Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F4GNW4

Protein Details
Accession A0A0F4GNW4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-101DDTPKPKNKARKEQDKSAGVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-133KPKNKARKEQDKSAGVGGRGGGRGGPRGGRGGGRGGGRGRGRGGGRGF
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 9, cyto_nucl 8, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027141  LSm4/Sm_D1/D3  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR034102  Sm_D1  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0120114  C:Sm-like protein family complex  
GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
CDD cd01724  Sm_D1  
Amino Acid Sequences MKLVRFLMKCTNETVTIELKTGTIVQGTIASISPQMNTNLRNAKMTPRGGSQIALEHVSIRGSEIRYYILPDSLPLDTLLIDDTPKPKNKARKEQDKSAGVGGRGGGRGGPRGGRGGGRGGGRGRGRGGGRGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.28
3 0.25
4 0.24
5 0.2
6 0.17
7 0.16
8 0.15
9 0.12
10 0.08
11 0.07
12 0.07
13 0.08
14 0.08
15 0.08
16 0.07
17 0.07
18 0.08
19 0.09
20 0.09
21 0.1
22 0.12
23 0.14
24 0.15
25 0.2
26 0.25
27 0.26
28 0.27
29 0.27
30 0.31
31 0.35
32 0.36
33 0.33
34 0.29
35 0.31
36 0.29
37 0.29
38 0.23
39 0.18
40 0.17
41 0.15
42 0.13
43 0.1
44 0.1
45 0.09
46 0.09
47 0.07
48 0.08
49 0.08
50 0.09
51 0.09
52 0.1
53 0.1
54 0.11
55 0.11
56 0.09
57 0.08
58 0.08
59 0.1
60 0.08
61 0.09
62 0.07
63 0.07
64 0.06
65 0.06
66 0.07
67 0.05
68 0.05
69 0.06
70 0.09
71 0.14
72 0.18
73 0.23
74 0.28
75 0.38
76 0.47
77 0.57
78 0.64
79 0.71
80 0.74
81 0.79
82 0.82
83 0.76
84 0.68
85 0.62
86 0.55
87 0.43
88 0.37
89 0.28
90 0.22
91 0.18
92 0.16
93 0.13
94 0.11
95 0.14
96 0.14
97 0.16
98 0.15
99 0.17
100 0.19
101 0.19
102 0.2
103 0.21
104 0.23
105 0.23
106 0.25
107 0.24
108 0.31
109 0.31
110 0.32
111 0.3
112 0.32
113 0.33