Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P0CN00

Protein Details
Accession P0CN00    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-46AILARSSDPTLKKKRKKQQTNEDYIGGHydrophilic
260-288DPAAAFLTKKKKKGPRRPKYEGPWAPNRFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-36KKKRKK
198-234RIREEEERRKEAERKEWTKGMVQRRDREERRRLEKKM
268-278KKKKKGPRRPK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018609  Bud13  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0070274  C:RES complex  
GO:0005684  C:U2-type spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF09736  Bud13  
Amino Acid Sequences MSDLKAYLAAKYMSGPKADAILARSSDPTLKKKRKKQQTNEDYIGGSVKAEASGGLMLRDEDEVWGRSKNEDEEDDAPVIGKDLATFKGSKSSWATVANKSALPLPQAEPTSPQDIKPDIKEEPDIDGPAASAPVQMTKRRGGLRTAAQLKEDTERELAEQRSPSPAEGEERPDPTETVHRDATGKIIDVKKRQEEERIREEEERRKEAERKEWTKGMVQRRDREERRRLEKKMAEADVGRSKDDVRMNKEMKEEERWNDPAAAFLTKKKKKGPRRPKYEGPWAPNRFGIAPGFRWDGVDRSNGFEKKYFQAQNTRARREYEHNQWSVEDM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.22
4 0.24
5 0.24
6 0.23
7 0.19
8 0.21
9 0.21
10 0.21
11 0.22
12 0.21
13 0.26
14 0.3
15 0.37
16 0.43
17 0.53
18 0.62
19 0.72
20 0.81
21 0.86
22 0.91
23 0.93
24 0.93
25 0.93
26 0.93
27 0.87
28 0.78
29 0.67
30 0.57
31 0.47
32 0.35
33 0.24
34 0.15
35 0.1
36 0.08
37 0.07
38 0.06
39 0.06
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.08
46 0.09
47 0.08
48 0.08
49 0.1
50 0.11
51 0.13
52 0.15
53 0.15
54 0.16
55 0.19
56 0.2
57 0.21
58 0.21
59 0.24
60 0.24
61 0.26
62 0.25
63 0.22
64 0.2
65 0.16
66 0.15
67 0.1
68 0.08
69 0.06
70 0.08
71 0.09
72 0.11
73 0.12
74 0.11
75 0.19
76 0.19
77 0.22
78 0.25
79 0.25
80 0.27
81 0.33
82 0.36
83 0.31
84 0.35
85 0.33
86 0.29
87 0.27
88 0.27
89 0.21
90 0.19
91 0.18
92 0.15
93 0.18
94 0.19
95 0.18
96 0.2
97 0.22
98 0.27
99 0.25
100 0.24
101 0.23
102 0.25
103 0.27
104 0.26
105 0.26
106 0.21
107 0.22
108 0.23
109 0.21
110 0.22
111 0.2
112 0.19
113 0.15
114 0.14
115 0.12
116 0.1
117 0.1
118 0.06
119 0.05
120 0.04
121 0.09
122 0.11
123 0.14
124 0.17
125 0.19
126 0.24
127 0.26
128 0.28
129 0.26
130 0.29
131 0.31
132 0.36
133 0.39
134 0.35
135 0.33
136 0.32
137 0.3
138 0.29
139 0.25
140 0.18
141 0.13
142 0.13
143 0.13
144 0.17
145 0.16
146 0.15
147 0.15
148 0.14
149 0.17
150 0.17
151 0.16
152 0.13
153 0.13
154 0.13
155 0.14
156 0.18
157 0.17
158 0.18
159 0.19
160 0.19
161 0.18
162 0.16
163 0.21
164 0.19
165 0.21
166 0.2
167 0.19
168 0.2
169 0.2
170 0.21
171 0.15
172 0.13
173 0.14
174 0.18
175 0.22
176 0.26
177 0.3
178 0.34
179 0.36
180 0.37
181 0.42
182 0.46
183 0.48
184 0.52
185 0.51
186 0.48
187 0.5
188 0.54
189 0.53
190 0.51
191 0.47
192 0.42
193 0.42
194 0.46
195 0.46
196 0.5
197 0.52
198 0.51
199 0.52
200 0.53
201 0.5
202 0.51
203 0.53
204 0.53
205 0.52
206 0.54
207 0.56
208 0.6
209 0.69
210 0.7
211 0.72
212 0.72
213 0.72
214 0.75
215 0.77
216 0.73
217 0.73
218 0.7
219 0.68
220 0.66
221 0.58
222 0.5
223 0.43
224 0.44
225 0.42
226 0.38
227 0.31
228 0.24
229 0.23
230 0.26
231 0.31
232 0.32
233 0.32
234 0.4
235 0.42
236 0.45
237 0.48
238 0.46
239 0.44
240 0.45
241 0.44
242 0.38
243 0.42
244 0.41
245 0.39
246 0.37
247 0.33
248 0.28
249 0.25
250 0.25
251 0.2
252 0.25
253 0.34
254 0.38
255 0.44
256 0.5
257 0.59
258 0.66
259 0.77
260 0.81
261 0.81
262 0.86
263 0.9
264 0.91
265 0.89
266 0.89
267 0.86
268 0.82
269 0.82
270 0.76
271 0.7
272 0.61
273 0.54
274 0.44
275 0.37
276 0.34
277 0.27
278 0.25
279 0.27
280 0.29
281 0.26
282 0.28
283 0.27
284 0.26
285 0.24
286 0.28
287 0.25
288 0.27
289 0.35
290 0.35
291 0.36
292 0.37
293 0.39
294 0.38
295 0.46
296 0.46
297 0.43
298 0.51
299 0.57
300 0.63
301 0.69
302 0.72
303 0.66
304 0.65
305 0.66
306 0.64
307 0.65
308 0.65
309 0.65
310 0.6
311 0.57