FuNGI

A0A0F4GQD2

Protein Details

Accession

A0A0F4GQD2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
336-357	SSLASGRRKKRKGAKTSTTNYS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
341-350	GRRKKRKGAK

Subcellular Location(s)

nucl 13, mito 12

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPRRKVFDKKTATTFALVHRAQNDPLIHDENAPSMVFAEKQTRRPNEDDYAGSSAGSQYSGASYRSRKVKQRGDLEDEFGSAVRQNEGEAAQHGVFYDDTRYDYMQHMKDLGTGEGPVMWVEANAPTQKGKGKQKLEDVLRDMDLSETRSVGMSSTTSSVARSLLPEDVLPSEFVQRRSYQDQQDVPDEIAGFQPDMDPRLREVLEALEDEEYVDDEEDIFAELTKDGYEVEKDEWDLYGEQQLFEEDDAGWESDDTIKAPGSPPPSNVSLADLNLPEGEDAKPPEDVQAQPPADPTAGAWLEEFEKFKAADKASHAKPVKLNPMAPSTLESSVLSSLASGRRKKRKGAKTSTTNYSMTSSALARTGQLTLLDDRFDKFENAYSVAEFPEEEEDDYLADNASAMSGMTSLSKASRASRYSTASGMSGVSGVSSYSRATDSEAPQLTRSDFDGIMDDFLGSHSKTGKLGRRVKRGGPQSGMEQLDEIRSQLGPARMKTGAKSAAAK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.5
3	0.5
4	0.43
5	0.4
6	0.36
7	0.37
8	0.35
9	0.38
10	0.34
11	0.27
12	0.31
13	0.32
14	0.3
15	0.29
16	0.29
17	0.24
18	0.25
19	0.22
20	0.16
21	0.13
22	0.13
23	0.12
24	0.14
25	0.22
26	0.26
27	0.34
28	0.44
29	0.5
30	0.55
31	0.58
32	0.62
33	0.59
34	0.58
35	0.52
36	0.47
37	0.45
38	0.38
39	0.34
40	0.28
41	0.22
42	0.17
43	0.15
44	0.11
45	0.07
46	0.09
47	0.11
48	0.13
49	0.17
50	0.2
51	0.27
52	0.37
53	0.44
54	0.51
55	0.59
56	0.67
57	0.71
58	0.77
59	0.78
60	0.77
61	0.73
62	0.67
63	0.58
64	0.49
65	0.4
66	0.3
67	0.22
68	0.16
69	0.14
70	0.11
71	0.1
72	0.1
73	0.11
74	0.12
75	0.13
76	0.12
77	0.14
78	0.13
79	0.13
80	0.13
81	0.12
82	0.12
83	0.11
84	0.12
85	0.1
86	0.12
87	0.14
88	0.14
89	0.15
90	0.19
91	0.26
92	0.25
93	0.25
94	0.25
95	0.23
96	0.25
97	0.25
98	0.22
99	0.15
100	0.13
101	0.12
102	0.11
103	0.11
104	0.08
105	0.06
106	0.05
107	0.05
108	0.05
109	0.07
110	0.09
111	0.1
112	0.11
113	0.11
114	0.14
115	0.19
116	0.26
117	0.35
118	0.42
119	0.48
120	0.52
121	0.6
122	0.66
123	0.66
124	0.64
125	0.57
126	0.5
127	0.44
128	0.39
129	0.31
130	0.24
131	0.2
132	0.16
133	0.13
134	0.11
135	0.1
136	0.11
137	0.1
138	0.09
139	0.09
140	0.07
141	0.07
142	0.09
143	0.1
144	0.1
145	0.1
146	0.1
147	0.1
148	0.1
149	0.1
150	0.1
151	0.1
152	0.1
153	0.1
154	0.1
155	0.11
156	0.11
157	0.11
158	0.1
159	0.15
160	0.18
161	0.2
162	0.22
163	0.22
164	0.27
165	0.32
166	0.38
167	0.36
168	0.4
169	0.41
170	0.41
171	0.42
172	0.38
173	0.32
174	0.27
175	0.22
176	0.16
177	0.13
178	0.11
179	0.07
180	0.06
181	0.07
182	0.07
183	0.09
184	0.09
185	0.09
186	0.1
187	0.14
188	0.14
189	0.12
190	0.13
191	0.12
192	0.12
193	0.11
194	0.11
195	0.08
196	0.08
197	0.08
198	0.07
199	0.06
200	0.05
201	0.05
202	0.04
203	0.04
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.04
215	0.05
216	0.05
217	0.06
218	0.07
219	0.08
220	0.08
221	0.08
222	0.08
223	0.09
224	0.09
225	0.08
226	0.11
227	0.1
228	0.1
229	0.1
230	0.1
231	0.09
232	0.09
233	0.09
234	0.04
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.06
244	0.06
245	0.05
246	0.06
247	0.07
248	0.1
249	0.14
250	0.15
251	0.16
252	0.19
253	0.2
254	0.21
255	0.2
256	0.2
257	0.15
258	0.15
259	0.15
260	0.12
261	0.11
262	0.09
263	0.09
264	0.06
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.08
269	0.09
270	0.09
271	0.09
272	0.11
273	0.12
274	0.13
275	0.13
276	0.2
277	0.2
278	0.2
279	0.2
280	0.19
281	0.17
282	0.16
283	0.13
284	0.11
285	0.11
286	0.11
287	0.1
288	0.1
289	0.11
290	0.12
291	0.14
292	0.08
293	0.1
294	0.1
295	0.13
296	0.17
297	0.17
298	0.19
299	0.23
300	0.3
301	0.3
302	0.39
303	0.38
304	0.36
305	0.39
306	0.41
307	0.45
308	0.4
309	0.4
310	0.34
311	0.37
312	0.34
313	0.31
314	0.27
315	0.22
316	0.19
317	0.19
318	0.16
319	0.13
320	0.12
321	0.12
322	0.1
323	0.07
324	0.09
325	0.13
326	0.2
327	0.25
328	0.34
329	0.44
330	0.48
331	0.57
332	0.65
333	0.7
334	0.75
335	0.79
336	0.8
337	0.8
338	0.82
339	0.8
340	0.74
341	0.64
342	0.54
343	0.46
344	0.36
345	0.27
346	0.22
347	0.16
348	0.12
349	0.13
350	0.12
351	0.1
352	0.1
353	0.11
354	0.1
355	0.09
356	0.11
357	0.12
358	0.13
359	0.14
360	0.13
361	0.14
362	0.15
363	0.16
364	0.15
365	0.13
366	0.16
367	0.17
368	0.19
369	0.19
370	0.18
371	0.17
372	0.16
373	0.16
374	0.12
375	0.1
376	0.11
377	0.11
378	0.11
379	0.11
380	0.1
381	0.1
382	0.11
383	0.1
384	0.07
385	0.06
386	0.05
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.03
391	0.03
392	0.03
393	0.04
394	0.05
395	0.05
396	0.06
397	0.07
398	0.09
399	0.11
400	0.15
401	0.22
402	0.24
403	0.29
404	0.34
405	0.38
406	0.38
407	0.38
408	0.35
409	0.28
410	0.26
411	0.21
412	0.16
413	0.11
414	0.09
415	0.07
416	0.06
417	0.05
418	0.05
419	0.06
420	0.06
421	0.08
422	0.09
423	0.09
424	0.14
425	0.2
426	0.22
427	0.3
428	0.33
429	0.33
430	0.34
431	0.36
432	0.32
433	0.27
434	0.27
435	0.22
436	0.18
437	0.17
438	0.19
439	0.17
440	0.17
441	0.16
442	0.14
443	0.1
444	0.11
445	0.13
446	0.1
447	0.11
448	0.12
449	0.14
450	0.17
451	0.26
452	0.34
453	0.41
454	0.51
455	0.59
456	0.68
457	0.72
458	0.76
459	0.78
460	0.78
461	0.76
462	0.71
463	0.65
464	0.59
465	0.6
466	0.54
467	0.45
468	0.37
469	0.29
470	0.27
471	0.25
472	0.2
473	0.14
474	0.13
475	0.13
476	0.17
477	0.24
478	0.26
479	0.27
480	0.32
481	0.34
482	0.36
483	0.38
484	0.4
485	0.39

A0A0F4GQD2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer