDALGQNLEPTMTFTSKNGLNGIDHHRTDAVFATASNTVQIWDEQRTAPLSTLQFGSSMETVSGVKFNQSETSVLASVGNDRTMCLYDIRTGKAERRIVTQFTSNCLSWCPTLPTLLLLGSEDHNLYTFDIRNLETPNQIYKGHVGGVMGCDWSPTGEGFVSGSYDRTVRLWNREEGKSRDVYHTKRMQRVFDVSYTPTADFVLSASDDGNVRIWKSDASKKLGPVSTKERQAIEYRQKLVERYAREKGVREVKERRHVPQSIHNATKLKREMIEARNIKEDRRRKHSRAGREKPKAERKKTVVVEQR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.31
3	0.28
4	0.29
5	0.22
6	0.26
7	0.26
8	0.27
9	0.29
10	0.32
11	0.37
12	0.36
13	0.38
14	0.36
15	0.38
16	0.38
17	0.38
18	0.41
19	0.37
20	0.36
21	0.37
22	0.41
23	0.45
24	0.46
25	0.48
26	0.51
27	0.54
28	0.54
29	0.54
30	0.55
31	0.48
32	0.47
33	0.48
34	0.44
35	0.44
36	0.41
37	0.37
38	0.33
39	0.36
40	0.37
41	0.33
42	0.29
43	0.24
44	0.24
45	0.24
46	0.2
47	0.17
48	0.17
49	0.23
50	0.2
51	0.2
52	0.19
53	0.18
54	0.17
55	0.21
56	0.19
57	0.11
58	0.11
59	0.17
60	0.18
61	0.22
62	0.26
63	0.26
64	0.26
65	0.27
66	0.26
67	0.24
68	0.24
69	0.2
70	0.16
71	0.12
72	0.1
73	0.09
74	0.08
75	0.05
76	0.03
77	0.03
78	0.03
79	0.03
80	0.03
81	0.03
82	0.06
83	0.08
84	0.12
85	0.13
86	0.14
87	0.17
88	0.21
89	0.25
90	0.27
91	0.31
92	0.31
93	0.4
94	0.41
95	0.39
96	0.35
97	0.31
98	0.29
99	0.24
100	0.2
101	0.12
102	0.11
103	0.1
104	0.11
105	0.1
106	0.11
107	0.19
108	0.24
109	0.26
110	0.34
111	0.35
112	0.37
113	0.41
114	0.4
115	0.36
116	0.39
117	0.39
118	0.34
119	0.34
120	0.31
121	0.28
122	0.28
123	0.25
124	0.2
125	0.22
126	0.21
127	0.21
128	0.21
129	0.21
130	0.24
131	0.24
132	0.23
133	0.2
134	0.22
135	0.24
136	0.26
137	0.27
138	0.24
139	0.23
140	0.22
141	0.23
142	0.24
143	0.22
144	0.2
145	0.22
146	0.21
147	0.22
148	0.22
149	0.16
150	0.12
151	0.11
152	0.1
153	0.06
154	0.06
155	0.04
156	0.05
157	0.05
158	0.05
159	0.05
160	0.05
161	0.04
162	0.04
163	0.04
164	0.04
165	0.03
166	0.03
167	0.03
168	0.03
169	0.04
170	0.04
171	0.03
172	0.03
173	0.03
174	0.03
175	0.04
176	0.03
177	0.03
178	0.03
179	0.03
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.06
184	0.06
185	0.06
186	0.08
187	0.09
188	0.1
189	0.13
190	0.13
191	0.15
192	0.15
193	0.15
194	0.14
195	0.14
196	0.13
197	0.11
198	0.11
199	0.09
200	0.12
201	0.13
202	0.14
203	0.13
204	0.12
205	0.12
206	0.15
207	0.21
208	0.23
209	0.22
210	0.22
211	0.21
212	0.2
213	0.21
214	0.18
215	0.12
216	0.07
217	0.07
218	0.08
219	0.08
220	0.08
221	0.08
222	0.07
223	0.07
224	0.07
225	0.08
226	0.08
227	0.09
228	0.1
229	0.1
230	0.11
231	0.12
232	0.12
233	0.12
234	0.13
235	0.12
236	0.11
237	0.12
238	0.11
239	0.1
240	0.1
241	0.11
242	0.08
243	0.08
244	0.06
245	0.06
246	0.06
247	0.06
248	0.07
249	0.06
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.08
254	0.09
255	0.09
256	0.09
257	0.11
258	0.1
259	0.1
260	0.1
261	0.09
262	0.1
263	0.1
264	0.1
265	0.07
266	0.07
267	0.08
268	0.09
269	0.09
270	0.08
271	0.09
272	0.13
273	0.15
274	0.16
275	0.18
276	0.18
277	0.22
278	0.28
279	0.31
280	0.28
281	0.31
282	0.32
283	0.32
284	0.32
285	0.34
286	0.27
287	0.27
288	0.29
289	0.24
290	0.21
291	0.2
292	0.2
293	0.15
294	0.16
295	0.17
296	0.14
297	0.15
298	0.14
299	0.14
300	0.13
301	0.12
302	0.11
303	0.07
304	0.08
305	0.08
306	0.08
307	0.08
308	0.07
309	0.07
310	0.08
311	0.08
312	0.09
313	0.1
314	0.1
315	0.11
316	0.12
317	0.14
318	0.17
319	0.18
320	0.18
321	0.18
322	0.2
323	0.21
324	0.21
325	0.19
326	0.18
327	0.18
328	0.16
329	0.15
330	0.12
331	0.1
332	0.11
333	0.11
334	0.09
335	0.08
336	0.07
337	0.06
338	0.07
339	0.07
340	0.05
341	0.06
342	0.06
343	0.06
344	0.06
345	0.07
346	0.08
347	0.08
348	0.08
349	0.08
350	0.08
351	0.09
352	0.1
353	0.16
354	0.18
355	0.25
356	0.29
357	0.35
358	0.4
359	0.45
360	0.51
361	0.5
362	0.5
363	0.47
364	0.46
365	0.48
366	0.49
367	0.48
368	0.51
369	0.55
370	0.57
371	0.61
372	0.62
373	0.57
374	0.55
375	0.56
376	0.5
377	0.44
378	0.4
379	0.34
380	0.33
381	0.31
382	0.27
383	0.21
384	0.18
385	0.15
386	0.12
387	0.1
388	0.09
389	0.07
390	0.07
391	0.07
392	0.08
393	0.08
394	0.09
395	0.12
396	0.11
397	0.12
398	0.13
399	0.13
400	0.15
401	0.21
402	0.29
403	0.32
404	0.38
405	0.41
406	0.43
407	0.5
408	0.52
409	0.48
410	0.46
411	0.49
412	0.49
413	0.52
414	0.52
415	0.46
416	0.45
417	0.49
418	0.52
419	0.55
420	0.55
421	0.52
422	0.54
423	0.54
424	0.52
425	0.54
426	0.51
427	0.48
428	0.47
429	0.5
430	0.52
431	0.53
432	0.55
433	0.55
434	0.58
435	0.56
436	0.58
437	0.61
438	0.63
439	0.71
440	0.72
441	0.69
442	0.68
443	0.67
444	0.64
445	0.64
446	0.65
447	0.63
448	0.63
449	0.62
450	0.6
451	0.58
452	0.62
453	0.56
454	0.5
455	0.43
456	0.45
457	0.49
458	0.48
459	0.57
460	0.54
461	0.52
462	0.58
463	0.57
464	0.56
465	0.57
466	0.6
467	0.59
468	0.63
469	0.7
470	0.67
471	0.77
472	0.8
473	0.82
474	0.84
475	0.86
476	0.87
477	0.88
478	0.9
479	0.89
480	0.92
481	0.91
482	0.89
483	0.88
484	0.84
485	0.83
486	0.82

A0A0S2LI92

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer