Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F4GWH6

Protein Details
Accession A0A0F4GWH6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-128DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQHydrophilic
409-439AIFKRRREADKKSEQRNKRNQERDNRFNNKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
412-434KRRREADKKSEQRNKRNQERDNR
438-438K
Subcellular Location(s) cyto 10, mito 9, cyto_nucl 8.833, nucl 6.5, cyto_pero 6.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSKKYPKIITPVVEEPGREVENSDGSITKIPANSLGPNPNGEEMDNLYLDMNGIVHPCSHPEDRPPPANEEEMMIAVFEYTERVVNMVRPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAAEKDAEASEFHARMVANGERSANGDGDDSSPKKTWDSNSITPGTPFMDLLAASLRYWVSYKLSTDPAWEKLKVIISDATVPGEGEHKIMNFVRSQRSSPEHDPNLRHVMYGLDADLIMLGIATHEPHFRILREDVFANDTKPGHCRKCNQPGHIAAHCQGLVKPKDEDANIVKPPKPFIWLHVGVLREYLAVEMSVPNQGFRFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIREDAIDTLIAIWRDNIPSMGGYVTKDGHVDLARAQSILAGLAKQEDAIFKRRREADKKSEQRNKRNQERDNRFNNKKPRYSGGGEPTGFDETIVRRGARGGIIRGEAAPDPNALPTFAPGAAQTRNDPRYAANLTHADVVGGKAALDKANQDNRSAAAALKEKLMGSKKPADNQKAELDALFSGANGGSGTTPVLGKRTRDMIEDSVANEPSSDPSTPGRNTPDKEIADPMNRGSSGALGGTSKNTSEDMPEDTVKLWEDGYQDRYYEQKFHASPQDIEFRHKVARHYVEGLAWVLLYYFQGCPSWTWYYPFHYAPFAADFVDMEKQVVSFEKGKPFHPYEQLMGVMPVASNHTLPAVFHPLMTEDTSPIKEFYPLEFDLDLNGKKFAWQGVALLPFIDEKKLLSAMAEKYPLLTEDEQRRNAFGEEVLIFSTKHPLYQEVVSNFYGKKATDAKVKLNPKVTEGLAGKASKDPSYNPNSELTFPFDSGEQDQFGDLEVDESVKVSYHMPVLSTLHKSMLLPGVKFKEPVLDYNDVEVTRNRANNSGRRHGGVQLSEHGDRSDGRRINYAAGNNGYAGNGRGGGNGYGANGGYGRGNGGQDQFSSRAADVFANLPPHLAAQAAQHGFQPPPMGGYPPPGYPPMPPQGYQPPGQYGQSRGPPLSQNGYGARGGGGYGQGGYNGGGYGGGDSYRGGGGNSHRGGGSYGAGGDSYRGGGDYGRGGGRGGRRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.62
3 0.66
4 0.68
5 0.65
6 0.62
7 0.59
8 0.56
9 0.48
10 0.44
11 0.39
12 0.37
13 0.33
14 0.25
15 0.23
16 0.21
17 0.22
18 0.23
19 0.21
20 0.17
21 0.17
22 0.21
23 0.2
24 0.21
25 0.19
26 0.19
27 0.22
28 0.24
29 0.27
30 0.29
31 0.34
32 0.32
33 0.33
34 0.35
35 0.33
36 0.31
37 0.27
38 0.24
39 0.21
40 0.22
41 0.2
42 0.18
43 0.15
44 0.14
45 0.14
46 0.12
47 0.09
48 0.07
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.1
53 0.12
54 0.18
55 0.21
56 0.23
57 0.31
58 0.39
59 0.45
60 0.53
61 0.53
62 0.53
63 0.53
64 0.53
65 0.44
66 0.38
67 0.32
68 0.24
69 0.21
70 0.15
71 0.11
72 0.09
73 0.08
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.07
78 0.07
79 0.09
80 0.1
81 0.16
82 0.26
83 0.33
84 0.36
85 0.37
86 0.39
87 0.41
88 0.41
89 0.39
90 0.32
91 0.29
92 0.27
93 0.25
94 0.24
95 0.21
96 0.2
97 0.18
98 0.15
99 0.1
100 0.13
101 0.19
102 0.26
103 0.37
104 0.46
105 0.55
106 0.66
107 0.74
108 0.8
109 0.82
110 0.79
111 0.76
112 0.76
113 0.73
114 0.7
115 0.71
116 0.63
117 0.59
118 0.56
119 0.48
120 0.39
121 0.31
122 0.24
123 0.15
124 0.16
125 0.17
126 0.15
127 0.15
128 0.17
129 0.16
130 0.16
131 0.21
132 0.21
133 0.19
134 0.2
135 0.21
136 0.19
137 0.22
138 0.23
139 0.18
140 0.15
141 0.13
142 0.13
143 0.15
144 0.21
145 0.2
146 0.22
147 0.23
148 0.23
149 0.25
150 0.28
151 0.3
152 0.33
153 0.4
154 0.43
155 0.48
156 0.5
157 0.48
158 0.44
159 0.41
160 0.33
161 0.25
162 0.19
163 0.13
164 0.11
165 0.1
166 0.1
167 0.12
168 0.11
169 0.1
170 0.12
171 0.11
172 0.11
173 0.12
174 0.13
175 0.14
176 0.16
177 0.18
178 0.21
179 0.25
180 0.24
181 0.29
182 0.31
183 0.34
184 0.36
185 0.34
186 0.31
187 0.31
188 0.36
189 0.3
190 0.29
191 0.25
192 0.21
193 0.24
194 0.24
195 0.21
196 0.16
197 0.15
198 0.13
199 0.13
200 0.12
201 0.1
202 0.1
203 0.09
204 0.13
205 0.15
206 0.16
207 0.18
208 0.22
209 0.3
210 0.31
211 0.33
212 0.35
213 0.39
214 0.45
215 0.48
216 0.53
217 0.52
218 0.56
219 0.57
220 0.57
221 0.59
222 0.52
223 0.45
224 0.36
225 0.29
226 0.24
227 0.21
228 0.16
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.06
234 0.04
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.04
240 0.05
241 0.07
242 0.08
243 0.11
244 0.13
245 0.14
246 0.18
247 0.2
248 0.21
249 0.23
250 0.23
251 0.21
252 0.23
253 0.23
254 0.2
255 0.2
256 0.19
257 0.18
258 0.22
259 0.29
260 0.32
261 0.37
262 0.44
263 0.5
264 0.6
265 0.67
266 0.66
267 0.66
268 0.66
269 0.67
270 0.63
271 0.55
272 0.46
273 0.41
274 0.36
275 0.3
276 0.24
277 0.26
278 0.25
279 0.25
280 0.24
281 0.23
282 0.27
283 0.26
284 0.29
285 0.26
286 0.3
287 0.32
288 0.35
289 0.36
290 0.33
291 0.37
292 0.33
293 0.32
294 0.26
295 0.26
296 0.31
297 0.3
298 0.3
299 0.3
300 0.3
301 0.25
302 0.25
303 0.22
304 0.12
305 0.11
306 0.09
307 0.06
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.06
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.1
316 0.1
317 0.1
318 0.11
319 0.14
320 0.12
321 0.15
322 0.15
323 0.17
324 0.17
325 0.2
326 0.18
327 0.14
328 0.14
329 0.11
330 0.1
331 0.09
332 0.08
333 0.05
334 0.05
335 0.06
336 0.07
337 0.06
338 0.06
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.11
347 0.12
348 0.12
349 0.11
350 0.12
351 0.12
352 0.11
353 0.11
354 0.07
355 0.05
356 0.05
357 0.07
358 0.06
359 0.06
360 0.07
361 0.08
362 0.08
363 0.09
364 0.09
365 0.07
366 0.07
367 0.08
368 0.08
369 0.07
370 0.07
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.08
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.1
380 0.12
381 0.12
382 0.12
383 0.11
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.07
388 0.05
389 0.05
390 0.06
391 0.06
392 0.05
393 0.06
394 0.08
395 0.1
396 0.19
397 0.24
398 0.24
399 0.31
400 0.37
401 0.45
402 0.5
403 0.56
404 0.58
405 0.63
406 0.72
407 0.76
408 0.79
409 0.8
410 0.84
411 0.85
412 0.85
413 0.85
414 0.85
415 0.82
416 0.83
417 0.84
418 0.83
419 0.82
420 0.82
421 0.78
422 0.77
423 0.8
424 0.77
425 0.73
426 0.68
427 0.62
428 0.58
429 0.55
430 0.54
431 0.5
432 0.48
433 0.42
434 0.39
435 0.36
436 0.31
437 0.27
438 0.2
439 0.15
440 0.1
441 0.13
442 0.14
443 0.12
444 0.11
445 0.12
446 0.13
447 0.14
448 0.15
449 0.13
450 0.13
451 0.14
452 0.14
453 0.13
454 0.14
455 0.11
456 0.1
457 0.09
458 0.08
459 0.07
460 0.08
461 0.08
462 0.07
463 0.07
464 0.07
465 0.07
466 0.07
467 0.07
468 0.06
469 0.09
470 0.1
471 0.11
472 0.12
473 0.18
474 0.19
475 0.19
476 0.2
477 0.18
478 0.21
479 0.23
480 0.21
481 0.18
482 0.18
483 0.18
484 0.19
485 0.18
486 0.13
487 0.11
488 0.1
489 0.07
490 0.06
491 0.05
492 0.04
493 0.05
494 0.06
495 0.06
496 0.07
497 0.12
498 0.19
499 0.2
500 0.2
501 0.2
502 0.2
503 0.21
504 0.19
505 0.15
506 0.11
507 0.13
508 0.13
509 0.13
510 0.13
511 0.12
512 0.15
513 0.18
514 0.15
515 0.17
516 0.25
517 0.26
518 0.31
519 0.38
520 0.4
521 0.39
522 0.41
523 0.39
524 0.33
525 0.31
526 0.25
527 0.19
528 0.14
529 0.13
530 0.09
531 0.06
532 0.05
533 0.05
534 0.05
535 0.04
536 0.04
537 0.03
538 0.03
539 0.04
540 0.04
541 0.04
542 0.04
543 0.08
544 0.09
545 0.1
546 0.11
547 0.16
548 0.16
549 0.18
550 0.2
551 0.19
552 0.19
553 0.19
554 0.19
555 0.16
556 0.16
557 0.14
558 0.11
559 0.1
560 0.09
561 0.1
562 0.09
563 0.09
564 0.1
565 0.15
566 0.16
567 0.18
568 0.22
569 0.25
570 0.27
571 0.3
572 0.35
573 0.32
574 0.32
575 0.32
576 0.3
577 0.28
578 0.27
579 0.23
580 0.17
581 0.16
582 0.16
583 0.13
584 0.1
585 0.07
586 0.07
587 0.06
588 0.05
589 0.05
590 0.06
591 0.07
592 0.06
593 0.07
594 0.07
595 0.07
596 0.08
597 0.09
598 0.11
599 0.13
600 0.13
601 0.13
602 0.13
603 0.13
604 0.12
605 0.11
606 0.09
607 0.08
608 0.1
609 0.12
610 0.16
611 0.15
612 0.15
613 0.15
614 0.18
615 0.18
616 0.19
617 0.18
618 0.2
619 0.2
620 0.23
621 0.29
622 0.29
623 0.29
624 0.29
625 0.36
626 0.31
627 0.34
628 0.32
629 0.28
630 0.29
631 0.29
632 0.28
633 0.27
634 0.3
635 0.29
636 0.3
637 0.29
638 0.25
639 0.24
640 0.23
641 0.15
642 0.11
643 0.08
644 0.05
645 0.05
646 0.05
647 0.05
648 0.05
649 0.05
650 0.06
651 0.07
652 0.07
653 0.12
654 0.16
655 0.16
656 0.19
657 0.2
658 0.24
659 0.28
660 0.28
661 0.25
662 0.22
663 0.21
664 0.19
665 0.19
666 0.15
667 0.11
668 0.1
669 0.08
670 0.09
671 0.1
672 0.09
673 0.08
674 0.07
675 0.07
676 0.07
677 0.08
678 0.1
679 0.12
680 0.15
681 0.23
682 0.24
683 0.25
684 0.32
685 0.35
686 0.36
687 0.38
688 0.37
689 0.31
690 0.31
691 0.31
692 0.24
693 0.2
694 0.16
695 0.11
696 0.08
697 0.07
698 0.07
699 0.07
700 0.06
701 0.06
702 0.07
703 0.07
704 0.07
705 0.1
706 0.14
707 0.13
708 0.13
709 0.14
710 0.14
711 0.16
712 0.17
713 0.15
714 0.1
715 0.12
716 0.14
717 0.14
718 0.14
719 0.13
720 0.14
721 0.14
722 0.14
723 0.18
724 0.17
725 0.18
726 0.18
727 0.17
728 0.17
729 0.19
730 0.18
731 0.14
732 0.14
733 0.11
734 0.12
735 0.13
736 0.12
737 0.11
738 0.11
739 0.11
740 0.14
741 0.16
742 0.15
743 0.14
744 0.13
745 0.12
746 0.12
747 0.12
748 0.08
749 0.07
750 0.08
751 0.09
752 0.09
753 0.08
754 0.12
755 0.15
756 0.17
757 0.18
758 0.16
759 0.16
760 0.17
761 0.17
762 0.16
763 0.16
764 0.19
765 0.28
766 0.34
767 0.38
768 0.38
769 0.38
770 0.36
771 0.35
772 0.29
773 0.19
774 0.16
775 0.13
776 0.13
777 0.13
778 0.12
779 0.11
780 0.11
781 0.17
782 0.14
783 0.15
784 0.15
785 0.17
786 0.19
787 0.22
788 0.27
789 0.22
790 0.26
791 0.25
792 0.27
793 0.25
794 0.24
795 0.23
796 0.16
797 0.19
798 0.21
799 0.24
800 0.3
801 0.33
802 0.38
803 0.45
804 0.52
805 0.52
806 0.55
807 0.52
808 0.47
809 0.47
810 0.4
811 0.39
812 0.34
813 0.31
814 0.27
815 0.27
816 0.25
817 0.25
818 0.26
819 0.2
820 0.21
821 0.22
822 0.25
823 0.32
824 0.33
825 0.31
826 0.34
827 0.34
828 0.35
829 0.33
830 0.32
831 0.26
832 0.24
833 0.23
834 0.19
835 0.2
836 0.2
837 0.2
838 0.15
839 0.13
840 0.13
841 0.12
842 0.12
843 0.11
844 0.08
845 0.07
846 0.06
847 0.07
848 0.06
849 0.07
850 0.06
851 0.06
852 0.07
853 0.07
854 0.09
855 0.1
856 0.11
857 0.11
858 0.13
859 0.16
860 0.19
861 0.21
862 0.21
863 0.2
864 0.2
865 0.2
866 0.2
867 0.25
868 0.24
869 0.21
870 0.27
871 0.3
872 0.31
873 0.31
874 0.29
875 0.29
876 0.27
877 0.31
878 0.31
879 0.3
880 0.3
881 0.32
882 0.34
883 0.26
884 0.26
885 0.24
886 0.23
887 0.23
888 0.26
889 0.25
890 0.29
891 0.36
892 0.42
893 0.49
894 0.53
895 0.51
896 0.5
897 0.51
898 0.49
899 0.48
900 0.43
901 0.37
902 0.34
903 0.36
904 0.34
905 0.32
906 0.28
907 0.23
908 0.22
909 0.24
910 0.28
911 0.26
912 0.27
913 0.32
914 0.33
915 0.37
916 0.4
917 0.38
918 0.34
919 0.32
920 0.31
921 0.26
922 0.25
923 0.21
924 0.17
925 0.15
926 0.11
927 0.1
928 0.1
929 0.1
930 0.11
931 0.11
932 0.12
933 0.11
934 0.11
935 0.1
936 0.09
937 0.09
938 0.08
939 0.08
940 0.07
941 0.07
942 0.08
943 0.09
944 0.1
945 0.12
946 0.14
947 0.15
948 0.16
949 0.2
950 0.2
951 0.19
952 0.21
953 0.19
954 0.17
955 0.17
956 0.17
957 0.14
958 0.15
959 0.16
960 0.17
961 0.16
962 0.16
963 0.15
964 0.15
965 0.14
966 0.12
967 0.1
968 0.1
969 0.18
970 0.19
971 0.19
972 0.2
973 0.22
974 0.22
975 0.23
976 0.22
977 0.14
978 0.17
979 0.17
980 0.19
981 0.17
982 0.23
983 0.25
984 0.24
985 0.26
986 0.25
987 0.26
988 0.25
989 0.31
990 0.33
991 0.35
992 0.34
993 0.37
994 0.44
995 0.47
996 0.48
997 0.44
998 0.42
999 0.41
1000 0.44
1001 0.41
1002 0.36
1003 0.39
1004 0.43
1005 0.43
1006 0.39
1007 0.39
1008 0.4
1009 0.42
1010 0.44
1011 0.38
1012 0.36
1013 0.34
1014 0.36
1015 0.33
1016 0.29
1017 0.24
1018 0.17
1019 0.16
1020 0.13
1021 0.11
1022 0.08
1023 0.08
1024 0.08
1025 0.08
1026 0.08
1027 0.08
1028 0.08
1029 0.07
1030 0.06
1031 0.06
1032 0.06
1033 0.06
1034 0.06
1035 0.06
1036 0.06
1037 0.06
1038 0.08
1039 0.08
1040 0.09
1041 0.08
1042 0.12
1043 0.17
1044 0.26
1045 0.27
1046 0.27
1047 0.26
1048 0.27
1049 0.28
1050 0.25
1051 0.22
1052 0.13
1053 0.13
1054 0.11
1055 0.12
1056 0.11
1057 0.1
1058 0.09
1059 0.09
1060 0.08
1061 0.08
1062 0.08
1063 0.08
1064 0.1
1065 0.12
1066 0.15
1067 0.15
1068 0.15
1069 0.15
1070 0.2