Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5K960

Protein Details
Accession Q5K960    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
149-171IESKDEGRGKRKRQNIGGRDEKKBasic
540-564EATDGRGQRKKKKVNYKIEENDNKYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
108-173EKRKAEARAEIRKANKEKKEAEAKEIRREGVGDKRKPKRAEIESKDEGRGKRKRQNIGGRDEKKAK
548-551RKKK
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 9.5, cyto_mito 7.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR038718  SNF2-like_sf  
IPR000330  SNF2_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0008094  F:ATP-dependent activity, acting on DNA  
GO:0140658  F:ATP-dependent chromatin remodeler activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0044030  P:regulation of DNA methylation  
KEGG cne:CNK03090  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00271  Helicase_C  
PF00176  SNF2-rel_dom  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18793  SF2_C_SNF  
Amino Acid Sequences MSTVTPSLANSTAATSPMSQSPSTRSASPSKEEVKIVSSSERDAAADGADVDGQEGIADPKKVVEELKEEGQHDPEAAARAARLNFLLDKSTIYAKIIGDRMARQQIEKRKAEARAEIRKANKEKKEAEAKEIRREGVGDKRKPKRAEIESKDEGRGKRKRQNIGGRDEKKAKVDKDEVDVDERPPEQVSEQTQSVHAEQDGEEEDDGDVQYSFKQPELVTGAKLRDYQLAGVQWMISLYENGLNGILADEMGLGKTLQTISFLSHLRSKGTWGPFLIVCPLSVLNNWIMEFEKFTPSVPVLMYHGNPDHRAELRATRLQTPTASDAGSSKTKGRKSNSNLAGNNTSTFPIVITTYEMCMKDKQFLSGIKWKFIVVDEGHRLKNLDCKLIRELKSYTSANRMILTGTPLHNNLAELWSLLNFILPDIFDDLDSFQQWFNFDEMNEGQTTEGLLNKSNVVASLHAILKPFLLRRLKVDVEKELPPKKEYLLYAPLTQMQKDIYQAIVSGQIREYLIDKVSSSGSGSNTPKEETPELEAAVEATDGRGQRKKKKVNYKIEENDNKYVRDLEEGRIRPEDGPTGLEEKSAAEVGREWALKQATKHVNNMRLQNLVMQLRKISSHPYLFDWPSDPATGELVVDDNLVNASGKMLLLNRLLDALFQKGHRVLLFSQFTTMLDVIEDWATVYKGWKVCRIDGSTPQESRREQMDEFNGGKDDPNACKLFLLSTRAGGLGINLVSADTVIFFDQDWNPQMDLQAQDRAHRIGQTKPVLVFRLVSAHTIESKILAKAGNKRKLEALVISQGKFGRVVDENGRVLLGRKSTKKAEAKESVTEMAKALLDLEGEEINVASKDDQIISDADLEILLDRSPAAFARQKGWSAGLSKAGAHGRAEQLKKGEKTTFEVFETAKDDGQGLSGMFGGDGDAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.16
3 0.17
4 0.2
5 0.23
6 0.21
7 0.22
8 0.27
9 0.31
10 0.33
11 0.33
12 0.34
13 0.39
14 0.43
15 0.46
16 0.48
17 0.48
18 0.49
19 0.48
20 0.45
21 0.41
22 0.38
23 0.35
24 0.33
25 0.29
26 0.27
27 0.27
28 0.26
29 0.22
30 0.21
31 0.19
32 0.14
33 0.13
34 0.11
35 0.09
36 0.09
37 0.08
38 0.07
39 0.07
40 0.06
41 0.05
42 0.06
43 0.08
44 0.11
45 0.12
46 0.12
47 0.13
48 0.15
49 0.16
50 0.17
51 0.19
52 0.2
53 0.24
54 0.31
55 0.34
56 0.34
57 0.35
58 0.36
59 0.32
60 0.28
61 0.23
62 0.19
63 0.18
64 0.17
65 0.15
66 0.13
67 0.17
68 0.17
69 0.18
70 0.17
71 0.16
72 0.18
73 0.19
74 0.21
75 0.17
76 0.18
77 0.19
78 0.22
79 0.2
80 0.19
81 0.21
82 0.19
83 0.24
84 0.25
85 0.26
86 0.26
87 0.27
88 0.32
89 0.37
90 0.37
91 0.36
92 0.42
93 0.48
94 0.55
95 0.56
96 0.55
97 0.53
98 0.59
99 0.6
100 0.61
101 0.61
102 0.61
103 0.63
104 0.66
105 0.65
106 0.68
107 0.73
108 0.73
109 0.72
110 0.69
111 0.68
112 0.7
113 0.74
114 0.67
115 0.67
116 0.68
117 0.65
118 0.66
119 0.66
120 0.57
121 0.47
122 0.46
123 0.41
124 0.42
125 0.47
126 0.46
127 0.52
128 0.61
129 0.69
130 0.71
131 0.73
132 0.72
133 0.73
134 0.75
135 0.73
136 0.73
137 0.71
138 0.71
139 0.69
140 0.65
141 0.58
142 0.57
143 0.58
144 0.59
145 0.6
146 0.65
147 0.69
148 0.74
149 0.81
150 0.79
151 0.8
152 0.81
153 0.78
154 0.77
155 0.75
156 0.67
157 0.63
158 0.63
159 0.55
160 0.52
161 0.54
162 0.49
163 0.49
164 0.51
165 0.46
166 0.43
167 0.42
168 0.35
169 0.32
170 0.29
171 0.24
172 0.19
173 0.18
174 0.15
175 0.18
176 0.21
177 0.21
178 0.22
179 0.22
180 0.23
181 0.24
182 0.24
183 0.21
184 0.17
185 0.14
186 0.13
187 0.14
188 0.14
189 0.13
190 0.12
191 0.11
192 0.11
193 0.1
194 0.1
195 0.08
196 0.07
197 0.06
198 0.07
199 0.1
200 0.1
201 0.1
202 0.13
203 0.13
204 0.17
205 0.22
206 0.22
207 0.21
208 0.24
209 0.25
210 0.24
211 0.26
212 0.23
213 0.21
214 0.21
215 0.2
216 0.2
217 0.19
218 0.18
219 0.17
220 0.15
221 0.11
222 0.1
223 0.1
224 0.06
225 0.05
226 0.06
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.08
248 0.09
249 0.13
250 0.14
251 0.15
252 0.19
253 0.2
254 0.21
255 0.21
256 0.23
257 0.26
258 0.29
259 0.29
260 0.25
261 0.27
262 0.25
263 0.25
264 0.25
265 0.18
266 0.15
267 0.13
268 0.13
269 0.11
270 0.11
271 0.12
272 0.09
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.11
277 0.1
278 0.13
279 0.13
280 0.14
281 0.13
282 0.14
283 0.15
284 0.14
285 0.15
286 0.13
287 0.12
288 0.11
289 0.14
290 0.14
291 0.14
292 0.17
293 0.17
294 0.18
295 0.19
296 0.2
297 0.19
298 0.2
299 0.19
300 0.21
301 0.25
302 0.28
303 0.29
304 0.3
305 0.3
306 0.3
307 0.28
308 0.27
309 0.24
310 0.21
311 0.19
312 0.14
313 0.14
314 0.16
315 0.18
316 0.16
317 0.18
318 0.23
319 0.29
320 0.35
321 0.39
322 0.45
323 0.5
324 0.6
325 0.63
326 0.65
327 0.61
328 0.59
329 0.58
330 0.48
331 0.42
332 0.33
333 0.25
334 0.16
335 0.15
336 0.1
337 0.08
338 0.07
339 0.07
340 0.08
341 0.08
342 0.09
343 0.12
344 0.12
345 0.13
346 0.15
347 0.16
348 0.2
349 0.2
350 0.21
351 0.21
352 0.22
353 0.26
354 0.32
355 0.33
356 0.29
357 0.29
358 0.27
359 0.24
360 0.23
361 0.22
362 0.14
363 0.18
364 0.22
365 0.25
366 0.25
367 0.25
368 0.25
369 0.21
370 0.27
371 0.23
372 0.25
373 0.22
374 0.25
375 0.3
376 0.38
377 0.39
378 0.35
379 0.35
380 0.3
381 0.35
382 0.33
383 0.29
384 0.26
385 0.27
386 0.24
387 0.23
388 0.21
389 0.16
390 0.15
391 0.15
392 0.12
393 0.11
394 0.12
395 0.12
396 0.12
397 0.12
398 0.12
399 0.1
400 0.09
401 0.08
402 0.07
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.05
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.05
414 0.06
415 0.05
416 0.06
417 0.06
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.06
422 0.07
423 0.08
424 0.08
425 0.09
426 0.08
427 0.08
428 0.1
429 0.1
430 0.11
431 0.1
432 0.09
433 0.08
434 0.08
435 0.08
436 0.05
437 0.07
438 0.06
439 0.07
440 0.07
441 0.08
442 0.08
443 0.07
444 0.08
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.08
449 0.09
450 0.09
451 0.1
452 0.09
453 0.09
454 0.1
455 0.1
456 0.14
457 0.16
458 0.16
459 0.19
460 0.24
461 0.26
462 0.28
463 0.3
464 0.27
465 0.28
466 0.32
467 0.35
468 0.35
469 0.34
470 0.32
471 0.31
472 0.28
473 0.28
474 0.24
475 0.22
476 0.23
477 0.23
478 0.23
479 0.23
480 0.26
481 0.23
482 0.22
483 0.19
484 0.13
485 0.13
486 0.12
487 0.12
488 0.08
489 0.08
490 0.08
491 0.07
492 0.12
493 0.11
494 0.11
495 0.1
496 0.11
497 0.11
498 0.12
499 0.13
500 0.08
501 0.09
502 0.09
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.09
507 0.08
508 0.09
509 0.09
510 0.15
511 0.16
512 0.17
513 0.17
514 0.18
515 0.19
516 0.2
517 0.2
518 0.16
519 0.18
520 0.17
521 0.16
522 0.15
523 0.14
524 0.11
525 0.1
526 0.09
527 0.05
528 0.04
529 0.06
530 0.07
531 0.1
532 0.15
533 0.2
534 0.29
535 0.39
536 0.48
537 0.56
538 0.66
539 0.74
540 0.8
541 0.83
542 0.84
543 0.81
544 0.82
545 0.81
546 0.74
547 0.71
548 0.62
549 0.55
550 0.45
551 0.39
552 0.29
553 0.26
554 0.23
555 0.19
556 0.26
557 0.27
558 0.28
559 0.28
560 0.29
561 0.25
562 0.24
563 0.22
564 0.14
565 0.14
566 0.13
567 0.14
568 0.13
569 0.13
570 0.12
571 0.1
572 0.1
573 0.1
574 0.09
575 0.06
576 0.07
577 0.08
578 0.12
579 0.11
580 0.11
581 0.14
582 0.16
583 0.17
584 0.17
585 0.25
586 0.31
587 0.33
588 0.4
589 0.42
590 0.48
591 0.5
592 0.54
593 0.47
594 0.4
595 0.37
596 0.33
597 0.31
598 0.28
599 0.25
600 0.21
601 0.2
602 0.19
603 0.2
604 0.18
605 0.18
606 0.19
607 0.2
608 0.21
609 0.24
610 0.29
611 0.29
612 0.29
613 0.26
614 0.23
615 0.22
616 0.21
617 0.17
618 0.13
619 0.13
620 0.12
621 0.09
622 0.08
623 0.07
624 0.06
625 0.06
626 0.06
627 0.05
628 0.05
629 0.05
630 0.05
631 0.04
632 0.04
633 0.04
634 0.05
635 0.05
636 0.06
637 0.09
638 0.1
639 0.11
640 0.1
641 0.11
642 0.11
643 0.11
644 0.11
645 0.11
646 0.11
647 0.11
648 0.14
649 0.14
650 0.16
651 0.15
652 0.17
653 0.16
654 0.23
655 0.25
656 0.23
657 0.23
658 0.21
659 0.21
660 0.21
661 0.2
662 0.11
663 0.09
664 0.08
665 0.08
666 0.08
667 0.08
668 0.05
669 0.06
670 0.06
671 0.06
672 0.08
673 0.11
674 0.15
675 0.17
676 0.24
677 0.26
678 0.29
679 0.36
680 0.4
681 0.4
682 0.45
683 0.51
684 0.51
685 0.5
686 0.5
687 0.49
688 0.44
689 0.42
690 0.38
691 0.34
692 0.28
693 0.32
694 0.33
695 0.34
696 0.34
697 0.33
698 0.29
699 0.25
700 0.25
701 0.22
702 0.21
703 0.18
704 0.22
705 0.22
706 0.22
707 0.22
708 0.21
709 0.21
710 0.21
711 0.24
712 0.19
713 0.19
714 0.19
715 0.19
716 0.19
717 0.15
718 0.12
719 0.09
720 0.08
721 0.07
722 0.06
723 0.06
724 0.06
725 0.06
726 0.05
727 0.03
728 0.04
729 0.04
730 0.05
731 0.05
732 0.09
733 0.1
734 0.14
735 0.16
736 0.17
737 0.18
738 0.18
739 0.18
740 0.19
741 0.21
742 0.2
743 0.25
744 0.23
745 0.25
746 0.27
747 0.29
748 0.27
749 0.29
750 0.29
751 0.27
752 0.36
753 0.38
754 0.39
755 0.39
756 0.41
757 0.38
758 0.37
759 0.32
760 0.24
761 0.24
762 0.22
763 0.2
764 0.19
765 0.18
766 0.19
767 0.19
768 0.18
769 0.15
770 0.16
771 0.15
772 0.16
773 0.17
774 0.2
775 0.29
776 0.39
777 0.46
778 0.45
779 0.46
780 0.48
781 0.49
782 0.47
783 0.4
784 0.35
785 0.35
786 0.38
787 0.37
788 0.36
789 0.34
790 0.31
791 0.29
792 0.24
793 0.19
794 0.18
795 0.22
796 0.24
797 0.29
798 0.29
799 0.28
800 0.28
801 0.24
802 0.23
803 0.23
804 0.24
805 0.26
806 0.31
807 0.37
808 0.42
809 0.51
810 0.58
811 0.6
812 0.63
813 0.64
814 0.63
815 0.63
816 0.61
817 0.56
818 0.49
819 0.43
820 0.34
821 0.27
822 0.22
823 0.17
824 0.14
825 0.1
826 0.09
827 0.08
828 0.09
829 0.08
830 0.08
831 0.08
832 0.07
833 0.07
834 0.07
835 0.08
836 0.07
837 0.08
838 0.09
839 0.1
840 0.11
841 0.11
842 0.12
843 0.12
844 0.13
845 0.12
846 0.11
847 0.1
848 0.1
849 0.09
850 0.09
851 0.07
852 0.06
853 0.06
854 0.06
855 0.07
856 0.08
857 0.13
858 0.18
859 0.2
860 0.25
861 0.3
862 0.31
863 0.32
864 0.34
865 0.32
866 0.29
867 0.3
868 0.3
869 0.27
870 0.25
871 0.29
872 0.29
873 0.28
874 0.26
875 0.28
876 0.3
877 0.38
878 0.4
879 0.4
880 0.44
881 0.5
882 0.52
883 0.52
884 0.5
885 0.45
886 0.49
887 0.51
888 0.47
889 0.41
890 0.41
891 0.36
892 0.34
893 0.35
894 0.3
895 0.24
896 0.21
897 0.19
898 0.16
899 0.17
900 0.14
901 0.11
902 0.1
903 0.09
904 0.09
905 0.08
906 0.07