Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5K8S1

Protein Details
Accession Q5K8S1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
392-414EPEFQPPKRKRGRPTKAEKAAKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
203-204RR
397-413PPKRKRGRPTKAEKAAK
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 11, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG cne:CNL04700  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MSCPPAPNRIHQLPVRVSYYIPASSQTYSTIFPSLQQVYIHPQSAGGDDETWGSIYLKTVVKGVLAASPELHPAYPGTSDLSLYVLDPRETYFRRARVGSAHHGNTDTTGSEVWTGKGLVSWSLAEHGQGKNLIAGRLERDVAFTTAIRTQGMSALEALMAADQMGNVSEESWGIDISLGLNMGLGAPGGFARARASSPAVRRRRSSLEKEERGHITPPYPRQQKRASVPPAPQTFDIQEKLPAHPSSSSYSHDQPFRPGHNISHASSPIDPPRARGRPTKSASTGGRPRKVTASSHSSSTSIDGADPRQRPAHSQRPYEIPLPSSEGPNVYDALSSIPENILARPESLTREQAQRLLASPAFIDMLGKITGTSIPTGKPNPNNKRLRDGEEPEFQPPKRKRGRPTKAEKAAKEAQEAAARLAEAVKQKAEAVDGPQEDSRNPVCWNCGRTKSAIWRTKVMENGQSVRVCNACGLYWNKLGTMRPPNLWADGDDDRRSERAQSTFSEAPSEHGPAHRVDKPLARAQESFKRTLSAAVEQDARRMATRHKGRAPTSPNKHSKLGPMTSPPRGSASATKSLKQRKYTAASSPGGFVETMHDSFESEVNEASPEDEDESPHFRARPAPHPHRLTRNPPSNTDTRTLDLPLSDDGLGSGASRGNNEWNDEVSAFFDVEGFSMSTMAQHEIPEYSRRHHRQEVIQETKLGAHRSNPIHVTSSSMMENGHVGTDSTLEEDTVLSQLFNRTSSIAGPGSSPSGFDFSQLPPSSPPMSVLSSDALPHSALLLSSPVKKNTPSVSGQTPSASGLTPVDGNRLPQSSSKLRHSVNAGDSHDNDRQAGGNGGVQQLDFEGIQRMFNLMSHPDYVSQENTSAGTNHTPLSTFEDPQYGALNELIDGLGGGASGMKVNVGGEVVCGGEGETSSASAVLADGNGEDIFASFLDGGAFV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.54
3 0.46
4 0.41
5 0.36
6 0.37
7 0.31
8 0.25
9 0.22
10 0.22
11 0.23
12 0.23
13 0.23
14 0.21
15 0.2
16 0.22
17 0.22
18 0.19
19 0.19
20 0.24
21 0.24
22 0.24
23 0.24
24 0.24
25 0.3
26 0.34
27 0.34
28 0.27
29 0.25
30 0.24
31 0.25
32 0.25
33 0.18
34 0.14
35 0.13
36 0.14
37 0.14
38 0.13
39 0.13
40 0.11
41 0.1
42 0.11
43 0.16
44 0.17
45 0.17
46 0.19
47 0.18
48 0.18
49 0.18
50 0.17
51 0.15
52 0.14
53 0.14
54 0.14
55 0.14
56 0.17
57 0.17
58 0.16
59 0.13
60 0.13
61 0.14
62 0.14
63 0.14
64 0.14
65 0.14
66 0.14
67 0.14
68 0.14
69 0.12
70 0.12
71 0.16
72 0.15
73 0.14
74 0.15
75 0.16
76 0.23
77 0.26
78 0.32
79 0.35
80 0.37
81 0.42
82 0.43
83 0.44
84 0.43
85 0.48
86 0.5
87 0.51
88 0.49
89 0.46
90 0.45
91 0.43
92 0.37
93 0.32
94 0.23
95 0.15
96 0.13
97 0.11
98 0.14
99 0.14
100 0.13
101 0.14
102 0.13
103 0.12
104 0.14
105 0.14
106 0.12
107 0.12
108 0.12
109 0.11
110 0.13
111 0.13
112 0.12
113 0.16
114 0.15
115 0.17
116 0.17
117 0.17
118 0.19
119 0.21
120 0.2
121 0.18
122 0.19
123 0.19
124 0.21
125 0.22
126 0.18
127 0.18
128 0.19
129 0.19
130 0.19
131 0.16
132 0.16
133 0.17
134 0.18
135 0.16
136 0.14
137 0.14
138 0.16
139 0.16
140 0.14
141 0.12
142 0.11
143 0.11
144 0.1
145 0.1
146 0.06
147 0.05
148 0.04
149 0.04
150 0.03
151 0.03
152 0.04
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.07
160 0.06
161 0.05
162 0.06
163 0.05
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.07
180 0.08
181 0.09
182 0.11
183 0.16
184 0.2
185 0.29
186 0.39
187 0.46
188 0.5
189 0.53
190 0.57
191 0.62
192 0.65
193 0.66
194 0.67
195 0.69
196 0.72
197 0.72
198 0.72
199 0.66
200 0.6
201 0.53
202 0.43
203 0.37
204 0.36
205 0.4
206 0.45
207 0.5
208 0.51
209 0.56
210 0.62
211 0.66
212 0.67
213 0.7
214 0.67
215 0.64
216 0.66
217 0.67
218 0.64
219 0.58
220 0.51
221 0.44
222 0.39
223 0.37
224 0.33
225 0.25
226 0.27
227 0.26
228 0.27
229 0.3
230 0.28
231 0.25
232 0.25
233 0.26
234 0.25
235 0.26
236 0.27
237 0.26
238 0.31
239 0.33
240 0.37
241 0.35
242 0.37
243 0.4
244 0.4
245 0.4
246 0.37
247 0.34
248 0.38
249 0.41
250 0.36
251 0.35
252 0.33
253 0.3
254 0.29
255 0.31
256 0.27
257 0.31
258 0.29
259 0.28
260 0.37
261 0.4
262 0.43
263 0.47
264 0.5
265 0.53
266 0.57
267 0.61
268 0.54
269 0.56
270 0.55
271 0.56
272 0.58
273 0.56
274 0.58
275 0.53
276 0.52
277 0.5
278 0.5
279 0.44
280 0.41
281 0.4
282 0.35
283 0.36
284 0.35
285 0.31
286 0.28
287 0.26
288 0.21
289 0.13
290 0.12
291 0.11
292 0.13
293 0.2
294 0.21
295 0.22
296 0.25
297 0.25
298 0.3
299 0.37
300 0.44
301 0.44
302 0.47
303 0.48
304 0.5
305 0.53
306 0.5
307 0.43
308 0.34
309 0.28
310 0.3
311 0.27
312 0.23
313 0.2
314 0.18
315 0.17
316 0.17
317 0.16
318 0.1
319 0.1
320 0.08
321 0.09
322 0.09
323 0.08
324 0.07
325 0.07
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.1
333 0.11
334 0.14
335 0.15
336 0.18
337 0.19
338 0.23
339 0.23
340 0.25
341 0.25
342 0.22
343 0.21
344 0.22
345 0.19
346 0.15
347 0.14
348 0.11
349 0.1
350 0.09
351 0.08
352 0.05
353 0.07
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.07
359 0.07
360 0.08
361 0.07
362 0.08
363 0.12
364 0.15
365 0.19
366 0.27
367 0.37
368 0.45
369 0.54
370 0.61
371 0.6
372 0.66
373 0.64
374 0.63
375 0.6
376 0.57
377 0.52
378 0.5
379 0.49
380 0.45
381 0.45
382 0.39
383 0.41
384 0.4
385 0.44
386 0.48
387 0.53
388 0.59
389 0.66
390 0.76
391 0.76
392 0.82
393 0.83
394 0.84
395 0.84
396 0.75
397 0.71
398 0.67
399 0.58
400 0.49
401 0.39
402 0.31
403 0.27
404 0.26
405 0.19
406 0.14
407 0.12
408 0.1
409 0.1
410 0.1
411 0.1
412 0.1
413 0.1
414 0.1
415 0.1
416 0.11
417 0.11
418 0.09
419 0.09
420 0.12
421 0.12
422 0.14
423 0.14
424 0.15
425 0.14
426 0.16
427 0.15
428 0.13
429 0.14
430 0.13
431 0.15
432 0.18
433 0.21
434 0.23
435 0.26
436 0.25
437 0.26
438 0.29
439 0.35
440 0.42
441 0.45
442 0.43
443 0.43
444 0.44
445 0.45
446 0.45
447 0.38
448 0.32
449 0.28
450 0.29
451 0.28
452 0.26
453 0.23
454 0.21
455 0.19
456 0.15
457 0.13
458 0.11
459 0.07
460 0.1
461 0.12
462 0.14
463 0.16
464 0.16
465 0.16
466 0.17
467 0.18
468 0.19
469 0.24
470 0.23
471 0.22
472 0.24
473 0.24
474 0.24
475 0.24
476 0.19
477 0.16
478 0.18
479 0.2
480 0.19
481 0.18
482 0.18
483 0.18
484 0.18
485 0.16
486 0.16
487 0.15
488 0.16
489 0.17
490 0.23
491 0.23
492 0.23
493 0.23
494 0.2
495 0.19
496 0.19
497 0.19
498 0.13
499 0.12
500 0.13
501 0.13
502 0.17
503 0.19
504 0.19
505 0.2
506 0.23
507 0.26
508 0.3
509 0.3
510 0.29
511 0.26
512 0.29
513 0.36
514 0.35
515 0.33
516 0.29
517 0.28
518 0.25
519 0.27
520 0.24
521 0.19
522 0.17
523 0.17
524 0.21
525 0.2
526 0.21
527 0.19
528 0.18
529 0.14
530 0.15
531 0.16
532 0.21
533 0.28
534 0.34
535 0.39
536 0.45
537 0.46
538 0.54
539 0.59
540 0.6
541 0.61
542 0.64
543 0.65
544 0.63
545 0.63
546 0.56
547 0.54
548 0.51
549 0.45
550 0.37
551 0.38
552 0.38
553 0.4
554 0.39
555 0.34
556 0.3
557 0.28
558 0.28
559 0.26
560 0.26
561 0.31
562 0.32
563 0.35
564 0.39
565 0.47
566 0.51
567 0.5
568 0.5
569 0.47
570 0.52
571 0.52
572 0.51
573 0.49
574 0.45
575 0.4
576 0.37
577 0.3
578 0.24
579 0.21
580 0.15
581 0.11
582 0.12
583 0.11
584 0.11
585 0.11
586 0.1
587 0.11
588 0.13
589 0.11
590 0.09
591 0.08
592 0.08
593 0.09
594 0.08
595 0.08
596 0.07
597 0.06
598 0.08
599 0.08
600 0.09
601 0.11
602 0.15
603 0.16
604 0.17
605 0.17
606 0.16
607 0.22
608 0.26
609 0.34
610 0.4
611 0.47
612 0.54
613 0.61
614 0.65
615 0.68
616 0.7
617 0.7
618 0.69
619 0.71
620 0.65
621 0.63
622 0.63
623 0.58
624 0.54
625 0.49
626 0.42
627 0.33
628 0.32
629 0.29
630 0.24
631 0.19
632 0.17
633 0.13
634 0.13
635 0.11
636 0.09
637 0.08
638 0.08
639 0.08
640 0.06
641 0.06
642 0.07
643 0.07
644 0.08
645 0.09
646 0.13
647 0.14
648 0.17
649 0.17
650 0.16
651 0.17
652 0.17
653 0.16
654 0.12
655 0.12
656 0.1
657 0.08
658 0.07
659 0.06
660 0.06
661 0.07
662 0.06
663 0.05
664 0.05
665 0.05
666 0.06
667 0.07
668 0.09
669 0.08
670 0.08
671 0.09
672 0.1
673 0.12
674 0.18
675 0.18
676 0.22
677 0.32
678 0.37
679 0.43
680 0.48
681 0.53
682 0.55
683 0.63
684 0.69
685 0.66
686 0.62
687 0.56
688 0.5
689 0.47
690 0.42
691 0.35
692 0.25
693 0.21
694 0.27
695 0.29
696 0.32
697 0.31
698 0.29
699 0.3
700 0.29
701 0.31
702 0.25
703 0.24
704 0.2
705 0.19
706 0.17
707 0.14
708 0.15
709 0.1
710 0.09
711 0.07
712 0.06
713 0.06
714 0.07
715 0.07
716 0.08
717 0.07
718 0.07
719 0.07
720 0.07
721 0.07
722 0.07
723 0.07
724 0.06
725 0.07
726 0.1
727 0.11
728 0.11
729 0.12
730 0.11
731 0.12
732 0.13
733 0.16
734 0.14
735 0.13
736 0.13
737 0.13
738 0.15
739 0.14
740 0.14
741 0.11
742 0.14
743 0.14
744 0.14
745 0.16
746 0.15
747 0.24
748 0.24
749 0.24
750 0.22
751 0.26
752 0.27
753 0.25
754 0.26
755 0.2
756 0.21
757 0.21
758 0.21
759 0.19
760 0.17
761 0.17
762 0.15
763 0.13
764 0.11
765 0.1
766 0.09
767 0.08
768 0.07
769 0.07
770 0.1
771 0.11
772 0.18
773 0.22
774 0.24
775 0.26
776 0.28
777 0.33
778 0.34
779 0.37
780 0.34
781 0.36
782 0.39
783 0.39
784 0.39
785 0.35
786 0.31
787 0.27
788 0.23
789 0.18
790 0.13
791 0.11
792 0.11
793 0.13
794 0.12
795 0.16
796 0.16
797 0.18
798 0.2
799 0.21
800 0.22
801 0.23
802 0.3
803 0.34
804 0.39
805 0.44
806 0.47
807 0.47
808 0.5
809 0.51
810 0.51
811 0.48
812 0.49
813 0.46
814 0.43
815 0.44
816 0.45
817 0.44
818 0.38
819 0.33
820 0.27
821 0.24
822 0.21
823 0.21
824 0.16
825 0.15
826 0.16
827 0.17
828 0.16
829 0.14
830 0.13
831 0.11
832 0.12
833 0.09
834 0.08
835 0.12
836 0.12
837 0.13
838 0.13
839 0.14
840 0.13
841 0.14
842 0.16
843 0.14
844 0.16
845 0.17
846 0.18
847 0.2
848 0.22
849 0.24
850 0.24
851 0.23
852 0.21
853 0.2
854 0.2
855 0.18
856 0.16
857 0.16
858 0.17
859 0.17
860 0.17
861 0.17
862 0.17
863 0.17
864 0.25
865 0.25
866 0.24
867 0.24
868 0.27
869 0.26
870 0.26
871 0.28
872 0.2
873 0.18
874 0.17
875 0.16
876 0.13
877 0.13
878 0.11
879 0.07
880 0.07
881 0.06
882 0.05
883 0.04
884 0.04
885 0.03
886 0.04
887 0.05
888 0.04
889 0.04
890 0.05
891 0.05
892 0.06
893 0.06
894 0.06
895 0.06
896 0.06
897 0.07
898 0.06
899 0.06
900 0.06
901 0.06
902 0.06
903 0.07
904 0.07
905 0.07
906 0.07
907 0.08
908 0.07
909 0.07
910 0.07
911 0.06
912 0.05
913 0.05
914 0.05
915 0.07
916 0.07
917 0.06
918 0.06
919 0.06
920 0.07
921 0.06
922 0.08
923 0.06
924 0.06