Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KCD1

Protein Details
Accession Q5KCD1    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
113-134HQSHHNRSKPEQSRNHNHQQPMHydrophilic
678-700CSHPGCGKKFSRPDQLKRHMTIHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
701-716NKPPGEKRRGSGVPAK
Subcellular Location(s) nucl 26.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG cne:CNH00600  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00096  zf-C2H2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MYQQQTMASHPFFSHNNPWARSAICCDQHHGESTSAAMARLAGNIPFSHDENLHDHHLGYHDSSGCTSDCPLDTYCCSGDYCCDKHGSCSSGDECCDDPRCEEAHRPDSRASHQSHHNRSKPEQSRNHNHQQPMSLEEWAGTQEGCNAIQQLIECCNQPDCHIPVCPTDNSEVHPLPADPLSALFASLDAQQQPQPISTAQQPMAPVSSVEASHTCHWGNCHLVFGSMPDLLAHVAADHLNAAGTAHQSDQLLQQAQSAQSAQSTPLALLTERALSSISTNTTGLQSHLPTNSSLQATSLAVNDALLSCMWDDCFPVPEVPAASSTSHSTFHHYNSDNCQAPHNHQHDHSYAAGEPFNPGTMLRHVLEEHLGIPPDIIGWPNEAELQAQAQAILEKHHHHHHIDPREALVNHSENCNHVHPHPHSHSHGNSAGTGANDSHPHGHALAHSQFHPNLHPHPHSLPHERSYAHSHSLSHSRPLSHEPLPTPPSTVKTEACTSPAASNDSVASTVLTASQSSKDLICLWPGCTIHTPFASTASLMDHLSEMHIPKGKDCYTCHWGGCGGEEGRVFKSRQKVLRHLQSHIGHKPFVCGVCNQAFSEAAPLTAHMRRHAQEKPFKCEHPGCGKSFAISSSLTIHMRTHNGEKPFVCPYCQKGFVEASNLTKHIRTHTGERPFACSHPGCGKKFSRPDQLKRHMTIHNKPPGEKRRGSGVPAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.39
3 0.46
4 0.47
5 0.48
6 0.47
7 0.46
8 0.42
9 0.41
10 0.41
11 0.41
12 0.41
13 0.43
14 0.46
15 0.47
16 0.49
17 0.44
18 0.36
19 0.28
20 0.28
21 0.26
22 0.21
23 0.19
24 0.14
25 0.13
26 0.12
27 0.13
28 0.14
29 0.11
30 0.12
31 0.12
32 0.16
33 0.18
34 0.2
35 0.21
36 0.21
37 0.23
38 0.26
39 0.3
40 0.3
41 0.27
42 0.25
43 0.24
44 0.26
45 0.24
46 0.21
47 0.22
48 0.2
49 0.2
50 0.21
51 0.21
52 0.19
53 0.18
54 0.18
55 0.16
56 0.15
57 0.17
58 0.19
59 0.2
60 0.21
61 0.24
62 0.24
63 0.22
64 0.22
65 0.19
66 0.24
67 0.27
68 0.28
69 0.27
70 0.31
71 0.3
72 0.35
73 0.4
74 0.35
75 0.29
76 0.33
77 0.33
78 0.31
79 0.32
80 0.29
81 0.25
82 0.28
83 0.31
84 0.27
85 0.26
86 0.26
87 0.27
88 0.28
89 0.34
90 0.38
91 0.43
92 0.46
93 0.48
94 0.49
95 0.51
96 0.54
97 0.54
98 0.49
99 0.45
100 0.52
101 0.58
102 0.65
103 0.7
104 0.7
105 0.69
106 0.71
107 0.75
108 0.75
109 0.75
110 0.74
111 0.74
112 0.78
113 0.8
114 0.86
115 0.81
116 0.76
117 0.69
118 0.65
119 0.57
120 0.51
121 0.44
122 0.34
123 0.27
124 0.23
125 0.2
126 0.15
127 0.13
128 0.09
129 0.07
130 0.08
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.11
137 0.11
138 0.12
139 0.13
140 0.14
141 0.14
142 0.15
143 0.18
144 0.17
145 0.18
146 0.22
147 0.22
148 0.23
149 0.25
150 0.25
151 0.26
152 0.3
153 0.29
154 0.25
155 0.26
156 0.25
157 0.25
158 0.3
159 0.26
160 0.22
161 0.23
162 0.21
163 0.18
164 0.18
165 0.16
166 0.09
167 0.09
168 0.1
169 0.09
170 0.09
171 0.07
172 0.06
173 0.07
174 0.08
175 0.1
176 0.09
177 0.11
178 0.12
179 0.14
180 0.15
181 0.14
182 0.15
183 0.13
184 0.15
185 0.18
186 0.22
187 0.2
188 0.21
189 0.21
190 0.2
191 0.21
192 0.19
193 0.14
194 0.11
195 0.11
196 0.09
197 0.1
198 0.11
199 0.12
200 0.14
201 0.16
202 0.15
203 0.15
204 0.16
205 0.17
206 0.21
207 0.18
208 0.19
209 0.16
210 0.16
211 0.15
212 0.15
213 0.14
214 0.1
215 0.09
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.06
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.1
238 0.13
239 0.14
240 0.13
241 0.14
242 0.14
243 0.15
244 0.15
245 0.13
246 0.1
247 0.09
248 0.1
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.07
263 0.08
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.1
268 0.1
269 0.1
270 0.11
271 0.11
272 0.11
273 0.11
274 0.12
275 0.13
276 0.13
277 0.13
278 0.14
279 0.16
280 0.14
281 0.13
282 0.11
283 0.12
284 0.11
285 0.12
286 0.1
287 0.08
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.05
292 0.05
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.1
312 0.11
313 0.11
314 0.13
315 0.13
316 0.16
317 0.16
318 0.17
319 0.23
320 0.23
321 0.24
322 0.27
323 0.33
324 0.31
325 0.3
326 0.31
327 0.26
328 0.28
329 0.35
330 0.33
331 0.3
332 0.28
333 0.31
334 0.29
335 0.3
336 0.26
337 0.18
338 0.15
339 0.14
340 0.14
341 0.11
342 0.1
343 0.08
344 0.08
345 0.07
346 0.06
347 0.06
348 0.07
349 0.1
350 0.1
351 0.1
352 0.1
353 0.11
354 0.11
355 0.1
356 0.09
357 0.08
358 0.08
359 0.07
360 0.06
361 0.06
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.04
366 0.05
367 0.05
368 0.06
369 0.07
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.05
378 0.06
379 0.06
380 0.07
381 0.08
382 0.09
383 0.12
384 0.17
385 0.19
386 0.2
387 0.26
388 0.33
389 0.38
390 0.4
391 0.38
392 0.34
393 0.36
394 0.35
395 0.3
396 0.25
397 0.21
398 0.18
399 0.19
400 0.18
401 0.15
402 0.18
403 0.19
404 0.17
405 0.15
406 0.23
407 0.23
408 0.31
409 0.34
410 0.36
411 0.37
412 0.4
413 0.4
414 0.37
415 0.38
416 0.31
417 0.27
418 0.23
419 0.21
420 0.16
421 0.15
422 0.11
423 0.09
424 0.09
425 0.1
426 0.11
427 0.1
428 0.11
429 0.11
430 0.11
431 0.1
432 0.15
433 0.16
434 0.16
435 0.17
436 0.19
437 0.19
438 0.2
439 0.22
440 0.19
441 0.21
442 0.25
443 0.26
444 0.27
445 0.28
446 0.34
447 0.36
448 0.41
449 0.41
450 0.38
451 0.39
452 0.37
453 0.37
454 0.38
455 0.36
456 0.32
457 0.29
458 0.27
459 0.27
460 0.34
461 0.32
462 0.31
463 0.29
464 0.27
465 0.28
466 0.32
467 0.33
468 0.29
469 0.31
470 0.28
471 0.32
472 0.34
473 0.32
474 0.3
475 0.27
476 0.28
477 0.28
478 0.3
479 0.25
480 0.25
481 0.28
482 0.26
483 0.27
484 0.24
485 0.22
486 0.2
487 0.21
488 0.2
489 0.17
490 0.16
491 0.15
492 0.14
493 0.13
494 0.11
495 0.09
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.06
500 0.06
501 0.07
502 0.09
503 0.09
504 0.1
505 0.11
506 0.11
507 0.12
508 0.12
509 0.16
510 0.16
511 0.16
512 0.19
513 0.19
514 0.21
515 0.23
516 0.24
517 0.23
518 0.22
519 0.23
520 0.19
521 0.21
522 0.19
523 0.15
524 0.13
525 0.12
526 0.13
527 0.11
528 0.11
529 0.09
530 0.08
531 0.1
532 0.11
533 0.11
534 0.13
535 0.17
536 0.17
537 0.18
538 0.25
539 0.27
540 0.29
541 0.31
542 0.35
543 0.37
544 0.41
545 0.4
546 0.34
547 0.33
548 0.28
549 0.27
550 0.25
551 0.19
552 0.18
553 0.18
554 0.19
555 0.2
556 0.24
557 0.23
558 0.23
559 0.31
560 0.36
561 0.42
562 0.48
563 0.55
564 0.61
565 0.7
566 0.7
567 0.64
568 0.66
569 0.64
570 0.64
571 0.63
572 0.56
573 0.48
574 0.44
575 0.43
576 0.38
577 0.34
578 0.28
579 0.21
580 0.24
581 0.27
582 0.29
583 0.26
584 0.23
585 0.22
586 0.2
587 0.24
588 0.18
589 0.14
590 0.11
591 0.12
592 0.15
593 0.19
594 0.2
595 0.19
596 0.25
597 0.26
598 0.32
599 0.38
600 0.44
601 0.5
602 0.55
603 0.6
604 0.61
605 0.61
606 0.63
607 0.62
608 0.6
609 0.61
610 0.6
611 0.55
612 0.54
613 0.52
614 0.46
615 0.42
616 0.34
617 0.26
618 0.2
619 0.18
620 0.16
621 0.2
622 0.19
623 0.19
624 0.2
625 0.22
626 0.25
627 0.28
628 0.31
629 0.34
630 0.36
631 0.41
632 0.4
633 0.4
634 0.44
635 0.41
636 0.38
637 0.36
638 0.39
639 0.42
640 0.46
641 0.43
642 0.4
643 0.43
644 0.41
645 0.43
646 0.39
647 0.36
648 0.34
649 0.35
650 0.32
651 0.31
652 0.3
653 0.3
654 0.34
655 0.34
656 0.38
657 0.46
658 0.54
659 0.57
660 0.57
661 0.58
662 0.53
663 0.5
664 0.49
665 0.42
666 0.38
667 0.42
668 0.49
669 0.45
670 0.5
671 0.55
672 0.57
673 0.66
674 0.69
675 0.7
676 0.72
677 0.79
678 0.82
679 0.87
680 0.85
681 0.81
682 0.79
683 0.76
684 0.75
685 0.74
686 0.73
687 0.73
688 0.68
689 0.68
690 0.73
691 0.75
692 0.74
693 0.7
694 0.63
695 0.64
696 0.64